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2017年江苏省急性驰缓性麻痹患者感染非脊髓灰质炎肠道病毒的鉴定分析
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作者 戚宇华 冷红英 +2 位作者 陈强 吴昀 郭宏雄 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第4期417-419,425共4页
目的对2017年江苏省急性驰缓性麻痹(AFP)患者粪便中分离的非脊髓灰质炎肠道病毒(NPEV)进行分型鉴定。方法收集249例AFP患者粪便,分离NPEV病毒,采用多对引物RT-PCR扩增VP1区基因序列并测序,进行Blast比对和基因进化树分析。结果共分离出N... 目的对2017年江苏省急性驰缓性麻痹(AFP)患者粪便中分离的非脊髓灰质炎肠道病毒(NPEV)进行分型鉴定。方法收集249例AFP患者粪便,分离NPEV病毒,采用多对引物RT-PCR扩增VP1区基因序列并测序,进行Blast比对和基因进化树分析。结果共分离出NPEV13株,RT-PCR扩增VP1区基因后进行测序分型,其中3株为肠道病毒A群(CVA2 2株,CVA10 1株);8株为肠道病毒B群(E6 2株,E11 2株,CVB5、E3、E5、E25各1株);2株为混合感染(A群中的CVA8+B群的E11和B群的CVB5+E6);未分离到C群和D群毒株。结论2017年江苏省AFP患者肠道中的NPEV以HEV-B群为优势群,其次为HEV-A群,可为本地NPEV的病原谱研究提供依据。 展开更多
关键词 非脊髓灰质炎肠道病毒 急性驰缓性麻痹病例 分子分型 鉴定
林木根际细菌JYZ-SD5的促生抗逆性能及种类鉴定 预览
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作者 徐秀倩 吴小芹 +1 位作者 吴天宇 曾梦嫚 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期31-38,共8页
旨在探究林木根际细菌JYZ-SD5促生抗逆性能,以期揭示该菌在野外应用的价值。采用特定培养基定性检测该菌的固氮解磷解钾特性,测定该菌产IAA能力;平板对峙法检测菌株拮抗病原真菌活性;检测该菌重金属耐受性;将根际细菌JYZSD5施用于水杉... 旨在探究林木根际细菌JYZ-SD5促生抗逆性能,以期揭示该菌在野外应用的价值。采用特定培养基定性检测该菌的固氮解磷解钾特性,测定该菌产IAA能力;平板对峙法检测菌株拮抗病原真菌活性;检测该菌重金属耐受性;将根际细菌JYZSD5施用于水杉盆栽幼苗,观测对水杉生长的影响;采用形态、生理生化测试及16S rRNA基因序列分析,对菌株JYZ-SD5进行种类鉴定。结果显示,菌株JYZ-SD5具有固氮、解磷、解钾的能力;不加色氨酸前提下产IAA量可达6.818 6μg/mL;对链格孢(Alternaria sp.)、异色状拟盘多毛孢(Pestalotiopsis vesicolor)有一定拮抗活性,可产生蛋白酶和纤维素酶;对重金属Mn7+、Cr6+耐受性强,最高均可达400 mg/L;温室盆栽试验表明,根际细菌JYZ-SD5可提高水杉苗木叶绿素相对含量,对水杉株高和地径增长具有促进作用。结合形态学、生理生化和分子鉴定的方法初步确定该菌为拟蕈状芽孢杆菌(Bacillus paramycoides)。根际细菌JYZ-SD5具有良好的促生抗逆特性,具有成为新型生物菌肥的开发潜力和野外应用价值。 展开更多
关键词 根际细菌 促生特性 抗逆特性 种类鉴定
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矮化核桃枝枯病病原菌的形态与分子鉴定 预览
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作者 程相瑞 李丙雪 +2 位作者 卢靖天 陈倩倩 康业斌 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期78-82,133共6页
为了明确河南省洛阳地区核桃枝条一种新病害的病原种类,对采自田间的典型症状枝条进行了常规组织分离,对单孢菌株进行了形态鉴定、rDNA ITS序列分析及致病性测定。结果表明,病原菌在PDA培养基上菌落初为白色,随着色素的积累,由中心向边... 为了明确河南省洛阳地区核桃枝条一种新病害的病原种类,对采自田间的典型症状枝条进行了常规组织分离,对单孢菌株进行了形态鉴定、rDNA ITS序列分析及致病性测定。结果表明,病原菌在PDA培养基上菌落初为白色,随着色素的积累,由中心向边缘变为灰绿色,再变成墨绿色,最终全部变成黑色;气生菌丝棉絮毛状,菌落边缘不整齐,近圆形或不规则形。分生孢子器散生或聚生,呈黑色小粒状,分生孢子器球形或近球形,深褐色,具孔口;分生孢子梗短缺,无色,杆状,末端产生分生孢子;分生孢子梭形、纺锤形,无色,无隔,基部钝圆,顶部稍尖,单孢(24.5~ 29.0)μm×(4.8~7.5)μm。离体枝条接种结果表明,该菌能侵染核桃枝条引起与田间相同的症状。据此将分离物鉴定为葡萄座腔菌 Botryosphaeria dothidea 。 展开更多
