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基于SSR序列的江西省不同生态地区稻瘟病菌遗传多样性分析 认领
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作者 兰波 孙强 +2 位作者 杨迎青 李湘民 霍光华 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期292-301,共10页
为明确江西省稻瘟病菌Magnaporthe oryzae群体遗传结构及其多样性水平,选用13对SSR引物对分离自5个不同生态地理县(市)水稻穗颈瘟标样的稻瘟病菌单孢菌株的全基因组进行PCR扩增,利用最长距离法和POPGENE 32生物学软件对其进行聚类分析... 为明确江西省稻瘟病菌Magnaporthe oryzae群体遗传结构及其多样性水平,选用13对SSR引物对分离自5个不同生态地理县(市)水稻穗颈瘟标样的稻瘟病菌单孢菌株的全基因组进行PCR扩增,利用最长距离法和POPGENE 32生物学软件对其进行聚类分析和群体遗传多样性分析。结果显示,共分离获得189株稻瘟病菌菌株,13对SSR引物对其均能扩增出1条大小相同且清晰的条带,多态性位点百分率高达100.00%。供试189株稻瘟病菌菌株在相似系数为0.74时可划分为15个遗传宗谱,其中宗谱JXL01包含71株菌株,占总菌株数的37.57%,为优势宗谱;宗谱JXL02、JXL14为亚优势宗谱,分别包含31、26株菌株,占总菌株数的16.40%和13.76%;宗谱JXL03、JXL08、JXL10为次要宗谱,包含10~17株菌株;其它9个宗谱为小宗谱,包含菌株都在5株以下。在群体水平上,来源于不同生态型地区的5个稻瘟病菌群体的Nei’s基因多样性指数为0.375,Shannon信息指数为0.558,具有丰富的遗传多样性,且群体间差异较大;这5个种群基于非加权配对平均法大多聚为一类,种群遗传谱系与地理区域分布呈一定相关性,群体遗传多样性均值为0.373,存在一定的遗传分化,且群体内多样性大于群体间多样性,总遗传变异的64.56%存在于群体内。表明江西省稻瘟病菌群体结构既包含明显的优势宗谱,又存在复杂多变的特异性小宗谱,遗传多样性丰富,且与地理分布有一定的相关性。 展开更多
关键词 稻瘟病菌 遗传多样性 SSR标记 遗传分化
缅甸蟒线粒体Cytb基因遗传多样性分析 认领
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作者 段玉宝 樊翠平 +1 位作者 李媛 田秀华 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期1042-1046,共5页
为了探讨海南文昌种蟒养殖基地的种蟒的遗传多样性和个体来源,本研究对27条种蟒的细胞色素b基因的全序列进行了测定和分析。结果表明:缅甸蟒cytb基因全长1 111 bp,序列中A+T含量为58.0%,G+C含量为42.0%,单倍型多样性(Hd)为(0.755±0... 为了探讨海南文昌种蟒养殖基地的种蟒的遗传多样性和个体来源,本研究对27条种蟒的细胞色素b基因的全序列进行了测定和分析。结果表明:缅甸蟒cytb基因全长1 111 bp,序列中A+T含量为58.0%,G+C含量为42.0%,单倍型多样性(Hd)为(0.755±0.053),核苷酸多样性(Pi)为(0.003 29±0.000 43),表明该种群遗传多样性较高。共检测出6条单倍型,单倍型间遗传距离最大为0.007,最小为0.001;与已知地理来源的个体构建系统发育树显示,该养殖种群来源两个母系世系。本研究结果为制定缅甸蟒合理圈养计划和科学放归提供理论基础。 展开更多
关键词 缅甸蟒 CYTB基因 遗传多样性 养殖种群
文冠果经济性状的遗传变异分析及油用型优株选择 认领
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作者 梁强 王锦柯 +2 位作者 苑福林 李守科 杨克强 《中国粮油学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第1期80-86,90共8页
