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缺氧缺血损伤新生大鼠大脑海马组织线粒体DNA羟甲基化水平
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作者 彭华 王国新 +2 位作者 林月钰 赵方 周于新 《中国优生与遗传杂志》 2019年第4期416-419,513共5页
目的本研究检测新生大鼠缺氧缺血大脑损伤后海马组织线粒体DNA(Mitochondrial DNA,mtDNA)5-羟甲基胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶甲基化的修饰水平差异。方法采用右颈总动脉血管结扎的方法构建新生大鼠缺氧缺血大脑损伤模型,大鼠模型随机分成3组... 目的本研究检测新生大鼠缺氧缺血大脑损伤后海马组织线粒体DNA(Mitochondrial DNA,mtDNA)5-羟甲基胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶甲基化的修饰水平差异。方法采用右颈总动脉血管结扎的方法构建新生大鼠缺氧缺血大脑损伤模型,大鼠模型随机分成3组,对照组和分别处理24h和48h的大鼠模型。提取各组mtDNA样本并采用化学氧化法结合重亚硫酸盐转的测序技术检测5hmC和5mC的水平。qPCR和Western blot验证5hmC重要调节酶(TET1,TET2及DNMT1)及呈现5hmC修饰差异的基因的mRNA水平。结果解剖发现结扎后24h和48h大鼠模型的后海马部位出现缺血。海马组织mtDNA的oxBS-Seq结果显示模型组24h、48h海马mtDNA的5hmC和5mC的水平高于对照组(P<0.05)。qPCR和Western blot结果显示模型组5hmC重要调节酶TET2,DNMT1的mRNA和蛋白表达水平高于对照组(P<0.05)。此外,mtNDA中呈现5hmC修饰差异的CO1、APT6和ND2基因mRNA表达水平显著高于对照组(P<0.05)。结论新生大鼠缺氧缺血大脑损伤后海马组织线mtDNA的5hmC和5mC含量与正常组织存在差异。线粒体5hmC相关酶和CO1、APT6和ND2的上调提示HIE中5hmC可能与mtDNA中CO1,ATP6和ND2基因的转录调节具有调控作用。 展开更多
关键词 新生儿缺氧缺血性脑病 甲基化 5-羟甲基胞嘧啶 5-甲基胞嘧啶甲基化 海马
山核桃甲基化敏感扩增多态体系的建立与甲基化初步分析 预览
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作者 陈文充 贾宁 +2 位作者 董昂 闫道良 曾燕如 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期468-478,共11页
山核桃Carya cathayensis为浙江省重要的经济树种。近年来细胞生物学及分子标记的研究发现,山核桃中存在无融合生殖,天然群体的多态性不佳,存在印迹数量性状位点(iQTLs)。iQTLs与DNA甲基化有关,而DNA甲基化对生物表观遗传调控起着重要... 山核桃Carya cathayensis为浙江省重要的经济树种。近年来细胞生物学及分子标记的研究发现,山核桃中存在无融合生殖,天然群体的多态性不佳,存在印迹数量性状位点(iQTLs)。iQTLs与DNA甲基化有关,而DNA甲基化对生物表观遗传调控起着重要的作用,是可遗传的生物现象。甲基化敏感扩增多态(MSAP)是基于PCR扩增多态性的DNA甲基化检测方法。在建立山核桃MSAP标记体系的基础上对来自3个天然居群的山核桃单株样品进行了分析。结果表明:山核桃存在甲基化,非甲基化相对水平大于总甲基化相对水平,且两者间差异极显著(Wilcoxon Rank Sum检验P<0.001),内侧胞嘧啶甲基化相对水平远大于半甲基化相对水平,且两者间差异极显著(分子方差分析及邓肯多重比较,P<0.001);天然居群山核桃内侧胞嘧啶甲基化相对水平高,则半甲基化相对水平和非甲基化相对水平则相对较低,反之亦然;居群间存在明显的表观遗传分化,主要变异存在于居群内。此外,山核桃的MSAP体系可用于薄壳山核桃Carya illinoensis,2个物种在位点及位点数上存在差异。图4表5参53。 展开更多
关键词 林木育种学 山核桃 甲基化 甲基化敏感扩增多态性 表观遗传
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Identification of differentially expressed genes regulated by methylation in colon cancer based on bioinformatics analysis 预览
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作者 Yu Liang Cheng Zhang Dong-Qiu Dai 《世界胃肠病学杂志:英文版》 SCIE CAS 2019年第26期3392-3407,共16页
BACKGROUND DNA methylation, acknowledged as a key modification in the field of epigenetics, regulates gene expression at the transcriptional level. Aberrant methylation in DNA regulatory regions could upregulate oncog... BACKGROUND DNA methylation, acknowledged as a key modification in the field of epigenetics, regulates gene expression at the transcriptional level. Aberrant methylation in DNA regulatory regions could upregulate oncogenes and downregulate tumor suppressor genes without changing the sequences.However, studies of