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闽西地区猪流行性腹泻病毒FJLY1703株基因特征及遗传进化分析 认领 被引量:1
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作者 董波 傅云扉 +2 位作者 戴爱玲 李晓华 杨小燕 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期336-340,共5页
为阐明闽西地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传进化和重组事件。本研究从福建龙岩感染PEDV仔猪送检样品中鉴定出1株PEDV(闽西FILY1703株),采用PCR方法扩增其N、E、M以及S基因序列并测序。N、E、M以及S基因同源性及进化分析显示,FJLY1703... 为阐明闽西地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传进化和重组事件。本研究从福建龙岩感染PEDV仔猪送检样品中鉴定出1株PEDV(闽西FILY1703株),采用PCR方法扩增其N、E、M以及S基因序列并测序。N、E、M以及S基因同源性及进化分析显示,FJLY1703株与CV777等早期经典株同源性较低且亲缘关系较远,而与2010年后国内分离株的同源性较高且进化关系较近。S基因编码的氨基酸序列与疫苗株CV777 S蛋白的氨基酸序列相比,FJLY1703株S蛋白抗原表位COE中存在8个突变,这些变化与2010年后中国PEDV分离株相似;且FJLY1703株E、M以及N基因编码的氨基酸序列中分别存在1个、3个和12个突变位点,均与我国当前流行株突变位点相似。S基因的重组分析表明,FJLY1703株是一株以CV777株为代表的早期经典株与2010年后PEDV变异株的重组流行株,上述研究结果提示在闽西地区需要研制针对PEDV流行株的疫苗来控制PEDV的感染。本研究为闽西地区PEDV流行病学研究提供参考依据。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 S基因 E基因 M基因 N基因 遗传进化分析 序列分析 重组分析
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3株猪博卡病毒的全基因遗传进化及重组分析 认领
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作者 覃绍敏 王浩 +6 位作者 刘金凤 莫模双 秦树英 陈凤莲 马玲 白安斌 吴健敏 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1247-1255,共9页
【目的】了解猪博卡病毒(Porcine bocavirus,PBoV)在广西猪群中的流行状况及遗传学特征,为有效防控PBoV感染提供科学依据。【方法】采用PCR对采自广西境内养殖场的388份猪源样品进行PBoV检测,挑选3份阳性样品(1份为PBoVG1阳性样品,2份为... 【目的】了解猪博卡病毒(Porcine bocavirus,PBoV)在广西猪群中的流行状况及遗传学特征,为有效防控PBoV感染提供科学依据。【方法】采用PCR对采自广西境内养殖场的388份猪源样品进行PBoV检测,挑选3份阳性样品(1份为PBoVG1阳性样品,2份为PBoVG3阳性样品)进行全基因扩增,测序获得的序列使用LaserGene进行处理及多重比对分析,应用MEGA 5.2中的ClustalW进行遗传进化分析,通过邻接法(NJ)构建系统发育进化树,并以SimPlot 3.5.1进行潜在基因重组事件分析。【结果】猪内脏组织(肺脏、脾脏和淋巴结的混合样品)、扁桃体、脑组织和公猪精液的PBoV阳性率分别为25.19%、8.33%、2.94%和1.54%。在所有检测样品中,PBoVG3基因群的阳性率最高,为9.02%,PBoVG2和PBoVG1基因群的阳性率均为1.55%;不同基因群的PBoV存在混合感染现象,其中,PBoVG1+PBoVG3二重感染率为1.03%,PBoVG2+PBoVG3二重感染率为0.77%。从PBoV阳性样品中扩增获得3条PBoV全基因序列(毒株),命名为GXBH2014、GXBH2015和GXLC2014,对应的GenBanK登录号为MN747332、MN747333和MN747339。其中,GXBH2014株序列全长5055 bp,GXBH2015株序列全长5070 bp,GXLC2014株序列全长4313 bp。GXBH2014株和GXBH2015株与PBoVG3基因群参考毒株SH20F各编码基因的推导氨基酸序列同源性较高,为70.9%~98.5%;GXLC2014株与PBoVG1基因群参考毒株SX各编码基因的推导氨基酸序列同源性最高,为98.0%~99.1%。基于PBoV全基因编码区(CDS)全长序列构建的系统发育进化树也显示,GXBH2014株和GXBH2015株同处于PBoVG3基因群分支上,GXLC2014株处于PBoVG1基因群分支上。基因重组分析结果显示,在GXBH2014株的全基因序列中检测到1个潜在的重组断点,位于NP1基因的第391位核苷酸;而在GXBH2015株和GXLC2014株的全基因序列中均未检测到潜在的重组断点。【结论】广西猪群中普遍存在PBoV感染,且PBoVG1、PBoVG2和PBoVG3基因群毒株同时存在。其中,GXBH2014株可能是 展开更多
