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Population Genomic Analysis and De Novo Assembly Reveal the Origin of Weedy Rice as an Evolutionary Game
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作者 Jian Sun Dianrong Ma +18 位作者 Liang Tang Minghui Zhao Guangchen Zhangh Wenjia Wang Jiayu Song Xiang Li Zimeng Liu Wenxing Zhang Quan Xu Yuncheng Zhou Jianzhong Wu Toshio Yamamoto Fei Dai Yan Lei Song Li Gang Zhou Hongkun Zheng Zhengjin Xu Wenfu Chen 《分子植物:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第5期632-647,共16页
Crop weediness,especially that of weedy rice(Oryza sativa f.spontanea),remains mysterious.Weedy rice possesses robust ecological adaptability;however,how this strain originated and gradually formed proprietary genetic... Crop weediness,especially that of weedy rice(Oryza sativa f.spontanea),remains mysterious.Weedy rice possesses robust ecological adaptability;however,how this strain originated and gradually formed proprietary genetic features remains unclear?Here,we demonstrate that weedy rice at Asian high latitudes(WRAH)is phylogenetically well defined and possesses unselected genomic characteristics in many divergence regions between weedy and cultivated rice.We also identified novel quantitative trait loci underlying weedy-specific traits,and revealed that a genome block on the end of chromosome 1 is associated with rice weediness.To identify the genomic modifications underlying weedy rice evolution,we generated the first de novo assembly of a high-quality weedy rice genome(WR04-6),and conducted a comparative genomics study between WR04-6 with other rice reference genomes.Multiple lines of evidence,including the results of demographic scenario comparisons,suggest that differentiation between weedy rice and cultivated rice was initiated by genetic improvement of cultivated rice and that the essence of weediness arose through semi-domestication.A plant height model further implied that the origin of WRAH can be modeled as an evolutionary game and indicated that strategy-based selection driven by fitness shaped its genomic diversity. 展开更多
关键词 weedy rice POPULATION GENOMICS de novo assembly COMPARATIVE GENOMICS EVOLUTIONARY GAME
Host-Pathogen Wars: New Weapons from Biotechnology and Genomics 预览
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作者 Mychele B. da Silva Richard F. Davis +3 位作者 Andrew H. Paterson Nelson Dias Suassuna Shavannor M. Smith Peng W. Chee 《美国植物学期刊(英文)》 2019年第3期402-416,共15页