methylation in the control of gene expression are still inadequate. In the present research, we performed bioinformatics analysis to clarify the function of methylation and supply candidate methylation-related biomarkers and drivers for colon cancer.AIM To identify and analyze methylation-regulated differentially expressed genes(MeDEGs) in colon cancer by bioinformatics analysis.METHODS We downloaded RNA expression profiles, Illumina Human Methylation 450 K BeadChip data, and clinical data of colon cancer from The Cancer Genome Atlas project. MeDEGs were identified by analyzing the gene expression and methylation levels using the edgeR and limma package in R software. Gene ontology(GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG) pathway enrichment analyses were performed in the DAVID database and KEGG Orthology-Based Annotation System 3.0, respectively. We then conducted Kaplan–Meier survival analysis to explore the relationship between methylation and expression and prognosis. Gene set enrichment analysis(GSEA) and investigation of protein-protein interactions(PPI) were performed to clarify the function of prognosis-related genes.RESULTS A total of 5 up-regulated and 81 down-regulated genes were identified asMeDEGs. GO and KEGG pathway analyses indicated that MeDEGs were enriched in multiple cancer-related terms. Furthermore, Kaplan–Meier survival analysis showed that the prognosis was negatively associated with the methylation status of glial cell-derived neurotrophic factor(GDNF) and reelin(RELN). In PPI networks, GDNF and RELN interact with neural cell adhesion molecule 1. Besides, GDNF can interact with GDNF family receptor alpha(GFRA1), GFRA2, GFRA3, and RET. RELN can interact with RAFAH1 B 展开更多
关键词 COLON CANCER BIOINFORMATICS analysis The CANCER Genome Atlas project DNA METHYLATION Methylation-regulated DIFFERENTIALLY expressed genes Overall survival
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新鲜、玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚全基因组甲基化模式初探 预览
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作者 赵亚涵 郝海生 +6 位作者 杜卫华 庞云渭 闫长亮 刘岩 赵善江 赵学明 朱化彬 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1179-1188,共10页
旨在初步分析新鲜及玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚全基因组甲基化模式。本研究采用单细胞全基因组甲基化测序技术(scWGMS)检测新鲜、玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚全基因组甲基化水平和差异甲基化区域(DMR),探讨两者之间DNA甲... 旨在初步分析新鲜及玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚全基因组甲基化模式。本研究采用单细胞全基因组甲基化测序技术(scWGMS)检测新鲜、玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚全基因组甲基化水平和差异甲基化区域(DMR),探讨两者之间DNA甲基化水平上的差异。结果表明,新鲜卵母细胞体外受精囊胚的整体甲基化水平显著高于玻璃化冷冻卵母细胞体外受精囊胚的整体甲基化水平(P<0.05)。采用基因本体分析(GO)和相关信号通路(KEGG)对143个DMRs分析,发现生物学过程主要显著富集在新陈代谢、生长发育、细胞定位、细胞刺激反应等,通路主要富集在生长发育、核酸结合及组蛋白乙酰化上,并筛选出几个与之相关的候选基因(FARP2、PI4KA、FAM3D、NCOR2、ZNF827等)。本研究初步发现,玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚的全基因组甲基化水平显著降低,且DMR区域主要集中在ATP结合、生长发育及组蛋白乙酰化,为提高玻璃化冷冻卵母细胞体外受精囊胚质量提供信息参考。 展开更多