关键词 猪博卡病毒 全基因组 遗传进化分析 基因重组分析
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新疆部分地区牛病毒性腹泻的流行病学调查 认领
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作者 魏其 屈勇刚 +7 位作者 常军帅 谷思颖 吴圆圆 于会举 李静 张家瑞 肖陈城 李岩 《畜牧与兽医》 北大核心 2020年第12期105-109,共5页
为调查新疆部分地区规模化牛养殖场牛病毒(BVDV)性腹泻病毒的感染情况,本试验采用RT-PCR方法对640份牛全血进行牛病毒性腹泻病毒检测,并对检测基因序列进行分析及同源性比较。结果表明:各地区牛养殖场BVDV阳性检出率为22.5%~62.5%,平均... 为调查新疆部分地区规模化牛养殖场牛病毒(BVDV)性腹泻病毒的感染情况,本试验采用RT-PCR方法对640份牛全血进行牛病毒性腹泻病毒检测,并对检测基因序列进行分析及同源性比较。结果表明:各地区牛养殖场BVDV阳性检出率为22.5%~62.5%,平均总阳性率为40.0%(256/640),不同年龄段牛群感染BVDV的平均阳性率为22.5%(27/120)。将目的片段克隆至T载体,经测序获得5株BVDV部分基因序列,与预期的大小一致为288 bp。根据同源性分析表明,本研究的5株克隆毒株序列之间的同源性为98.3%~99.7%。遗传演化分析可知,本研究获得的毒株在同一簇,与中国北京株BVDV1a亚型归为同一簇,亲缘关系比较接近,但与BVDV2型、BVDV3型的遗传关系较远。研究结果表明,新疆地区BVDV普遍存在,经测序核苷酸序列之间的同源性较高,遗传关系较接近,该结果为新疆地区牛病毒性腹泻病毒病的防控工作奠定基础。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 新疆 RT-PCR 克隆 同源性分析 遗传进化分析
2013-2018年广西地区猪伪狂犬病病毒gB、gE与TK基因遗传变异分析 认领 被引量:1
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作者 赵硕 王若木 +7 位作者 党佳佳 许力士 秦树英 薛辉 韦祖樟 陈樱 欧阳康 黄伟坚 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期810-819,共10页
为了解广西近年猪伪狂犬病(PR)流行情况及猪伪狂犬病病毒(PRV)流行株gB、gE、TK基因的遗传变异特点,于2013-2018年采集广西各地区疑似PR发病猪靶组织714份,进行PRV的PCR检测及病毒分离鉴定,并运用DNAStar、MEGA 6.0等生物学软件对分离毒... 为了解广西近年猪伪狂犬病(PR)流行情况及猪伪狂犬病病毒(PRV)流行株gB、gE、TK基因的遗传变异特点,于2013-2018年采集广西各地区疑似PR发病猪靶组织714份,进行PRV的PCR检测及病毒分离鉴定,并运用DNAStar、MEGA 6.0等生物学软件对分离毒株gB、gE、TK基因进行遗传变异分析。结果显示:样品检测阳性率为24.5%(175/714),共分离获得PRV流行株38株。受检猪群普遍存在PRV感染,经典毒株及变异毒株并存,而且以变异毒株为主。广西流行株不同亚群PRV在gB、gE、TK基因上均存在相同的氨基酸变异特点,与国内变异株亲缘关系较近。推测广西流行株存在两种不同重组变异形式产生的PRV重组毒株,分别为疫苗株gB基因和变异株gE基因重组产生的重组毒株,以及经典株的TK基因被疫苗株(HB98)的TK基因替换而产生的重组毒株。近年广西受检猪场较普遍存在PRV感染,而且PRV流行株以变异毒株为主,可能存在两种不同重组变异形式产生的重组毒株,猪场需重视及实施针对性PR免疫防控计划。 展开更多
关键词 猪伪狂犬病病毒(PRV) GB基因 GE基因 TK基因 序列分析 遗传变异
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猫白血病病毒的检测及pol基因遗传进化分析 认领
5
作者 刘雪娇 崔燕蕾 +4 位作者 李子荷 柳婷婷 杨海燕 单虎 张传美 《动物医学进展》 北大核心 2020年第7期34-37,共4页
