期刊文献+
共找到1,629篇文章
< 1 2 82 >
每页显示 20 50 100
中华绒螯蟹长江、黄河和辽河水系野生和养殖群体的遗传多样性 预览
1
作者 苏雨 张成 +3 位作者 李清清 郑海地 成永旭 吴旭干 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期436-444,共9页
中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)是中国最重要的淡水养殖蟹类,广泛分布于东亚地区,养殖区域主要集中在长江、黄河和辽河流域。本研究基于线粒体 DNA D-loop 区评估辽河野生群体(LW)和养殖群体(LC)、黄河野生群体(HW)和养殖群体(HC)及长... 中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)是中国最重要的淡水养殖蟹类,广泛分布于东亚地区,养殖区域主要集中在长江、黄河和辽河流域。本研究基于线粒体 DNA D-loop 区评估辽河野生群体(LW)和养殖群体(LC)、黄河野生群体(HW)和养殖群体(HC)及长江野生群体(YW)和养殖群体(YC)的遗传多样性和种群结构。结果显示:(1)用于本研究的 D-loop基因片段长度为 477 bp,共包含 234个变异位点和 131个简约信息位点, 6个群体的 262个个体中共有 110个单倍型,包括 90个独有单倍型和 20个共享单倍型;(2)6个种群的单倍型多样性指数(Hd)范围为 0.88889~0.96522,核苷酸多样性指数(π)范围为 0.00887~0.01602,养殖和野生群体遗传多样性水平依次为: HC>YC>LC 及HW>LW>YW;(3)6 个群体的遗传距离(Da)范围为 0.0119~0.0173,不论是养殖群体还是野生群体,辽河群体和长江群体之间的遗传距离均最小,且 6个群体间遗传分化指数 FST为 0.12938。对 6个群体进行中性检验显示 Tajima’s D和 Fu’s Fs的值均为负值。综上,基于线粒体 D-loop基因的研究结果表明,三水系养殖和野生群体均具有较高的遗传多样性,且辽河和长江水系中华绒螯蟹的亲缘关系相对较近,该研究为中华绒螯蟹的种质资源评估、保护和开发提供了参考。 展开更多
关键词 中华绒螯蟹 D-LOOP 地理种群 遗传多样性 遗传结构
在线阅读 下载PDF
基于线粒体细胞色素b的秋刀鱼种群遗传结构的研究 预览
2
作者 赵丽丽 朱清澄 花传祥 《海洋通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期312-318,共7页
秋刀鱼主要分布在西北太平洋亚热带到温带水域中,是一种资源量较高的上层洄游性鱼类。为了对秋刀鱼的遗传结构进行研究,2016年 6月-11月,在 38°38"-44°31"N,146°36"-162°26"E 海域随机取 145 ... 秋刀鱼主要分布在西北太平洋亚热带到温带水域中,是一种资源量较高的上层洄游性鱼类。为了对秋刀鱼的遗传结构进行研究,2016年 6月-11月,在 38°38"-44°31"N,146°36"-162°26"E 海域随机取 145 条秋刀鱼,取其肌肉与DNA、PCR以及测序后获得 421 bp 基于线粒体细胞色素 b (Cytb)基因的 DNA 序列。分析结果显示,145 条序列中共发现了 15 个单倍型,单倍型多样性指数 h = 0.258± 0.049,核苷酸多样性π= 0.000 87±0.007 56。计算得出 Tajima’s D 与 Fu’s Fs 均呈负值并且绘制的核苷酸不配对曲线呈现单峰,可得出秋刀鱼群体经历了种群扩张。Nm 值表明 4 个采样点的秋刀鱼群体之间存在频繁的基因交流,AMOVA 分析结果显示 97.22 %的遗传变异来自群体内,结合遗传分化系数 Fst 得出群体遗传分化水平较低。单倍型网络图呈现星状拓扑结构、系统发育树分枝不明显均显示地域性差异不显著。研究发现秋刀鱼群体遗传多样性较低,需对其进行合理保护。 展开更多
关键词 秋刀鱼 细胞色素 b 基因 遗传结构 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
不同瓣型腾冲红花油茶的遗传多样性与遗传结构分析 预览
3
作者 甘沛华 李旦 +3 位作者 沈德周 周安佩 谢忠利 何承忠 《西南林业大学学报》 CAS 北大核心 2019年第4期46-52,共7页
