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长链非编码RNA HELT-3和MT1B-1在慢性心力衰竭患者外周血单个核细胞中的表达
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作者 刘淑珍 万大国 +2 位作者 马军 孙金旗 谢艳辉 《中华心力衰竭和心肌病杂志(中英文)》 2019年第1期2-7,共6页
目的 研究慢性心力衰竭(CHF)患者外周血单个核细胞(PBMC)中异常表达的长链非编码RNA(lncRNA),并验证lncRNAs和CHF的相关性.方法 心力衰竭组和健康对照组各3例分离PBMC,提取总RNA,用博奥人类lncRNA V4芯片筛选差异表达的lncRNA.从差异lnc... 目的 研究慢性心力衰竭(CHF)患者外周血单个核细胞(PBMC)中异常表达的长链非编码RNA(lncRNA),并验证lncRNAs和CHF的相关性.方法 心力衰竭组和健康对照组各3例分离PBMC,提取总RNA,用博奥人类lncRNA V4芯片筛选差异表达的lncRNA.从差异lncRNA中,选择前几位差异显著的lncRNA作为目的lncRNA.采用荧光定量PCR(qPCR)检测51例CHF患者和52例健康人表达量,对筛选出的lncRNA进行验证.结果 芯片筛选出359个上调和369个下调lncRNA,其中HELT-3、MT1B-1为CHF高表达转录本.qPCR验证发现HELT-3和MT1B-1在心力衰竭组高于健康对照组(P均<0.01),与芯片结果一致.结论 HELT-3和MT1B-1在CHF患者PBMC中的表达上调,可能成为CHF诊断的分子标记物和治疗靶点. 展开更多
关键词 心力衰竭 基因 芯片分析技术
骨形态发生蛋白9调节乳腺癌细胞中长链非编码RNA的表达
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作者 彭书生 袁永强 +3 位作者 李述 代红莹 朱天金 王科 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期19-29,共11页
目的:筛选出与骨形态发生蛋白9(bone morphogenetic protein-9,BMP-9)表达相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA),为探讨BMP-9通过调节LncRNA表达水平参与乳腺癌细胞生长、分化、迁移和凋亡等的作用机制提供实验依据。方法 ... 目的:筛选出与骨形态发生蛋白9(bone morphogenetic protein-9,BMP-9)表达相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA),为探讨BMP-9通过调节LncRNA表达水平参与乳腺癌细胞生长、分化、迁移和凋亡等的作用机制提供实验依据。方法 :将携带有BMP-9全基因的重组腺病毒Ad-BMP-9和携带有绿色荧光蛋白(greenuorescent protein,GFP)基因的空载体腺病毒Ad-GFP(对照组)分别感染MDA-MB-231细胞。应用微阵列芯片技术分别检测BMP-9过表达组(MDA-MB-231/BMP-9细胞)和对照组(MDA-MB-231/GFP细胞)中Lnc RNA表达谱的差异,并通过实时荧光定量PCR法验证筛选获得的14条LncRNA(LINC00443、LINC00638、LINC00486、RHNO1、SERHL、HOXA11-AS、IQCA1、LINC00461、LOC440173、LHFPL、ANKRD36BP2、BVES-AS1、LINC00937和LINC00608)在MDA-MB-231/BMP-9和MDA-MB-231/GFP细胞中的表达情况。通过基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析发生表达水平变化的Lnc RNA涉及的功能及通路。结果 :重组BMP-9腺病毒感染的MDA-MB-231细胞中BMP-9 mRNA的表达水平较对照组明显升高。与对照组相比,BMP-9过表达的MDA-MB-231/BMP-9细胞中LncRNA表达水平发生明显变化。实时荧光定量PCR检测结果显示,LINC00443、LINC00638和LINC00486的表达水平上调(P值均<0.05),IQCA1、LINC00461、LOC440173、LHFPL和ANKRD36BP2的表达水平下调(P值均<0.05)。发生表达改变的LncRNA参与了细胞骨架和细胞膜等的形成,或作为细胞间信号转导的信号分子发挥作用。结论 :BMP-9过表达的MDA-MB-231细胞中LncRNA表达谱较对照组出现显著变化,提示部分LncRNA可能参与了BMP-9调控乳腺癌MDAMB-231细胞增殖和侵袭等生物学过程,并发挥关键作用。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 RNA 长链非编码 芯片分析技术 计算生物学
液相芯片系统在检测抗核抗体谱中的应用 预览
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作者 张程 吴姗姗 吕丹 《国际检验医学杂志》 CAS 2019年第1期71-73,共3页