关键词 核桃 枝枯病 葡萄座腔菌 形态鉴定 分子鉴定
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寄生醉马草的孢囊线虫种类鉴定 预览
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作者 张译文 李惠霞 +3 位作者 陈秀菊 徐鹏刚 郭静 张淑玲 《草业科学》 CAS CSCD 2019年第5期1283-1291,共9页
为了解孢囊线虫在禾本科牧草上的寄生情况,2017年8月中旬采集甘肃省天祝高寒草原禾本科牧草根及根际土样,通过简易漂浮法分离孢囊线虫。结果发现,在醉马草(Achnathernm inebrians)根部观察到白色孢囊线虫,并从根际土样中分离到褐色孢囊... 为了解孢囊线虫在禾本科牧草上的寄生情况,2017年8月中旬采集甘肃省天祝高寒草原禾本科牧草根及根际土样,通过简易漂浮法分离孢囊线虫。结果发现,在醉马草(Achnathernm inebrians)根部观察到白色孢囊线虫,并从根际土样中分离到褐色孢囊。通过对该线虫群体阴门膜孔、阴门裂、阴门下桥、泡状突等形态特征进行观察和测量,初步将其鉴定为禾谷孢囊线虫(Heterodera avenae Wollenweber)。用最大似然法对该群体的ITS1-rDNA和28SrDNA序列在软件MEGA6.0构建系统发育树,结果显示:其ITS1序列与中国的H.avenae群体聚为一支,其相似性为99%;28S序列与捷克的H.avenae群体聚为一支,其相似性为99%。通过形态学和系统发育学综合分析,将醉马草上寄生的线虫群体鉴定为禾谷孢囊线虫,这是首次发现醉马草可被禾谷孢囊线虫寄生。该研究结果为醉马草的防治提供了理论依据。 展开更多
关键词 醉马草 禾谷孢囊线虫 形态鉴定 分子鉴定
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Identification of Microplankton in South China Sea with Image-Matching Individual PCR 预览
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作者 LI Si YANG Guanpin +1 位作者 ZHU Baohua PAN Kehou 《中国海洋大学学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第1期219-226,共8页
In this study,marine microplankton were identified by combining standard light microscopy with Sanger 18S rRNA gene sequencing.The image-matching individual PCR technique was applied to identify the image collectable ... In this study,marine microplankton were identified by combining standard light microscopy with Sanger 18S rRNA gene sequencing.The image-matching individual PCR technique was applied to identify the image collectable unicellular microplankton to genera.Instead of pure strain culture and morphological identification,microplankton individual cells were isolated and fixed with glutaraldehyde,frozen and stored for months.Finally,they were imaged under a microscope and molecularly identified via phylogenetic analysis of their 18S ribosomal RNA gene(18S rDNA).Microplankton cells were collected at 30 locations in South China Sea,and were assigned to 21 known and 4 unidentified genera(2 uncultured fungi and 2 uncultured stramenopiles)with phylogenetic analysis in parallel to the morphological identification. 展开更多