采用荧光AFLP标记技术,对采集于腾冲的3个自然类型90份腾冲红花油茶样本进行遗传变异分析,结果显示:7对AFLP引物扩增出697条带,多态性条带百分率(PPB)为100%,有效等位基因数(Ne)为1.3614,基因多样性指数(H)为0.2576,Shannon’s信息指数... 采用荧光AFLP标记技术,对采集于腾冲的3个自然类型90份腾冲红花油茶样本进行遗传变异分析,结果显示:7对AFLP引物扩增出697条带,多态性条带百分率(PPB)为100%,有效等位基因数(Ne)为1.3614,基因多样性指数(H)为0.2576,Shannon’s信息指数(I)为0.4215,腾冲红花油茶具有较为丰富的遗传变异。在自然类型水平上,基因多样性指数(Hnfp)和Shannon’s信息指数(Infp)分别介于0.2418~0.2558和0.3959~0.4132之间,遗传多样性水平为单瓣类型>半重瓣类型>重瓣类型。3个自然类型之间的遗传分化系数(Gst)为0.0345,与AMOVA分析结果一致(Φst=0.056),表明自然类型内不同个体的遗传差异是腾冲红花油茶遗传多样性的主要来源,需要对现存个体加强保护。基于Nei’s遗传距离的UPGMA聚类分析,将3个自然类型分为2个大组,其中单瓣类型独自构成一组,半重瓣类型与重瓣类型构成另一组。而基于单株之间Nei’s遗传距离的UPGMA聚类结果,将90个个体主要聚分为3个大组,较清晰地将3个自然类型分开,并表明半重瓣是单瓣和重瓣类型的过渡类型,且3种自然类型具有各自特有的遗传物质基础。因此,腾冲红花油茶划分为3种自然类型具有一定的科学性和合理性。 展开更多
关键词 腾冲红花油茶 不同瓣型 遗传多样性 遗传结构 AFLP标记
在线阅读 下载PDF
基于SSR标记的山西晋南漆树种群遗传结构
4
作者 郭晋宏 刘淑娇 +3 位作者 武艳虹 郭雅坤 王智 王祎玲 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期2950-2955,共6页
漆树(Toxicodendron vernicifluum (Stokes) F. A. Barkley)是中国重要的多年生落叶乔木,在生态群落保护和生物制药方面均有较高的利用价值,因此,具有重要的研究意义。本研究首先通过单因素试验确定了漆树SSR-PCR体系,进一步经正交试验... 漆树(Toxicodendron vernicifluum (Stokes) F. A. Barkley)是中国重要的多年生落叶乔木,在生态群落保护和生物制药方面均有较高的利用价值,因此,具有重要的研究意义。本研究首先通过单因素试验确定了漆树SSR-PCR体系,进一步经正交试验对其SSR-PCR体系进行优化和筛选。通过PCR扩增筛选出7对条带清晰、多态性好的引物,7对引物最适退火温度分别是:57℃,55.6℃,58℃,57℃,56.8℃,56℃,58℃。基于建立的漆树SSR-PCR体系,利用选出的7对引物,对46个漆树样本进行遗传多样性及遗传结构分析,获得漆树种群内的观察等位基因平均数Na、有效等位基因数Ne、Shannon多样性指数I、Nei’s基因多样性指数H分别为1.79、1.24、0.27、0.16,多态位点百分率PPB为88.72%,表明漆树种群内部具有丰富遗传多样性,AMOVA分子方差分析结果显示漆树种群内遗传变异74%高于种群间变异26%,表明种群内的遗传变异大于种群间。导致此种现象可能与漆树的传粉方式、种子特征和种子播撒机制以及环境抑制有一定的关系,本研究结果为合理开发利用漆树天然林,发掘其经济价值提供理论依据。 展开更多
关键词 漆树 SSR 遗传多样性 遗传结构
峨眉山地区杨叶木姜子群体遗传多样性研究
5
作者 王雪 高暝 +3 位作者 吴立文 汪阳东 刘红彩 陈益存 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期359-369,共11页
杨叶木姜子在中医药、天然香精香料、趋避剂等领域具有重要应用价值,但其分布地域狭窄,仅在四川省部分地区分布,严重影响杨叶木姜子的开发和利用。本研究以四川盆地西南边缘峨眉山地带的杨叶木姜子为材料,在峨眉山全分布区内根据地理位... 杨叶木姜子在中医药、天然香精香料、趋避剂等领域具有重要应用价值,但其分布地域狭窄,仅在四川省部分地区分布,严重影响杨叶木姜子的开发和利用。本研究以四川盆地西南边缘峨眉山地带的杨叶木姜子为材料,在峨眉山全分布区内根据地理位置和海拔高度的差异选择7个不同区域采集到84个样本,利用简化基因组测序(GBS)技术对其进行遗传多样性分析。基于GBS文库,共检测获得到48795个SNP位点,主要变异来源于内含子区域(47.69%)和基因间区(30.71%)。系统进化树分析、主成分分析和群体结构分析均显示7个杨叶木姜子居群聚类到3个大群体。这3个群体分别来自不同的祖先,分别位于峨眉山以金顶为中心向外延伸的2条主要山脉和峨眉山断层向外延伸的山谷区域中,表明峨眉山区地理差异是造成遗传多样性的主要因素。3个群体平均观测杂合度(Ho)为0.27218,平均期望杂合度(He)为0.24596。群体内变异百分率达到96.28%,而群体间变异仅为3.72%。结果表明,峨眉山杨叶木姜子群体间具有较低的遗传多样性水平,但其在群体内具有较高的核苷酸多样性,变异主要来源于群体内变异。研究结果为杨叶木姜子遗传育种和物种多样性保护提供依据,在家系选择方面需注意群体内大量采样,种质资源保存应尽量选择较低海拔。 展开更多
关键词 杨叶木姜子 峨眉山 GBS 遗传结构 遗传多样性
广西稻田养殖金边鲤群体遗传多样性分析 预览
6
作者 甘宝江 张盛 +5 位作者 韦玲静 黄杰 莫洁琳 甘习军 滕忠作 叶香尘 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期636-646,共11页