为调查猫白血病病毒(FeLV)在青岛地区的流行情况,对2018年—2019年在青岛地区动物医院采集的25份临床疑似患有猫白血病的病料进行FeLV的RT-PCR检测,并对阳性样品的PCR产物进行了测序和遗传进化分析。结果表明,25份样品中14份检测为FeLV... 为调查猫白血病病毒(FeLV)在青岛地区的流行情况,对2018年—2019年在青岛地区动物医院采集的25份临床疑似患有猫白血病的病料进行FeLV的RT-PCR检测,并对阳性样品的PCR产物进行了测序和遗传进化分析。结果表明,25份样品中14份检测为FeLV阳性,检出率为56%,检出率较高。同源性分析表明,除4株毒株同源性为100%外,其余各毒株间同源性差异较大,在85.5%~99.6%之间,各毒株间发生了一定变异。遗传进化分析表明,13株毒株独自形成一个分支,与来自中国台湾的FeLV-TWK30毒株遗传进化关系较远。可见猫白血病病毒在青岛地区的感染已较为严重,加强监测及防疫已经刻不容缓。 展开更多
关键词 猫白血病病毒 检测 遗传进化分析
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猪圆环病毒3型河北株全基因组序列特征和遗传进化分析 认领
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作者 王承玉 李杰峰 +3 位作者 赵志强 段宝宁 杨威 马玉忠 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期35-44,共10页
【目的】扩增猪圆环病毒3型(PCV3)全基因组序列,对其进行序列特征及遗传进化分析.【方法】以PCV3阳性样品为模板,利用两对引物扩增全基因组片段并测序,通过DNA Star和MEGA-X软件进行遗传进化分析.【结果】发现1株新PCV3毒株(GenBank登录... 【目的】扩增猪圆环病毒3型(PCV3)全基因组序列,对其进行序列特征及遗传进化分析.【方法】以PCV3阳性样品为模板,利用两对引物扩增全基因组片段并测序,通过DNA Star和MEGA-X软件进行遗传进化分析.【结果】发现1株新PCV3毒株(GenBank登录号:MK105924),PCV3 Cap蛋白为3b亚型,与河北省9株PCV3 Cap蛋白的同源性在97.8%~99.8%;所获得的PCV3与PCV1和PCV2全基因组序列的同源性均小于50%,遗传进化树分析3种PCV处于不同的分支,表明其属于不同的基因型;与国内外其他43株PCV3全基因组序列的同源性在98.7%~99.3%,其中与俄罗斯PCV3毒株(GenBank登录号:MG679916)的同源性最高,为99.3%,表明不同PCV3毒株之间的全基因组序列的同源性很高,尚未发现明显的变异;与GenBank上已发表的全部国内外174株PCV3的全基因组序列进行遗传进化树分析,发现全球PCV3及其亚型的分布有地域的差异.【结论】获得1株新PCV3毒株,其与PCV1、PCV2属于不同的基因型;不同PCV3毒株之间存在着较高的同源性;全球PCV3及其亚型的分布与地域有一定的关系. 展开更多
关键词 PCV3 全基因组 序列特征 遗传进化分析
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广东省茂名市2017-2018年空肠弯曲菌食品分离株病原特征 认领
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作者 陈伟冰 李柏生 +3 位作者 李振翠 宋曼丹 邱福明 吴常红 《中国热带医学》 CAS 2020年第5期452-455,共4页
目的采集2017-2018年茂名市禽类和畜类食品(仅宰杀切割),了解空肠弯曲菌携带率,分析其病原学特征。方法对茂名市禽类和畜类食品(仅宰杀切割)监测过程中分离的空肠弯曲菌进行了抗生素敏感性检测、耐药基因检测和全基因组测序,并基于全基... 目的采集2017-2018年茂名市禽类和畜类食品(仅宰杀切割),了解空肠弯曲菌携带率,分析其病原学特征。方法对茂名市禽类和畜类食品(仅宰杀切割)监测过程中分离的空肠弯曲菌进行了抗生素敏感性检测、耐药基因检测和全基因组测序,并基于全基因测序进行遗传进化分析。结果2017-2018年共检出空肠弯曲菌食品分离株14株,对链霉素、环丙沙星、克林霉素、萘啶酸、阿奇霉素、强力霉素、四环素等抗生素高度耐药,携带着多种耐药基因;基于全基因组的遗传进化分析显示,茂名市检出的12株空肠弯曲菌分离株处在不同进化分支上,显示出多样遗传性。结论在茂名地区,家禽和畜牧类食品的空肠弯曲菌感染率很高,具有多种抗药性,对畜牧农场和饲料中这种细菌抗药性的监测需要加强,以便为有效防治空肠弯曲菌引起的相关疾病提供参考。 展开更多
关键词 空肠弯曲菌 抗生素敏感试验 耐药基因 遗传进化分析
2018—2019年广东省猪流行性腹泻病毒S1、M和ORF3基因遗传进化分析 认领
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作者 范兰兰 于林洋 +8 位作者 班艳芳 董建国 张驰 王爽云 刘献辉 梁太润 张乐宜 刘燕玲 宋长绪 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第17期18-25,共8页
