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嗜酸性粒细胞胃肠炎病理切片的计算机辅助诊断 认领
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作者 万真真 李春雪 +2 位作者 刘芳 张绍永 韩帅 《激光与光电子学进展》 CSCD 北大核心 2020年第20期345-352,共8页
嗜酸性粒细胞胃肠炎(EG)是一种以外周血嗜酸性粒细胞(EOS)增多为特征的胃肠道疾病,其主要诊断依据为消化道黏膜标本病理切片中嗜酸性粒细胞的数目是否超标。利用计算机图像分析算法对病理切片图像中的嗜酸性粒细胞进行识别并计数,旨在... 嗜酸性粒细胞胃肠炎(EG)是一种以外周血嗜酸性粒细胞(EOS)增多为特征的胃肠道疾病,其主要诊断依据为消化道黏膜标本病理切片中嗜酸性粒细胞的数目是否超标。利用计算机图像分析算法对病理切片图像中的嗜酸性粒细胞进行识别并计数,旨在辅助病理医生人工计算EOS的数目,减少医生的工作量,提高工作效率。采用鲁棒性较强的分水岭算法作为识别EOS的核心算法,并通过距离变换和前后景标记的改进算法解决传统分水岭算法中的过分割问题,提高识别计数的准确性。采用改进分水岭算法对EG病理图像中的EOS进行识别计数,并将其与病理医生的金标准进行比对。改进分水岭算法的平均准确率为95.0%。与传统算法相比,改进算法准确率的相对标准方差由5.8%提高到2.2%,过分割率由13.4%降低为3.7%,算法的运行时间由40 s缩短为27 s左右。 展开更多
关键词 医用光学 计算机辅助诊断 病理切片 嗜酸性粒细胞 分水岭 过分割 前后景标记
大白菜重组自交系群体构建过程中剩余杂合位点的变化趋势 认领 被引量:3
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作者 刘栓桃 张志刚 +6 位作者 李巧云 赵智中 王立华 王淑芬 徐文玲 刘贤娴 刘辰 《分子植物育种》 CSCD 北大核心 2017年第7期2730-2735,共6页
剩余杂合系是QTL精细定位的较好衍生群体,它是在重组自交系构建过程中形成的。本研究均匀选择了遍布大白菜全基因组的51对前景/背景标记,随机选择了重组自交系群体构建过程中的57个家系,从中选株系的F5跟踪检测至F8。研究数据表明:从F5... 剩余杂合系是QTL精细定位的较好衍生群体,它是在重组自交系构建过程中形成的。本研究均匀选择了遍布大白菜全基因组的51对前景/背景标记,随机选择了重组自交系群体构建过程中的57个家系,从中选株系的F5跟踪检测至F8。研究数据表明:从F5至F8,特定位点的平均剩余杂合率分别是7.06%、3.51%、1.38%和0.38%;剩余杂合位点在所选株系内的基因组覆盖率分别是90.19%、76.47%、52.94%和21.57%,覆盖率迅速降低。值得关注的是:在F5代时,剩余杂合位点不仅覆盖了90%以上的基因组范围,且特定家系多个杂合位点多位于不同的染色体上,在接下来F6代的筛选中很容易得到单位点剩余杂合单株。因此,本研究基于前景/背景标记的检测数据认为,高效率筛选剩余杂合单株的时期是F5-F6世代。这为提高作物农艺性状精细解析和精准定位提供了参考依据。 展开更多
关键词 大白菜 重组自交系群体 前景/背景标记 剩余杂合位点 基因组覆盖率
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