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文章速递泛基因组及其在植物功能基因组学研究中的应用 认领
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作者 赵均良 张少红 刘斌 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期7-15,共9页
参考基因组是现代功能基因组学的核心框架,以此为基础的现代基因组学技术在过去20年对植物遗传变异发掘、功能基因克隆等研究起了巨大的推动作用。然而,越来越多的研究发现,单一或少数参考基因组不能完整代表和呈现物种或特定群体内的... 参考基因组是现代功能基因组学的核心框架,以此为基础的现代基因组学技术在过去20年对植物遗传变异发掘、功能基因克隆等研究起了巨大的推动作用。然而,越来越多的研究发现,单一或少数参考基因组不能完整代表和呈现物种或特定群体内的所有基因组变异,因此其在功能基因组学研究中应用存在很大的局限性,甚至会导致错误的结果。泛基因组是指物种或特定群体内全部基因或基因组序列的总和。泛基因组通过完整捕获和呈现群体内全部的基因或基因组序列,代替单一参考基因组应用于功能基因组学研究,可以突破单一参考基因组的局限性。泛基因组在植物功能基因组学研究中有广泛的应用,以泛基因组为基础,结合最新的基因组学技术可以高效、精准鉴定种质资源中的遗传变异。泛基因组研究是目前植物基因组学研究的前沿和热点。本文综述了泛基因组概念的起源和发展,泛基因组组装的技术和策略,以及泛基因组在植物基因组学研究和分子育种方面的应用和最新进展,最后对植物泛基因组研究目前存在的问题和今后研究方向进行了展望。本综述可为植物泛基因组研究和应用提供参考。 展开更多
关键词 泛基因组 种质资源 功能基因组学 遗传变异
文章速递2年生云南松实生苗生物量家系间变异研究 认领
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作者 魏巍 蔡年辉 +6 位作者 李根前 郑畹 许玉兰 李孙玲 陈诗 王磊 孙睿 《西部林业科学》 CAS 北大核心 2021年第1期97-104,共8页
以20个云南松半同胞家系的2 a生实生苗为研究对象,对其生物量的累积与分配在家系层次的变异规律进行研究,以期为科学评价云南松苗木质量和提高遗传改良的潜在增益提供依据。结果表明,20个云南松半同胞家系2 a生实生苗的生物量累积与分... 以20个云南松半同胞家系的2 a生实生苗为研究对象,对其生物量的累积与分配在家系层次的变异规律进行研究,以期为科学评价云南松苗木质量和提高遗传改良的潜在增益提供依据。结果表明,20个云南松半同胞家系2 a生实生苗的生物量累积与分配指标,在家系间均达到显著或极显著水平的差异。根干重、茎干重、叶干重、地上干重、全株干重、根分配、茎分配、叶分配、地上地下生物量比9个生物量指标的表型分化系数为57.74%~92.86%,家系间方差分量百分比为12.77%~34.03%,变异系数为7.78%~55.40%。叶分配比例的遗传力最高(0.62),其次是地上地下生物量比(0.60)。以地上地下生物量比为依据进行优良性状选择可获遗传增益最高(14.31%)。具较大生物量的苗木,其针叶和茎生物量分配的范围集中在50%和40%附近,对应的根茎比在5.0~10.0之间。 展开更多
关键词 云南松 家系 生物量 遗传变异
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野生大豆遗传多样性研究进展 认领
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作者 李向华 王克晶 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1344-1356,共13页
野生大豆自花授粉和低异交率的繁殖系统使其遗传变异和分化具有其内在特点。本文对近年来野生大豆遗传多样性的研究进展进行了总结,从不同地理空间尺度、天然居群、地理空间遗传结构和基因流的角度综述了野生大豆遗传变异和分化的特点... 野生大豆自花授粉和低异交率的繁殖系统使其遗传变异和分化具有其内在特点。本文对近年来野生大豆遗传多样性的研究进展进行了总结,从不同地理空间尺度、天然居群、地理空间遗传结构和基因流的角度综述了野生大豆遗传变异和分化的特点。研究结果表明,野生大豆遗传变异往往表现大的地理空间区域内变异和小的区域间变异、或大的天然居群间变异和小的居群内变异;在个别生态系统或特定地理位置的居群间也出现小的居群间和大的居群内变异,这可能是高强度的基因流超过了环境选择压力、干扰和遗传漂变作用,或与物种传播史上的"基因扩散"有关;野生大豆基因流与地理距离也存在密切关系。同时,本文还从野生大豆保护遗传学和生态遗传学方面探讨了未来遗传多样性研究方向。 展开更多