为了解广西稻田养殖金边鲤群体的遗传多样性现状,本研究利用10个高度多态微卫星标记,以野生太湖鲤和黑龙江鲤群体,池塘养殖福瑞鲤、兴国红鲤、建鲤群体,广西稻田养殖晒江鲤群体作对照,共7个鲤鱼群体进行群体遗传结构分析。试验结果显示... 为了解广西稻田养殖金边鲤群体的遗传多样性现状,本研究利用10个高度多态微卫星标记,以野生太湖鲤和黑龙江鲤群体,池塘养殖福瑞鲤、兴国红鲤、建鲤群体,广西稻田养殖晒江鲤群体作对照,共7个鲤鱼群体进行群体遗传结构分析。试验结果显示,10个位点共检测到242个等位基因,每个群体的平均等位基因数、期望杂合度、观测杂合度和多态信息含量分别为6~16、0.736~0.900、0.620~0.800和0.689~0.878。9个位点在7个鲤鱼群体中的等位基因频率显著偏离哈迪—温伯格平衡(P<0.05),7个鲤鱼群体遗传多样性丰度由高到低顺序为太湖鲤、黑龙江鲤、建鲤、晒江鲤、福瑞鲤、金边鲤、兴国红鲤。所有群体的遗传分化系数值为0.015~0.141,表明7个鲤鱼群体间存在不同程度的遗传分化,其中金边鲤群体与野生和池塘养殖群体间遗传分化均达中等程度。AMOVA分析显示,群体间的遗传分化占7.15%,而群体内的遗传分化占92.85%,表明鲤鱼群体主要的遗传分化来自于群体内部。7个鲤鱼群体间的遗传距离为0.286~0.977,根据Nei′s遗传距离所绘制的聚类图显示,7个鲤鱼群体被划分为4大支,贝叶斯分析结果与聚类结果相似,其中两个稻田鲤群体遗传结构相似聚为一类。本研究是对金边鲤遗传背景的初探,试验结果表明,金边鲤群体具有较高的遗传多样性和进一步选育的潜力。本研究结果可为稻田养殖鲤品种的选育和遗传改良提供基础遗传学信息。 展开更多
关键词 微卫星 遗传多样性 遗传结构
在线阅读 下载PDF
基于COⅠ基因探讨北京及其周边地区跳钩虾种群遗传结构 预览
7
作者 崔昕宇 刘宏广 李枢强 《四川动物》 北大核心 2019年第4期402-407,共6页
跳钩虾Platorchestia japonica栖息于湖泊、河流岸边,是重要的环境指示生物。本研究以线粒体COⅠ基因片段为分子标记,对北京及其周边地区22个采样点的128个样本进行种群遗传多样性和遗传结构研究。结果显示,623 bp的COⅠ基因序列中有56... 跳钩虾Platorchestia japonica栖息于湖泊、河流岸边,是重要的环境指示生物。本研究以线粒体COⅠ基因片段为分子标记,对北京及其周边地区22个采样点的128个样本进行种群遗传多样性和遗传结构研究。结果显示,623 bp的COⅠ基因序列中有567个保守位点、56个变异位点和38个简约信息位点。128个样本检测到43个单倍型,单倍型多样性为0.938,核苷酸多样性为0.011 72。最大似然法和贝叶斯法构建的系统发育树以及单倍型网络图表明,研究区域跳钩虾没有明显的地理种群结构,但所有单倍型形成2个遗传进化支。分子变异分析结果证实,跳钩虾2个进化支间的遗传变异显著高于进化支内的,进化支间固定系数为0.852 19,表明2个进化支遗传分化明显。本研究为进一步研究中国区域跳钩虾的遗传结构提供了有意义的基础数据。 展开更多
关键词 跳钩虾 COⅠ 系统发育 遗传结构 遗传多样性
在线阅读 免费下载
基于线粒体Cytb序列的伯氏肩孔南极鱼群体遗传结构初步分析 预览
8
作者 赵娜 马春艳 +6 位作者 宋炜 冯春雷 王鲁民 张凤英 蒋科技 赵宪勇 马凌波 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2019年第1期16-24,共9页
选择线粒体Cytb序列为遗传标记分析了伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)在5个采样点(凯西站、罗斯海、长城站、戴维斯站和中山站)的种群多样性、遗传结构与种群演化历史。从5个采样点98个样本的线粒体Cytb序列中共检测到27种单倍... 选择线粒体Cytb序列为遗传标记分析了伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)在5个采样点(凯西站、罗斯海、长城站、戴维斯站和中山站)的种群多样性、遗传结构与种群演化历史。从5个采样点98个样本的线粒体Cytb序列中共检测到27种单倍型。与其它分布于南大洋的鱼类相比,伯氏肩孔南极鱼有着相似的遗传多样性特征,即较高的单倍型多样性(haplotype diversity,h=0.685 90±0.002 36)和较低的核苷酸多样性(nucleotide diversity,P i=0.002 59±0.013 43)。伯氏肩孔南极鱼种群间的平均遗传距离为0.39%,分子变异分析(AMOVA)结果显示,组群间的变异为4.42%(P<0.05),群体内的为95.58%(P<0.05),基于单倍型构建的进化树的结果均表明伯氏肩孔南极鱼群体不具有明显的地理谱系结构。中性进化分析表明伯氏肩孔南极鱼群体在10万年前(大约中更新世时期)经历过快速扩张时期。分子方差分析和F st表明伯氏肩孔南极鱼的遗传变异主要来自种群内的个体之间,极少数遗传变异来自于群体之间。研究结果显示南极地区的伯氏肩孔南极鱼5个采样点之间具有一定的基因交流,是一个随机交配的群体。 展开更多
关键词 伯氏肩孔南极鱼 CYTB 遗传结构 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