目的探讨抗核抗体谱联合检测在液相芯片检测系统中的性能,提高自身免疫性疾病的诊疗效果。方法收集已确诊为自身免疫性疾病患者血样120例(病例组),体检正常血清90例(健康对照组),分别以线性免疫印迹法(LIA法)和液相芯片系统联合检测抗R... 目的探讨抗核抗体谱联合检测在液相芯片检测系统中的性能,提高自身免疫性疾病的诊疗效果。方法收集已确诊为自身免疫性疾病患者血样120例(病例组),体检正常血清90例(健康对照组),分别以线性免疫印迹法(LIA法)和液相芯片系统联合检测抗Ro52、抗SSA、抗SSB、抗Sm、抗RNP、抗Scl-70、抗Jo-1、抗Rib、抗His、抗PCNA、抗CB、抗PM、抗M2、抗NUC、抗双链DNA抗体15种自身抗体,评估其灵敏度、特异度和交叉反应。结果健康对照组与病例组患者总体阳性率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。液相芯片系统与LIA法对15种自身抗体的检测结果具有良好的一致性(P<0.05),但灵敏度优于LIA法。抗体在液相芯片系统中无交叉反应。结论液相芯片系统对抗核抗体联合检测具有良好的性能,其对抗核抗体谱的检测具有较好的灵敏度和特异度。 展开更多
关键词 芯片分析技术 免疫测定 抗体 抗核 自身免疫疾病
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全转录组芯片筛选肝癌组织中CX43的作用靶点 预览
4
作者 谈震 郭卫东 +4 位作者 张璐 吴泽华 占世雄 刘世国 王祖森 《中华肝脏外科手术学电子杂志》 CAS 2019年第2期164-168,共5页
目的运用全转录组芯片测序技术结合生物信息学筛选缝隙连接蛋白CX43 的下游差异性表达基因并进行功能分析。方法采用TransIntroTM EL 将重组pCX43 质粒转染至人肝癌SMMC-7721 细胞,构建CX43 过表达组,对照组仅转染空载质粒。采用RT-PCR... 目的运用全转录组芯片测序技术结合生物信息学筛选缝隙连接蛋白CX43 的下游差异性表达基因并进行功能分析。方法采用TransIntroTM EL 将重组pCX43 质粒转染至人肝癌SMMC-7721 细胞,构建CX43 过表达组,对照组仅转染空载质粒。采用RT-PCR、Western blot 检测转染后细胞CX43 mRNA 和蛋白的表达情况,两组CX43 mRNA 和蛋白表达量比较采用t 检验。运用全转录组芯片Clariomtm D Assays 筛选CX43 的下游差异表达基因;利用DAVID 和STRING 数据库对差异性表达基因进行基因功能、信号通路和蛋白相互作用分析,确定中心节点蛋白。采用Kaplan-Meier曲线和Cox 回归分析靶点蛋白在生存预后中的价值。结果过表达组CX43 mRNA 和蛋白表达量分别为363±64、1.36±0.02,明显高于对照组的1、0.81±0.01(t=5.67,19.12;P<0.05)。筛选CX43 下游差异表达基因,其中上调基因394 个,下调基因534 个。STRING 数据库分析出9 个中心节点蛋白。Kaplan-Meier 曲线和Cox 回归分析显示,ENO1、RALA、SRC 高表达患者总体生存率较差(HR=2.29,1.72,1.75;95%CI:1.61~3.27,1.20~2.46,1.22~2.53;P<0.05)。结论 ENO1、RALA、SRC 为CX43 的下游作用靶点,3 个靶点蛋白为生存预后的独立影响因素,靶点蛋白高表达患者生存预后差。 展开更多
关键词 肝细胞 连接蛋白43 芯片分析技术
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单核苷酸多态性微阵列分析对智力障碍和发育迟缓的遗传学诊断价值 预览
5
作者 胡珺洁 钱叶青 +3 位作者 孙义锡 俞佳玲 罗玉琴 董旻岳 《浙江大学学报:医学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期420-428,共9页
目的:评估单核苷酸多态性微阵列(SNP array)分析在智力障碍/发育迟缓(ID/DD)遗传学诊断中的应用价值。方法:以2013年1月至2018年6月在浙江大学医学院附属妇产科医院因ID/DD行SNP array的145例患者为研究对象,采用CHAS软件与多种数据库... 目的:评估单核苷酸多态性微阵列(SNP array)分析在智力障碍/发育迟缓(ID/DD)遗传学诊断中的应用价值。方法:以2013年1月至2018年6月在浙江大学医学院附属妇产科医院因ID/DD行SNP array的145例患者为研究对象,采用CHAS软件与多种数据库对染色体拷贝数变异(CNV)进行分析。结果:145例ID/DD患者通过SNP array技术发现致病性CNV26例,可能致病CNV6例,意义不明18例,可能良性14例,未见明显异常(包含良性)81例。结论:SNP array技术是一种高效和特异的遗传学分析技术,适用于ID/DD的遗传学病因诊断。 展开更多
关键词 智力障碍/遗传学 发育障碍/遗传学 染色体 芯片分析技术 多态性 单核苷酸
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金属硫蛋白2A、E钙黏蛋白及细胞周期蛋白E与前列腺癌生化复发的相关性
6
作者 程伟 马丁 +3 位作者 杨彬 尚吉文 米振国 张雁钢 《肿瘤研究与临床》 CAS 2019年第6期395-400,共6页