关键词 遗传变异 遗传多样性 遗传结构 野生大豆
栗属杂交F1代生长与枝条性状遗传变异及杂种优势分析 认领
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作者 章平生 江锡兵 +4 位作者 徐阳 龚榜初 赖俊声 杨龙 吴聪连 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期1582-1594,共13页
为探索栗属杂交F1代幼林期生长、枝条性状遗传变异规律及杂种优势,并为栗属育种亲本选配及早期选择指标筛选奠定理论基础,该研究以锥栗、板栗种内和种间9个杂交组合子代及其亲本为材料,在分析F1代幼林期生长、枝条性状遗传变异规律及杂... 为探索栗属杂交F1代幼林期生长、枝条性状遗传变异规律及杂种优势,并为栗属育种亲本选配及早期选择指标筛选奠定理论基础,该研究以锥栗、板栗种内和种间9个杂交组合子代及其亲本为材料,在分析F1代幼林期生长、枝条性状遗传变异规律及杂种优势的基础上,利用SSR分子标记检测7个亲本的遗传距离,进而分析栗属杂交子代生长、枝条性状杂种优势与亲本遗传距离间的关系。结果显示:(1)栗属杂交F1代生长、枝条性状均存在较高的遗传变异,各性状组合间F值的变动范围为5.08~22.03,组合内的变异系数范围为6.60%~27.69%;各性状广义遗传力均在0.5以上,性状受遗传影响较大;除地径外,其他性状遗传传递力均大于100%,性状遗传稳定性较高;各性状中亲优势率为-6.01%~44.40%,且F1代生长、枝条性状存在普遍的超亲分离现象。(2)28对引物在7个亲本中共检测出115个多态性等位位点,每对引物的等位基因数3~5个不等,平均每对引物等位基因数为4.1个,多态性程度较高;Shannon's指数(I)、多态性信息含量(PIC)的平均值分别为1.25、0.674,亲本遗传多样性较为丰富。(3)相关分析表明,杂交子代一年生枝长、一年生枝粗及节间距的杂种优势与亲本遗传距离均存在显著的线性关系,并随遗传距离增大杂种优势增强。 展开更多
关键词 栗属 杂交子代 遗传变异 杂种优势 遗传距离
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新疆野苹果叶绿体DNA变异与遗传进化分析 认领 被引量:1
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作者 高源 王大江 +4 位作者 王昆 丛佩华 张彩霞 李连文 朴继成 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期579-587,共9页
利用4对叶绿体DNA引物对来源于新疆巩留、霍城和新源3个地区的242份新疆野苹果种质资源的4个非编码区trnH-psbA、trnS-trnG spacer+intron、trnT-5′trnL和5′trnL-trnF进行了扩增,基于4个叶绿体基因间区的序列变异,从母系遗传的角度评... 利用4对叶绿体DNA引物对来源于新疆巩留、霍城和新源3个地区的242份新疆野苹果种质资源的4个非编码区trnH-psbA、trnS-trnG spacer+intron、trnT-5′trnL和5′trnL-trnF进行了扩增,基于4个叶绿体基因间区的序列变异,从母系遗传的角度评价了遗传变异和不同居群的遗传进化关系。结果表明:4个叶绿体DNA非编码区经测序、拼接、比对和合并之后的片段长度为3812 bp,共有171个多态性变异位点,其中包含6个单一突变位点、16个简约信息位点和149个插入-缺失位点。在242份新疆野苹果种质中,trnH-psbA、trnS-trnG spacer+intron、trnT-5′trnL和5′trnL-trnF区域的变异位点的数量分别为68个、25个、77个和1个,单倍型数量分别为36个、6个、6个和2个,合并之后的叶绿体DNA片段的单倍型为52个。核苷酸多样性和单倍型多样性最高的区域均为trnH-psbA(Hd=0.773,Pi=0.01982),最低的为5′trnL-trnF(Hd=0.025,Pi=0.00002)。242份新疆野苹果种质4个叶绿体DNA区域合并后的遗传多样性较高(Hd=0.806,Pi=0.00291)。Tajima′s D检验中,4个cpDNA区域合并后片段在P<0.05水平上显著,4个cpDNA区域整体不遵循中性进化模型,自然选择的压力是新疆野苹果遗传进化的主要动力。新疆野苹果的遗传变异主要存在于居群内部,新疆巩留和新源居群间的遗传距离较近,与霍城居群间遗传距离相对较远,居群间的遗传分化与地理距离相关。3个地区的新疆野苹果各自经历着遗传分化但又存在频繁的基因交流,有向新疆新源的新疆野苹果演化的趋势。 展开更多