Pathogens are imminent threats to crop production. Among the management tools available to protect crops from diseases, the use of host-plant resistance had been hindered by a lack of tools and resources to identify r... Pathogens are imminent threats to crop production. Among the management tools available to protect crops from diseases, the use of host-plant resistance had been hindered by a lack of tools and resources to identify resistance genes (R-genes). Genomic technologies have empowered acquisition of a new level and quality of information on plant-pathogen interactions. Next generation sequencing, differential transcriptome analysis, gene editing, and use of bioinformatics have greatly expanded the numbers of R-genes identified, enriched understanding of R-avirulence gene interactions, and disease diagnosis. In this review, we highlight the application of genomic technologies to identification of pathogen machinery for future improvement of host plant resistance. 展开更多
关键词 HOST-PLANT Resistance R-Genes GENOMICS CROP Improvement
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A Chromosome-Scale Genome Assembly of Paper Mulberry(Bmussonetia papyrifera)Provides New Insights into Its Forage and Papermaking Usage
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作者 Xianjun Peng Hui Liu +21 位作者 Peilin Chen Feng Tang Yanmin Hu Fenfen Wang Zhi Pi Meiling Zhao Naizhi Chen Hui Chen Xiaokang Zhang Xueqing Yan Min Liu Xiaojun Fu Guofeng Zhao Pu Yao Lili Wang He Dai Xuming Li Wei Xiong Wencai Xu Hongkun Zheng Haiyan Yu Shihua Shen 《分子植物:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第5期661-677,共17页
Paper mulberry(Broussonetia papyrifera)is a well-known woody tree historically used for Cai Lun papermaking,one of the four great inventions of ancient China.More recently,Paper mulberry has also been used as forage t... Paper mulberry(Broussonetia papyrifera)is a well-known woody tree historically used for Cai Lun papermaking,one of the four great inventions of ancient China.More recently,Paper mulberry has also been used as forage to address the shortage of feedstuff because of its digestible crude fiber and high protein contents.In this study,we obtained a chromosome-scale genome assembly for Paper mulberry using integrated approaches,including Illumina and PacBio sequencing platform as well as Hi-C,optical,and genetic maps.The assembled Paper mulberry genome consists of 386.83 Mb,which is close to the estimated size,and 99.25%(383.93 Mb)of the assembly was assigned to 13 pseudochromosomes.Comparative genomic analysis revealed the expansion and contraction in the flavonoid and lignin biosynthetic gene families,respectively,accounting for the enhanced flavonoid and decreased lignin biosynthesis in Paper mulberry.Moreover,the increased ratio of syringyl-lignin to guaiacyl-lignin in Paper mulberry underscores its suitability for use in medicine,forage,papermaking,and barkcloth making.We also identified the rootassociated microbiota of Paper mulberry and found that Pseudomonas and Rhizobia were enriched in its roots and may provide the source of nitrogen