文冠果(Xanthoceras sorbifoliumBunge)是我国特有的植物源神经酸来源木本油料树种。本研究对山东省的35个文冠果单株的遗传多样性进行了评价,测定供试材料种仁的脂肪酸、氨基酸构成;用主成分分析综合指数法筛选了油用型优良单株。结果... 文冠果(Xanthoceras sorbifoliumBunge)是我国特有的植物源神经酸来源木本油料树种。本研究对山东省的35个文冠果单株的遗传多样性进行了评价,测定供试材料种仁的脂肪酸、氨基酸构成;用主成分分析综合指数法筛选了油用型优良单株。结果表明,35个文冠果单株的18个性状平均遗传多样性指数(H′)达1.863,平均变异系数(CV)达29.2%,单株间性状变异的多样性为文冠果良种选育提供基础。供试材料种仁平均脂肪含量为58.69%,脂肪酸构成中有11种脂肪酸,亚油酸是主要组分,含量为(41.13±1.70)%;其次是油酸,平均质量分数为(29.03±3.20)%;神经酸平均质量分数为(3.99±0.38)%,芥酸平均质量分数为(9.94±0.66)%。供试材料种仁中蛋白质平均质量分数为27.00%,有17种氨基酸,其中必需氨基酸7种,其AAS值在24.44~53.95之间。依据主成分综合评价指数,选出WF17、WF15、WF9、LY5、WF18、WF4、WF16、WF10等8个文冠果油用型优良单株。研究结果为文冠果油用型良种选育及其开发利用提供了科学依据。 展开更多
关键词 文冠果 遗传多样性 优株选择 脂肪酸 氨基酸
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西双版纳自然保护区球孢白僵菌的遗传多样性 认领
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作者 李亦菲 郑亚强 +3 位作者 赵永鑫 徐天梅 LOINHEUANG Chanhom 陈斌 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期302-311,共10页
为了解西双版纳自然保护区球孢白僵菌Beauveria bassiana的遗传多样性,采用SSR分子标记技术对西双版纳自然保护区的240株球孢白僵菌的遗传结构、基因流、菌株分化以及遗传变异相关性进行了测定和分析。结果表明,9条引物扩增240株球孢白... 为了解西双版纳自然保护区球孢白僵菌Beauveria bassiana的遗传多样性,采用SSR分子标记技术对西双版纳自然保护区的240株球孢白僵菌的遗传结构、基因流、菌株分化以及遗传变异相关性进行了测定和分析。结果表明,9条引物扩增240株球孢白僵菌菌株多态位点数为77个,多态位点比率为97.40%。采集的240株球孢白僵菌的总体等位基因数、有效等位基因数、Nei’s基因多样性指数和Shannon信息多样性指数分别为1.97、1.31、0.18和0.29。从寄主居群来看,鞘翅目昆虫球孢白僵菌群体遗传多样性最高,螳螂目最低,其Nei’s基因多样性指数和Shannon信息多样性指数分别为0.20和0.30、0和0;总遗传变异的29.27%存在于寄主居群间。从生境水平来看,五十五生境中球孢白僵菌群体遗传多样性最高,丫口寨生境中最低,其Nei’s基因多样性指数和Shannon信息多样性指数最高分别为0.19和0.31、0.06和0.09;总遗传变异的14.92%存在于生境居群间。从季节水平来看,球孢白僵菌秋季居群的遗传多样性最高,夏季最低,其Nei’s基因多样性指数和Shannon信息多样性指数分别为0.20和0.32、0.17和0.26;总遗传变异的3.45%存在于季节居群间。表明西双版纳自然保护区球孢白僵菌在寄主昆虫、生境分布和季节间存在明显的遗传多样性,与寄主昆虫类群的关系密切。 展开更多
关键词 西双版纳自然保护区 球孢白僵菌 简单重复序列 遗传多样性
7个福建茶树品种的遗传多样性分析及其分子指纹图谱构建 认领
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作者 张俊杰 郭晨 +5 位作者 彭姗姗 宋玉婷 尚益民 李硕 饶耿慧 傅天龙 《轻工学报》 CAS 2020年第3期19-27,共9页
基于SSR分子标记技术,对来自福建省的7个供试茶树品种的遗传多样性水平进行分析,并构建其分子指纹图谱.结果表明:初步筛选的14个SSR分子标记均为多态性标记,其多态性信息含量较丰富,可以较好地区分7个供试茶树品种;福云六号与福云七号... 基于SSR分子标记技术,对来自福建省的7个供试茶树品种的遗传多样性水平进行分析,并构建其分子指纹图谱.结果表明:初步筛选的14个SSR分子标记均为多态性标记,其多态性信息含量较丰富,可以较好地区分7个供试茶树品种;福云六号与福云七号供试茶树品种之间的遗传相似性系数最高,为8.06,亲缘关系最近;以扩增条带较少、多态性较高的3个SSR分子标记引物(PS3,PS15,PS19)相组合而构建的分子指纹图谱,可有效鉴别7个供试茶树品种,实现以最少的分子标记引物鉴定所有品种的目的. 展开更多
关键词 茶树 遗传多样性 分子标记技术 分子指纹图谱
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基于微卫星标记的中国东北地区灰飞虱遗传变异及种群遗传结构分析 认领
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作者 姜姗 王兴亚 王小奇 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期73-84,共12页