关键词 新疆野苹果 叶绿体DNA 遗传变异 遗传进化
柳杉半同胞子代测定林树高性状遗传变异研究 认领
6
作者 陈秋玲 《防护林科技》 2020年第9期14-17,共4页
以营建于2018年的柳杉二代种子园半同胞子代测定林为研究对象,对其1~2年生林木树高性状遗传参数进行了分析,结果表明:生长量和表型变异系数均较高,表型变异系数分别为25.9%和20.5%;家系内单株生长量差异很大,家系间的生长量差异变化也较... 以营建于2018年的柳杉二代种子园半同胞子代测定林为研究对象,对其1~2年生林木树高性状遗传参数进行了分析,结果表明:生长量和表型变异系数均较高,表型变异系数分别为25.9%和20.5%;家系内单株生长量差异很大,家系间的生长量差异变化也较大;加性遗传方差、小区方差、单株狭义遗传力均显著;加性遗传变异系数较低,分别为3.1%和3.7%;单株狭义遗传力较低,分别为0.067±0.042和0.128±0.058;各家系遗传增益绝对值和排名变化很大。 展开更多
关键词 柳杉 遗传力 遗传变异 遗传增益
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基于COI基因的鸽遗传多样性和品种鉴定研究 认领
7
作者 陆俊贤 贾晓旭 +5 位作者 付胜勇 唐修君 樊艳凤 葛庆联 卜柱 高玉时 《农业生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期1635-1641,共7页
我国鸽(Columba livia)产量仅次于鸡(Gallus gallus)、鸭(Anas platyrhynchos)、鹅(Anser cygnoides orientalis),为名副其实的第四家禽。研究鸽遗传资源的遗传多样性和品种鉴定,对于品种的保护和开发利用有重要的意义。本研究对白羽王... 我国鸽(Columba livia)产量仅次于鸡(Gallus gallus)、鸭(Anas platyrhynchos)、鹅(Anser cygnoides orientalis),为名副其实的第四家禽。研究鸽遗传资源的遗传多样性和品种鉴定,对于品种的保护和开发利用有重要的意义。本研究对白羽王鸽、泰深鸽和银王鸽3个群体的线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome C oxidase subunitⅠ,COI)基因全序列进行PCR扩增和测序。结果表明,鸽mtDNA COI基因全长为1551 bp,没有发现插入和缺失,编码517个氨基酸。共计检测到核苷酸变异位点7个,定义了6个单倍型,其中单倍型Hap1和Hap2为3个鸽品种共享,出现频率分别为26次和15次。总体单倍型多样性、核苷酸多样性和平均核苷酸差异数分别0.726、0.00098和1.518,其中银王鸽最高,白羽王鸽最低。系统发育分析发现,家鸽和原鸽可以分为A和B 2个世系分支,中介网络图以Hap1为中心节点,呈星状发散分布,经历过群体扩张。上述结果揭示,鸽COI基因突变较少,相对较为保守,不太适合区分不同鸽品种,但可以作为遗传标记研究遗传多样性和起源。该研究结果提供了鸽遗传多样性和遗传结构信息,为以后相关研究提供了参考依据。 展开更多
关键词 线粒体COI基因 遗传变异 遗传多样性
野生荔枝半同胞家系果实性状遗传变异分析及遗传参数估算 认领
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作者 吴洁芳 欧良喜 +4 位作者 陈洁珍 蔡长河 严倩 姜永华 李华 《中国农学通报》 2020年第5期46-52,共7页
以26个野生荔10号荔枝自然杂交子代半同胞单株为材料,分析其果实性状的遗传变异和估测其遗传参数,以期弄清野生荔枝的遗传规律和在酿酒品种培育中的可行性提供依据。结果表明,果实的表型性状(果实形状、果肩形状、果皮颜色、龟裂片形状... 以26个野生荔10号荔枝自然杂交子代半同胞单株为材料,分析其果实性状的遗传变异和估测其遗传参数,以期弄清野生荔枝的遗传规律和在酿酒品种培育中的可行性提供依据。结果表明,果实的表型性状(果实形状、果肩形状、果皮颜色、龟裂片形状、裂片峰形状)变异范围广,均分离出3~5个不同类型;除果皮颜色外,其余性状亲本性状遗传更加顽固;呈母本性状占比数依次为果肩形状(55.56%)>果实形状(44.44%)>龟裂片形状(40.74%)>裂片峰形状(29.63%)>果皮颜色(14.81%)。品质性状家系间具有极显著差异(P<0.01),变异系数由大到小依次为单果重(28.44%)>果皮厚度(17.48%)>果肉厚度(15.44%)>可食率(12.21%)>可溶性固形物含量(8.8%)>果形指数(5.59%);遗传力由大到小依次为单果重(0.9992)>可食率(0.9987)>可溶性固形物含量(0.9753)>果形指数(0.9733)>果肉厚度(0.9663)>果皮厚度(0.9585);遗传增益由大到小依次为单果重(87.74%)>果肉厚度(48.32%)>果皮厚度(30.16%)>可食率(17.96%)>可溶性固形物含量(14.37%)>果形指数(-4.77%)。单果重在变异系数、遗传力、遗传增益3项指标值均最高,表现出突出的遗传变异、遗传力和遗传增益效果,表明该性状受较强的遗传控制,且后代的选择余地较大。筛选出9个特异单株:8个单株入选高可溶性固形物含量(≥18.5%)特异单株,1个单株入选高可食率(≥80%)特异单株,改良效果好。 展开更多