for its stems and leaves via symbiotic nitrogen fixation.Collectively,these results suggest that Paper mulberry might have undergone adaptive evolution and recruited nitrogen-fixing microbes to promote growth by enhancing flavonoid production and altering lignin monomer composition.Our study provides significant insights into genetic basis of the usefulness of Paper mulberry in papermaking and barkcloth making,and as forage.These insights will facilitate further domestication and selection as well as industrial utilization of Paper mulberry worldwide. 展开更多
关键词 FORAGE PLANT barkcloth making nitrogen fixation comparative GENOMICS GENOMICS plant-microbe interactio ns
基于文献计量的昆虫基因组研究发展态势浅析
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作者 孙勇 李美 +3 位作者 孟丽君 李小杰 曾晔临 钱万强 《中国基础科学》 2019年第2期51-58,共8页
自2000年黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)基因组公布以来,昆虫基因组学得到了快速发展并为昆虫学的研究思路和方法带来了革命性转变。本文以昆虫基因组学相关的中外文献与专利为研究基础,利用文献计量学和信息可视化方法,分析了近年... 自2000年黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)基因组公布以来,昆虫基因组学得到了快速发展并为昆虫学的研究思路和方法带来了革命性转变。本文以昆虫基因组学相关的中外文献与专利为研究基础,利用文献计量学和信息可视化方法,分析了近年来农业昆虫基因组学研究的发展态势,综述了全球及我国昆虫基因组领域SCI论文及专利的发展趋势,并对我国昆虫基因组学研究发展提出了建议与展望。 展开更多
关键词 昆虫 基因组学 文献计量 发展趋势
Recent Progress on Functional Genomics Research of Enterovirus 71
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作者 Huiqiang Wang Yuhuan Li 《中国病毒学:英文版》 CAS CSCD 2019年第1期9-21,共13页
Enterovirus 71(EV71) is one of the main pathogens that causes hand-foot-and-mouth disease(HFMD). HFMD caused by EV71 infection is mostly self-limited;however, some infections can cause severe neurological diseases, su... Enterovirus 71(EV71) is one of the main pathogens that causes hand-foot-and-mouth disease(HFMD). HFMD caused by EV71 infection is mostly self-limited;however, some infections can cause severe neurological diseases, such as aseptic meningitis, brain stem encephalitis, and even death. There are still no effective clinical drugs used for the prevention and treatment of HFMD. Studying EV71 protein function is essential for elucidating the EV71 replication process and developing anti-EV71 drugs and vaccines. In this review, we summarized the recent progress in the studies of EV71 noncoding regions(50 UTR and 30 UTR) and all structural and nonstructural proteins, especially the key motifs involving in viral infection, replication, and immune regulation. This review will promote our understanding of EV71 virus replication and pathogenesis, and will facilitate the development of novel drugs or vaccines to treat EV71. 展开更多
关键词 ENTEROVIRUS 71 (EV71) FUNCTIONAL GENOMICS Structural PROTEIN Nonstructural PROTEIN VIRAL PROTEIN function
基于文献计量的农作物基因组研究领域发展态势分析 预览
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作者 袁雪 钱万强 +2 位作者 郭溪川 卢垚 颜蕴 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期118-128,共11页