关键词 玻璃化冷冻 囊胚 全基因组 甲基化 差异甲基化区域
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SLC5A8 CpG岛甲基化与肝癌临床病理特征及预后的关系 预览
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作者 郭飞宇 黄伟 +3 位作者 钱毅 李冬方 胡本顺 李建平 《交通医学》 2019年第2期111-113,118共4页
目的:探讨SLC5A8 CpG岛甲基化与肝细胞肝癌临床病理特征及预后的关系。方法:采用甲基化特异性PCR检测85例肝癌组织及癌旁组织中SLC5A8 CpG岛甲基化情况,分析SLC5A8 CpG岛甲基化与肝癌临床病理特征的关系,比较SLC5A8 CpG岛甲基化与未甲... 目的:探讨SLC5A8 CpG岛甲基化与肝细胞肝癌临床病理特征及预后的关系。方法:采用甲基化特异性PCR检测85例肝癌组织及癌旁组织中SLC5A8 CpG岛甲基化情况,分析SLC5A8 CpG岛甲基化与肝癌临床病理特征的关系,比较SLC5A8 CpG岛甲基化与未甲基化肝癌患者术后5年生存率,分析肝癌患者预后的影响因素。结果:肝癌组织SLC5A8 CpG岛甲基化阳性率为61.2%,高于癌旁组织的36.5%,差异有统计学意义(P<0.05)。SLC5A8 CpG岛甲基化与肝癌肿瘤直径、组织分化、TNM分期及血清AFP有关,差异均有统计学意义(P<0.05),而与年龄、性别、HBsAg是否阳性无关,差异均无统计意义(P<0.05)。SLC5A8 CpG岛甲基化组患者5年生存率26.2%,低于阴性组的49.1%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:SLC5A8 CpG岛甲基化在肝癌发生、发展中扮演重要角色,可作为判断肝癌患者预后的独立预测因子。 展开更多
关键词 肝细胞肝癌 SLC5A8 甲基化 临床病理特征 预后
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子宫内膜异位症恶变组织中RASSF2A启动子甲基化的表达差异性检测及其临床意义 预览
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作者 蔡艳 陈良 汪期明 《现代实用医学》 2019年第3期288-291,295,I0001共6页
目的通过运用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测子宫内膜异位囊肿(EC)组织、子宫内膜异位相关的卵巢癌(EAOC)中RASSF2A基因启动子甲基化(以下简称甲基化)的情况。探讨该基因启动子甲基化在子宫内膜异位恶变组织中的表达及临床意义。方... 目的通过运用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测子宫内膜异位囊肿(EC)组织、子宫内膜异位相关的卵巢癌(EAOC)中RASSF2A基因启动子甲基化(以下简称甲基化)的情况。探讨该基因启动子甲基化在子宫内膜异位恶变组织中的表达及临床意义。方法选取在宁波市妇女儿童医院进行手术治疗患者的石蜡包埋标本。30份正常子宫内膜组织,30份EC组织,30例卵巢透明细胞癌(OCC)组织,30份卵巢子宫内膜样腺癌(OEA)组织,比较甲基化在不同组织类型患者中的表达差异。显微镜观察筛选20份EAOC样本,比较甲基化与各种临床病理特征的关系。结果 OCC组织中RASSF2A启动子甲基化阳性率明显高于EC和正常子宫内膜组织(均P <0.05),OEA组织中RASSF2A启动子甲基化阳性率明显高于EC组织和正常子宫内膜组织(均P<0.05),EC组织中RASSF2A启动子甲基化阳性率高于正常子宫内膜组织(P<0.05)。EAOC组织中RASSF2A基因启动子甲基化率与患者年龄、临床分期、组织学分级及临床病理类型无关(均P> 0.05);RASSF2A基因启动子甲基化程度与淋巴结转移有关(P <0.05)。结论 RASSF2A基因启动子甲基化与子宫内膜异位症恶变存在联系。 展开更多
关键词 甲基化 甲基化特异性聚合酶链反应 RASSF2A基因启动子 子宫内膜异位症恶变
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甲基化结合高分辨质谱的磷脂酸高通量分析方法的建立和应用 预览
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作者 王雪颖 宗兆运 +4 位作者 焦玉佩 许丽娜 王昱淞 栗琳 刘晓蕙 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2019年第2期249-255,共7页
基于甲基化反应,建立了同时测定磷脂酸和溶血磷脂酸的超高液相色谱-静电轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q Exactive Orbitrap MS)高通量定性与定量分析方法,并用于小鼠衰老模型脑组织样品的测定。样品经氯仿-甲醇溶剂进行全脂提取,使用三甲基硅... 基于甲基化反应,建立了同时测定磷脂酸和溶血磷脂酸的超高液相色谱-静电轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q Exactive Orbitrap MS)高通量定性与定量分析方法,并用于小鼠衰老模型脑组织样品的测定。样品经氯仿-甲醇溶剂进行全脂提取,使用三甲基硅烷化重氮甲烷衍生化试剂改善磷脂酸和溶血磷脂酸的色谱峰形,并采用高分辨质谱的数据依赖型扫描模式(Full MS/dd-MS^2),利用Tracefinder软件自建本地二级碎片数据库,结合正离子和负离子两种扫描模式下的碎片规律进行高通量的鉴定和定量分析。在本实验条件下,标准品PA(14∶0/14∶0)的线性相关指数大于0.99,定量限为0.125μg/mL,日内和日间精密度小于8.5%。将本方法用于C57BL/6小鼠衰老模型脑组织中,成功鉴定并定量检测了14个溶血磷脂酸和磷脂酸分子。脂肪酸链的数据分析结果表明,含有多不饱和脂肪酸链的磷脂酸在衰老过程中呈现下降趋势。本方法具有较高灵敏度及准确度,适用于生物体内磷脂酸和溶血磷脂酸的定性与定量分析。 展开更多