关键词 野生荔枝 半同胞家系 果实性状 遗传变异 遗传参数
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四川省丁香假单胞猕猴桃致病变种的遗传多样性分析 认领
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作者 杨潇湘 伍文宪 +3 位作者 黄小琴 张蕾 杜磊 刘勇 《中国农学通报》 2020年第9期132-137,共6页
为明确四川省猕猴桃溃疡病菌丁香假单胞菌猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv.actinidiae,Psa)的遗传多样性及群组划分与地理来源的相关性。以四川省不同地理来源的40个Psa菌株为研究试材,用rep-PCR技术进行分子标记,NTSYS软件分析... 为明确四川省猕猴桃溃疡病菌丁香假单胞菌猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv.actinidiae,Psa)的遗传多样性及群组划分与地理来源的相关性。以四川省不同地理来源的40个Psa菌株为研究试材,用rep-PCR技术进行分子标记,NTSYS软件分析UPGMA聚类。3对rep-PCR检测引物(REP、ERIC和BOX)共获得42个位点,其中38个为多态位点,占90.5%。UPGMA聚类结果显示,以相似系数为0.70阀值时,40个Psa菌株被分为2个类群(Ⅰ、Ⅱ),其中85.0%的菌株属于第Ⅱ类群;在相似性系数为0.80时,第Ⅰ类又可分为2个亚类(Ⅰ-1、Ⅰ-2),第Ⅱ类则分为5个亚类(Ⅱ-1、Ⅱ-2、Ⅱ-3、Ⅱ-4、Ⅱ-5),菌株无明显的采集地聚类。以上结果表明,四川省各地区的猕猴桃溃疡病菌菌株具有较高的遗传多样性,但其遗传变异与菌株地理来源无明显相关性。 展开更多
关键词 猕猴桃 丁香假单胞菌猕猴桃致病变种 REP-PCR 遗传多样性 遗传变异
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漳州地区交趾黄檀幼龄期生长表现及适应性分析 认领
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作者 洪舟 吴培衍 +4 位作者 张金文 王维辉 许丽鸿 申巍 徐大平 《南京林业大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期118-124,共7页
【目的】研究交趾黄檀在漳州地区引种的适应性及稳定性,筛选早期生长优良的家系。【方法】以26个交趾黄檀家系为材料,分别在龙海、诏安和漳浦试验点营造子代测定林,对5年生交趾黄檀地径、胸径和树高生长性状进行多地点联合分析。【结果... 【目的】研究交趾黄檀在漳州地区引种的适应性及稳定性,筛选早期生长优良的家系。【方法】以26个交趾黄檀家系为材料,分别在龙海、诏安和漳浦试验点营造子代测定林,对5年生交趾黄檀地径、胸径和树高生长性状进行多地点联合分析。【结果】生长性状在各试验点均达到极显著水平差异(P<0.01),树高性状的家系×地点互作效应明显,其他性状的家系×立地互作效应则较小。交趾黄檀各生长性状家系遗传力估算值总体较高且各性状间均呈极显著的遗传正相关。综合隶属函数、生产力指数法及基因型分组法等方法,2、13和22号家系在福建省漳州地区的平均生长速度均较快,适应性较强。【结论】交趾黄檀适合在漳州地区生长,且以泰国北柳的13号家系在漳州地区的适应性更强,可作为在漳州地区引种栽培交趾黄檀的首选家系。 展开更多
关键词 交趾黄檀 遗传变异 多点试验 家系选择 遗传稳定性
柴达木野生黑果枸杞的空间遗传结构 认领
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作者 王春成 马松梅 +1 位作者 张丹 王绍明 《植物生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期661-668,共8页