关键词 image-matching INDIVIDUAL PCR MICROPLANKTON 18S ribosomal RNA gene morphological IDENTIFICATION molecular IDENTIFICATION South China Sea
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洛阳烟区烟株根围抗烟草疫霉放线菌的筛选与鉴定 预览
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作者 陈奇园 丁钥琪 +2 位作者 赵世民 李淑君 康业斌 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期22-28,共7页
为筛选对烟草疫霉具有拮抗作用的放线菌菌株,有效防治烟草黑胫病,对洛阳烟区烟株根围土壤中分离的放线菌采用改良平板对峙法与菌丝生长速率法测定了供试菌株及其发酵液对烟草疫霉的拮抗作用,并通过形态学观察、生理生化测定及16S rDNA... 为筛选对烟草疫霉具有拮抗作用的放线菌菌株,有效防治烟草黑胫病,对洛阳烟区烟株根围土壤中分离的放线菌采用改良平板对峙法与菌丝生长速率法测定了供试菌株及其发酵液对烟草疫霉的拮抗作用,并通过形态学观察、生理生化测定及16S rDNA序列分析鉴定了优势拮抗放线菌的种类。结果表明:在获得的227个放线菌单菌落中,8个菌株的发酵液对烟草疫霉菌丝生长的抑制率达100%,被确定为优势拮抗放线菌。根据这些菌株的形态学观察、生理生化反应与16S rDNA序列分析结果,将菌株YY75鉴定为鲁萨链霉菌(Streptomyces lucensis),菌株YY124、YY135鉴定为高贵链霉菌(S. nobilis),菌株LN204、LN221、LN247鉴定为娄彻链霉菌(S. rochei),菌株SX92鉴定为珊瑚链霉菌(S. coralus),菌株SX59鉴定为金黄回旋链霉(S. aureoverticillatus),均属于放线菌门、放线菌纲、链霉菌目、链霉菌科、链霉菌属。 展开更多
关键词 洛阳烟区 烟草 烟草疫霉 拮抗放线菌 形态鉴定 分子鉴定
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牦牛肺炎病原多杀性巴氏杆菌和殊异支原体的分子鉴定与分析 预览
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作者 张学勇 郭志宏 +6 位作者 简莹娜 朵红 沈秀英 马怡隽 付永 宋永武 才让周在 《青海畜牧兽医杂志》 2019年第2期39-42,55共5页
青海省刚察县某牦牛产业基地牦牛发生咳嗽,鼻孔有分泌物流出,呼吸困难等症状的疾病。为快速确诊发病牛的致病原因,及时防控和治疗,从发病和病死的牦牛中,采集鼻腔拭子和肺脏、胸腔积液,利用PCR方法进行分子鉴定与分析。结果显示:此牛场... 青海省刚察县某牦牛产业基地牦牛发生咳嗽,鼻孔有分泌物流出,呼吸困难等症状的疾病。为快速确诊发病牛的致病原因,及时防控和治疗,从发病和病死的牦牛中,采集鼻腔拭子和肺脏、胸腔积液,利用PCR方法进行分子鉴定与分析。结果显示:此牛场中引发肺炎的病原是A型多杀性巴氏杆菌和殊异支原体两种病原体混合感染,测序结果显示5个有效样品中鉴定的为完全相同的病原,P.multocida-GC1的Kmt基因与参考序列中国株CP031554/3/2/1同源性在99%以上,M.dispar-GC1与参考序列的16SrRNA基因同源性在97%以上。同时在遗传进化角度再次分析确认了鉴定的P.multocida与中国和俄罗斯的A型多杀性巴氏杆菌聚成一大支;鉴定的M.dispar与殊异支原体聚为一支。结果表明,青海刚察地区牦牛存在感染多杀性巴氏杆菌和殊异支原体的潜在风险,该研究为牦牛呼吸道疾病与肺炎的病原学调查和病原的流行病学调查提供了参考数据。 展开更多
关键词 牦牛 多杀性巴氏杆菌 殊异支原体 分子鉴定
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基于便携式和CFX96实时荧光PCR仪的冬虫夏草及其混伪品鉴定研究