基因组学研究是近年来世界上发展最为迅速的研究领域之一。农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。目前国内外科学家已经对诸如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花等重要农作物... 基因组学研究是近年来世界上发展最为迅速的研究领域之一。农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。目前国内外科学家已经对诸如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花等重要农作物的基因组进行了测序,并在此基础上克隆和鉴定了控制重要农艺性状的基因。科技文献客观地记录了各个学科或知识领域的发展概貌,基于文献计量学的学科发展态势分析,可以系统地总结领域研究现状与热点问题、评价研究机构科研实力与成果产出。本研究综合利用文献定量分析和专家定性分析相结合的方法,通过对中美自然科学基金项目资助情况及SCI论文收录文献多维度、深层次的计量分析,全面揭示近10年农作物基因组领域的研发现状、重要国家、重要机构和热门研究主题,相关研究结果可为我国相关领域未来的研发布局和决策提供参考依据。 展开更多
关键词 农作物 基因组 文献计量
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果树育种40 年回顾与展望 预览 被引量:3
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作者 邓秀新 王力荣 +7 位作者 李绍华 张绍铃 张志宏 丛佩华 易干军 陈学森 陈厚彬 钟彩虹 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期514-520,共7页
改革开放以来,我国果树遗传改良与品种选育研究取得长足进展。据不完全统计,主要的11种果树选育了1968个品种(含砧木),有力支撑了我国果树产业的快速发展,为我国果树实现鲜果供应期延长、品质提升、栽培模式改变提供了保障。细胞工程技... 改革开放以来,我国果树遗传改良与品种选育研究取得长足进展。据不完全统计,主要的11种果树选育了1968个品种(含砧木),有力支撑了我国果树产业的快速发展,为我国果树实现鲜果供应期延长、品质提升、栽培模式改变提供了保障。细胞工程技术广泛应用于果树遗传改良,分子标记开始在育种中应用,提高了育种效率。我国果树基因组学研究发展迅速,进入世界先进行列。培育多样化品种满足不同用途和不同人群的需求,以及培育抗性好、适合省力化栽培的品种将是未来果树品种发展的方向。 展开更多
关键词 果树 遗传改良 品种 生物技术 组学
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精准医学时代骨肉瘤诊疗的研究进展 预览
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作者 陈祉璇 姜亚飞 +1 位作者 华莹奇 蔡郑东 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2019年第17期914-918,共5页
随着组学技术和大数据技术的不断发展和成熟,精准医学在肿瘤领域取得了许多引人注目的成果。骨肉瘤多发于儿童和青少年,是最常见的骨骼系统原发性恶性肿瘤。自20世纪70年代至今,手术切除和药物化疗一直是骨肉瘤的主要治疗手段,高度基因... 随着组学技术和大数据技术的不断发展和成熟,精准医学在肿瘤领域取得了许多引人注目的成果。骨肉瘤多发于儿童和青少年,是最常见的骨骼系统原发性恶性肿瘤。自20世纪70年代至今,手术切除和药物化疗一直是骨肉瘤的主要治疗手段,高度基因异质性是其生存率停滞的主要原因。精准医学以组学等技术为基础,根据患者的生物学特征进行精确的诊断和治疗方案的定制。精准医学的实践有望为骨肉瘤研究及患者生存率提高提供新的契机。本文拟对精准医学在骨肉瘤治疗中的研究进展作一系统综述,并进一步探讨骨肉瘤精准治疗的前景和方向。 展开更多
关键词 精准医学 骨肉瘤 基因组学 异种移植模型 肿瘤免疫
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铁皮石斛基因组学、转录组学与功能基因研究进展
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作者 詹忠根 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第16期3979-3989,共11页
铁皮石斛Dendrobium officinale是兰科石斛属药用植物中最为珍稀名贵的物种,内含多糖、茋类、联苄类、生物碱类等化学成分,具有抗氧化、抗肿瘤、增强免疫力、减轻肝损伤、降血糖等功效。其巨大的药用价值、科学价值和商业价值掀起了相... 铁皮石斛Dendrobium officinale是兰科石斛属药用植物中最为珍稀名贵的物种,内含多糖、茋类、联苄类、生物碱类等化学成分,具有抗氧化、抗肿瘤、增强免疫力、减轻肝损伤、降血糖等功效。其巨大的药用价值、科学价值和商业价值掀起了相关研究热潮,尤其是近5年,铁皮石斛在核酸分子生物学方面的研究取得了越来越多的成果。从铁皮石斛基因组学研究、转录组学研究和功能基因克隆等方面的研究进展进行综述,以期为铁皮石斛功能基因的进一步深入研究提供参考。 展开更多
关键词 铁皮石斛 基因组学 转录组学 功能基因 克隆
川崎病体外研究现状 预览
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作者 郑小兰 吴刚 +2 位作者 张怡 华益民 周开宇 《中华妇幼临床医学杂志(电子版)》 CAS 2019年第4期468-471,共4页
川崎病(Kawasaki disease)是一种主要发生在5岁以下婴幼儿的全身中小动脉血管炎,是发达国家儿童获得性心脏病的最常见病因。临床对于川崎病的发病机制迄今尚未阐明。随着近年分子生物学技术的发展,对川崎病的研究取得很大进步。笔者拟... 川崎病(Kawasaki disease)是一种主要发生在5岁以下婴幼儿的全身中小动脉血管炎,是发达国家儿童获得性心脏病的最常见病因。临床对于川崎病的发病机制迄今尚未阐明。随着近年分子生物学技术的发展,对川崎病的研究取得很大进步。笔者拟从基因组学、蛋白质组学、外泌体3个方面,对川崎病的体外研究现状进行阐述。 展开更多