基于cp DNA序列,研究柴达木野生黑果枸杞(Lycium ruthenicum)的遗传多样性、遗传结构和单倍型进化关系,可为其种群的遗传保护提供理论依据。该研究基于3个筛选的叶绿体多态引物:psb A-trn H、psb K-psb I和trn V,利用群体遗传分析方法... 基于cp DNA序列,研究柴达木野生黑果枸杞(Lycium ruthenicum)的遗传多样性、遗传结构和单倍型进化关系,可为其种群的遗传保护提供理论依据。该研究基于3个筛选的叶绿体多态引物:psb A-trn H、psb K-psb I和trn V,利用群体遗传分析方法研究柴达木盆地野生黑果枸杞的遗传变异格局:利用软件DnaSP6.0和Permut2.0计算分子多样性指标,利用分子方差分析研究组间和种群间的遗传变异来源,利用单倍型网络分析和主坐标分析研究单倍型的聚类关系;利用最大似然树和贝叶斯系统树分析单倍型的谱系进化关系。结果显示:叶绿体序列psb A-trn H、psb K-psb I和trn V拼接后的总长度为1454 bp,鉴别出14个核苷酸变异位点,共定义了7个单倍型。种群间总的遗传多样(hT)和种群内遗传多样性(hS)分别为0.916和0.512。AMOVA分析结果表明,80%以上的遗传变异来源于组间和种群间。叶绿体单倍型的贝叶斯系统树和最大似然树均表明柴达木盆地黑果枸杞种群聚为2支:德令哈和格尔木为一支,诺木洪为另一支。单倍型网络和主坐标分析结果揭示的拓扑结构和聚类关系与系统树一致。Mantel检验结果表明柴达木黑果枸杞种群间的遗传距离与地理距离存在显著的弱相关关系(r=0.5911,p=0.0009)。柴达木盆地黑果枸杞种群具有较高的遗传多样性,种群间遗传分化显著。从遗传多样性保护的角度而言,具有较高遗传多样性的诺木洪林业站和格尔木新乐村种群可划分为保护管理单元。 展开更多
关键词 黑果枸杞 柴达木盆地 叶绿体片段 遗传变异 遗传结构
香椿种质生长及叶部表型性状的遗传变异分析 认领 被引量:1
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作者 姚程程 王俊臣 +5 位作者 胡继文 肖遥 杨桂娟 王军辉 翟文继 麻文俊 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期112-122,共11页
以84个香椿(Toona sinensis(A.Juss.)Roem.)种质为材料,对其2个生长性状和18个叶部性状(包含6个质量性状和12个数量性状)进行测定。结果显示,香椿6个叶部质量性状变异类型丰富,呈现出多态化特点,单一性状的主要表型多为1~2个。苗高、地... 以84个香椿(Toona sinensis(A.Juss.)Roem.)种质为材料,对其2个生长性状和18个叶部性状(包含6个质量性状和12个数量性状)进行测定。结果显示,香椿6个叶部质量性状变异类型丰富,呈现出多态化特点,单一性状的主要表型多为1~2个。苗高、地径及叶部表型等14个数量性状在种质间的差异均达到极显著水平,且除地径外,其他性状的遗传方差分量均大于环境方差分量,表明此类性状主要受遗传控制。参试的14个数量性状的平均表型变异系数为20.35%,平均遗传变异系数为16.36%;综合表型和遗传变异系数,叶柄长度较其他性状变异大,而叶片夹角稳定性最高,各数量性状(除地径外)遗传变异系数与表型变异系数之差小于7%。香椿种质各性状间Shannon-Weaver遗传多样性指数相差不大(1.892~2.069),遗传多样性水平高,具有良好的遗传改良基础。聚类分析可将84个香椿种质分为5类,类群Ⅰ表现为生长旺盛、小比叶重型;类群Ⅱ生长较快、叶片较大;类群Ⅲ种质数量最多,属生长缓慢、大比叶重型;类群Ⅳ特征为大叶片、多叶型;类群Ⅴ为小叶片、稀叶型。研究结果表明参试香椿种质变异丰富,遗传多样性水平高,能为良种选育、遗传改良等研究提供丰富的遗传材料。 展开更多
关键词 香椿 表型性状 遗传变异 遗传多样性
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云南变绿红菇的遗传多样性与群体遗传分化研究 认领 被引量:1
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作者 余金凤 陈正启 +2 位作者 周汐 吴素蕊 郭相 《食药用菌》 2020年第3期178-184,共7页