关键词 溶血磷脂酸 磷脂酸 甲基化 高分辨质谱 高通量
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医药中间体甲氧胺盐酸盐的绿色合成工艺 预览
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作者 申宏丹 刘德驹 +1 位作者 朱驯 项东升 《精细石油化工》 CAS 北大核心 2019年第3期9-12,共4页
以1,8-二氮杂二环十一碳-7-烯为催化剂,硫酸二甲酯(Me2SO4)作为甲基化试剂,制备了甲氧胺盐酸盐。分析了反应机理,考察了溶剂、反应温度、反应时间、pH值及摩尔配比等因素对实验结果的影响。结果表明,较佳合成工艺为:以二氯甲烷和甲醇(... 以1,8-二氮杂二环十一碳-7-烯为催化剂,硫酸二甲酯(Me2SO4)作为甲基化试剂,制备了甲氧胺盐酸盐。分析了反应机理,考察了溶剂、反应温度、反应时间、pH值及摩尔配比等因素对实验结果的影响。结果表明,较佳合成工艺为:以二氯甲烷和甲醇(体积比2∶1)混合物为溶剂,反应物摩尔比1∶0.7,pH值9~10,反应温度10℃,反应时间6h,总收率达到86.2%。 展开更多
关键词 甲基化 1 8-二氮杂二环十一碳-7-烯 硫酸二甲酯 催化 绿色合成
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不同类型城市人工湿地水体汞的分布特征
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作者 樊宇飞 刘伟豪 +5 位作者 孙涛 苑萌 吕东威 李先源 王永敏 王定勇 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第5期2226-2233,共8页
为了解城市人工湿地水体中汞的时空分布及甲基化特征,以便探究其潜在的汞暴露生态风险,在重庆市选择4个不同类型的人工湿地,于2017年3月~2018年3月,按季度采集垂直剖面水样,分析总汞(THg)和甲基汞(MeHg)的分布.结果表明:城市人工湿地由... 为了解城市人工湿地水体中汞的时空分布及甲基化特征,以便探究其潜在的汞暴露生态风险,在重庆市选择4个不同类型的人工湿地,于2017年3月~2018年3月,按季度采集垂直剖面水样,分析总汞(THg)和甲基汞(MeHg)的分布.结果表明:城市人工湿地由于景观布局、功能设置不同,其汞分布特征有一定差异. 4个湿地水体THg均高于背景水域,但远低于有污染历史的水体;湿地中部水体THg均略高于进、出水口,表明城市湿地对水体THg有截留作用.除彩云湖湿地出水口MeHg浓度高于入水口外,其余3个湿地出水口MeHg均低于入水口;湿地中水体MeHg呈随水深增加而升高的趋势,且MeHg占THg的比例(MeHg/THg)均高于其他水域,说明城市湿地具有净汞甲基化的作用. 4个城市湿地水体THg春秋两季高,夏季略有降低,冬季最低;水体MeHg冬季最低,而其他三季差异不大但远高于冬季,约为冬季的3倍.本研究明晰了城市湿地中汞的时空分布和甲基化规律,探究了人类活动对湿地的干扰程度和湿地的响应特征以及湿地汞对下游流域的影响,从控制潜在汞暴露风险的角度,为人工湿地建设提供建议. 展开更多
关键词 人工湿地 甲基汞 甲基化 季节变化
New findings showing how DNA methylation influences diseases 预览
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作者 Fabio Sallustio Loreto Gesualdo Anna Gallone 《世界生物化学杂志:英文版(电子版)》 2019年第1期1-6,共6页
In 1975,Holliday and Pugh as well as Riggs independently hypothesized that DNA methylation in eukaryotes could act as a hereditary regulation mechanism that influences gene expression and cell differentiation.Interest... In 1975,Holliday and Pugh as well as Riggs independently hypothesized that DNA methylation in eukaryotes could act as a hereditary regulation mechanism that influences gene expression and cell differentiation.Interest in the study of epigenetic processes has been inspired by their reversibility as well as their potentially preventable or treatable consequences.Recently,we have begun to understand that the features of DNA methylation are not the same for all cells.Major differences have been found between differentiated cells and stem cells.Methylation influences various pathologies,and it is very important to improve the understanding of the pathogenic mechanisms.Epigenetic modifications may take place throughout