【目的】本研究旨在明确我国东北地区灰飞虱Laodelphax striatellus种群遗传变异及种群遗传结构,阐明种群间遗传分化与基因流。【方法】利用9对微卫星引物对采自我国东北地区15个地理种群的375头灰飞虱样品进行测序与分析;利用GeneAlex6... 【目的】本研究旨在明确我国东北地区灰飞虱Laodelphax striatellus种群遗传变异及种群遗传结构,阐明种群间遗传分化与基因流。【方法】利用9对微卫星引物对采自我国东北地区15个地理种群的375头灰飞虱样品进行测序与分析;利用GeneAlex6.51,GENEPOP4.0.9和STRUCTURE 2.3.4等软件分析灰飞虱地理种群间的遗传多样性、遗传分化、基因流及种群遗传结构。【结果】在所分析的375头灰飞虱个体中,各位点平均有效等位基因数Na=6.898;总体上,灰飞虱不同地理种群遗传多样性较高(平均观测杂合度Ho=0.548;平均期望杂合度He=0.582),各种群间基因流较低(Nm=0.660)。UPGMA聚类树、PCoA及STRCTURE分析结果表明,东北地区灰飞虱种群分为两分支:吉林(JL)和沈阳(SY2012,SY2013和SY2014)种群聚为一支;其余种群聚为一支。AMOVA分析结果表明,灰飞虱遗传变异主要来自种群内(87%),种群间变异水平较低(13%)。【结论】中国东北地区灰飞虱遗传多样性较高,不同地理种群存在一定程度的遗传分化,且基因交流较低,存在一定的种群遗传结构。 展开更多
关键词 灰飞虱 微卫星 遗传多样性 遗传结构 基因流
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基于mtDNA COI基因序列的中国柑橘果实蝇的分子鉴定及柑橘大实蝇种群的遗传多样性分析 认领
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作者 崔中翌 周琼 +2 位作者 刘一鹏 司品法 汪洋 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期85-96,共12页
【目的】探明危害我国柑橘的实蝇种类以及柑橘大实蝇Bactrocera minax不同地理种群和不同寄主种群的遗传多样性。【方法】利用mtDNA COI基因对危害柑橘的果实蝇进行种类鉴定,采用MEGA软件对其中28个地理种群的535头果实蝇COI基因片段(约... 【目的】探明危害我国柑橘的实蝇种类以及柑橘大实蝇Bactrocera minax不同地理种群和不同寄主种群的遗传多样性。【方法】利用mtDNA COI基因对危害柑橘的果实蝇进行种类鉴定,采用MEGA软件对其中28个地理种群的535头果实蝇COI基因片段(约505 bp)序列进行比对,分析种间及种内遗传距离,构建系统发育树。使用DnaSP软件分析柑橘大实蝇不同地理种群和不同寄主种群的遗传多样性。【结果】从柑橘虫果内共鉴定出4种实蝇,分别为柑橘大实蝇B.minax、桔小实蝇B.dorsalis、蜜柑大实蝇B.tsuneonis和瑞丽果实蝇B.ruiliensis。这4种实蝇的种间遗传距离为0.0264~0.2410,种内遗传距离为0.0000~0.0140,种间与种内遗传距离没有重叠区域。单个柑橘虫果内一般仅有1种实蝇,极个别柑橘果实可同时被两种实蝇危害(4/43);在这些为害柑橘的实蝇种类中,以柑橘大实蝇的个体数量比例最大,占90.70%。柑橘大实蝇地理种群遗传多样性高,28个种群共有17个单倍型。【结论】柑橘大实蝇是所调查地区柑橘实蝇的绝对优势种,其种群遗传分化程度较高,扩散危害风险大。本研究结果对柑橘果实蝇类的监测和防控具有重要意义。 展开更多
关键词 柑橘果实蝇 柑橘大实蝇 COI基因 系统发育 遗传多样性 柑橘
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新疆春小麦育成品种遗传演变分析 认领
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作者 张金波 严勇亮 +4 位作者 王小波 路子峰 肖菁 彭惠茹 丛花 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期418-426,共9页