关键词 黏膜皮肤淋巴结综合征 冠状动脉瘤 基因组学 蛋白质组学 外泌体 免疫球蛋白类 静脉内 儿童
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入侵害虫美国白蛾综合防治研究概述 预览
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作者 闻鸣 王寅亮 任炳忠 《安徽农学通报》 2019年第5期65-69,共5页
美国白蛾(Hyphantria cunea)是一种重要的入侵害虫,近年来在我国多个地区爆发,对农林业造成巨大的经济损失。该文对美国白蛾的种群特点和分布、基因组学、性信息素研究以及生物防治等方面的研究现状作了简要综述,以期为其防治研究提供... 美国白蛾(Hyphantria cunea)是一种重要的入侵害虫,近年来在我国多个地区爆发,对农林业造成巨大的经济损失。该文对美国白蛾的种群特点和分布、基因组学、性信息素研究以及生物防治等方面的研究现状作了简要综述,以期为其防治研究提供参考。 展开更多
关键词 美国白蛾 基因组学 性信息素 周氏啮小蜂 核型多角体病毒
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Multispecies hybridization in birds 预览
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作者 Jente Ottenburghs 《鸟类学研究:英文版》 CSCD 2019年第3期239-249,共11页
Hybridization is not always limited to two species;often multiple species are interbreeding. In birds, there are numerous examples of species that hybridize with multiple other species. The advent of genomic data prov... Hybridization is not always limited to two species;often multiple species are interbreeding. In birds, there are numerous examples of species that hybridize with multiple other species. The advent of genomic data provides the oppotunity to investigate the ecological and evolutionary consequences of multispecies hybridization. The interactions between several hybridizing species can be depicted as a network in which the interacting species are connected by edges. Such hybrid networks can be used to identify ‘hub-species’ that interbreed with multiple other species. Avian examples of such ‘hub-species’ are Common Pheasant (Phasianus colchicus), Mallard (Anas platyrhynchos) and European Herring Gull (Larus argentatus). These networks might lead to the formulation of hypotheses, such as which connections are most likely conducive to interspecific gene flow (i.e. introgression). Hybridization does not necessarily result in introgression. Numerous statistical tests are available to infer interspecific gene flow from genetic data and the majority of these tests can be applied in a multispecies setting. Specifically, model-based approaches and phylogenetic networks are promising in the detection and characterization of multispecies introgression. It remains to be determined how common multispecies introgression in birds is and how often this process fuels adaptive changes. Moreover, the impact of multispecies hybridization on the build-up of reproductive isolation and the architecture of genomic landscapes remains elusive. For example, introgression between certain species might contribute to increased divergence and reproductive isolation between those species and other related species. In the end, a multispecies perspective on hybridization in combination with network approaches will lead to important insights into the history of life on this planet. 展开更多