滇龙胆基于叶绿体psbA-trnH、trnL-trnF序列多态性遗传评价
9
作者 赵宗苹 严媛 +1 位作者 郑梅梅 刘小莉 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1203-1206,共4页
目的研究云南各地区包括8个居群116个样品的滇龙胆Gentiana rigescens Franch. ex Hemsl.的遗传多样性,分析滇龙胆遗传分化和遗传结构,评价其遗传变异。方法采用试剂盒按照个体提取滇龙胆的DNA,扩增其叶绿体基因psbA-trnH、trnL-trnF并... 目的研究云南各地区包括8个居群116个样品的滇龙胆Gentiana rigescens Franch. ex Hemsl.的遗传多样性,分析滇龙胆遗传分化和遗传结构,评价其遗传变异。方法采用试剂盒按照个体提取滇龙胆的DNA,扩增其叶绿体基因psbA-trnH、trnL-trnF并测序,两个片段拼接后综合分析。结果序列中存在22个变异位点并构成11种单倍体类型,滇龙胆的遗传多样性指数(Hd)为0.737,居群间的遗传分化系数(Gst)为0.37632、基因流(Nm)为0.41,地理区域间Gst为0.19680,Nm为1.02。结论滇龙胆具有较高的遗传多样性,且其遗传变异主要出现在居群间,而2个叶绿体DNA片段在滇龙胆的产地鉴别中意义有限,品质差异的形成可能跟环境因子有较大的关系。 展开更多
关键词 滇龙胆 叶绿体DNA psbA-trnH、trnL-trnF间隔序列 序列分析 遗传变异
硬核资源遗传多样性的AFLP分析 预览
10
作者 毛常丽 吴裕 +1 位作者 张凤良 何美莹 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期29-35,共7页
为了解云南省硬核[Scleropyrum wallichianum(Wight et Arn.)Arn.]的遗传多样性,采用AFLP标记分析了7个居群84份种质材料的遗传变异。结果表明,从64对引物组合中挑选出多态性较好的引物8对,共扩增出1 728条带,其中多态性条带1 388条,多... 为了解云南省硬核[Scleropyrum wallichianum(Wight et Arn.)Arn.]的遗传多样性,采用AFLP标记分析了7个居群84份种质材料的遗传变异。结果表明,从64对引物组合中挑选出多态性较好的引物8对,共扩增出1 728条带,其中多态性条带1 388条,多态性百分率为80.14%。硬核在物种水平的多样性指数分别为Na=1.416,Ne=1.179,H=0.137,I=0.225,在居群水平上分别为H=0.111,I=0.175;在遗传相似性系数为0.52时,这些种质材料可分为3组,其中易武居群具有丰富的遗传变异,大部分的遗传变异存在于居群内,而在0.05置信区间内居群间遗传变异仅为11.5%;居群间的遗传距离和地理距离无显著相关性(r=0.0323,P=0.5820)。因此,硬核资源可采用就地和迁地保护策略,以增加其遗传多样性。 展开更多
关键词 硬核 AFLP 遗传结构 遗传多样性 引种 保护策略
在线阅读 下载PDF
大口黑鲈3个养殖群体的遗传多样性分析 预览
11
作者 孙成飞 谢汶峰 +4 位作者 胡婕 董浚键 田园园 吴灶和 叶星 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期64-71,共8页
该研究通过毛细管电泳法筛选微卫星引物,从GenBank的51对微卫星引物中共筛选出12对具有特异性和多态性的引物,并合成荧光标记引物,对广东大口黑鲈(Micropterus salmoides)主养区3个养殖群体进行STR分型,以分析其遗传多样性。结果显示所... 该研究通过毛细管电泳法筛选微卫星引物,从GenBank的51对微卫星引物中共筛选出12对具有特异性和多态性的引物,并合成荧光标记引物,对广东大口黑鲈(Micropterus salmoides)主养区3个养殖群体进行STR分型,以分析其遗传多样性。结果显示所检测的12个微卫星位点中,3个位点呈现高多态性,4个具有中度多态性,其余5个位点为低多态性。3个群体的遗传多样性水平偏低,期望杂合度(He)分别为0.3125、0.3606和0.3284。群体间遗传分化指数及AMOVA分析显示,群体间遗传分化属于低水平,遗传变异有85.83%是由群体内不同个体间的差异造成的。群体间遗传距离分析显示,3个养殖群体间的遗传距离和遗传相似度比较接近。遗传结构分析表明3个养殖群体来自于同一个亚群。研究结果提示现阶段中国大口黑鲈养殖群体的遗传多样性已显著下降,因此在选育种过程应高度重视提高与维持种群遗传多样性的问题。 展开更多
关键词 大口黑鲈 微卫星 遗传多样性 遗传结构 毛细管电泳
在线阅读 下载PDF
Shallow Genetic Structure of Pholis fangi in Bohai Sea andYellow Sea Inferred from mtDNA Control Region 预览
12
作者 GAO Tianxiang LI Lin +4 位作者 FANG Rundong LIU Guanghui WANG Lei XU Hanxiang SONG Na 《中国海洋大学学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第4期947-952,共6页