以昆明、曲靖、楚雄、玉溪、昭通、临沧、大理等7个变绿红菇地理居群的30个子实体样本为试验材料,基于ITS序列和LSU序列,对其分子变异、遗传多样性、群体遗传分化进行分析。结果:30个样品中,基于ITS序列检测到18个单倍型,基于LSU序列检... 以昆明、曲靖、楚雄、玉溪、昭通、临沧、大理等7个变绿红菇地理居群的30个子实体样本为试验材料,基于ITS序列和LSU序列,对其分子变异、遗传多样性、群体遗传分化进行分析。结果:30个样品中,基于ITS序列检测到18个单倍型,基于LSU序列检测到10个单倍型;基于ITS序列和LSU序列分别构建的单倍型系统发育树及30个样品的系统发育树显示,各地理居群的遗传距离与地理距离之间没有形成对应关系,二者无明显相关性。基于两个序列的分析结果均显示,各地理居群内单倍型多样性较丰富,而核苷酸多样性低。表明变绿红菇在不同的地理居群中的适应能力强,遗传多样性较低,绝大部分遗传分化来自于个体间的差异。 展开更多
关键词 变绿红菇 ITS LSU 遗传多样性 群体遗传分化
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凡纳滨对虾连续3个世代选育群体的遗传多样性分析 认领
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作者 彭敏 陈慧芳 +7 位作者 李强勇 杨春玲 曾地刚 刘青云 赵永贞 陈晓汉 林勇 陈秀荔 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1442-1450,共9页
【目的】明确凡纳滨对虾连续3个世代选育群体的遗传变异情况及近亲繁殖对个体生长速度和抗病性的影响,为凡纳滨对虾种质改良提供理论依据。【方法】从GenBank收录的微卫星(SSR)引物序列中筛选11对能有效扩增的SSR引物,对2016—2018年桂... 【目的】明确凡纳滨对虾连续3个世代选育群体的遗传变异情况及近亲繁殖对个体生长速度和抗病性的影响,为凡纳滨对虾种质改良提供理论依据。【方法】从GenBank收录的微卫星(SSR)引物序列中筛选11对能有效扩增的SSR引物,对2016—2018年桂海1号凡纳滨对虾连续3个世代选育群体(合计853个样品)进行遗传多样性分析,监测相邻2个世代选育群体间的遗传变异情况。【结果】11对SSR引物在凡纳滨对虾连续3个世代选育群体中共检测到103个等位基因,各SSR位点的等位基因数(Na)平均为9.3636个,有效等位基因数(Ne)平均为3.8355个,观测杂合度(Ho)平均为0.4794,期望杂合度(He)平均为0.7074,多态信息含量(PIC)平均为0.6708;除TUMXLv10.33位点呈中度多态性(0.25<PIC<0.50)外,其余10个SSR位点均为高度多态性。凡纳滨对虾连续3个世代选育群体的平均PIC分别为0.6689、0.6657和0.6650,即均属于高度多态性(PIC>0.50);对应的平均Na为8.7272、7.3636和8.0000个,平均Ne为3.8676、3.7654和3.8010个,平均Ho为0.3975、0.5224和0.4876,平均He为0.7057、0.7057和0.7029。Hardy-Weinberg平衡检测结果显示,绝大部分SSR位点偏离Hardy-Weinberg平衡。凡纳滨对虾连续3个世代选育群体在11个SSR位点上的遗传分化系数(Fst)均小于0.0500,即凡纳滨对虾群体的遗传分化很小;凡纳滨对虾群体内近交系数(Fis)介于-0.0101~0.8098,平均为0.3543,且除C11654位点为负值外,其余SSR位点均为正值,表明凡纳滨对虾连续3个世代选育群体的近交程度较高。分子方差分析(AMOVA)结果显示,69.78%的遗传变异来源于凡纳滨对虾个体内,而29.96%的变异来源于凡纳滨对虾个体间。【结论】桂海1号凡纳滨对虾各世代选育群体尚具有较丰富的遗传变异,但群体遗传结构处于不稳定状态。因此,今后应通过人工选育方式保留有利突变、淘汰有害突变,同时避免近亲繁殖,或引进优质品种进行杂交以扩 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 选育群体 微卫星(SSR)分子标记 遗传多样性 遗传变异
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小叶锦鸡儿天然居群叶形态性状变异研究 认领
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作者 艾喆 徐婷婷 +1 位作者 周兆娜 马飞 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期1595-1604,共10页