关键词 Adaptation ADMIXTURE Genomics INTROGRESSION Network analysis PHYLOGENETICS SPECIATION
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First complete genome sequence in Arborophila and comparative genomics reveals the evolutionary adaptation of Hainan Partridge (Arborophila ardens) 预览
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作者 Chuang Zhou Shuai Zheng +5 位作者 Xue Jiang Wei Liang Megan Price Zhenxin Fan Yang Meng Bisong Yue 《鸟类学研究:英文版》 CSCD 2019年第1期63-70,共8页
Background:The Hainan Partridge (Arborophila ardens,Phasianidae,Galliformes) is an endemic species of Hainan Island,China,and it is classified as globally vulnerable species.There are at least 16 species in genus Arbo... Background:The Hainan Partridge (Arborophila ardens,Phasianidae,Galliformes) is an endemic species of Hainan Island,China,and it is classified as globally vulnerable species.There are at least 16 species in genus Arborophila and no genome sequence is available.Methods:The whole genome of Hainan Partridge was de novo sequenced (with shotgun approach on the Illumina 2000 platform) and assembled.Results:The genome size of Arborophila ardens is about 1.05 Gb with a high N50 scaffold length of 8.28 Mb and it is the first high quality genome announced in Arborophila genus.About 9.19% of the genome was identified as repeat sequences and about 5.88 million heterozygous SNPs were detected.A total of 17,376 protein-coding genes were predicted and their functions were annotated.The genome comparison between Hainan Partridge and Red Junglefowl (Gallus gallus) demonstrated a conserved genome structure.The phylogenetic analysis indicated that the Hainan Partridge possessed a basal phylogenetic position in Phasianidae and it was most likely derived from a common ancestor approximately 36.8 million years ago (Mya).We found that the Hainan Partridge population had experienced bottleneck and its effective population decreased from about 1,040,000 individuals 1.5 Mya to about 200,000 individuals 0.2 Mya,and then recovered to about 460,000 individuals.The number of 1:1 orthologous genes that were predicted to have undergone positive selection in the Hainan Partridge was 504 and some environmental adaptation related categories,such as response to ultraviolet radiation were represented in GO distribution analysis.Conclusions:We announced the first high quality genome in Arborophila genus and it will be a valuable genomic resource for the further studies such as evolution,adaption,conservation,not only on Hainan Partridge but also on Arborophila or Phasianidae species. 展开更多
关键词 HAINAN Partridge Arborophila ardens COMPARATIVE GENOMICS POSITIVE selection
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群发7型腺病毒肺炎42例临床特点及基因组学分析