为了了解2018—2019年广东省猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)的遗传变异情况,试验采用RT-PCR方法对采集到的69份样品进行PEDV抗原检测,并对部分阳性样品的S1、M和ORF3基因进行测序,再利用分子生物学软件对测... 为了了解2018—2019年广东省猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)的遗传变异情况,试验采用RT-PCR方法对采集到的69份样品进行PEDV抗原检测,并对部分阳性样品的S1、M和ORF3基因进行测序,再利用分子生物学软件对测序结果与NCBI中的参考毒株进行遗传进化树的构建、同源性分析及氨基酸序列比对。结果表明:经RT-PCR检测有38份样品为PEDV阳性,阳性率为55%,阳性率较高。在PEDV S1基因遗传进化分析中,检测毒株均位于G2分支,与VN-VAP1113核苷酸序列同源性较高,为96.0%~97.6%;主要有3个氨基酸缺失、5个氨基酸插入及多个氨基酸突变。在PEDV M基因遗传进化分析中,GDxh毒株位于G1-2分支,与DR13核苷酸序列同源性较高,为98.3%;GDhz-1毒株位于G2-1分支,与VN-VAP1113核苷酸序列同源性较高,为98.3%;其他12株毒株位于G2-2分支,与OH851核苷酸序列同源性较高,为97.4%~99.1%;主要有5个氨基酸突变和1个氨基酸插入。在PEDV ORF3基因遗传进化分析中,GDxh毒株与DR13核苷酸序列同源性为91.6%,主要有4个氨基酸突变和一段氨基酸缺失;其他检测毒株均位于G2分支,其中7株毒株与OH851核苷酸序列同源性为90.2%~92.0%,主要有5个氨基酸突变;另外5株毒株与VN-VAP1113核苷酸序列同源性均为87.6%,主要有11个氨基酸突变。说明2018—2019年广东省PEDV流行毒株主要为G1型和G2型,流行情况复杂,其S1和ORF3基因对应的氨基酸序列容易发生突变、插入或缺失,给该地区猪流行性腹泻的防治工作带来较大挑战。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒(PEDV) 流行性 肠道 抗原检测 S1、M和ORF3基因 测序 遗传进化分析
猫杯状病毒GX2019的分离鉴定及全基因克隆遗传进化分析 认领 被引量:1
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作者 王浩 秦树英 +3 位作者 刘金凤 白安斌 覃绍敏 吴健敏 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期880-885,共6页
从南宁某宠物医院疑似感染猫杯状病毒(Feline calicivirus,FCV)猫鼻咽拭子中,利用F81细胞分离1株FCV后,RT-PCR和电镜鉴定,测定TCID50和理化性质。同时利用RT-PCR分段扩增病毒全基因序列,进行同源性及遗传进化分析。结果显示,FCV GX2019... 从南宁某宠物医院疑似感染猫杯状病毒(Feline calicivirus,FCV)猫鼻咽拭子中,利用F81细胞分离1株FCV后,RT-PCR和电镜鉴定,测定TCID50和理化性质。同时利用RT-PCR分段扩增病毒全基因序列,进行同源性及遗传进化分析。结果显示,FCV GX2019分离株的TCID50为1×10-8.67/0.1 mL,基因组全长为7687 bp,与FCV CH-JL4(长春株)毒株核苷酸序列相似性最高,为85.3%,属于同一分支。氨基酸分析表明,与国内FCV疫苗株255、国外FCV疫苗株F9、FCV跛行综合征株2280及FCV GX01分离株氨基酸变异率分别为46.7%、26.7%、53.3%、40.0%,其中B细胞抗原识别表位中氨基酸位点发生了改变。 展开更多
关键词 猫杯状病毒 分离鉴定 全基因克隆 遗传进化分析
一株多重配H13N8亚型禽流感病毒分子进化以及对鸡致病性研究 认领
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作者 李玉磊 李明慧 +3 位作者 田井满 刘丽娜 李雁冰 陈化兰 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期217-222,共6页
2018年对宁夏回族自治区沙湖自然保护区进行禽流感病毒(AIV)流行病学调查中,本研究室分离到一株H13N8亚型AIV。为了解这株H13N8亚型AIV生物学特性,本研究对其全基因组进行了测序及遗传演化分析。结果显示,该病毒HA和NA基因分别来自H13N6... 2018年对宁夏回族自治区沙湖自然保护区进行禽流感病毒(AIV)流行病学调查中,本研究室分离到一株H13N8亚型AIV。为了解这株H13N8亚型AIV生物学特性,本研究对其全基因组进行了测序及遗传演化分析。结果显示,该病毒HA和NA基因分别来自H13N6和H3N8亚型AIV,内部基因来源于H13N8、H6N2、H13N6、H13N2亚型AIV,是一株多亚型重组AIV,其HA蛋白碱性裂解位点氨基酸序列为ISNR↓GLF,为低致病AIV分子标志。关键氨基酸位点分析显示,其M1蛋白具有N30D和T215A的突变,NS1蛋白具有P42S、L98F和I101M的突变,表明其具有增强对哺乳动物致病性的潜在能力。SPF鸡的感染性试验显示,鸡感染该病毒后不能通过喉头或泄殖腔排毒,在感染鸡各脏器均不能有效复制,其感染鸡的潜在风险较小。本研究对禽流感的综合防控具有一定的指导意义。 展开更多