Pholis fangi is an ecologically important fish species inhabiting Chinese coastal waters of Yellow Sea and Bohai Sea. To investigate the genetic diversity and population genetic structure of P. fangi, a fragment of 48... Pholis fangi is an ecologically important fish species inhabiting Chinese coastal waters of Yellow Sea and Bohai Sea. To investigate the genetic diversity and population genetic structure of P. fangi, a fragment of 487 bp in the first hypervariable region (HVR-1) of the mitochondrial DNA (mtDNA) control region was sequenced for 181 individuals collected from Bohai Sea and Yel- low Sea. A total of 18 polymorphic sites were detected, which defined 25 haplotypes. A moderate level of haplotype diversity (h = 0.7052) and a low level of nucleotide diversity (π= 0.0028) were detected. Both the phylogenetic tree and the haplotype network showed no significant genealogical structure difference among sampling locations. Pairwise FST comparison and hierarchical mo- lecular variance analysis (AMOVA) revealed that no significant genetic structure difference existed throughout the investigated re- gions, suggesting a high gene exchange among different populations. The results of neutrality test and mismatch distribution analysis indicated that a late Pleistocene population expansion (38000 127000 years ago) happened. Seasonal schooling migration may con- tribute to the genetically homogeneous population structure of the species. 展开更多
关键词 Pholis fangi control region of mtDNA GENETIC diversity GENETIC structure DEMOGRAPHIC history
在线阅读 下载PDF
滇杨种群遗传多样性与遗传结构
13
作者 张亚红 贾会霞 +3 位作者 王志彬 孙佩 曹德美 胡建军 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期355-365,共11页
滇杨(Populus yunnanensis)是我国西南地区的特有树种,具有速生、易无性繁殖、适应性强等优良特性,是典型的南方型杨属树种。研究滇杨遗传多样性及种群结构对其种质资源的收集、保存和利用具有重要的意义。本研究从我国滇杨主要分布区... 滇杨(Populus yunnanensis)是我国西南地区的特有树种,具有速生、易无性繁殖、适应性强等优良特性,是典型的南方型杨属树种。研究滇杨遗传多样性及种群结构对其种质资源的收集、保存和利用具有重要的意义。本研究从我国滇杨主要分布区云南和四川共采集了6个种群,包括云南的昭通(ZT)、会泽(HZ)、嵩明(SM)、洱源(EY)、拉市海(LS)以及四川的美姑(MG),共64个个体,利用34对SSR分子标记和3对cp DNA叶绿体标记开展遗传多样性与遗传结构研究。SSR引物共检测到154个等位基因,平均等位基因数为4.529,观测杂合度(Ho)与期望杂合度(He)分别为0.552和0.472,遗传分化系数(Fst)平均值为0.238,多态性信息含量指数(PIC)平均值为0.421,基因流(Nm)为0.806。滇杨的遗传结构分析(DAPC)与遗传距离的主坐标分析(PCo A)、UPGMA聚类分析均将6个种群划分为3个亚类:第?亚类包括昭通种群、会泽种群和嵩明种群的4个个体,第??亚类包括嵩明种群的6个个体以及洱源种群和拉市海种群,第III亚类为美姑种群;嵩明种群包含第?和第??两个亚类的混合遗传成分。3个cp DNA联合序列中共检测到35个变异位点,分为13个单倍型,其中单倍型H5在种群中分布最为广泛,其余的单倍型均为种群特有的单倍型。分子方差分析(AMOVA)表明种群内的遗传变异大于种群间变异。研究表明滇杨不同种群的遗传分化具有地域性,可选择就地保护;昭通种群遗传多样性最高,且包含7种叶绿体单倍型,单倍型类型最多,应优先保护。 展开更多