为揭示小叶锦鸡儿(Caragana microphylla)天然居群叶形态性状的变异规律及其生态适应性特征,该研究以10个小叶锦鸡儿天然居群为对象,通过多重比较、巢式方差分析、相关性分析、聚类分析和主成分分析等方法,对7个叶形态性状进行分析。结... 为揭示小叶锦鸡儿(Caragana microphylla)天然居群叶形态性状的变异规律及其生态适应性特征,该研究以10个小叶锦鸡儿天然居群为对象,通过多重比较、巢式方差分析、相关性分析、聚类分析和主成分分析等方法,对7个叶形态性状进行分析。结果表明:(1)小叶锦鸡儿叶形态性状在居群内和居群间均存在极显著差异(P<0.01),平均变异系数为10.13%,不同性状的变异幅度为6.23%~12.78%;平均叶形态性状的表型分化系数为43.62%,居群内变异(30.09%)大于居群间变异(24.91%),说明居群内是其叶形态性状变异的主要来源。(2)相关性分析表明,环境因子对小叶锦鸡儿的叶形态性状变异有很大的影响,在地理空间上主要呈现出沿海拔梯度的变异模式;主成分分析的结果显示,小叶宽、叶柄宽和叶柄长对小叶锦鸡儿叶形态变异起主导作用;利用欧式距离对小叶锦鸡儿居群进行UPGMA聚类分析结果显示,基于叶形态性状和环境因子可分别将小叶锦鸡儿10个居群分为3类和2类,Mantel检验结果表明,小叶锦鸡儿的叶形态性状变异不存在地理连续性。研究结果为小叶锦鸡儿的适应性进化和开发利用提供了理论依据。 展开更多
关键词 小叶锦鸡儿 天然居群 叶形态变异 环境因子 遗传变异
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山羊基因组与遗传变异图谱研究进展 认领
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作者 李晓凯 范一星 +11 位作者 乔贤 张磊 王凤红 王志英 王瑞军 张燕军 刘志红 王志新 何利兵 李金泉 苏蕊 张家新 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期175-184,共10页
高通量测序技术和生物信息学的发展极大的促进了山羊分子生物学研究。山羊参考基因组的不断完善以及基因组重测序技术的应用,在全基因组水平上发现了大量的遗传变异信息(SNP、Indel和CNV),丰富了山羊分子群体遗传学研究利用的分子标记... 高通量测序技术和生物信息学的发展极大的促进了山羊分子生物学研究。山羊参考基因组的不断完善以及基因组重测序技术的应用,在全基因组水平上发现了大量的遗传变异信息(SNP、Indel和CNV),丰富了山羊分子群体遗传学研究利用的分子标记。综述了山羊参考基因组组装和全基因组变异图谱的构建及其在山羊上的研究进展,以期为进一步利用分子遗传标记进行山羊的各种性状的遗传基础研究和遗传资源保护利用提供科学依据和参考。 展开更多
关键词 山羊 参考基因组 遗传变异 单核苷酸多态性 插入缺失 拷贝数变异
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高寒地区钙果叶片表形特征差异分析 认领
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作者 张巍 刘运伟 +2 位作者 徐宜彬 李阳 任伟超 《森林工程》 2020年第5期40-44,共5页
针对从吉林引进的钙果在小兴安岭伊春地区的栽培试验,通过分析叶片表形特征,对钙果在高寒地区的表形多样性表现进行探讨,为优选、改良寒地浆果类品种及开发利用提供技术支持。本文采用露地栽培和塑料大棚栽培两种设计,结合叶长、叶宽和... 针对从吉林引进的钙果在小兴安岭伊春地区的栽培试验,通过分析叶片表形特征,对钙果在高寒地区的表形多样性表现进行探讨,为优选、改良寒地浆果类品种及开发利用提供技术支持。本文采用露地栽培和塑料大棚栽培两种设计,结合叶长、叶宽和叶面积等调查数据,对钙果叶片的比叶面积、遗传变异系数和叶片干物质含量等指标进行分析。结果表明,定植后的钙果叶片表形性状变异幅度为21.87%~34.44%,各品系均表现出较为丰富的遗传变异特征,这与环境因子的差异有直接关系。在不同立地条件下,不同品系表现出了不同的遗传程度,表现最为明显的是钙果4号品系。结论:在引进伊春地区后,钙果不同品系间遗传丰富度差异确实存在;各品系表形特征产生的差异性均取决于环境因子;而各品系遗传活跃度相近也证明了钙果品系内遗传性状相对稳定。 展开更多
关键词 钙果 叶片变异 表形差异 遗传变异
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蒙古莸叶片解剖结构的地理种源变异及其对环境变化响应的意义 认领
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作者 纪若璇 于笑 +5 位作者 常远 沈超 白雪卡 夏新莉 尹伟伦 刘超 《植物生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期277-286,共10页