【目的】研究新疆春小麦育成品种遗传演变规律,提高小麦资源的利用效率,为新疆春小麦品种选育和改良提供参考依据。【方法】以新疆春小麦育成品种为材料,对其主要性状进行综合评价分析,以春小麦90K芯片开展新疆春小麦育成种亲缘关系分... 【目的】研究新疆春小麦育成品种遗传演变规律,提高小麦资源的利用效率,为新疆春小麦品种选育和改良提供参考依据。【方法】以新疆春小麦育成品种为材料,对其主要性状进行综合评价分析,以春小麦90K芯片开展新疆春小麦育成种亲缘关系分析。【结果】新疆春小麦育成种遗传多样性丰富,平均遗传多样性指数2.005,变幅为1.902~2.181。相关性分析结果表明,蛋白质含量、湿面筋含量、穗粒数与育种年代呈极显著正相关。新疆春小麦品种选育主要是通过常规杂交育种、杂交辐射诱变育种、引种3种方式。利用小麦90K芯片将新疆春小麦育成种划分为3个类群,显示了各品种之间的亲缘关系。【结论】新疆春小麦育种遗传基础薄弱、遗传多样性逐渐散失,新疆小麦育种应加强资源收集与利用,扩大育种亲本选择,提高品种变异的丰度和广度,以多抗、高产稳产、优质高效的聚合育种,加快新品种选育进程,提高育种效率。 展开更多
关键词 春小麦 育成品种 遗传多样性 90K芯片 遗传演变
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菜豆种质资源的植物凝集素含量测定及变化分析 认领
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作者 胡燕秋 冯国军 +3 位作者 杨晓旭 刘畅 刘大军 闫志山 《中国农学通报》 2020年第5期18-25,共8页
为了研究菜豆种质中植物凝集素的遗传多样性及含量变化,本研究以317份菜豆品种为试验材料,利用改进的血凝法测定鲜荚中的植物凝集素含量。同时,对不同发育时期‘紫冠’和‘白珍珠’的豆荚、荚壁和种子中的植物凝集素含量进行测定分析。... 为了研究菜豆种质中植物凝集素的遗传多样性及含量变化,本研究以317份菜豆品种为试验材料,利用改进的血凝法测定鲜荚中的植物凝集素含量。同时,对不同发育时期‘紫冠’和‘白珍珠’的豆荚、荚壁和种子中的植物凝集素含量进行测定分析。结果表明:菜豆种质中植物凝集素含量变幅为0.004~1.783 mg/g,变异系数为0.493,品种频率分布曲线总体显现连续性,主峰明显,呈近似正态分布。菜豆品种群体间的凝集素水平差异极显著,表现出明显的种质特异性和遗传多样性‘。紫冠’和‘白珍珠’豆荚在花后4~6天中检测到少量凝集素,表明豆荚凝集素是在花后4天开始积累。‘紫冠’与‘白珍珠’的植物凝集素含量随着豆荚生长发育都呈现出相同趋势,先上升后下降,再上升后下降,出现‘双峰’现象。 展开更多
关键词 菜豆 植物凝集素 血凝法 遗传多样性 凝集素含量动态变化
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红螯螯虾累代繁养群体的遗传多样性分析 认领
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作者 彭刚 徐宇 +4 位作者 张燕 王静 黄鸿兵 严维辉 许志强 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期615-619,共5页
为研究国内不同繁养基地红螯螯虾群体的遗传结构特征,采用线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)序列直接测序的方法,获取红螯螯虾国内6个繁养群体(安徽阜阳、浙江湖州、广东珠海、江苏镇江、海南澄迈、江苏苏州)共180个样本的COⅠ序列。试... 为研究国内不同繁养基地红螯螯虾群体的遗传结构特征,采用线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)序列直接测序的方法,获取红螯螯虾国内6个繁养群体(安徽阜阳、浙江湖州、广东珠海、江苏镇江、海南澄迈、江苏苏州)共180个样本的COⅠ序列。试验结果显示,序列比对长度为831 bp,其中变异位点56个,简约信息位点16个。基因序列G+C(%)含量较低(39.765%),表现出较明显的碱基组成偏倚性。180个样本共检测到10种单倍型,其中单倍型H1出现次数最多,为安徽阜阳、广东珠海、江苏镇江、海南澄迈、江苏苏州群体的共享单倍型。国内红螯螯虾繁养群体的遗传多样性较高,所有样本的总体单倍型多样性指数为0.693,核苷酸多样性指数为0.00652。其中苏州群体的单倍型多样性指数最高(0.964),海南澄迈群体最低(0.618)。不同群体间的遗传距离为0.00403~0.00969,海南澄迈和安徽阜阳群体间的遗传距离较大(0.00969),广东珠海和江苏苏州群体间遗传距离最小(0.00403)。试验结果表明,国内红螯螯虾繁养群体保持着较高的遗传多样性,群体间存在着一定的基因交流。试验结果为后续合理开发利用国内红螯螯虾种质资源积累了数据资料。 展开更多
关键词 红螯螯虾 遗传多样性 线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)
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禾生指葡孢霉的遗传多样性及对苗期青稞的致病性 认领