关键词 滇杨 遗传多样性 遗传结构 分子标记 SSR CPDNA
中国山荆子和楸子种质资源遗传多样性和遗传结构的荧光SSR分析
14
作者 高源 王昆 +3 位作者 王大江 刘立军 李连文 朴继成 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1225-1237,共13页
采用荧光SSR分子标记对来源于中国9个省的苹果属山荆子8个种群和楸子9个种群共288份种质的遗传多样性和种群遗传结构进行了研究。结果显示:19对SSR引物对288份种质共扩增出416个多态性等位基因,平均每个位点等位基因21.895个,多态性位... 采用荧光SSR分子标记对来源于中国9个省的苹果属山荆子8个种群和楸子9个种群共288份种质的遗传多样性和种群遗传结构进行了研究。结果显示:19对SSR引物对288份种质共扩增出416个多态性等位基因,平均每个位点等位基因21.895个,多态性位点百分率(PPB)为100%。山荆子和楸子共计17个种群总体的遗传多样性较高,有效等位基因数(Ne)为9.284,平均期望杂合度(He)为0.862,Shannon’s多样性指数(I)为2.432;种群水平上,楸子的遗传多样性水平(He=0.870,I=2.412,Ne=9.019)高于山荆子(He=0.848,I=2.350,Ne=8.652)。分子方差分析(AMOVA)表明,遗传变异主要来自种群内(95%)。种群间的遗传分化系数(Fst)为0.278,基因流(Nm)为5.031,表明楸子和山荆子均为异交的混交类群,各个种群在过去的某个时间都可能相互发生过基因交流,抵制了由于基因漂变而导致的种群间遗传分化。通过NJ聚类和Structure分组划分类群,种群间遗传距离和类群归属与地理位置不完全相关。 展开更多
关键词 山荆子 楸子 荧光SSR 遗传多样性 遗传结构
基于rpl16序列分析大百合的遗传多样性及遗传结构
15
作者 张晓芸 杨妙琴 +2 位作者 徐英 张永洪 李洪飞 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期199-206,共8页
大百合是百合科大百合属一种重要的野生植物资源,本文采用基因测序法,利用叶绿体DNA rpl16序列对10个大百合居群进行了遗传多样性和遗传结构分析,旨在为其资源保护和开发利用提供理论基础。结果显示:rpl16序列矩阵长度为699 bp,共检测... 大百合是百合科大百合属一种重要的野生植物资源,本文采用基因测序法,利用叶绿体DNA rpl16序列对10个大百合居群进行了遗传多样性和遗传结构分析,旨在为其资源保护和开发利用提供理论基础。结果显示:rpl16序列矩阵长度为699 bp,共检测到14个变异位点和12个单倍型,单倍型多态性(Hd)为0.604;总的遗传多样性(HT)为0.660。该居群间遗传变异(71.53 %)大于居群内遗传变异(28.47 %),说明居群间变异是其居群的主要变异来源;居群间遗传分化很高(Gst-=0.677,Nst-= 0.614,Fst =0.71531),基因流较低(Nm = 0.0995)。失配分析结果表明种群在进化过程中曾经历过快速扩张,中性检验支持上述结果:Tajima's D =-1.74368(P>0.05);Fu and Li's D = -2.69366(P<0.05);Fu and Li's F=-2.79896(P<0.05)。研究结果表明:大百合居群遗传多样性较高,居群间存在较高的遗传分化,主要与其生活史特征相关。基于得到的居群遗传信息,建议采取就地保护为主的保护策略。 展开更多
关键词 大百合 rpl16 遗传多样性 遗传结构
Genome-wide developed microsatellite markers for the melon thrips Thrips palmi Karny(Thysanoptera:Thripidae)
16
作者 Yongfu Gao Yajun Gong +4 位作者 Ling Ma Lijun Cao Jincui Chen Min Chen Shujun Wei 《动物分类学报:英文版》 CSCD 2019年第2期100-110,共11页