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作者 李小芳 席雯 +15 位作者 王媛媛 王秀琴 赵娜 王海娟 吴涛 杨建昌 张国林 张立勇 赵佳丽 杨爱龙 宁元元 刘艳楠 平杰 高占成 童贻刚 田桂珍 《中华结核和呼吸杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期206-212,共7页
目的探讨7型腺病毒肺炎患者的临床表现及7型腺病毒株(CHN/BeiJing/2018)的基因组学特征。方法收集2017年10月27日至2018年2月28日北京某兵营群发性7型腺病毒肺炎病例42例,均为男性,年龄20~25岁,平均(21±2)岁。收集BALF并用试剂盒... 目的探讨7型腺病毒肺炎患者的临床表现及7型腺病毒株(CHN/BeiJing/2018)的基因组学特征。方法收集2017年10月27日至2018年2月28日北京某兵营群发性7型腺病毒肺炎病例42例,均为男性,年龄20~25岁,平均(21±2)岁。收集BALF并用试剂盒提取其中的腺病毒DNA,进行病毒全基因组测序,将所得序列与国内外已知流行株进行在线比对。应用Mega 6.0软件基于A~F腺病毒不同亚属全基因组绘制系统进化树并进行相关分析。结果42例中38例表现为流感样症状,36例发热,41例咳嗽,38例咳痰,12例出现胸痛,5例合并化脓性扁桃体炎。4例出现一过性痰中带血,3例出现喘息,肺部体检无明显阳性体征,仅3例肺部可闻及湿性啰音;8例患者肌酸激酶明显升高(肌酸激酶>400 U/L),经治疗后均恢复正常。4例合并低氧血症,动脉血氧分压<80 mmHg(1mmHg=0.133 kPa),未出现呼吸衰竭和急性呼吸窘迫综合征病例。胸部影像学可见斑片状渗出或实变影,双肺各叶段均可受累,以肺下叶多见。10例合并流感病毒感染,32例合并非典型病原体感染。本次分离株基因组与国内外已知流行株(19BOVLB/Volg ograd/Rus/2014及0901HZ/ShX/CHN/2009)基因组覆盖率为100%,同源性为99%,基因片段无明显插入或缺失,未见关键位点碱基突变;进化分析提示该病毒株与2012年湖北荆门分离的7型腺病毒株亲缘关系最近。结论7型腺病毒肺炎临床主要表现为轻型肺炎,呈自限性,对症治疗后多数患者预后良好。引起本次腺病毒肺炎的7型腺病毒流行株与其他国内外流行株基因组相比无明显突变,提示7型腺病毒可以在外界环境中长期存在,导致散发病例或在小范围内流行。 展开更多
关键词 腺病毒科 肺炎 基因组学
冬虫夏草生物学及生态学研究中的关键科学问题研究进展 预览
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作者 徐梦 徐明 李仁强 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1853-1862,共10页
冬虫夏草是一种具有极高药用和食用价值的珍稀菌类,其生物学特性和可持续发展关键技术一直是冬虫夏草研究关注的重点。总结了冬虫夏草生物学及生态学中的几个重要科学问题,包括冬虫夏草菌侵染蝙蝠蛾幼虫的途径及机制、冬虫夏草菌子实体... 冬虫夏草是一种具有极高药用和食用价值的珍稀菌类,其生物学特性和可持续发展关键技术一直是冬虫夏草研究关注的重点。总结了冬虫夏草生物学及生态学中的几个重要科学问题,包括冬虫夏草菌侵染蝙蝠蛾幼虫的途径及机制、冬虫夏草菌子实体形成及生长过程中的关键调控因子、冬虫夏草菌遗传多样性及基因组学研究、天然冬虫夏草及其微环境中的微生物群落组成、全球变暖背景下未来青藏高原地区的气候变化对冬虫夏草资源的影响等的研究进展,并分析了现有研究中尚未明确和不足之处。未来在冬虫夏草生物学及生态学的研究中,需要利用和研发更加先进的观测设备及试验方法,以实现天然冬虫夏草发生发育的原位观测和机理研究;充分利用冬虫夏草人工培植技术,结合分子生物学研究,从基因水平上揭示冬虫夏草菌生态适应性及侵染蝙蝠蛾幼虫的机理;建立冬虫夏草科学研究基地,开展长期定位观测试验并结合生态学模型构建明确未来气候变化对冬虫夏草资源的影响,以期进一步深入冬虫夏草生物学和生态学研究、推进我国冬虫夏草资源的合理利用及可持续发展的政策制定。 展开更多
关键词 冬虫夏草菌 发生发育 遗传多样性 基因组学 微生物群落 气候变化 可持续利用
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猪等孢球虫研究进展 预览
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作者 戚南山 康桦华 +7 位作者 林栩慧 吴彩艳 吕敏娜 李娟 胡俊菁 肖文婉 廖申权 孙铭飞 《动物医学进展》 北大核心 2019年第6期88-91,共4页
猪等孢球虫是一种能引起仔猪球虫病的专性寄生性原虫,可引起仔猪严重腹泻甚至死亡,其发病率可高达50%~75%,病死率高达75%,呈世界性流行,严重危害养猪业发展。目前对仔猪球虫病的防控主要以药物预防为主,随着耐药虫株的不断产生及公众对... 猪等孢球虫是一种能引起仔猪球虫病的专性寄生性原虫,可引起仔猪严重腹泻甚至死亡,其发病率可高达50%~75%,病死率高达75%,呈世界性流行,严重危害养猪业发展。目前对仔猪球虫病的防控主要以药物预防为主,随着耐药虫株的不断产生及公众对药物残留的高度关注,使得这一防控手段面临巨大挑战,新型抗猪球虫药物、疫苗及其他防控手段亟待研究开发。论文对猪等孢球虫的生活史、基因组学、免疫学及其与其他微生物的互作关系等方面进行综述,以期为仔猪球虫病的综合防控提供参考。 展开更多
关键词 猪等孢球虫 生活史 免疫学 基因组学 相互作用
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生物转化技术制备稀有人参皂苷的研究进展 预览
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作者 刘蓉 许盼盼 +1 位作者 李仕琳 张伟 《特产研究》 2019年第2期114-117,共4页