life and have been related to cancer,brain aging,memory disturbances,changes in synaptic plasticity,and neurodegenerative diseases,such as Parkinson’s disease and Huntington’s disease.DNA methylation also has a very important role in tumor biology.Many oncogenes are activated by mutations in carcinogenesis.However,many genes with tumor-suppressor functions are“silenced”by the methylation of CpG sites in some of their regions.Moreover,the role of epigenetic alterations has been demonstrated in neurological diseases.In neuronal precursors,many genes associated with development and differentiation are silenced by CpG methylation.In addition,recent studies show that DNA methylation can also influence diseases that do not appear to be related to the environment,such as IgA nephropathy,thus affecting the expression of some genes involved in the T-cell receptor signaling.In conclusion,DNA methylation provides a whole series of fundamental information for the cell to regulate gene expression,including how and when the genes are read,and it does not depend on the DNA sequence. 展开更多
关键词 DNA METHYLATION Stem cells ENHANCER IGA NEPHROPATHY Gene regulation
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DNA甲基化转移酶1与2,3,7,8-四氯二苯并对二噁英诱导小鼠腭裂的相关性研究 预览
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作者 李勇 张伟 +5 位作者 安莉 宋红权 张兴伟 高雨蔚 臧棨光 焦晓辉 《口腔医学研究》 CAS 北大核心 2019年第2期129-132,共4页
目的:通过检测DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)在四氯二苯并对二噁英(2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-paradioxin,TCDD)诱导的腭裂小鼠体内的表达,探讨其与腭裂发病机制的相关性。方法:TCDD通过对腭部中嵴上皮细胞的毒性作... 目的:通过检测DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)在四氯二苯并对二噁英(2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-paradioxin,TCDD)诱导的腭裂小鼠体内的表达,探讨其与腭裂发病机制的相关性。方法:TCDD通过对腭部中嵴上皮细胞的毒性作用,导致胎鼠腭裂发生。应用TCDD(64μg/kg)处理胚胎处于第10.5天(E10.5)的C57BL/6J怀孕小鼠建模。分别获取E13.5、E14.5、E15.5和E17.5胎鼠的口腔组织,苏木精-伊红(hematoxylin-eosin staining,HE)染色检测胎鼠腭裂组织。逆转录-定量聚合酶链反应(reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)检测以上各组胎鼠DNMT1 mRNA表达水平的变化,Western blot检测DNMT1蛋白表达水平的变化。结果:HE染色结果显示TCDD组腭裂发生率为98.25%,对照组无腭裂发生。RT-qPCR结果显示TCDD组DNMT1 mRNA水平与对照组比较显著增高,差异有统计学意义(P<0.01)。Western blot结果表明与对照组比较,TCDD组DNMT1蛋白表达水平显著增高,差异有统计学意义(P<0.01)。结论:在TCDD诱导胎鼠腭裂的形成过程中,DNMT1发挥重要的作用。 展开更多
关键词 非综合征型唇腭裂 甲基化 四氯二苯并对二噁英 DNA甲基转移酶1
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外周血白细胞PDE4C基因甲基化及环境因素交互作用与乳腺癌发病的关系 预览
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作者 李烁 张楠楠 +4 位作者 李亮亮 龙志平 尹慧慧 赵亚双 王帆 《实用肿瘤学杂志》 CAS 2019年第3期233-238,共6页