目的探讨金属硫蛋白2A(MT-2A)、E钙黏蛋白(E-cadherin)、白细胞介素6(IL-6)、细胞周期蛋白E(cyclin E)、增殖细胞核抗原(PCNA)和抗凋亡蛋白bcl-2在前列腺癌组织中的表达及其与前列腺癌生化复发之间的相关性。方法收集2012年10月至2017... 目的探讨金属硫蛋白2A(MT-2A)、E钙黏蛋白(E-cadherin)、白细胞介素6(IL-6)、细胞周期蛋白E(cyclin E)、增殖细胞核抗原(PCNA)和抗凋亡蛋白bcl-2在前列腺癌组织中的表达及其与前列腺癌生化复发之间的相关性。方法收集2012年10月至2017年10月于山西大医院接受前列腺癌根治性手术的128例患者的前列腺癌组织标本,记录患者的临床数据。制作组织芯片,采用免疫组织化学生物素-亲和素复合物(ABC)染色法检测芯片组织MT-2A、E-cadherin、IL-6、cyclin E、PCNA和bcl-2的表达水平,并分析不同分子标志物与前列腺癌生化复发之间的相关性。结果 128例前列腺癌患者生化复发率为30.5%(39/128),低危、中危和高危前列腺癌患者生化复发率分别是14.8%(8/54)、38.7%(24/62)和58.3%(7/12)。前列腺癌患者危险分级和病理学T分期与MT-2A、cyclin E、IL-6、E-cadherin表达均有关(均P<0.05)。多因素Cox风险模型结果显示,高危险分级(HR=1.81,95% CI 1.56~2.19,P=0.042)、MT-2A阳性表达(HR=2.01,95% CI 1.08~3.15,P=0.005)、cyclin E阳性表达(HR=1.79,95% CI 1.08~2.21,P=0.042)和E-cadherin阴性表达(HR=1.92,95% CI 1.22~2.45,P=0.020)是前列腺癌生化复发的独立危险因素。结论前列腺癌组织中MT-2A、cyclin E和E-cadherin是预测前列腺癌生化复发的重要分子标志物。 展开更多
关键词 前列腺肿瘤 金属硫蛋白2A 钙黏着糖蛋白类 细胞周期蛋白E 生化复发 芯片分析技术
129株非结核分枝杆菌采用两种分子检测技术行菌种鉴定的结果分析
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作者 刘佳文 吕红艳 +1 位作者 丁北川 张治国 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2019年第9期999-1004,共6页
目的分析北京地区3个单位非结核分枝杆菌(NTM)临床分离株采用芯片杂交法(简称“芯片法”)和16SrRNA基因测序(简称“基因测序”)进行菌种鉴定的结果,为临床分枝杆菌病的快速准确诊断提供科学依据。方法用芯片法和基因测序进行北京地区3... 目的分析北京地区3个单位非结核分枝杆菌(NTM)临床分离株采用芯片杂交法(简称“芯片法”)和16SrRNA基因测序(简称“基因测序”)进行菌种鉴定的结果,为临床分枝杆菌病的快速准确诊断提供科学依据。方法用芯片法和基因测序进行北京地区3个单位129株NTM临床分离株的菌种鉴定,实验操作者之间采用双盲法,对两种鉴定方法的结果进行比较和评价。结果129株NTM菌株中,有107株进行分枝杆菌基因测序,其中59株为胞内分枝杆菌(55.1%);29株为堪萨斯分枝杆菌(27.1%);5株为龟分枝杆菌/脓肿分枝杆菌(4.7%);3株为鸟分枝杆菌(2.8%);2株为偶发分枝杆菌(1.9%);2株为戈登分枝杆菌(1.9%);1株为蟾蜍分枝杆菌(0.9%);1株为草分枝杆菌(0.9%);1株为瘰疬分枝杆菌(0.9%);4株为其他NTM(3.7%)。有116株进行芯片法分枝杆菌菌种鉴定,且有96株同时进行芯片法和基因测序法检测,两种方法进行菌种鉴定的符合率为88.5%(85/96)。基因测序发现有3株外来菌株,分别为明尼苏达分枝杆菌、熊本分枝杆菌、提门分枝杆菌(M.temen)。结论北京3家机构NTM菌种以胞内分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌和龟分枝杆菌/脓肿分枝杆菌为主。用芯片法和基因测序对NTM临床分离株进行菌种鉴定的一致率较高。 展开更多
关键词 分枝杆菌 非典型性 生物学鉴定法 芯片分析技术 分子探针技术 寡核苷酸序列分析 结果与过程评价(卫生保健)
新一代微测序基因芯片的设计及其耐药性检测效果的初步研究 被引量:1
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作者 孙照刚 张洪静 +7 位作者 李自慧 孙琦 吕琳娜 潘丽萍 Sandy Gilbert 张宗德 许绍发 James Xia 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2019年第6期609-615,共7页
目的设计和评价微测序基因芯片检测结核分枝杆菌(MTB)耐药性的价值。方法于北京结核病临床数据和样本资源库选取MTB实验室标准菌株(H37Rv)和109株MTB临床分离株,采用绝对浓度法进行表型药物敏感性试验(简称“表型药敏试验”)和基因测序... 目的设计和评价微测序基因芯片检测结核分枝杆菌(MTB)耐药性的价值。方法于北京结核病临床数据和样本资源库选取MTB实验室标准菌株(H37Rv)和109株MTB临床分离株,采用绝对浓度法进行表型药物敏感性试验(简称“表型药敏试验”)和基因测序法检测MTB耐药相关基因突变(包括inhA、katG、rpsL、gyrA、rrs、eis、rpoB和embB基因)。以荧光标记探针为基本检测原理设计制备微测序基因芯片,检测109株MTB临床分离株耐药基因突变,分析微测序基因芯片的检测效能。结果通过表型药敏试验及基因测序检测,明确了109株MTB临床分离株耐药相关基因(inhA、katG、rpsL、gyrA、rrs、eis、rpoB和embB基因)突变位点及突变形式。