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作者 陈琳 蔺瑞明 +11 位作者 王凤涛 庞云星 李雪 赵爱平 张艳霞 张金玲 李文兴 何苏琴 冯晶 李赟 文才艺 徐世昌 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期213-224,共12页
【背景】在青藏高原及周边高海拔地区,青稞是当地唯一的小禾谷类粮食作物,也是主要饲草来源。穗腐病是近年来仅在青藏高原青稞种植区发现的一种新真菌病害,病原菌为禾生指葡孢霉(Dactylobotrys graminicola),它能侵染多种麦类作物及禾... 【背景】在青藏高原及周边高海拔地区,青稞是当地唯一的小禾谷类粮食作物,也是主要饲草来源。穗腐病是近年来仅在青藏高原青稞种植区发现的一种新真菌病害,病原菌为禾生指葡孢霉(Dactylobotrys graminicola),它能侵染多种麦类作物及禾本科杂草,给青稞安全生产带来严重的挑战。【目的】研究禾生指葡孢霉遗传多样性、系统进化以及对寄主种子萌发的影响,揭示该病原菌的流行传播、与寄主植物互作关系以及初侵染菌源,为病害防治提供参考。【方法】从病害流行区采集病株标本,并从典型病穗组织分离禾生指葡孢霉菌株27个,依据无性世代形态特征加以鉴定,分离获得菌株的单孢培养物,提取基因组DNA。利用SRAP分子标记分析禾生指葡孢霉的全基因组多态性,获得菌株特异性分子标记;利用LSU和Rpb2保守遗传位点比较禾生指葡孢霉与其近缘种属的进化关系;将禾生指葡孢霉分生孢子悬浮液与未萌发或发芽后的青稞种子共培养,分析其对青稞种子萌发及幼苗的影响。【结果】选用14对SRAP引物组合进行穗腐菌遗传多样性分析,平均一对引物扩增产生90个多态性条带;平均每个穗腐病菌株1.4个特异分子性标记,分离自小麦的菌株Z 13008特异性标记最多(7个),而对照菌株禾谷镰孢(Fusarium graminearum)具有20个特异性标记。禾生指葡孢霉的地域分布与其遗传多样性缺乏明显相关性。在鉴定的菌株中,仅有分离自小麦(Z13008)、黑麦(Z 13024)和2个分离自青稞的菌株(Z 13013和Z 13006)的遗传多样性与其他菌株差异较大,说明病原菌群体的遗传变异水平较低。利用20个分子标记编制DNA指纹二叉式分类检索表,可鉴定21个禾指葡孢霉菌株。系统进化分析揭示禾生指葡孢霉与丛赤壳属真菌遗传距离较近。青稞种子萌发前接种处理对种子萌发、幼苗生长均无明显的抑制作用,在萌发后共培养处理 展开更多
关键词 大麦 青稞 禾生指葡孢霉 穗腐病 SRAP 遗传多样性 指纹检索表
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96份中、日春兰资源遗传多样性的ISSR分析 认领
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作者 孙叶 赵国琦 +5 位作者 袁媛 张甜 刘红 曹宏 包建忠 陈秀兰 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1535-1547,共13页
为了探讨中、日春兰优良种质资源的生物遗传多样性,本研究通过L9(34)正交试验,确立ISSR-PCR最佳扩增反应体系,筛选ISSR引物对4个类群96份中、日春兰种质材料进行标记扩增。结果表明:本试验筛选出的ISSR-PCR最佳扩增反应体系中主要影响... 为了探讨中、日春兰优良种质资源的生物遗传多样性,本研究通过L9(34)正交试验,确立ISSR-PCR最佳扩增反应体系,筛选ISSR引物对4个类群96份中、日春兰种质材料进行标记扩增。结果表明:本试验筛选出的ISSR-PCR最佳扩增反应体系中主要影响因子的浓度为:Mg2+浓度2 mmol/L,引物浓度0.4μmol/L,Taq聚合酶用量1.5 U/20μL,d NTPs浓度0.2μmol/L;筛选出的13条引物在93份材料中扩增出126个条带,每条引物平均扩增条带数为9.69,多态性比例(PPB)为100%,种群总等位基因数(Na)为2.000 0,有效等位基因数(Ne)为1.304 5,Nei’s基因多样性(He)为0.203 3,Shannon’s信息多样性指数(Ⅰ)为0.334 0,种群水平上的遗传多样性较高;在类群水平上PPB平均值为82.94%,Na平均值为1.829 4,Ne平均值为1.301 1,He平均值为0.193 8,Ⅰ平均值为0.311 9;类群间的遗传分化系数(Gst)为0.052 1,基因流水平(Nm)为9.089 6,类群间的基因交流程度很高,类群间的变异低于类群内的变异;各类群的遗传多样性水平由高到低依次为Ⅰ类群(中国春兰正格花品种)>Ⅲ类群(中国春兰杂交种)>Ⅱ类群(中国春兰蝶花品种)>Ⅳ类群(日本春兰品种),4个春兰类群两两之间的遗传相似性系数(GS)范围为0.966 1~0.995 1,总体上遗传距离较小。UPGMA聚类分析结果显示,ISSR分子标记能很好的鉴定表型性状相似的春兰原生种和杂交种,在遗传相似系数为0.82时,Ⅱ类(中国春兰蝶花品种)品种和Ⅳ类(日本春兰品种)品种能分组聚类,Ⅰ类(中国春兰正格花品种)品种和Ⅲ类(中国春兰杂交种)种质混合在一起。春兰是中国的传统特色花卉,春兰优良品种的产业化开发潜力大,中、日春兰种质资源的遗传多样性研究对春兰种质的保护、利用和创新有重要的意义。 展开更多