目的探讨外周血白细胞中磷酸二酯酶4C(PDE4C)基因甲基化和环境因素的交互作用与乳腺癌发病的关系。方法采用病例对照研究,选择2010年10月—2014年12月纳入的402例乳腺癌病例和470例对照作为研究对象,使用特异性DNA甲基化修饰的定量PCR... 目的探讨外周血白细胞中磷酸二酯酶4C(PDE4C)基因甲基化和环境因素的交互作用与乳腺癌发病的关系。方法采用病例对照研究,选择2010年10月—2014年12月纳入的402例乳腺癌病例和470例对照作为研究对象,使用特异性DNA甲基化修饰的定量PCR方法检测PDE4C基因的甲基化水平。应用叉生分析、多因素Logistic回归,分析基因甲基化水平及其和环境因素的交互作用与乳腺癌发病的关系。结果未发现PDE4C甲基化与乳腺癌的发病有显著关联。高频次/摄入量的粗粮、蔬菜、葱属性植物、禽肉、牛奶及经常运动可降低乳腺癌的发病风险;高频次/摄入量的猪肉,以及月经周期不规律、心理应激指数偏高可增加乳腺癌的发病风险。PDE4C高甲基化与食用葱属性植物大于3次/周有显著的联合作用( OR =0.373,95% CI :0.208~0.668, P =0.001)。结论PDE4C基因高甲基化不是乳腺癌发病的独立危险因素,其与环境因素的联合作用影响乳腺癌的发病风险。 展开更多
关键词 乳腺癌 甲基化 磷酸二酯酶4C 发病风险
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miR-146a对父代高脂高糖饮食背景下子代新生鼠肝脏胰岛素受体基因表达的影响
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作者 唐华 党伟 +1 位作者 魏颖莉 曹银利 《中华内分泌代谢杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期404-409,共6页
目的探讨miR-146a对父代高脂高糖饮食(HGFD)背景下新生鼠肝组织胰岛素受体(insr)基因表达的影响及作用机制。方法取5周龄雄性SD大鼠随机分为:正常饮食组(ND组)及HGFD组,分组饲养3个月后与正常雌鼠交配。检测子代新生鼠血糖水平、葡萄糖... 目的探讨miR-146a对父代高脂高糖饮食(HGFD)背景下新生鼠肝组织胰岛素受体(insr)基因表达的影响及作用机制。方法取5周龄雄性SD大鼠随机分为:正常饮食组(ND组)及HGFD组,分组饲养3个月后与正常雌鼠交配。检测子代新生鼠血糖水平、葡萄糖耐量(GTT)及胰岛素耐量(ITT)。提取子代新生鼠肝组织miRNAs,合成cDNA。采用二代测序技术比较两组差异miRNAs,并通过实时荧光定量PCR(qPCR)的方法验证这些miRNA的表达差异。提取子代新生鼠肝组织基因组DNA、总RNA及总蛋白,qPCR比较父代HGFD对子代新生鼠肝组织中INSRmRNA相对表达量及INSR启动子甲基化水平的影响,分别分析INSR表达及甲基化水平与差异分子miR-146a表达水平的相关性。上调大鼠正常肝细胞系BRL-3A中miR-146a,观察miR-146a对肝细胞中INSR基因启动子甲基化水平(qPCR)及蛋白表达(Western-blot)的影响。结果HGFD组F1代雄性仔鼠葡萄糖耐量显著下降和胰岛素耐受。miRNA测序获得差异microRNAs60个,HGFD组上调的45个,下调的15个。qPCR检测提示其中8个miRNAs在扩大样本中仍有显著性差异,miR-146a在HGFD组仔鼠肝中表达上调超过10倍。miRNA-146a的表达水平与INSRmRNA的相对表达量负性相关,与INSR甲基化水平正相关。上调BRL-3A细胞中miR-146a表达,INSR基因启动子区的甲基化水平显著增强而蛋白表达则受到抑制。结论父代HGFD背景下F1代仔鼠肝组织中INSR表达抑制与miR-146a促INSR基因甲基化有关。 展开更多
关键词 microRNA-146a 甲基化 胰岛素受体基因 高脂高糖饮食 雄性 SD大鼠
血浆游离DNA中黑色素瘤抗原A1基因启动子区甲基化在非小细胞肺癌诊断中的临床应用 预览
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作者 文韬 韩毅 +1 位作者 周世杰 刘志东 《中国医刊》 CAS 2019年第6期635-639,共5页
目的对血浆游离DNA中黑色素瘤抗原A1(melanoma antigen-A1,MAGE-A1)基因启动子区CpG岛甲基化水平进行初步检测,并探讨其对非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的诊断价值。方法选取2017年3月至2018年6月首都医科大学附属北... 目的对血浆游离DNA中黑色素瘤抗原A1(melanoma antigen-A1,MAGE-A1)基因启动子区CpG岛甲基化水平进行初步检测,并探讨其对非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的诊断价值。方法选取2017年3月至2018年6月首都医科大学附属北京胸科医院收治的经病理诊断确诊的NSCLC患者(研究组)56例,肺部良性病变患者(对照组)27例。应用甲基化敏感性限制性内切酶定量聚合酶链反应(methylation-sensitive restriction enzymes-based quantitative PCR,MSREqPCR)对两组患者血浆游离DNA中MAGE-A1基因启动子区CpG岛甲基化水平进行检测,并结合临床常用肿瘤标志物癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)、血清骨胶素(CYFRA21-1)分析其在NSCLC诊断中的价值。结果研究组中MAGE-A1的甲基化水平明显低于对照组(P<0.05),其诊断NSCLC的敏感度和特异度分别为44.6%、88.9%,ROC曲线下面积(area underthe curve,AUC)为0.691;在联合CEA和CYFRA211后其诊断敏感度和特异度可提升至67.9%、92.6%,AUC为0.844。结论游离DNA中MAGE-A1基因启动子区CpG岛甲基化水平对于NSCLC具有潜在的非侵入性辅助诊断价值。 展开更多
关键词 黑色素瘤抗原A1 游离DNA 甲基化 非小细胞肺癌 诊断
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SEPT9、SFRP2、VIM基因的甲基化及其在结直肠癌诊断中的应用现状 预览
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作者 廖燕秋 龙嘉莉 +3 位作者 殷玉婷 何清莲 何佩珊 朱伟 《广东医科大学学报》 2019年第1期4-7,共4页