微测序耐药检测基因芯片初期设计包含了katG、inhA、rpoB、gyrA、embB、rpsL、rrs和eis基因的目前已报道的所有突变位点的全部已知突变形式,共计220条探针,并确认出67条优秀探针。采用包含67条探针的微测序耐药检测基因芯片对109株MTB临床分离株进行检测。结果发现,与测序结果相比,除检测embB基因突变的2条探针外,其余65条探针检测碱基突变形式的符合率均超过95%,其中42条探针检测的符合率达到100.00%。以测序结果为参照标准,基因芯片检测对embB基因、gyrA基因、inhA基因、katG基因、rpoB基因、rpsL基因、eis基因和rrs基因突变检测的敏感度分别为64.21%(61/95)、80.00%(8/10)、95.83%(23/24)、98.55%(68/69)、92.63%(88/95)、93.85%(61/65)、75.00%(3/4)和94.44%(17/18);特异度分别为92.86%(13/14)、100.00%(99/99)、97.65%(83/85)、87.50%(35/40)、85.71%(12/14)、63.64%(28/44)、100.00%(105/105)和98.90%(90/91);Kappa值分别为0.29、0.88、0.92、0.88、0.68、0.60、0.85、0.93。结论本研究研发设计了一套包含67条探针微测序耐药基因检测芯片,经过初步验证后证明其检测MTB耐药相关基因突变的效能较好,对embB基因的耐药检测探针还需进一步优 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 结核 抗多种药物性 微生物敏感性试验 基因 突变 芯片分析技术 技术评估 生物医学
呼吸道合胞体病毒感染患儿鼻黏膜拭子样品微RNA表达 预览
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作者 张伟 王燕 +2 位作者 曾毅文 邹国涛 罗勇 《重庆医学》 CAS 2019年第8期1344-1347,1353共5页
目的研究呼吸道合胞体病毒(RSV)感染患儿鼻黏膜拭子样品微RNA(miRNA)表达及与症状轻重间的关系。方法选取2017年9月至2018年2月该院收治的26例确诊为RSV感染阳性患儿作为试验组,按临床症状分轻度17例,重度9例。选择同期来院儿保门诊就诊... 目的研究呼吸道合胞体病毒(RSV)感染患儿鼻黏膜拭子样品微RNA(miRNA)表达及与症状轻重间的关系。方法选取2017年9月至2018年2月该院收治的26例确诊为RSV感染阳性患儿作为试验组,按临床症状分轻度17例,重度9例。选择同期来院儿保门诊就诊的12例健康儿童作为对照组。采集鼻黏膜上皮脱落细胞样品,通过miRNAs微阵列芯片分析其中2例重度、2例轻度和2例健康儿童的miRNA表达谱,通过qPCR对微阵列芯片筛选出的差异表达的24个miRNA进行验证。结果与对照组比较,试验组患儿miR-320d、miR-34b、miR-125a和miR-429表达下调,而miR-155、miR-203a和miR-106b表达上调;miR-125a在轻度患儿中的表达水平低于重度患儿(t=6.48,P<0.05)。结论RSV感染阳性患儿鼻黏膜脱落细胞差异表达miRNA与免疫系统密切相关,而与NF-κB信号通路相关的miR-125a能够解释RSV感染患儿疾病严重程度的差异。 展开更多
关键词 呼吸道合胞体病毒 微RNAs 鼻黏膜 儿童 芯片分析技术
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基因芯片与线性探针技术检测涂阳肺结核患者痰标本MTB耐药性的价值
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作者 刘元 周俊 +2 位作者 崔晓利 雷佳媛 党丽云 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2019年第7期738-742,共5页
目的评价基因芯片技术与线性探针技术(GenoType MTBDRplus)快速检测MTB耐药性的临床应用价值。方法选取西安市胸科医院2017年4月至2018年8月住院治疗的493例涂阳肺结核患者作为研究对象,收集其痰标本,痰标本量均不少于2ml。每例患者用... 目的评价基因芯片技术与线性探针技术(GenoType MTBDRplus)快速检测MTB耐药性的临床应用价值。方法选取西安市胸科医院2017年4月至2018年8月住院治疗的493例涂阳肺结核患者作为研究对象,收集其痰标本,痰标本量均不少于2ml。每例患者用同一份痰标本分别进行基因芯片检测、线性探针检测和BACTEC MGIT 960液体培养(简称“MGIT 960液体培养”),同时对培养阳性且鉴定为MTB的临床分离株进行MGIT 960液体药物敏感性试验(简称“药敏试验”)。以MGIT 960液体药敏试验结果为参照标准,分析基因芯片技术及线性探针技术检测涂阳肺结核患者痰标本MTB利福平和异烟肼耐药性的效能。结果 454例研究对象同时具有3种药敏试验检测结果。以MGIT 960液体药敏试验结果为参照标准,基因芯片法和线性探针法检测涂阳肺结核患者痰标本MTB利福平耐药性的敏感度、特异度、Kappa值分别为89.0%(65/73)、96.1%(366/381)、0.82和90.4%(66/73)、96.1%(366/381)、0.83;检测涂阳肺结核患者痰标本MTB异烟肼耐药性的敏感度、特异度、Kappa值分别为80.2%(93/116)、96.7%(327/338)、0.80和81.9%(95/116)、97.0%(328/338)、0.82。454例涂阳肺结核患者痰标本中,453例应用2种分子生物学检测方法检测MTB利福平耐药性结果相同,符合率为99.8%;445例应用2种分子生物学方法检测MTB异烟肼耐药性结果相同,符合率为98.0%。结论基因芯片技术和线性探针技术(GenoType MTBDRplus)检测涂阳肺结核患者痰标本MTB利福平和异烟肼耐药性与MGIT 960液体药敏试验具有较高的一致性,二者均可为临床提供快速、特异的耐药检测结果。 展开更多