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作者 贠凯祎 向丽 +3 位作者 王晓玥 刘杨 姚辉 宋经元 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期746-752,共7页
采用TaqMan探针实时荧光PCR方法对冬虫夏草及其混伪品进行分子鉴定研究。从100份冬虫夏草及其混伪品中提取总DNA,依据核糖体(rDNA)内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列,利用MEGA 7.0软件进行比较分析,找出冬虫夏草及... 采用TaqMan探针实时荧光PCR方法对冬虫夏草及其混伪品进行分子鉴定研究。从100份冬虫夏草及其混伪品中提取总DNA,依据核糖体(rDNA)内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列,利用MEGA 7.0软件进行比较分析,找出冬虫夏草及其混伪品的变异位点,通过Primer Premier 6.0软件设计一对特异性引物和TaqMan探针,分别在两种实时荧光PCR仪(Genesig q16和Bio-Rad CFX96)上进行灵敏度和特异性鉴定研究。灵敏度研究表明,在Bio-Rad CFX96系统中,该方法对冬虫夏草DNA模版的检测下限为0.016 ng·μL^-1;在Genesig q16系统中,该方法对冬虫夏草DNA模版的检测下限为15.527 ng·μL^-1。特异性鉴定研究表明,在Genesig q16和Bio-Rad CFX96系统上,该方法对冬虫夏草均具有良好的特异性,能与混伪品下垂虫草、古尼虫草、蛹虫草、蝉花、凉山虫草、新疆虫草明显区分。TaqMan探针实时荧光PCR方法可实现对冬虫夏草及其混伪品的准确鉴定,为药材市场的管理提供技术支撑,对名贵中药材的鉴别具有较好应用前景。 展开更多
关键词 冬虫夏草 TAQMAN探针 实时荧光PCR 分子鉴定
人造板表面微生物采集及真菌分子鉴定 预览
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作者 马星霞 张斌 +1 位作者 张景朋 蒋明亮 《中国人造板》 2019年第1期14-16,共3页
采取Petrifilm测试片法采集和培养微生物以及分子鉴定手段,快速鉴定人造板表面的微生物种类和数量,为人造板表面抗菌和防霉评价提供新方法。
关键词 表面微生物 霉菌 细菌 微生物采集 分子鉴定
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疣状毛癣菌致母女共患体癣分析 预览
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作者 尚盼盼 周亚斌 +3 位作者 汪旸 陈伟 万喆 王爱平 《中国麻风皮肤病杂志》 2019年第4期225-228,共4页
母亲上肢出现皮损1年,女儿面部皮损4个月,皮损表现为大小不一的环形红斑,表面覆有鳞屑及少许痂皮,境界清楚,边缘稍隆起。患者家中养牛。两例皮损真菌镜检均可见菌丝,真菌培养均阳性,分离菌株经表型及分子鉴定,两株菌均为疣状毛癣菌,体... 母亲上肢出现皮损1年,女儿面部皮损4个月,皮损表现为大小不一的环形红斑,表面覆有鳞屑及少许痂皮,境界清楚,边缘稍隆起。患者家中养牛。两例皮损真菌镜检均可见菌丝,真菌培养均阳性,分离菌株经表型及分子鉴定,两株菌均为疣状毛癣菌,体外药敏试验显示对伊曲康唑及特比萘芬均敏感。2例患者经口服和外用抗真菌药物联合治疗获痊愈。 展开更多
关键词 疣状毛癣菌 体癣 分子鉴定 药敏试验
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花楸烂皮病病原菌鉴定 预览
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作者 程德昊 贾含琪 +1 位作者 刘雪峰 董爱荣 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期83-87,共5页