关键词 禽流感病毒 H13N8亚型 遗传演化分析
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猪伪狂犬病毒流行株的分离鉴定及其毒力试验 认领
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作者 骆辉 王雪涛 +4 位作者 廖果 谢伟 罗旭 阴文奇 周远成 《四川畜牧兽医》 2020年第2期34-37,40共5页
本研究采集了猪伪狂犬病阳性样品,通过PK-15细胞对PRV流行毒株进行了分离培养、纯净性检验、中和试验鉴定、遗传进化分析和仔猪毒力试验,对我国当前流行的猪伪狂犬病毒的遗传变异与毒力变化情况进行了分析。通过病毒分离鉴定共获得6株... 本研究采集了猪伪狂犬病阳性样品,通过PK-15细胞对PRV流行毒株进行了分离培养、纯净性检验、中和试验鉴定、遗传进化分析和仔猪毒力试验,对我国当前流行的猪伪狂犬病毒的遗传变异与毒力变化情况进行了分析。通过病毒分离鉴定共获得6株猪伪狂犬病毒,其中SCY1株、HBA1株、JXN1株存在支原体或PCV2污染,SCHS株、SCM1株、JXHS株无外源污染,并能被猪伪狂犬病毒特异性血清中和。6个分离毒株的gB基因片段与JS-2012株的同源性为99.7%~100%,与Bartha K61株的同源性约为95%;gC基因片段与JS-2012株的同源性为99.5%~100%,与Bartha K61株的同源性为90.7%~91.2%;gD基因与JS-2012株的同源性为99.8%~100%,与Bartha K61株的同源性在98.7%~98.9%之间;gE基因与JS-2012株的同源性在99.1%~99.8%之间。用3株纯净毒株感染8~9周龄PRV抗体阴性仔猪后全部出现体温升高,部分试验猪出现呼吸道症状并死亡。试验结果表明,本次分离的猪伪狂犬病毒与我国当前流行毒株的遗传关系接近,但不同毒株的毒力存在一定差异。 展开更多
关键词 猪伪狂犬病毒 分离鉴定 遗传进化分析 毒力试验
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水貂杯状病毒SD1株的分离鉴定及序列分析 认领
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作者 黄佳培 康洪涛 +5 位作者 刘晓晓 刘永相 张继凯 李志杰 田进 曲连东 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期2127-2133,共7页
为分析水貂杯状病毒中国分离株的遗传特征,本研究于2018年在山东地区某水貂养殖场内感染圆环病毒死亡的水貂中分离到1株水貂杯状病毒(mink calicivirus,MCV),命名为SD1株,本研究对其进行了PCR鉴定、电镜观察和遗传演化分析。结果显示,SD... 为分析水貂杯状病毒中国分离株的遗传特征,本研究于2018年在山东地区某水貂养殖场内感染圆环病毒死亡的水貂中分离到1株水貂杯状病毒(mink calicivirus,MCV),命名为SD1株,本研究对其进行了PCR鉴定、电镜观察和遗传演化分析。结果显示,SD1株可在MDCK细胞上产生明显细胞病变。电镜观察可见病毒粒子表面成楔形杯状样凹陷,无囊膜,具有杯状病毒的形态特征。遗传演化分析显示,SD1株与2007年国内2株MCV的同源性分别为92.0%和91.2%,为水疮性病毒属新成员;RdRp基因编码的氨基酸序列比对分析显示其相对保守,蛋白变异不大,而vp1基因推导的氨基酸序列比对分析显示其变异较大,与国内分离株(MF677852)相比存在47处替换,该变异是否会引起病毒致病力的改变有待进一步解析。本研究为MCV流行株病原学研究提供参考,同时提示需重视MCV在水貂病毒感染中的作用。 展开更多
关键词 水貂杯状病毒 分离 鉴定 遗传演化分析
新疆乌苏天山山地南坡草原革蜱中立克次体感染调查及遗传进化分析 认领
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作者 孙素荣 王思远 +6 位作者 史深 张渝疆 张敬媛 袁逸伦 杨小飞 张媛 丁焱辉 《新疆大学学报:自然科学版》 CAS 2020年第2期190-196,共7页