关键词 结核 抗多种药物性 芯片分析技术 分子探针技术 利福平 异烟肼 对比研究
结核抗体检测辅助诊断结核病的价值研究 被引量:2
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作者 黄芳 党丽云 《中国防痨杂志》 CAS 2018年第1期41-46,共6页
目的 探讨应用结核抗体IgG检测试剂盒辅助诊断结核病的价值。方法 选择2013年1月至2016年12月在西安市胸科医院明确诊断为结核病的患者795例(TB组)、非结核分枝杆菌病的患者36例(NTM组),及除外TB与NTM的其他肺部疾患的患者185例(... 目的 探讨应用结核抗体IgG检测试剂盒辅助诊断结核病的价值。方法 选择2013年1月至2016年12月在西安市胸科医院明确诊断为结核病的患者795例(TB组)、非结核分枝杆菌病的患者36例(NTM组),及除外TB与NTM的其他肺部疾患的患者185例(对照组)。回顾性分析所有患者采用结核抗体检测的结果,以临床诊断及结核分枝杆菌培养结果为标准计算结核抗体检测的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值等,TB组与NTM组、对照组阳性率的比较采用卡方检验,评价结核抗体检测的应用价值。结果 以临床诊断为标准,结核抗体IgG检测的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、漏诊率、误诊率、患病率、准确度、约登指数分别为42.01%(334/795)、82.81%(183/221)、89.78%(334/372)、28.42%(183/644)、57.99%(461/795)、17.19%(38/221)、78.25%(795/1016)、50.89%(517/1016)、0.25;以结核分枝杆菌培养结果为标准,结核抗体检测的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、漏诊率、误诊率、患病率、准确度、约登指数分别为51.12%(160/313)、69.84%(491/703)、43.01%(160/372)、76.24%(491/644)、48.88%(153/313)、30.16%(212/703)、30.81%(313/1016)、64.07%(651/1016)、0.21。TB组、NTM组、菌阳肺结核、菌阴肺结核、结核性脑膜炎、结核性胸膜炎和(或)腹膜炎、结核性心包炎的结核抗体检测的阳性率分别为42.01%(334/795)、61.11%(22/36)、50.00%(80/160)、41.99%(97/231)、46.43%(13/28)、38.76%(138/356)、30.00%(6/20),各类结核病结核抗体检测阳性率差异无统计学意义(χ2=7.14,P=0.128)。而TB组(42.01%,334/795)、NTM组(61.11%,22/36)、对照组(8.65%,16/185)中以NTM组结核抗体检测阳性率最高,三组差异有统计学意义(χ2=81.63,P=0.000)。结论 应用结核分枝杆菌抗体IgG检测的敏感度、准确度均� 展开更多
关键词 结核 抗原抗体反应 芯片分析技术 实验室技术和方法 评价研究
结核抗体检测对活动性肺结核的诊断价值评价 被引量:4
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作者 杨松 严晓峰 +2 位作者 曾晓刚 谭顺 郭建琼 《中国防痨杂志》 CAS 2018年第1期47-52,共6页
目的 评价结核抗体检测对活动性肺结核的诊断价值。方法 收集2016年8月至2017年8月在重庆市公共卫生医疗救治中心结核科住院的495例活动性肺结核患者(观察组)和158例非结核呼吸道疾病患者(对照组),均为综合患者的临床表现、胸部影... 目的 评价结核抗体检测对活动性肺结核的诊断价值。方法 收集2016年8月至2017年8月在重庆市公共卫生医疗救治中心结核科住院的495例活动性肺结核患者(观察组)和158例非结核呼吸道疾病患者(对照组),均为综合患者的临床表现、胸部影像、痰细菌病原学检测或诊断性抗结核药物治疗有效等资料临床确诊后进行血清学诊断。分析血清MTB免疫球蛋白G(immunoglobulin G,IgG)、免疫球蛋白M(immunoglobulin M,IgM)、脂阿拉伯甘露聚糖(lipoarabinomannan,LAM),以及相对分子质量16 000(以下采用“16 kD”表示)和相对分子质量38 000(以下采用“38 kD”表示)的蛋白抗体的检测资料,以及单独及联合检测不同结核抗原(LAM、38 kD和16 kD)的结果,评价两组患者结核抗体检测的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值,以及对活动性肺结核的诊断效能。