The melon thrips, Thrips palmi Karny, is an economically important pest on many vegetables from Solanaceae and Cucurbitaceae. In this study, we developed novel microsatellite markers for Thrips palmi. First, we obtain... The melon thrips, Thrips palmi Karny, is an economically important pest on many vegetables from Solanaceae and Cucurbitaceae. In this study, we developed novel microsatellite markers for Thrips palmi. First, we obtained randomly sequenced regions from the genome using next-generation sequencing and assembled 356 Mb genomic sequences. In total, 155,789 microsatellites were identified from the genomic sequences, of which, 64.02% were loci of dinucleotide repeat. Sixty primer pairs were initially validated in seven individuals. Thirty-five polymorphic markers were retained according to the amplification efficiency and polymorphism.These 35 microsatellite loci were then assessed in 96 individuals in four geographical populations collected from China. The allele numbers ranged from 2 to 19 with an average value of 6.9 per locus, while the polymorphism information content ranged from 0.2219 to 0.8490.The observed and expected heterozygosity varied from 0.5252 to 0.5367 and 0.5934 to 0.6148,respectively. Genetic structure was found between populations from southern and northern China. These novel microsatellite markers developed in our study provide abundant molecular markers for the genetic study of T. palmi. 展开更多
关键词 MICROSATELLITE GENETIC marker genome population GENETIC structure
基于线粒体控制区的中国近海棘头梅童鱼群体遗传结构研究 预览
17
作者 梁述章 宋炜 +4 位作者 马春艳 蒋科技 张凤英 赵明 马凌波 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2019年第2期138-148,共11页
为研究我国沿海棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)的种群遗传结构,运用线粒体D-loop区全序列比较分析了中国连云港(LYG)、大丰(DF)、崇明(CM)、舟山(ZS)、温州(WZ)、宁德(ND)、厦门(XM)棘头梅童鱼7个野生群体的遗传结构特征。7个群体共20... 为研究我国沿海棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)的种群遗传结构,运用线粒体D-loop区全序列比较分析了中国连云港(LYG)、大丰(DF)、崇明(CM)、舟山(ZS)、温州(WZ)、宁德(ND)、厦门(XM)棘头梅童鱼7个野生群体的遗传结构特征。7个群体共208个样本的D-loop序列中,共检测到83种单倍型,66个变异位点,碱基组成符合AT碱基偏好性特点。7个群体的单倍型多样性为(0.55400±0.00998)~(0.95400±0.00067),核苷酸多样性为0.00183~0.00708,说明我国沿海棘头梅童鱼遗传多样性较高;根据海洋鱼类遗传多样性划分的分布模式,符合高h低π特点,说明其经历了快速扩张期。群体总的遗传分化系数Fst=0.86647 (P=0),两两群体间的遗传距离在0.004~0.039范围内,且明显的分为北方群体(LYG、DF、CM和ZS)和南方群体(WZ、ND和XM),DF和LYG、WZ和ND两两群体间存在显著的基因交流。AMOVA分析显示组间变异百分比为85.97%,符合南北分化特点。基于单倍型构建的单倍型邻接关系树和单倍型简约网络图等结果均表明,棘头梅童鱼以舟山为界,具有明显的南北地理遗传结构。中性检验(Tajima’s D、Fu’s Fs)和错配分析结果显示,棘头梅童鱼在3.87~12.9万年前(更新世冰期)经历了种群的规模性扩张或定向选择。本研究结果可为棘头梅童鱼资源的保护与利用提供基础数据。 展开更多