为了鉴定花楸(Sorbus pohuashanensis(Hance)Hedl)烂皮病的病原,在东北林业大学校园采集到带病植物标本,进行了病原菌的分离和纯化;通过孢子悬浮液对花楸树健康枝条刺伤接种,完成了病害柯赫氏法则的验证。通过观察菌株菌落的宏观和微观... 为了鉴定花楸(Sorbus pohuashanensis(Hance)Hedl)烂皮病的病原,在东北林业大学校园采集到带病植物标本,进行了病原菌的分离和纯化;通过孢子悬浮液对花楸树健康枝条刺伤接种,完成了病害柯赫氏法则的验证。通过观察菌株菌落的宏观和微观形态,对比相关参考文献对病原菌进行了形态学鉴定;提取供试菌株DNA,进行rDNA-ITS序列的PCR扩增与测序,对比NCBI数据库对病菌进行分子鉴定。结果表明:孢子悬浮液接种在花楸枝条上发病的病症与自然条件下病症相同;与NCBI数据库比对,病原菌与普尔松白孔座壳菌(Leucostoma persoonii(Nitschke)Hhn.)在覆盖度为96%的范围内相似度为99%。因此,鉴定引起花楸烂皮病的病原菌为普尔松白孔座壳菌,其无性型为核果壳囊孢(Cytospora leucostoma(Speg.)Sacc.)。该病害为花楸上的国内新病害。 展开更多
关键词 花楸烂皮病 普尔松白孔座壳菌 核果壳囊孢 分子鉴定 新病害
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基于线粒体COI基因的印度新曲厉螨的分子鉴定 预览
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作者 邓洁 郭浩杰 +3 位作者 黄少康 林焱 黄伟峰 段辛乐 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2019年第2期380-386,共7页
本研究利用线粒体 COI 基因对印度新曲厉螨进行分子鉴定,以期为研究该螨的生物学习性及对蜜蜂的危害提供技术支持。分别从中华蜜蜂、意大利蜜蜂工蜂体上,以及桉树花序上采集试螨,扩增印度新曲厉螨的 COI 基因,并将获得的 COI 基因序列在... 本研究利用线粒体 COI 基因对印度新曲厉螨进行分子鉴定,以期为研究该螨的生物学习性及对蜜蜂的危害提供技术支持。分别从中华蜜蜂、意大利蜜蜂工蜂体上,以及桉树花序上采集试螨,扩增印度新曲厉螨的 COI 基因,并将获得的 COI 基因序列在Genbank中Blast对比;利用Genedoc软件分析基因序列的相似性;利用MEGA 7.0计算厉螨科不同种螨之间的遗传距离,构建 COI 基因的系统发育树。结果表明:采自中华蜜蜂、意大利蜜蜂及桉树花序上的印度新曲厉螨样本 COI 基因序列完全一致,均表现出明显的A/T碱基偏向性,与同属 Neocypholaelaps apicola 的 COI 基因序列的相似性为88%。基于 COI 基因的印度新曲厉螨的种内的遗传距离(0.00)显著小于与厉螨科6种螨的遗传距离(0.203~0.403)且不存在重叠区域。构建的 COI 基因的系统发育树显示,采自印度新曲厉螨样本 COI 与同属的 Neocypholaelaps apicola 聚同一进化枝,其它不同属螨则按照属的不同聚集在不同的进化枝。本研究所用的线粒体 COI 基因序列的差异可应用于印度新曲厉螨的分子鉴定。 展开更多
关键词 印度新曲厉螨 COI基因 分子鉴定
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基于ITS2序列位点特异性PCR鉴别广藿香及其混伪品
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作者 吴文如 安鑫 +2 位作者 来慧丽 杨璐 付菲 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期897-900,共4页
目的建立一种简便、准确鉴别广藿香及其混伪品的方法。方法通过对GenBank数据库收录的广藿香及其混伪品的ITS2序列进行对比分析,根据差异位点设计位点特异性鉴别引物,并优化PCR条件,对广藿香新鲜植物、干燥药材、含广藿香中成药及其混... 目的建立一种简便、准确鉴别广藿香及其混伪品的方法。方法通过对GenBank数据库收录的广藿香及其混伪品的ITS2序列进行对比分析,根据差异位点设计位点特异性鉴别引物,并优化PCR条件,对广藿香新鲜植物、干燥药材、含广藿香中成药及其混伪品进行扩增和检测。结果广藿香新鲜植物、干燥药材及含广藿香中成药均扩增出162 bp条带,而广藿香的混伪品均无条带,且该方法灵敏度高,检出限可达0.3 g·L^-1。结论所建立的位点特异性PCR方法可实现广藿香的准确鉴别,具有操作简便、稳定可靠、应用范围广的优点。 展开更多
关键词 广藿香 ITS2 位点特异性PCR 分子鉴定
利用siRNA高通量测序和RT-PCR技术鉴定引起茄子斑驳紫花病的病毒种类
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作者 柴阿丽 陈利达 +4 位作者 曹金强 康华军 石延霞 谢学文 李宝聚 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期508-518,共11页