结果 495例观察组患者血清结核抗体检测阳性率[68.7%(340/495)]明显高于158例对照组患者[34.8%(55/158)],差异有统计学意义(χ2=57.50,P<0.01);菌阴肺结核患者血清结核抗体检测阳性率[64.0%(210/328)]明显低于菌阳肺结核患者[77.8%(130/167)],差异有统计学意义(χ2=9.83,P〈0.01)。观察组340例结核抗体阳性患者中,LAM、38 kD、IgG抗体联合检测同时均阳性的患者最多[61.8%(210/340)];对照组55例结核抗体阳性患者中,单一IgG抗体阳性最高[67.3%(37/55)]。以临床诊断为标准,血清结核抗体对活动性肺结核的诊断敏感度、特异度、阳性预测值和阴性预测值、总符合率、约登指数分别为68.7%(340/495)、65.2%(103/158)、86.1%(340/395)和39.9%(103/258)、67.8%(443/653)、0.34。结论 血清结核抗体检测活动性肺结核患者具有较高的阳性率和敏感度,对诊断活动性肺结核具有一定的辅助价值,其中菌阳肺结核患者的检测阳性率高于菌阴肺结核,LAM、 展开更多
关键词 结核 抗原抗体反应 实验室技术和方法 芯片分析技术 诊断 评价研究
慢性肾脏病中Cyr61加权基因共表达网络分析 预览
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作者 李宸羽 刘晓宇 +1 位作者 刘航 徐岩 《精准医学杂志》 2018年第1期28-33,共6页
目的使用加权基因共表达分析(WGCNA)构建慢性肾脏病(Choic Kidncy Discase,CKD)基因共表达网络,研究富含半胱氨酸蛋白61(Cyr61)基因在CKD肾小球及肾间质中表达情况,并探讨Cyr61基因是否为CKD枢纽基因。方法在公共基因芯片数据库NCBI GE... 目的使用加权基因共表达分析(WGCNA)构建慢性肾脏病(Choic Kidncy Discase,CKD)基因共表达网络,研究富含半胱氨酸蛋白61(Cyr61)基因在CKD肾小球及肾间质中表达情况,并探讨Cyr61基因是否为CKD枢纽基因。方法在公共基因芯片数据库NCBI GEO中搜集CKD相关样本,获得2个基因芯片平台共373个样本,其中包含正常对照和7种CKD,并按照样本的来源分为肾小球组及肾间质组。使用WGCNA包对表达差异基因进行基因共表达分析,识别与CKD发生相关性最高的枢纽基因,并获得Cyr61与其他枢纽基因的相关程度。结果与正常肾组织相比,Cyr61基因在高血压肾病、微小病变性肾病、膜性肾病、狼疮性肾炎、局灶阶段性肾小球硬化肾小球及肾间质中表达均降低,差异具有统计学意义;而在gA肾病中只有肾间质中表达降低,差异具有统计学意义。基因共表达分析结果显示,Cyr61基因为CKD发生的枢纽基因。相关分析结果显示,Cyr61基因与MAFF、JUN、KIF6基因间拓扑重叠系数>0.10,与ATF3JUNB基因间拓扑重叠系数>0.09,与EGRKMYC、GDF15、HBEGF、GEM、CCL2、RHOB、TRIBl基因间拓扑重叠系数>0.06。结论Cyr61基因在CKD中表达普遍下降;基因共表达分析结果显示,Cyr61基因为CKD发生的枢纽基因,并且MAFFJUN、KIF6、ATF3、UNB与Cyr61基因高度相关。 展开更多
关键词 肾疾病 半胱氨酸 基因表达 计算生物学 芯片分析技术 枢纽基因
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应用基因芯片技术筛选结直肠癌中差异DNA甲基化位点 预览
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作者 余捷 王梓桦 +1 位作者 杨世英 薛寒冰 《胃肠病学》 2018年第6期330-335,共6页
背景:DNA甲基化作为表观遗传学修饰的重要组成部分,与结直肠癌等多种肿瘤的发生、发展密切相关,但具体作用机制尚未完全明确。筛选特异性甲基化基因和构建肿瘤的甲基化表达谱已成为当前研究热点。目的:应用基因甲基化芯片技术初步筛选... 背景:DNA甲基化作为表观遗传学修饰的重要组成部分,与结直肠癌等多种肿瘤的发生、发展密切相关,但具体作用机制尚未完全明确。筛选特异性甲基化基因和构建肿瘤的甲基化表达谱已成为当前研究热点。目的:应用基因甲基化芯片技术初步筛选结直肠癌组织与癌旁正常黏膜组织间差异甲基化位点,构建特异性结直肠癌差异甲基化基因谱。方法:应用甲基化450K芯片技术对6例结直肠癌及其癌旁组织进行甲基化分析,共分析位点431 467个,按P值筛选出异常甲基化位点,按甲基化β值差值区分高甲基化位点和低甲基化位点;对筛选出的差异甲基化位点进一步行GO分析和KEGG分析,了解差异甲基化位点的功能。结果:共检出结直肠癌和癌旁正常组织显著差异的甲基化位点3 649个,其中高甲基化位点1 259个,主要分布于基因启动子区和基因体,筛选出特异的SLC15A3等高甲基化基因;低甲基化位点共2 390个,主要分布于基因间区和基因体,筛选出特异的ACOT2、TTLL8、UHRF1等低甲基化基因。GO分析和KEGG分析发现,这些基因功能与DNA结合、转录因子活性、信号转导通路等有关。结论:结直肠癌和癌旁正常组织存在大量差异甲基化位点,提示DNA异常甲基化与结直肠癌的发生、发展密切相关。基因芯片技术可用于结直肠癌差异甲基化位点的初筛,但构建结直肠癌差异甲基化谱作为临床分子标记物仍需行进一步验证。 展开更多
关键词 DNA甲基化 结直肠肿瘤 芯片分析技术