了解新疆乌苏地区草原革蜱中立克次体的感染情况.采集新疆乌苏天山山地南坡的草原革蜱,通过PCR对蜱中斑点热群立克次体、贝氏柯克斯体、埃立克体、伯氏疏螺旋体、查菲埃立克体、无形体、嗜吞噬细胞无形体、牛巴贝斯虫、巴贝西原虫、利... 了解新疆乌苏地区草原革蜱中立克次体的感染情况.采集新疆乌苏天山山地南坡的草原革蜱,通过PCR对蜱中斑点热群立克次体、贝氏柯克斯体、埃立克体、伯氏疏螺旋体、查菲埃立克体、无形体、嗜吞噬细胞无形体、牛巴贝斯虫、巴贝西原虫、利什曼原虫、恙虫立克次氏体等11种病原体进行DNA分子检测,对检出的阳性样本进行测序,并与GenBank (NCBI)中的相应基因序列进行比对分析.106只草原革蜱中斑点热群立克次体、贝氏柯克斯体、埃立克体检测结果为阳性,阳性率分别为57.23%(99/173)、37.50%(30/80)和37.74%(20/53),其余8种病原体检测结果均为阴性;对斑点热群立克次体进行序列分析,建立分子系统进化树,结果显示Guertu-Dn1801 OmpA与吉林两株M198 (MF511260.1)和M30 (MF511254.1)同源性最高,一致性均为96.90%,属劳氏立克次体;Guertu-Dn1803OmpA与俄罗斯Gorno-Altaisk-2014-H-2株(KT006594.1)和苏联246株(U43807.1)同源性最高,一致性均为94.40%,属西伯利亚立克次体;而Guertu-Dn1801 gltA和Guertu-Dn1809 gltA分别与黑龙江3LB01 (KM245567.1)和内蒙古MD0202 (KP742992.1)序列一致性均为100%,属劳氏立克次体.乌苏地区可能存在斑点热群立克次体、贝氏柯克斯体、埃立克体3种病原体的流行,且斑点热群立克次体感染率较高,应加强对当地蜱类和蜱传疾病的监测和防控. 展开更多
关键词 草原革蜱 蜱传病原体 立克次体 遗传进化分析
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猪圆环病毒2型Guizhou LZTQ/2017株全基因组序列分析 认领
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作者 张爱琼 梁海英 +6 位作者 曾智勇 王彬 徐国 咸文 何小莉 陈娟 吴好叶 《动物医学进展》 北大核心 2019年第7期14-19,共6页
为了解贵州省某新建猪场由猪圆环病毒2型(PCV2)和猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)引起的保育猪咳喘、腹泻死亡的病原中PCV2的基因型和变异情况,采用基因克隆技术,对其全基因进行克隆分析。结果显示,PCV2/Guizhou-LZTQ/2017株全长为1768bp... 为了解贵州省某新建猪场由猪圆环病毒2型(PCV2)和猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)引起的保育猪咳喘、腹泻死亡的病原中PCV2的基因型和变异情况,采用基因克隆技术,对其全基因进行克隆分析。结果显示,PCV2/Guizhou-LZTQ/2017株全长为1768bp,属PCV2a型,与国内外毒株碱基之间存在多处差异;其ORF2基因编码的Cap蛋白氨基酸与常用疫苗毒株之间同源性在92.2%~93.7%之间,与省内已经报道的PCV2毒株ORF2之间的氨基酸同源性在90.2%~92.7%之间,与4株疫苗株指数差异性较大;全基因遗传进化分析,其与Guangdong株和GZ-CS12012株属同一细分支,亲缘关系最近。研究结果可为后续PCV2分子生物学研究、流行病学调查及疫苗的选用提供基础数据。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 基因型 抗原指数 同源性分析 遗传进化分析
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羊口疮病毒大足株的分离鉴定 认领
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作者 李鹏飞 张友 +5 位作者 鲜思美 李婷 包细明 张益 饶体宇 吴伯梅 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第12期3725-3732,共8页
本研究旨在了解重庆地区羊口疮病毒(orf virus,ORFV)流行情况。从重庆大足等地区羊场采集18份临床疑似羊口疮病料,提取病料DNA,经PCR鉴定为ORFV阳性;将阳性病料做常规处理,接种羔羊睾丸细胞(LT),并盲传至5代,观察接毒LT细胞病变,将F5代... 本研究旨在了解重庆地区羊口疮病毒(orf virus,ORFV)流行情况。从重庆大足等地区羊场采集18份临床疑似羊口疮病料,提取病料DNA,经PCR鉴定为ORFV阳性;将阳性病料做常规处理,接种羔羊睾丸细胞(LT),并盲传至5代,观察接毒LT细胞病变,将F5代细胞培养物进行间接免疫荧光试验(IFA)、PCR扩增、测序、同源性比对、遗传进化分析和TCID 50测定。结果显示,经PCR检测,18份疑似羊口疮病料ORFV核酸阳性率为61.1%(11/18);大足株病料接种LT细胞36 h后,长梭型细胞变圆、融合、呈拉网状、皱缩,72 h后大部分细胞脱落;间接免疫荧光试验在显微镜下观察到细胞浆中出现特异性绿色荧光,且荧光绕核分布;F1至F5代细胞培养物经PCR扩增出特异性目的条带,大小为1137 bp;将测序结果与GenBank中19株ORFV B2L基因进行同源性比对,其核苷酸同源性在97.9%~100%之间,与美国SA00分离株同源性达100%,且遗传进化分析显示处于同一进化分支,亲缘关系较近;测定F5代细胞培养物TCID 50值为10-5.68/0.1 mL,在细胞中能稳定增殖。综上所述,本研究成功分离并获得1株ORFV,为后续ORFV研究提供了生物材料,同时为防控重庆地区的羊口疮奠定基础。 展开更多