随着对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中DNA甲基化研究不断深入,在CRC早期阶段,DNA启动子区域异常甲基化可作为临床上CRC患者早期诊断标准。目前已有较多研究报道检测患者血液和粪便中基因异常甲基化对于早期CRC筛查有较高的灵敏度和... 随着对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中DNA甲基化研究不断深入,在CRC早期阶段,DNA启动子区域异常甲基化可作为临床上CRC患者早期诊断标准。目前已有较多研究报道检测患者血液和粪便中基因异常甲基化对于早期CRC筛查有较高的灵敏度和特异性。该文将研究较为透彻的胞裂蛋白9(SEPT9)、联合分泌型卷曲相关蛋白2(SFRP2)、波形蛋白(VIM)3个基因的甲基化及其在CRC早期诊断中的应用现状作了综述。 展开更多
关键词 CRC 甲基化 SEPT9 SFRP2 VIM
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食管癌高发区LINE-1甲基化与食管癌临床特征的关系
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作者 崔国艳 杨建洲 +2 位作者 陈云霞 胡文庆 王金胜 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期532-535,共4页
目的探讨长散在重复序列(long interspersed nucleotide element-1,LINE-1)启动子区DNA甲基化水平与食管癌发生的关系。方法采用甲基化特异性上述聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)和焦磷酸测序法检测96例食管癌组织、癌... 目的探讨长散在重复序列(long interspersed nucleotide element-1,LINE-1)启动子区DNA甲基化水平与食管癌发生的关系。方法采用甲基化特异性上述聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)和焦磷酸测序法检测96例食管癌组织、癌旁组织和远癌组织标本中LINE-1基因甲基化水平,并用统计学方法分析LINE-1甲基化与食管癌临床特征及吸烟等生活习惯的关系。结果 96例癌组织、癌旁组织和远癌组织中LINE-1甲基化水平差异均无统计学意义(均有P>0.05)。LINE-1启动子区甲基化与食管癌患者的年龄、饮酒、家族史、病理组织类型、肿瘤部位及临床病理分期之间差异均无统计学意义(均有P>0.05);与患者性别、吸烟和分化程度之间差异均有统计学意义(均有P<0.05)。结论 LINE-1启动子区甲基化在食管癌患者中较为普遍,LINE-1启动子区低甲基化常发生于食管癌低分化组织和TNM晚期,LINE-1基因甲基化有潜力在食管癌诊断和预后监测方面发挥重要作用。 展开更多
关键词 食管癌 LINE-1基因 甲基化
药物代谢酶CYP2E1、GSTM1基因启动子区甲基化与抗结核药物性肝损伤的相关性研究 预览
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作者 邓乐乐 韦丽琴 +2 位作者 郝金奇 张冬 胡宝翠 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2019年第6期613-618,共6页
目的药物代谢酶基因异常甲基化是否与抗结核药物性肝损伤(ATLI)发生有关尚未见报道。文中旨在探讨蒙古族结核病患者细胞色素P4502E1(CYP2E1)和谷胱甘肽S-转移酶M1(GSTM1)基因启动子区CpG岛甲基化水平与ATLI之间的关系。方法选取2016年9... 目的药物代谢酶基因异常甲基化是否与抗结核药物性肝损伤(ATLI)发生有关尚未见报道。文中旨在探讨蒙古族结核病患者细胞色素P4502E1(CYP2E1)和谷胱甘肽S-转移酶M1(GSTM1)基因启动子区CpG岛甲基化水平与ATLI之间的关系。方法选取2016年9月至2018年12月在内蒙古自治区通辽市结核病防治所已确诊并进行治疗的93例蒙古族肺结核患者资料。肝损伤组(选择接受抗结核药物治疗6个月内发生ATLI的蒙古族结核病患者,n=31)、对照组(与肝损伤组同性别、年龄相差≤5岁、接受抗结核药物治疗6个月内未发生ATLI的蒙古族结核病患者,n=62)。分析比较2组CYP2E1和GSTM1基因甲基化水平及结核病患者ATLI发生的影响因素。结果肝损伤组和对照组CYP2E1基因启动子区总体甲基化水平([0.694±0.091)、(0.759±0.066)],及GSTM1基因启动子区总体甲基化水平([0.187±0.092)、(0.207±0.093)]差异有统计学意义(P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示:饮酒(OR=5.329,95%CI:1.442~19.697)、CYP2E1基因启动子区甲基化(OR=0.312,95%CI:0.165~0.591)是蒙古族结核病患者ATLI发生的影响因素(P<0.05)。结论蒙古族结核病患者ATLI与CYP2E1基因启动子区甲基化水平有关。提示CYP2E1基因甲基化可作为ATLI发生的生物标志物应用于结核病患者ATLI的预防和控制。 展开更多
关键词 细胞色素P4502E1 谷胱甘肽S-转移酶M1 甲基化 药物性肝损伤 抗结核药物
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IBDV感染对法氏囊RNA m~6A和DNA 5mC修饰以及相关催化酶基因表达的影响 被引量:1
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作者 张艳红 吴庆茹 +7 位作者 师梦梦 王建 李光辉 袁梦琪 朱昱波 侯丽敏 杜新府 郭锋 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期936-942,共7页