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微流控技术在临床检验中的应用 被引量:1
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作者 邹丽辉 李英 肖飞 《中华检验医学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第9期631-633,共3页
目前,临床检验正在向两种不同方向发展,一种是高度流水线化的中心实验室,一种是高度集成的便携式检测系统.后者从早期的单个项目检测,逐渐演化为基于微流控技术的集成平台,可以同时执行多个实验步骤和测试,进而形成包括生化、免疫、微... 目前,临床检验正在向两种不同方向发展,一种是高度流水线化的中心实验室,一种是高度集成的便携式检测系统.后者从早期的单个项目检测,逐渐演化为基于微流控技术的集成平台,可以同时执行多个实验步骤和测试,进而形成包括生化、免疫、微生物、细胞学检测的全套微型实验体系,这些基于微流控技术的快速诊断系统将伴随我国的医改进程,下沉到基层的医疗机构甚至家庭.本文综述了目前微流控技术在临床检验领域的应用现状以及未来发展趋势. 展开更多
关键词 芯片分析技术 微流体学 临床实验室技术
感染性疾病现场快速检验技术的现状与未来 被引量:1
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作者 吴文娟 《中华检验医学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第9期641-643,共3页
感染性疾病病原诊断在抗菌药物合理应用,疾病流行病学监测和管理以及控制传播等方面发挥着核心作用.理想的感染病现场快速检验方法应具有敏感、快速、特异、稳定、低成本和便于使用的特点.本文概览了POCT在感染病抗原检测、抗体检测、... 感染性疾病病原诊断在抗菌药物合理应用,疾病流行病学监测和管理以及控制传播等方面发挥着核心作用.理想的感染病现场快速检验方法应具有敏感、快速、特异、稳定、低成本和便于使用的特点.本文概览了POCT在感染病抗原检测、抗体检测、核酸检测等方面的临床应用状况,并重点介绍了微流控技术在病原体多重核酸检测和耐药性检测等方面的优势和潜力.选择合适的时间、合适的场所、正确应用现场快速诊断技术,将为分级诊疗模式下的感染病诊治提供新的策略. 展开更多
关键词 感染性疾病 即时检验 微流体学 芯片分析技术
蛇床子素通过上调微RNA-101a-3p抑制阿尔茨海默病细胞淀粉样前体蛋白表达 预览
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作者 蔺莹 姚璎珈 +6 位作者 梁喜才 时悦 孔亮 肖洪贺 吴雨桐 倪颖男 杨静娴 《浙江大学学报:医学版》 CSCD 北大核心 2018年第5期473-479,共7页
目的:研究阿尔茨海默病细胞模型中蛇床子素抑制淀粉样前体蛋白(APP)的作用及机制。方法:脂质体2000转染建立APP高表达的SH-SY5Y细胞模型。利用MTT和乳酸脱氢酶(LDH)法检测蛇床子素对APP高表达细胞的存活率和损伤程度的影响。利用基因芯... 目的:研究阿尔茨海默病细胞模型中蛇床子素抑制淀粉样前体蛋白(APP)的作用及机制。方法:脂质体2000转染建立APP高表达的SH-SY5Y细胞模型。利用MTT和乳酸脱氢酶(LDH)法检测蛇床子素对APP高表达细胞的存活率和损伤程度的影响。利用基因芯片技术筛选给予蛇床子素治疗后差异表达的微RNA(miRNA),然后通过生物信息学分析预测与差异表达miRNA靶向结合的基因。细胞内转入差异表达miRNA的抑制剂,然后采用免疫荧光细胞化学法观察细胞中APP、β淀粉样蛋白(Aβ)表达情况,RT-PCR法检测细胞中APP mRNA表达。结果:实验成功构建了APP高表达的阿尔茨海默病细胞模型。MTT和LDH法检测结果显示,蛇床子素对于APP高表达的细胞具有一定的保护作用,可以减轻细胞的损伤。miRNA-101a-3p是蛇床子素调控较明显的miRNA,其与APP的3’非翻译区靶向结合。与模型对照组比较,miR-101a-3p抑制剂组APP和Aβ蛋白荧光强度增加,APP mRNA表达量增加(均P<0.01);加入蛇床子素后细胞中APP和Aβ蛋白荧光强度降低,APP mRNA表达量减少(均P<0.01)。结论:在阿尔茨海默病细胞模型中,蛇床子素通过上调miR-101a-3p抑制APP表达。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 蛇床子素/药理学 微RNAs 淀粉样Β蛋白前体 蛋白质阵列分析 芯片分析技术
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人脑胶质瘤组织中趋化因子受体和血管内皮细胞生长因子的表达 预览
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作者 田陈 吴芳 +3 位作者 于海云 郭郑旻 李宁 李红梅 《贵州医科大学学报》 CAS 2018年第9期1046-1049,1064共5页