关键词 羊口疮病毒(ORFV) 分离鉴定 遗传进化分析
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2017年广东省H1N1亚型SIV复制及感染能力的研究 认领
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作者 冯亚玲 孙海亮 +7 位作者 刘杨 于亚南 林嘉特 吴梅花 李硕 张文轩 叶小苌 廖明 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期887-894,共8页
为了解2017年广东省H1N1亚型猪流感病毒基因型特征、体外复制能力和体内感染能力,挑选以A/swine/Guangdong/S182/2017(H1N1)为代表的4株病毒进行遗传演化分析、细胞生长曲线测定和动物感染试验。病毒遗传演化结果表明,4株病毒均属于欧... 为了解2017年广东省H1N1亚型猪流感病毒基因型特征、体外复制能力和体内感染能力,挑选以A/swine/Guangdong/S182/2017(H1N1)为代表的4株病毒进行遗传演化分析、细胞生长曲线测定和动物感染试验。病毒遗传演化结果表明,4株病毒均属于欧亚类禽分支,其内部基因为来自其他不同分支基因片段的重组;病毒在细胞上的生长曲线结果显示,MDCK、PK15、ST和IPEC-1这4种细胞系都能被病毒感染,病毒在细胞上复制滴度范围分别为(2.50~8.50)lgTCID50/mL、(3.33~6.33)lgTCID50/mL、(4.50~6.50)lgTCID50/mL、(0.67~3.00)lgTCID50/mL;病毒动物感染试验结果表明,S182毒株能够引起感染组和同居组猪产生体外排毒、肺内病毒复制和血清抗体转阳,两组猪鼻洗液滴度范围分别为(1.70~2.37)lgTCID50/mL、(1.37~3.37)lgTCID50/mL,肺载毒量滴度范围分别为(1.37~2.37)lgTCID50/(g·mL^-1)、(1.37~2.20)lgTCID50/(g·mL^-1),抗体滴度范围分别为1∶10~1∶20、1∶10~1∶160。本研究结果将为H1N1亚型猪流感病毒的监测防控、公共卫生学安全、适用于分离猪流感病毒猪源细胞的遴选以及近年主要流行H1N1猪流感病毒对猪的致病能力的研究提供理论依据和数据支持。 展开更多
关键词 H1N1亚型 猪流感病毒 遗传演化分析 病毒生长曲线 致病性
1株西藏H5N1亚型禽流感病毒HA和NA基因的遗传进化分析 认领
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作者 格桑卓玛 周赛赛 +5 位作者 任晨玮 王彪雄 钱雯娴 李天娇 朱家平 索朗斯珠 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2019年第9期16-20,25共6页
分析1株西藏H5N1亚型禽流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因的遗传进化特征。利用RT-PCR法对H5亚型抗原阳性流感病毒核酸检测,并分子克隆、核苷酸测序,再利用DNASTAR、MEGA7.0软件进行同源性分析和基因遗传进化分析。经基因遗传进... 分析1株西藏H5N1亚型禽流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因的遗传进化特征。利用RT-PCR法对H5亚型抗原阳性流感病毒核酸检测,并分子克隆、核苷酸测序,再利用DNASTAR、MEGA7.0软件进行同源性分析和基因遗传进化分析。经基因遗传进化分析表明,H5N1亚型禽流感病毒和2012年孟加拉国分离株亲缘关系最近,属于同一分支,HA蛋白裂解位点处有较多碱性氨基酸,从分子上表明西藏毒株H5N1是高致病性禽流感病毒。对西藏分离株H5N1亚型禽流感病毒HA和NA基因进行遗传进化分析,为西藏H5亚型禽流感病毒感染防控具有指导意义。 展开更多
关键词 H5N1亚型 禽流感病毒 HA基因 NA基因 遗传进化分析
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回顾性研究证明中国猪圆环病毒3型存在不同进化分支 认领
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作者 郭雨欣 姜海军 +3 位作者 王菁 侯磊 韦莉 刘爵 《当代畜牧》 2019年第5期28-32,共5页