传染性法氏囊病毒(IBDV)感染造成病鸡法氏囊严重损伤,引起免疫抑制,然其具体机制仍不明晰。本研究旨在探讨IBDV感染对法氏囊表遗传修饰及其相关酶表达的影响。试验采用21日龄商品肉鸡,给予IBDV处理,感染后3,5 d收集法氏囊组织。应用基于... 传染性法氏囊病毒(IBDV)感染造成病鸡法氏囊严重损伤,引起免疫抑制,然其具体机制仍不明晰。本研究旨在探讨IBDV感染对法氏囊表遗传修饰及其相关酶表达的影响。试验采用21日龄商品肉鸡,给予IBDV处理,感染后3,5 d收集法氏囊组织。应用基于ELISA试剂盒检测总5mC和m~6A,Real-time PCR检测相关催化酶基因表达。结果显示,感染后5 d,总m~6A水平及其甲基转移酶METTL3和METTL14 mRNA表达均显著降低(P<0.01);去甲基化酶FTO的表达在感染后3,5 d均显著降低(P<0.05)。总5mC水平在感染后3 d明显升高(P<0.05),其去甲基化酶Tet1 mRNA表达明显降低(P<0.01);感染后5 d,甲基转移酶DNMT1 mRNA表达显著降低(P<0.01),而DNMT3a的表达明显升高(P<0.01);结果表明IBDV能够影响法氏囊5mC和m~6A谱及相关酶的表达,这可能是IBDV影响宿主免疫功能的途径之一。 展开更多
关键词 IBDV 5mC m~6A 甲基化 DNMT TET METTL FTO
老年慢性心力衰竭患者去甲肾上腺素转运体SLC6A2基因启动子区甲基化水平及其与预后的相关性 预览
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作者 张丽娥 樊伟军 《临床和实验医学杂志》 2019年第17期1838-1841,共4页
目的探究老年慢性心力衰竭患者去甲肾上腺素转运体SLC6A2基因启动子区甲基化水平及其与预后的相关性。方法前瞻性研究,选择2017年3月至2018年4月西安交通大学第二附属医院心内科收治的200例老年慢性心力衰竭患者作为研究对象,根据预后... 目的探究老年慢性心力衰竭患者去甲肾上腺素转运体SLC6A2基因启动子区甲基化水平及其与预后的相关性。方法前瞻性研究,选择2017年3月至2018年4月西安交通大学第二附属医院心内科收治的200例老年慢性心力衰竭患者作为研究对象,根据预后情况将患者分为死亡组(n=40)和生存组(n=160)。比较两组患者的一般临床资料及SLC6A2基因启动子区相对集中Cp G岛的A、B、C和D共4个相关片段的甲基化率,分析老年慢性心力衰竭患者预后的影响因素。结果死亡组患者的年龄[(69. 46±7. 72)岁]、吸烟史(57. 50%)、饮酒史(80. 00%)和病程[(5. 55±1. 36)年]均显著高于生存组患者的年龄[(63. 83±7. 91)岁]、吸烟史(37. 50%)、饮酒史(60. 63%)和病程[(4. 34±1. 42)年](P <0. 05),死亡组患者的男性百分比(52. 50%)、体重指数[(23. 43±2. 12) kg/m2]、收缩压[(143. 51±8. 96) mm Hg]和舒张压[(78. 83±6. 15) mm Hg]与生存组患者的男性百分比(51. 88%)、体重指数[(23. 12±2. 33) kg/m2]、收缩压[(141. 65±7. 97) mm Hg]和舒张压[(77. 92±6. 96) mm Hg]的差异无统计学意义(P> 0. 05);死亡组患者Cp G岛的A、B、C和D共4个相关片段的甲基化率[(54. 29±2. 34)%、(52. 19±3. 03)%、(56. 26±4. 21)%、(57. 25±3. 34)%]及总体甲基化率(55. 89±3. 98)%均显著性高于生存组Cp G岛的A、B、C和D共4个相关片段的甲基化率[(43. 96±2. 13)%、(40. 50±2. 89)%、(41. 46±2. 89)%、(42. 47±3. 01)%]及总体甲基化率(42. 04±3. 23)%(P <0. 05);SLC6A2基因启动子区总体甲基化率以及年龄、吸烟史、饮酒史和病程是心力衰竭患者死亡预后的危险因素(P <0. 05)。结论去甲肾上腺素转运体SLC6A2基因启动子区甲基化与老年慢性心力衰竭患者的预后出现死亡具有正相关性,是影响老年慢性心力衰竭患者预后的危险因素,能够增加老年慢性心力衰竭患者的死亡风险。 展开更多
关键词 老年人 慢性心力衰竭 去甲肾上腺素转运体 SLC6A2基因 甲基化 预后
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鼠伤寒沙门菌中甲基化修饰调控PhoP活性的机制研究 预览
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作者 李建辉 苏杨 +1 位作者 姚玉峰 倪进婧 《上海交通大学学报:医学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期827-833,共7页
目的·探究鼠伤寒沙门菌转录调控因子PhoP的甲基化修饰与其活性的相关性,筛选PhoP的甲基转移酶。方法·Westernblotting检测不同培养条件下鼠伤寒沙门菌中PhoP的甲基化水平变化。通过生物信息学预测候选的甲基转移酶,体内过表... 目的·探究鼠伤寒沙门菌转录调控因子PhoP的甲基化修饰与其活性的相关性,筛选PhoP的甲基转移酶。方法·Westernblotting检测不同培养条件下鼠伤寒沙门菌中PhoP的甲基化水平变化。通过生物信息学预测候选的甲基转移酶,体内过表达预测的甲基转移酶后检测phoP及其下游基因的转录水平变化,找到可能的PhoP甲基转移酶,并体外验证该甲基转移酶能否甲基化PhoP。使用real-time PCR检测高浓度Mg^2+、弱酸性等培养条件下,phoP与其甲基转移酶在转录水平的相对表达变化。结果·随着培养基中Mg^2+浓度升高,PhoP甲基化水平上升;而经过弱酸刺激后,PhoP甲基化水平下降。生物信息学预测并筛选到9个甲基转移酶,其中体内过表达STM14_0023后,phoP及其下游基因的转录水平下降且PhoP蛋白水平也下降,但敲除STM14_0023对上述分子的表达无影响。体外甲基化酶促反应显示STM14_0023能够甲基化PhoP,体内过表达STM14_0023后也可提高PhoP的甲基化水平,且在抑制phoP表达的高浓度Mg2+培养条件下STM14_0023的转录水平升高。结论·STM14_0023是PhoP的甲基转移酶,甲基化修饰抑制PhoP活性。 展开更多
关键词 鼠伤寒沙门菌 PHOP 甲基化修饰 STM14_0023 毒力
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