为了明确引起茄子斑驳紫花病的病毒种类,利用小干扰RNA(si RNA)高通量测序技术,结合生物信息学方法寻找茄子样本中的病毒序列,发现存在烟草轻型绿花叶病毒(Tobacco mild green mosaic virus,TMGMV)和番茄斑驳花叶病毒(Tomato mottle mos... 为了明确引起茄子斑驳紫花病的病毒种类,利用小干扰RNA(si RNA)高通量测序技术,结合生物信息学方法寻找茄子样本中的病毒序列,发现存在烟草轻型绿花叶病毒(Tobacco mild green mosaic virus,TMGMV)和番茄斑驳花叶病毒(Tomato mottle mosaic virus,ToMMV)。为了验证该结果,对待测样品中TMGMV和ToMMV的外壳蛋白(coatprotein,CP)全长基因进行RT-PCR扩增和系统进化分析,分别得到500bp的TMGMV-CP和482bp的ToMMV-CP特异性条带,与GenBank中TMGMV和ToMMV序列相似性分别达到98%~100%和100%,说明待测样品中确实存在TMGMV和ToMMV。对采自山东、河南、辽宁、河北等地的23份疑似斑驳紫花病茄子样品,分别采用特异性引物524-F/R和ToMMV-F/R进行检测。结果显示,所有样品中均含有TMGMV,20份样品中含有ToMMV,复合侵染检出率为86.96%。对茄子、番茄和辣椒幼苗的致病性检测显示,接种后茄子花表现出与田间相同的症状,茄子、番茄和辣椒的叶片表现典型的病毒侵染症状,在接种发病组织中检测到病毒ToMMV和TMGMV。结果表明,茄子斑驳紫花病样中鉴定出TMGMV和ToMMV两种病毒。 展开更多
关键词 茄子斑驳紫花病 siRNA高通量测序 分子鉴定 烟草轻型绿花叶病毒 番茄斑驳花叶病毒
何首乌等位基因特异性PCR鉴别方法研究
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作者 解会群 赵玉姣 +3 位作者 查良平 程铭恩 彭华胜 彭代银 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期951-956,共6页
目的建立一种快速鉴别何首乌真伪的方法。方法通过何首乌及其混伪品的psb A-trn H基因序列,寻找SNP位点并设计特异性引物,对来自于不同产地的何首乌及其3个同属混伪品进行PCR扩增,优化反应体系条件,并对此方法进行考察。结果建立了何首... 目的建立一种快速鉴别何首乌真伪的方法。方法通过何首乌及其混伪品的psb A-trn H基因序列,寻找SNP位点并设计特异性引物,对来自于不同产地的何首乌及其3个同属混伪品进行PCR扩增,优化反应体系条件,并对此方法进行考察。结果建立了何首乌特异性PCR的方法,在退火温度48℃、循环次数30时仅有何首乌能扩增得到191 bp的特异性条带,伪品则无。结论等位基因特异性PCR鉴别何首乌真伪方法简单、可靠。 展开更多
关键词 何首乌 棱枝何首乌 等位基因特异性PCR PSBA-TRNH 分子鉴定
雷公山国家级自然保护区棉革菌属大型真菌形态描述及分子鉴定 预览
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作者 张文泉 罗国涛 姚庆智 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1-8,15共9页
为研究雷公山国家级自然保护区棉革菌属大型真菌的分类情况,探索棉革菌属(Tomentella)真菌对森林生态系统的重要意义。采用表型分析和rDNA-ITS序列分析等方法,对雷公山国家级自然保护区的棉革菌子实体样本进行形态观察并结合rDNA-ITS序... 为研究雷公山国家级自然保护区棉革菌属大型真菌的分类情况,探索棉革菌属(Tomentella)真菌对森林生态系统的重要意义。采用表型分析和rDNA-ITS序列分析等方法,对雷公山国家级自然保护区的棉革菌子实体样本进行形态观察并结合rDNA-ITS序列构建系统发育树。依据所采集的样品形态学特征将其分为7种类型,并对其特征进行详细描述。对7种类型的rDNA-ITS序列采用贝叶斯法构建系统发育树,分析得出:该7种类型的子实体均属于棉革菌属,首次对雷公山自然保护区棉革菌属大型真菌进行报道,可为棉革菌对雷公山自然保护区森林生态系统的功能研究等提供参考。 展开更多
关键词 棉革菌 大型真菌 形态特征 分子鉴定
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基于DNA条形码的桑黄真菌分子鉴定 预览
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作者 徐鑫 边勇 +5 位作者 陈哲 孙悦 刘子璐 胡渤洋 武扬 张国庆 《北京农学院学报》 2019年第1期20-27,共8页