为研究猪圆环病毒3型(PCV3)在我国的流行分布情况,以及对PCV3毒株的遗传进化进行分析,笔者利用PCR检测方法对2006年-2017年采集的猪组织和血清样本进行了PCV3检测,并进一步对全基因序列进行了扩增和测序,对基因序列和氨基酸序列进行比... 为研究猪圆环病毒3型(PCV3)在我国的流行分布情况,以及对PCV3毒株的遗传进化进行分析,笔者利用PCR检测方法对2006年-2017年采集的猪组织和血清样本进行了PCV3检测,并进一步对全基因序列进行了扩增和测序,对基因序列和氨基酸序列进行比对分析并绘制遗传进化树。结果表明,PCV3在我国各地区猪场广泛存在并传播,且近期分离到的PCV3毒株与早期的PCV3分离株有明显差异,证明了PCV3病毒在不断进化。该研究结果揭示了PCV3的进化趋势,并提示迫切需要对PCV3进行更为广泛的流行病学监测和致病性评估。 展开更多
关键词 猪圆环病毒3型 回顾性研究 遗传进化分析
辽宁地区猪常见传染病流行病学调查及遗传进化分析 认领
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作者 关淼 顾贵波 +4 位作者 杨本勇 赵培 闫明 刘耀川 魏萍 《山东农业大学学报:自然科学版》 北大核心 2019年第2期308-314,共7页
为研究猪瘟(Classical Swine Fever,CSF)、猪伪狂犬(Porcine pseudorabies,PR)、猪圆环病毒病(Porcine circovirusvirus disease,PCVD)、高致病性猪繁殖与呼吸综合征(Highly pathogenic-Porcine reproductive and respiratory syndrome,... 为研究猪瘟(Classical Swine Fever,CSF)、猪伪狂犬(Porcine pseudorabies,PR)、猪圆环病毒病(Porcine circovirusvirus disease,PCVD)、高致病性猪繁殖与呼吸综合征(Highly pathogenic-Porcine reproductive and respiratory syndrome,HP-PRRS)在辽宁省内的发病情况及致病毒株变异情况,本研究对辽宁地区自2012年至2016年五年内4种猪常见流行病进行流行病学调查,并对扩增阳性样品的主要致病基因进行遗传进化分析。在9600份样品中,CSFV(ClassicalSwine Fever virus)阳性18例、PRV阳性12例、PCV2阳性10例、HP-PRRSV阳性5例。选取CSFV代表毒株命名为LN01,LN02,LN03;PRV代表毒株LN04,LN05;PCV代表毒株LN06,LN07;HP-PRRSV代表毒株LN08,分别对其进行遗传进化分析。结果表明,CSFV代表株中,LN01与LN02的同源性较高,二者与GD株亲缘关系最近,同源性为99%以上;LN03株与HD株同源性较高为99.5%;PRV代表株中LN04与PV株的亲缘关系最近,同源率为99.4%;LN05与PD株亲缘关系最近,同源率为98.5%;PCV2代表株中LN06与GD株的亲缘关系最近,同源率为99.5%,与HQ 395021亲缘关系最远,同源率为88.4%,LN07与BF株的亲缘关系最近,同源率99.1%;HP-PRRSV代表毒株LN08与参考株GD-SS株的亲缘关系最近,同源率为99.8%。 展开更多
关键词 CSF PR PCVD HP-PRRS 流行病学调查 遗传进化分析
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2014-2017年中国部分地区PEDV流行株S基因遗传进化分析 认领
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作者 郑慧华 张鸿鑫 +3 位作者 韩昊莹 乔涵 赵宇 陈红英 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2019年第2期249-255,共7页
参考GenBank中PEDV经典CV777毒株基因组序列设计特异性引物,采用RT-PCR方法对临床采集的疑似PEDV样品进行S基因扩增、克隆和测序,拼接获得30条完整S基因序列,并进行遗传进化及同源性分析。结果显示,获得的30条PEDV S基因与25个参考株S... 参考GenBank中PEDV经典CV777毒株基因组序列设计特异性引物,采用RT-PCR方法对临床采集的疑似PEDV样品进行S基因扩增、克隆和测序,拼接获得30条完整S基因序列,并进行遗传进化及同源性分析。结果显示,获得的30条PEDV S基因与25个参考株S基因的核苷酸相似性介于93.6%~99.8%;且各流行毒株与经典毒株比较,具有多处的点突变、插入和缺失。与其他参考株相比,S1区存在157个氨基酸突变位点,占总数的65.7%(157/239),暗示PEDV的S1区域比S2区域易发生变异;表明目前中国PEDV流行株已经发生了变异,在一定程度揭示了免疫猪群仍然发病的原因。 展开更多
关键词 PEDV S基因 遗传进化分析 变异
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