目的: 探讨趋化因子受体(CXCR7)和血管内皮细胞生长因子(VEGF)在胶质瘤患者肿瘤组织的表达及其与胶质瘤发生发展的关系。 方法: 应用组织芯片技术及免疫组织化学SP法,检测10例正常脑组织和69例胶质瘤组织CXCR7和VEGF的表达水平... 目的: 探讨趋化因子受体(CXCR7)和血管内皮细胞生长因子(VEGF)在胶质瘤患者肿瘤组织的表达及其与胶质瘤发生发展的关系。 方法: 应用组织芯片技术及免疫组织化学SP法,检测10例正常脑组织和69例胶质瘤组织CXCR7和VEGF的表达水平,比较不同病理分级胶质瘤组织中CXCR7和VEGF的表达水平,采用 Spearman 法分析胶质瘤组织中 CXCR7和VEGF的相关性。 结果: 正常脑组织(对照组)、低级别胶质瘤组及高级别胶质瘤组患者脑组织中CXCR7、VEGF的表达阳性率逐渐升高,组间比较差异有统计学意义( P <0.05); CXCR7、VEGF表达随胶质瘤恶性程度的增加表达逐渐上调,呈正相关( r =0.327, P <0.01); Spearman 等级分析显示,CXCR7与VEGF在69例胶质瘤组织中的表达呈正相关关系( r =0.327, P <0.01)。 结论: CXCR7及VEGF在胶质瘤组织中表达上调,且随着肿瘤恶性程度的增高而增强,CXCR7和VEGF在胶质瘤的发生、发展过程中可能起协同作用。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 趋化因子受体 血管内皮细胞生长因子 免疫组织化学 芯片分析技术 基因表达
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Isatin抑制神经母细胞瘤机制的基因芯片技术研究 预览
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作者 赵圣敏 侯琳 +1 位作者 华亚男 魏尧悦 《齐鲁医学杂志》 2017年第2期139-141,146共4页
目的采用基因芯片技术研究2,3-吲哚醌(Isatin)抑制神经母细胞瘤的作用机制,并筛选与侵袭转移相关的可能效应靶点。方法体外培养神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞,采用CCK8方法检测不同浓度Isatin处理组的细胞活力,用Affymetrix表达谱芯片检测I... 目的采用基因芯片技术研究2,3-吲哚醌(Isatin)抑制神经母细胞瘤的作用机制,并筛选与侵袭转移相关的可能效应靶点。方法体外培养神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞,采用CCK8方法检测不同浓度Isatin处理组的细胞活力,用Affymetrix表达谱芯片检测Isatin对SH-SY5Y细胞基因表达谱的影响,然后用GeneGo软件进行GO分类分析,使用BIOCARTA和KEGG数据库筛选与侵袭转移相关的靶点。结果 Isatin对SH-SY5Y细胞的半抑制浓度为279.7μmol/L。与空白对照组相比,Isatin作用后,有284个基因上调,145个基因下调。GO分析显示,Isatin可以抑制细胞增殖、细胞循环,并对细胞内翻译、生物合成及代谢等过程有作用。哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路可能是侵袭转移相关的效应靶点,DDIT4、RHEB、EIF4EBP1、RPS6 KB1为mTOR信号通路的相关基因。结论 Isatin可能通过抑制mTOR信号通路,抑制SH-SY5Y细胞的侵袭转移。 展开更多
关键词 靛红 神经母细胞瘤 基因表达谱 芯片分析技术 肿瘤转移
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Affymetrix基因表达谱芯片技术筛选胰腺癌异常表达基因的研究 被引量:4
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作者 易超 依马木买买提江·阿布拉 +3 位作者 丁伟 苏雅婷 晏冬 李海军 《中国普通外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期294-303,共10页
目的:利用基因表达谱芯片筛选出胰腺癌组织与癌旁正常组织的差异表达基因。方法:收集新疆医科大学第二三附属医院2014年1月-2016年6月间手术切除的10例胰腺导管细胞癌组织及其相应癌旁正常组织,用TRIzol法提取总RNA后采用含49395个... 目的:利用基因表达谱芯片筛选出胰腺癌组织与癌旁正常组织的差异表达基因。方法:收集新疆医科大学第二三附属医院2014年1月-2016年6月间手术切除的10例胰腺导管细胞癌组织及其相应癌旁正常组织,用TRIzol法提取总RNA后采用含49395个基因探针的Affvmetrix基因表达谱芯片筛选出差异表达基因,并行GO分析和pathway分析,对部分差异表达基因行实时定量PCR法验证表达情况。结果:样本总RNA检测合格,基因芯片质量评估良好,检测结果可靠且可重复性高。经芯片降噪处理后共检测38079个基因,其中存在差异表达的基因共512个,表达上调的基因419个,表达下调的基因93个;共287个差异表达基因编码与3个GO分类(生物学过程、分子功能、细胞组分)相关的蛋白;共29条信号通路存在明显基因差异表达,涉及126个基因。经PCR验证,差异表达基因CPBl、CELA3B、CPAl、POSTN、PLA2G1B、CTRC及SPINKl的表达情况与基因芯片检测结果吻合。结论:胰腺导管细胞癌组织与癌旁正常组织问存在大量差异表达的基因,这些基因主要与生物学过程、分子功能及细胞组分相关,且参与了多个细胞信号通路的调控。 展开更多
关键词 胰腺肿瘤 基因表达谱 芯片分析技术 基因本体 信号传导
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