人参皂苷是人参提取物中重要的活性成分,稀有人参皂苷由于具有抗肿瘤等特殊活性而其药用价值更高。稀有人参皂苷的生物转化制备近年来取得了一些重要的研究成果。总结了近年来稀有人参皂苷生物转化技术的研究成果,并对生物转化手段制备... 人参皂苷是人参提取物中重要的活性成分,稀有人参皂苷由于具有抗肿瘤等特殊活性而其药用价值更高。稀有人参皂苷的生物转化制备近年来取得了一些重要的研究成果。总结了近年来稀有人参皂苷生物转化技术的研究成果,并对生物转化手段制备稀有皂苷的方法进行了总结,对未来稀有皂苷的制备及应用进行了展望。 展开更多
关键词 稀有人参皂苷 生物转化 基因组学 制备
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两栖爬行动物的高海拔适应性演化:现状与展望
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作者 高伟 付婷婷 车静 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2019年第4期345-360,共16页
高海拔极端环境具有低温、低氧、强紫外等特点,加之复杂的地质历史、独特的地形地貌等环境因素,为开展生物适应性演化研究提供了天然实验室.作为变温动物(poikilotherm)的代表类群,两栖爬行动物是高海拔生物区系中重要的组成部分,已知... 高海拔极端环境具有低温、低氧、强紫外等特点,加之复杂的地质历史、独特的地形地貌等环境因素,为开展生物适应性演化研究提供了天然实验室.作为变温动物(poikilotherm)的代表类群,两栖爬行动物是高海拔生物区系中重要的组成部分,已知物种最高海拔分布可达5300 m.前期研究显示两栖爬行动物代表物种在生理、形态及生活史等方面进化出一系列表型特征,以适应高海拔环境.近年来,随着新一代测序技术的发展,从基因组水平探讨高海拔适应的分子机制成为可能,并取得了突破性进展,尤其是青藏高原地区代表性两栖爬行动物基因组的解析,标志着两栖爬行动物适应性演化研究进入了一个新的时代.本文总结分析了目前表型研究已取得的成果,重点分析和讨论了分子机制的研究进展.展望未来,以下几个方面研究将是发展的重点:表型组学(phenomics)的建立;表型组和基因组(genomics)的关联分析;遗传变异的功能分析及实验体系的建立.高海拔适应性研究已成为两栖爬行动物适应性演化研究领域的开拓性工作和范例. 展开更多
关键词 两栖动物 爬行动物 高海拔适应 变温动物 表型组 基因组
组学技术及其在微藻研究中的应用 预览
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作者 武彩霞 魏薇 +4 位作者 刘进军 王静 顾嘉琦 杨翠军 兰金苹 《河北北方学院学报:自然科学版》 2019年第7期57-64,共8页
微藻是最有前景的生物原料及对环境友好的生物能源提供者。近年来,微藻与组学技术结合探究分子作用机理的研究日益增多。阐述微藻在组学方面的研究进展,分别从基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、细胞组学5大组学方面进行了综述... 微藻是最有前景的生物原料及对环境友好的生物能源提供者。近年来,微藻与组学技术结合探究分子作用机理的研究日益增多。阐述微藻在组学方面的研究进展,分别从基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、细胞组学5大组学方面进行了综述,阐述了组学技术在微藻研究中的应用,并对微藻的研究前景进行了总结与展望,以期进一步认识微藻的生理过程、基因功能、代谢机制及其在产油、制氢、固碳等方面的应用。 展开更多
关键词 微藻 基因组学 转录组学 蛋白质组学 代谢组学 细胞组学
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他汀类药物代谢相关基因检测在心脑血管疾病个体化用药中的作用 预览
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作者 童明宏 丁慧 +3 位作者 蒋银婷 孙寒晓 宣彬彬 盛慧明 《检验医学》 CAS 2019年第6期491-497,共7页
目的探讨他汀类药物代谢相关基因检测在心脑血管疾病患者个体化用药及血脂管理中的作用。方法选取141例心脑血管疾病患者(冠心病72例、脑梗死69例)及70名体检健康者(正常对照组)。检测所有对象血清载脂蛋白A(apo A)、载脂蛋白B(apo B)... 目的探讨他汀类药物代谢相关基因检测在心脑血管疾病患者个体化用药及血脂管理中的作用。方法选取141例心脑血管疾病患者(冠心病72例、脑梗死69例)及70名体检健康者(正常对照组)。检测所有对象血清载脂蛋白A(apo A)、载脂蛋白B(apo B)、载脂蛋白E(apo E)、脂蛋白(a)[Lp(a)]、总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、游离脂肪酸(FFA)水平,同时检测他汀类药物代谢相关基因ABCB1(2677G>T)、ABCB1(3435C>T)和SLCO1B1*5(T>C)单核苷酸多态性(SNP)。在72例冠心病患者中选取41例进行他汀类药物治疗前后基因多态性与血脂水平的相关性分析。结果心脑血管疾病组血清TG、HDL-C、apo A、Lp(a)、FFA水平与正常对照组比较,差异均有统计学意义(P<0.05);冠心病组血清TG、HDL-C、LDL-C、apo A、Lp(a)、FFA水平与正常对照组比较,差异均有统计学意义(P<0.05);脑梗死组血清TG、HDL-C、Lp(a)水平与正常对照组比较,差异均有统计学意义(P<0.05);其他血脂项目各组间比较差异均无统计学意义(P>0.05)。心脑血管疾病组、脑梗死组、冠心病组的基因分型和基因频率分布一致,均为ABCB1(2677G>T)G等位基因频率高于T等位基因频率、ABCB1(3435C>T)C等位基因频率高于T等位基因频率、SLCO1B1*5(T>C)T等位基因频率高于C等位基因频率。41例冠心病患者采用他汀类药物治疗后,血清TG、TC、LDL-C水平明显低于治疗前(P<0.05),血清HDL-C水平明显高于治疗前(P<0.05)。不同基因型患者对他汀类药物的疗效存在明显差异(P<0.05)。结论心脑血管疾病患者血脂水平异常,同一疾病患者的基因多态性存在明显的个体差异。心脑血管疾病患者的药物基因组学检测对指导他汀类药物临床降脂治疗有重要作用。 展开更多
关键词 他汀类药物 基因组学 单核苷酸多态性 冠心病 脑梗死
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