关键词 春兰(Cymbidium goeringii) 遗传多样性 ISSR 聚类分析
疫苗候选抗原Pvs48/45在中缅边境的遗传多样性特点 认领
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作者 魏海潮 王琳 +5 位作者 赵艳 张学星 胡钰冰 张杨明慧 王庆辉 曹雅明 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期7-11,共5页
目的了解间日疟原虫传播阻断疫苗候选抗原Pvs48/45在中缅边境地区的基因多态性和自然选择特点。方法提取39例来自中缅边境主要流行区(Laiza)的间日疟原虫基因组DNA,采用巢式PCR(nest-PCR)扩增Pvs48/45基因开放阅读区(Open reading frame... 目的了解间日疟原虫传播阻断疫苗候选抗原Pvs48/45在中缅边境地区的基因多态性和自然选择特点。方法提取39例来自中缅边境主要流行区(Laiza)的间日疟原虫基因组DNA,采用巢式PCR(nest-PCR)扩增Pvs48/45基因开放阅读区(Open reading frame,ORF);通过MEGA 4.0、DnaSP v5.10和NETWORK 4.6对Pvs48/45基因多态性和自然选择特点进行分析。结果研究发现了6个突变位点,均为非同义突变(E35K,H211N,K250N,D335Y,A376T,K418R),导致了5种单倍型;Pvs48/45基因的核苷酸多态性水平极低(π=0.00064),CRDⅢ区最高(π=0.00163);多种中性检验均表明Pvs48/45基因处于平衡选择;种群进化分析和单倍型网络图显示Pvs48/45具有较强的地理分化,且H2型为中缅边境地区频率最高的单倍型。结论Pvs48/45在中缅边境地区遗传多样性很低,且在进化过程中经历平衡选择,提示其可作为传播阻断疫苗候选靶点;Pvs48/45在全球具有较强的地理分化,应根据地区遗传特点开发更加有效的传播阻断疫苗。 展开更多
关键词 间日疟原虫 传播阻断疫苗 Pvs48/45 基因多态性 自然选择
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基于AFLP遗传多样性和叶片内含物的银杏特异种质资源分析 认领
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作者 胡亚平 曹福亮 +1 位作者 汪贵斌 郭起荣 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期466-472,共7页
本研究以南京林业大学银杏种质资源库中新收集30份特异种质资源为材料,通过对AFLP遗传关系和叶片黄酮总量和3个主要单体(槲皮素,山奈酚,异鼠李素)及可溶性糖含量分析,探究各特异种质资源间遗传联系。研究表明各种质资源间存在不同程度... 本研究以南京林业大学银杏种质资源库中新收集30份特异种质资源为材料,通过对AFLP遗传关系和叶片黄酮总量和3个主要单体(槲皮素,山奈酚,异鼠李素)及可溶性糖含量分析,探究各特异种质资源间遗传联系。研究表明各种质资源间存在不同程度的遗传差异,不同种质资源黄酮总量和单体组成比例均具有较大差异,筛选出具有较高特异性的种质资源C16。以黄酮单体和可溶性糖含量进行系统聚类,与UPGMA聚类结果不能完全吻合,说明UPGMA聚类分析结果和叶片内含物含量聚类具有一定的差别。通过结合AFLP分子标记技术和生理特征探究特异种质资源遗传多样性,发掘银杏种质遗传变异,可以为选育银杏特异种质资源提供思路,后续种质资源筛选与鉴定提供依据。 展开更多
关键词 AFLP 银杏(Ginkgo biloba) 遗传多样性 特异种质资源
澳洲坚果种质资源的SRAP分析及指纹图谱构建 认领
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作者 刘小翠 范建新 +3 位作者 刘荣 康专苗 韩树全 罗立娜 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1566-1577,共12页