关键词 棘头梅童鱼 D-LOOP 遗传结构 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
扁穗冰草不同地理种群cpDNAtrnT-trnL多态性分析 预览
18
作者 周学丽 杨路存 +3 位作者 李桂全 董世魁 史德军 土旦加 《青海草业》 2019年第3期2-6,共5页
对91份不同产地扁穗冰草(Agropyron cristatum(L.)Gaertn)样品的遗传多样性和遗传结构进行研究。采用叶绿体cpDNAtrnT-trnL直接测序的方法和邻接法(NJ)对91份扁穗冰草样品进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示:物种水平上单倍型多样... 对91份不同产地扁穗冰草(Agropyron cristatum(L.)Gaertn)样品的遗传多样性和遗传结构进行研究。采用叶绿体cpDNAtrnT-trnL直接测序的方法和邻接法(NJ)对91份扁穗冰草样品进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示:物种水平上单倍型多样性(Hd)指数为0.608,核苷酸多样性(Pi)指数为0.00295;种群水平上Hd介于0~0.9722,Pi指数介于0~0.00749。分子方差分析表明,扁穗冰草大部分遗传变异(91.63%)发生在居群内,居群间的基因流(Nm=5.474)较高,群体内变异是扁穗冰草的主要变异来源;NJ树表明,受试的6个野生种群可分为4大类群。扁穗冰草的遗传多样性居群内遗传分化较大。 展开更多
关键词 扁穗冰草 cpDNAtrnT-trnL 遗传多样性 遗传结构 种群
在线阅读 下载PDF
基于ND2基因的崖沙燕遗传多样性和遗传结构初探 预览
19
作者 安博洋 安月 +1 位作者 王兰芝 李波 《野生动物学报》 北大核心 2019年第2期377-383,共7页
利用线粒体DNA中的NADH脱氢酶第二亚基(ND2)对来自齐齐哈尔市50个崖沙燕(Riparia riparia)样本进行扩增和测序,发现了11条新的单倍型序列。结合从GenBank中下载的104条序列,对崖沙燕3个亚种种群(154只个体)进行序列变异及系统发育分析... 利用线粒体DNA中的NADH脱氢酶第二亚基(ND2)对来自齐齐哈尔市50个崖沙燕(Riparia riparia)样本进行扩增和测序,发现了11条新的单倍型序列。结合从GenBank中下载的104条序列,对崖沙燕3个亚种种群(154只个体)进行序列变异及系统发育分析。结果显示,3个亚种种群中有2个共享单倍型。群体总的单倍型多样性(Hd)为(0.885±0.019),群体总的核苷酸多样性(Pi)为(0.00292±0.00018)。与其近缘物种淡色崖沙燕(Riparia diluta)相比较,崖沙燕种群表现出较低水平的遗传多样性。分子方差分析(AMOVA)显示变异主要来自种群内(72.82%)。构建的单倍型系统发育树表明,62个单倍型没有形成明显的亚种分化和地理分化。 展开更多
关键词 崖沙燕 ND2基因 遗传多样性 遗传结构
在线阅读 下载PDF
基于SSR标记探讨三种金花茶植物的遗传多样性和遗传结构 预览
20
作者 陈海玲 路雪林 +1 位作者 叶泉清 唐绍清 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期318-327,共10页
薄叶金花茶、小花金花茶和小瓣金花茶是三种濒危金花茶植物,为了解珍稀濒危植物遗传多样性和遗传结构,该研究利用微卫星标记对他们的7个种群共184个个体进行了遗传多样性和遗传结构分析。结果表明:11个位点共检测到等位基因92个。在物... 薄叶金花茶、小花金花茶和小瓣金花茶是三种濒危金花茶植物,为了解珍稀濒危植物遗传多样性和遗传结构,该研究利用微卫星标记对他们的7个种群共184个个体进行了遗传多样性和遗传结构分析。结果表明:11个位点共检测到等位基因92个。在物种水平上,小瓣金花茶平均等位基因数(NA)为3.9、有效等位基因数(NE)为2.328、观测杂合度(Ho)为0.520、期望杂合度(He)为0.501,高于薄叶金花茶和小花金花茶。在种群水平上,有效等位基因数(NE)在1.788~2.466之间,期望杂合度(He)在0.379~0.543之间;种群间遗传分化系数(FST)在0.1437~0.4533之间,种群间基因流(Nm)在0.3015~1.4889之间。AMOVA分子变异分析显示65.72%的变异存在于种群内。三种金花茶具有较低水平的遗传多样性和高水平的种群间遗传分化。STRUCTURE和PCoA种群遗传结构分析结果将取样种群分为2组,即薄叶金花茶和小花金花茶大部分个体分为一组,小瓣金花茶大部分个体分为一组。现存所有种群应根据实际情况尽快采取就地保护或迁地保护措施。 展开更多
关键词 薄叶金花茶 小花金花茶 小瓣金花茶 遗传多样性 遗传结构
在线阅读 下载PDF
上一页 1 2 82 下一页 到第
使用帮助 返回顶部 意见反馈