长期受到生长环境影响而形成的遗传变异对植物生长发育有着显著的影响。叶片是植物对环境变化最敏感的器官,了解叶片解剖结构在不同环境中产生的适应性变异是探索植物对环境适应的基础。同质园试验是研究遗传与环境因素对植物生长代谢... 长期受到生长环境影响而形成的遗传变异对植物生长发育有着显著的影响。叶片是植物对环境变化最敏感的器官,了解叶片解剖结构在不同环境中产生的适应性变异是探索植物对环境适应的基础。同质园试验是研究遗传与环境因素对植物生长代谢等影响的一种有效方法,该研究利用同质园试验排除了环境梯度的影响,通过常规石蜡切片、多重比较、相关性分析、一般线性模型分析等方法,对7个不同种源地的蒙古莸(Caryopteris mongholica)叶片解剖结构及其影响因素进行了定量比较。结果表明,7个种源地的蒙古莸叶片均为等面叶,无海绵组织分化,其上表皮细胞较下表皮细胞厚,上栅栏组织较下栅栏组织厚;叶片各解剖结构参数间存在显著的自相关性,不同种源叶片解剖结构存在显著差异:随种源地年平均气温升高,叶厚度、栅栏组织厚度呈增大趋势,其中,最西南部的阿左旗种源蒙古莸叶片的上下栅栏组织、叶厚度及叶片结构紧密度值均最大,表现出明显的抗旱特征。种源地经纬度、气温、降水等对解剖结构指标有显著的影响,其解释程度为34.09%–81.43%。同质园试验说明,种源地气候差异驱动的遗传变异是引起不同种源叶片解剖结构差异的重要因素。 展开更多
关键词 蒙古莸 同质园 叶片 解剖结构 种源 遗传变异
3株临床分离的猪流行性腹泻病毒S基因克隆及序列分析 认领 被引量:1
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作者 张辛铭 杨顺利 +4 位作者 马雪婷 曹钰莹 何雪阳 蔡建平 尹双辉 《动物医学进展》 北大核心 2020年第7期16-20,共5页
对临床分离鉴定的3株猪流行性腹泻病毒(PEDV)的S基因进行克隆及序列分析,对丰富我国PEDV的遗传衍化特征具有重要意义。S基因序列分析发现,JX18毒株与CV777亲缘关系较近,核苷酸同源性为99.71%,氨基酸同源性95.7%,属于G1-b进化分支。JX18... 对临床分离鉴定的3株猪流行性腹泻病毒(PEDV)的S基因进行克隆及序列分析,对丰富我国PEDV的遗传衍化特征具有重要意义。S基因序列分析发现,JX18毒株与CV777亲缘关系较近,核苷酸同源性为99.71%,氨基酸同源性95.7%,属于G1-b进化分支。JX18毒株与CV777经典毒株S蛋白氨基酸序列相比较,不存在氨基酸的插入或缺失,在中和表位区及已鉴定抗原表位区仅有一处氨基酸突变。SD18、JingTai18与PEDV CV777亲缘关系较远,核苷酸同源性分别为93.64%和92.64%,S蛋白氨基酸序列同源性分别为93%和93.5%。SD18和JingTai18位于G2-b进化分支。SD18与JingTai18株与CV777经典毒株相比,S蛋白氨基酸序列中存在插入缺失及多位点的氨基酸突变。研究结果为进一步了解我国PEDV流行及变异情况提供了数据支持。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 S基因 生物信息学分析 遗传变异
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薏苡组培快繁技术及遗传变异研究 认领
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作者 王兰兰 徐剑 +1 位作者 赵德刚 赵懿琛 《种子》 北大核心 2020年第6期31-36,共6页
薏苡(Coix Lacryma-jobi L.)为禾本科药食兼用作物,具有较高的营养及药用价值。本研究以贵州省地方薏苡品种兴仁小白壳为材料,以芽顶端分生组织为外植体,探究外植体最佳消毒条件、最佳丛生芽增殖培养基、生根培养基配方以及适合幼苗移... 薏苡(Coix Lacryma-jobi L.)为禾本科药食兼用作物,具有较高的营养及药用价值。本研究以贵州省地方薏苡品种兴仁小白壳为材料,以芽顶端分生组织为外植体,探究外植体最佳消毒条件、最佳丛生芽增殖培养基、生根培养基配方以及适合幼苗移栽成活的基质配比,并采用SSR分子标记技术对继代兴仁小白壳组培苗进行遗传变异分析。结果表明:兴仁小白壳茎尖最佳消毒条件为75%酒精消毒30 s、0.2%升汞处理7 min,最佳增殖培养基为MS+0.5 mg·L^-1 NAA+9 mg·L^-16-BA,增值系数为2.9,最佳生根培养基为1/2 MS+0.5 mg·L^-1 NAA,生根率为100%,移栽条件为V营养土∶V珍珠岩=4∶1时成活率达95%,继代培养6次后的植株与亲本的遗传特性均保持一致。本研究建立的兴仁小白壳组培快繁体系为优质薏苡种质资源的保存提供了技术参考。 展开更多
关键词 薏苡 组培快繁 遗传变异
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