为了分析澳洲坚果种质资源的遗传多样性及其亲缘关系,加速澳洲坚果种质的遗传改良和新品种选育,本研究以45份澳洲坚果为材料,利用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记对其基因组扩增并进行遗传... 为了分析澳洲坚果种质资源的遗传多样性及其亲缘关系,加速澳洲坚果种质的遗传改良和新品种选育,本研究以45份澳洲坚果为材料,利用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记对其基因组扩增并进行遗传多样性分析。结果表明24对引物组合中能筛选出多态性较好的引物10对,利用这10对引物在45份澳洲坚果中共扩增出63条谱带,其中多态性条带47条,多态性比率74.60%。45份澳洲坚果种质资源的遗传相似系数范围为0.5873?0.9683,均值0.7778。UPGMA聚类分析表明:在遗传相似系数为0.785处可将45份澳洲坚果种质资源划分为6个类群,其中,‘黔澳1号’和‘黔澳3号’之间的遗传相似系数最大,高达0.9683,说明这两种坚果资源遗传背景相似,‘兴澳1号’和‘黔引36’号间的遗传相似系数最小,仅为0.5873,说明二者亲缘关系较远。本研究表明了SRAP技术适用于澳洲坚果种质资源的遗传多样性分析且45份澳洲坚果间的遗传变异较为丰富,为澳洲坚果种质资源的挖掘、遗传改良和进一步的分子辅助育种提供了科学依据。 展开更多
关键词 澳洲坚果(Macadamia) 种质资源 SRAP 遗传多样性 指纹图谱
山西太行黑山羊mtDNA D-Loop区遗传多样性分析 认领
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作者 闫益波 杜丽英 +6 位作者 张伯池 张凯 张菁 宋献艺 程俐芬 李文刚 曹宁贤 《山西农业科学》 2020年第6期974-980,共7页
山西太行黑山羊是一个重要的地方品种。为深入研究保种群遗传多样性,选择35只个体的线粒体DNA D-Loop区进行了测序和多态性分析。结果显示,山西太行黑山羊的D-Loop区序列长度为1211~1215 bp,A、T、C、G的含量分别为31.82%、28.44%、26.... 山西太行黑山羊是一个重要的地方品种。为深入研究保种群遗传多样性,选择35只个体的线粒体DNA D-Loop区进行了测序和多态性分析。结果显示,山西太行黑山羊的D-Loop区序列长度为1211~1215 bp,A、T、C、G的含量分别为31.82%、28.44%、26.22%和13.52%,富含A/T碱基;共发现多态性位点113个,34种单倍型,单倍型多样性为0.998;山西太行黑山羊与辽宁绒山羊、黄淮山羊和戴云山羊的遗传距离最小(0.014),与安哥拉山羊的遗传距离最大(0.029)。构建的系统发育树显示,20个山羊群体分为4个不同的支系。山西太行黑山羊群体的多态程度高,遗传多样性丰富,选育程度较低。研究结果可为山西太行黑山羊遗传资源保护、选育和开发利用提供参考。 展开更多
关键词 山西太行黑山羊 D-LOOP区 遗传多样性
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基于SNP标记的粳型香稻品种品质性状差异及遗传多样性分析 认领
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作者 赵一洲 倪善君 +5 位作者 张战 李鑫 毛艇 张丽丽 刘研 刘福才 《辽宁农业科学》 2020年第1期1-6,共6页
对29份粳型香稻品种品质性状及遗传多样性进行分析,旨在了解供试材料品质特性及亲缘结构。结果表明,12个品质性状的变异系数在2.5%~160.5%之间,垩白粒率、垩白度的变异系数分别为142.1%、160.5%。根据SNP标记计算的品种间遗传相似系数在... 对29份粳型香稻品种品质性状及遗传多样性进行分析,旨在了解供试材料品质特性及亲缘结构。结果表明,12个品质性状的变异系数在2.5%~160.5%之间,垩白粒率、垩白度的变异系数分别为142.1%、160.5%。根据SNP标记计算的品种间遗传相似系数在0.456~0.998之间,平均值为0.675。供试材料在品质性状上分为3个差异明显的类群,在亲缘结构上形成亲缘关系不同的4个类群。本研究为香稻品种种质资源研究及品质性状改良提供依据。 展开更多
关键词 香稻 品质性状 遗传多样性 SNP标记
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基于ISSR标记的洋紫荆种质资源亲缘关系分析 认领
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作者 陈勇 唐昌亮 +3 位作者 李浩 钱磊 罗树凯 周修任 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第1期26-31,共6页
【目的】分析所收集洋紫荆(Bauhinia variegata)种质资源亲缘关系和遗传多样性。【方法】通过ISSR-PCR方法,对15个不同来源和特征的洋紫荆个体间亲缘关系和遗传多样性进行研究。【结果】ISSR实验共得到150个清晰位点,其中145位点具有多... 【目的】分析所收集洋紫荆(Bauhinia variegata)种质资源亲缘关系和遗传多样性。【方法】通过ISSR-PCR方法,对15个不同来源和特征的洋紫荆个体间亲缘关系和遗传多样性进行研究。【结果】ISSR实验共得到150个清晰位点,其中145位点具有多态性,总的多态性比率为96.67%,其中8条引物的扩增产物多态位点比率达到100%;洋紫荆材料的平均等位基因(Na)为1.9667±0.1801、平均有效等位基因数(Ne)为1.6847±0.2934、平均Shannon信息指数(I)为0.5611±0.1639;亲缘关系分析表明,相同花色、相似开花量或相同来源地的不同个体间亲缘关系有时不显著。【结论】所收集洋紫荆资源形态特征具有丰富的遗传来源,亲缘关系复杂;同时,由于异地洋紫荆商品种苗活跃的流通导致不同来源种质资源亲缘关系复杂,种质资源高度杂合,育种过程亲本性状的纯化需较长周期。 展开更多
关键词 洋紫荆种质资源 ISSR-PCR 亲缘关系 遗传多样性
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不同品种牡丹ISSR遗传多样性分析 认领
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作者 李勇慧 于相丽 +2 位作者 马会萍 高凯 刘名雪 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期78-83,共6页
旨在为牡丹的合理利用及其资源管理奠定基础。对洛阳地区35个品种的牡丹进行遗传多样性分析。利用改良的CTAB法和ISSR-PCR来提取DNA以及进行DNA扩增,从UBC公布的220条ISSR引物中最后筛选出了12条扩增条带清晰的引物。筛选后总共获得了13... 旨在为牡丹的合理利用及其资源管理奠定基础。对洛阳地区35个品种的牡丹进行遗传多样性分析。利用改良的CTAB法和ISSR-PCR来提取DNA以及进行DNA扩增,从UBC公布的220条ISSR引物中最后筛选出了12条扩增条带清晰的引物。筛选后总共获得了130条清晰的扩增条带,多态性条带的占比为96.1%。统计条带之后,使用popgene32分析得出35种牡丹的平均Shannon信息指数H=0.465 9,平均Nei’s基因多样性指数He=0.294 5,说明35个牡丹品种遗传多样性丰富。利用NTSYSpc-2.10e分析软件进行聚类分析后,将洛阳的35个牡丹品种分为5大类。实验中的35种牡丹在进行分类时并不一定按照花色进行分类,只有在亲缘关系较近时才会聚在一起。 展开更多
关键词 牡丹 改良的CTAB法 PCR扩增 ISSR 遗传多样性
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琴叶风吹楠资源遗传多样性的AFLP分析 认领
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作者 毛常丽 张凤良 +4 位作者 李小琴 杨湉 赵祺 胡永华 吴裕 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期271-276,共6页
为研究濒危植物琴叶风吹楠(Horsfieldia pandurifolia)的遗传多样性,利用AFLP分子标记技术,对采自云南省西双版纳州、临沧市的8个居群共56份琴叶风吹楠样品进行了分析。结果表明,琴叶风吹楠在物种水平的多态性较高,多态性百分率为75.16%... 为研究濒危植物琴叶风吹楠(Horsfieldia pandurifolia)的遗传多样性,利用AFLP分子标记技术,对采自云南省西双版纳州、临沧市的8个居群共56份琴叶风吹楠样品进行了分析。结果表明,琴叶风吹楠在物种水平的多态性较高,多态性百分率为75.16%;在居群水平,平均多态性百分率为36.20%;AMOVA分析表明,琴叶风吹楠的遗传变异主要存在于居群内(75.45%),而居群间的变异仅为24.55%;mantel检验结果表明,地理距离和遗传距离存在不显著的正相关(r=0.1197,P=0.3210);基于遗传相似性系数,对8个居群进行了UPGMA聚类分析,在遗传相似性系数0.951处可将8个居群聚为3组。这些为琴叶风吹楠的保护和开发利用提供了理论依据,并提出了保护建议。 展开更多
关键词 琴叶风吹楠 种质资源 AFLP分子标记 遗传多样性
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