DNA条形码(DNA barcoding)技术是一种利用生物基因组内短遗传标签进行分类鉴定的方法.桑黄自古以来是一种名贵中药材,而市售桑黄主要依托简单的形态鉴定造成混淆众多.近年来大量研究表明,桑黄类真菌种类至少有7个种,并且其药效也不尽相... DNA条形码(DNA barcoding)技术是一种利用生物基因组内短遗传标签进行分类鉴定的方法.桑黄自古以来是一种名贵中药材,而市售桑黄主要依托简单的形态鉴定造成混淆众多.近年来大量研究表明,桑黄类真菌种类至少有7个种,并且其药效也不尽相同.【目的】为更准确、高效对桑黄类真菌进行鉴定,本研究以采集自西藏、吉林和浙江的3种桑黄子实体为材料,筛选最佳DNA条形码与相应PCR条件.【方法】利用组织分离获得3种桑黄纯培养菌株,分别编号为1713、1714和HS菌株.利用ITS、NL、rpb1、rpb2和ef1-α等7组DNA条形码分别对3种桑黄进行PCR扩增、测序、比对和发育树分析,并结合形态学特征,确定其最适DNA条形码和分类学地位.【结果】结果表明,ITS和NL条形码对3种桑黄均能够获得单一目的条带;rpb1Y、rpb2B和rpb2Y条形码特异性低,扩增后获得多个条带;而rpb1B和ef1-α条形码均无法获得条带.通过多序列比对,结合形态分析,确定1713菌株为桑黄纤孔菌(Inonotus sanghuang),而1714和HS菌株均为鲍姆纤孔菌(Inonotus baumii).【结论】本研究确定ITS和NL为桑黄分子鉴定的最佳DNA条形码,其PCR最适退火温度范围分别为58~59℃和49~50℃,为桑黄真菌快速鉴定提供参考依据. 展开更多
关键词 桑黄 分子鉴定 DNA条形码 NL ITS
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菌草绿洲一号内生菌的分离鉴定及其生物学特性 预览
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作者 叶文雨 谢序泽 +4 位作者 连加淳 王哲 牛晓庆 余文英 鲁国东 《热带农业科学》 2019年第1期52-57,74共7页
菌草(JUNCAO)是用于栽培食用菌、药用菌的草本植物。以菌草绿洲一号为研究材料,通过植物组织表面消毒、研磨组织、培养基培养等方法分离纯化内生菌,并进一步通过分子手段鉴定菌株,通过平板对峙法等方法对其生物学特性进行研究。16S r DN... 菌草(JUNCAO)是用于栽培食用菌、药用菌的草本植物。以菌草绿洲一号为研究材料,通过植物组织表面消毒、研磨组织、培养基培养等方法分离纯化内生菌,并进一步通过分子手段鉴定菌株,通过平板对峙法等方法对其生物学特性进行研究。16S r DNA序列同源性分析结果表明,该菌株为Enterobacter ludwigii;平板对峙等生物学特性试验结果表明,该菌株对马铃薯早疫病菌具有拮抗作用。该菌株具有溶磷性、接触酶反应呈阳性、能使明胶液化、水解淀粉等生物学特性。根据菌株的拮抗特性和其他生物学特性结果可以推测,该菌株可作为生防菌防治植物病原菌及作为促生菌促进植物的生长,提高产量。 展开更多
关键词 绿洲一号内生菌 分子鉴定 生物学特性
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泾阳茯砖茶中“金花菌”的分离、鉴定及抗氧化酶活性
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作者 唐万达 黄振东 +3 位作者 杨琳 万晴 张瑞玲 张忠 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2019年第1期12-16,共5页
目的分离鉴定泾阳茯砖茶中的金花菌,探讨其发酵产物的抗氧化酶活性。方法采用涂布平板法分离纯化泾阳茯砖茶中的'金花菌',通过其ITS序列分析进行分子鉴定。利用抗氧化酶试剂盒测定不同时期'金花菌'发酵液的抗氧化酶活... 目的分离鉴定泾阳茯砖茶中的金花菌,探讨其发酵产物的抗氧化酶活性。方法采用涂布平板法分离纯化泾阳茯砖茶中的'金花菌',通过其ITS序列分析进行分子鉴定。利用抗氧化酶试剂盒测定不同时期'金花菌'发酵液的抗氧化酶活性。结果从茶叶中分离出1株'金花菌'J17,通过ITS序列分析初步确定其为赤散囊菌(Eurotium rubrum)。在J17菌株发酵后第1、7、10、14和21天,其发酵液中过氧化物酶(POD)活性(U/mL)分别为0.22±0.11、1.22±0.13、2.46±1.64、7.35±2.77和45.19±1.54;过氧化氢酶(CAT)活性(U/mL)分别为0.06±0.00、0.45±0.00、1.52±0.20、2.35±0.20和2.75±0.37;总超氧化物歧化酶(T-SOD)活性(U/mL)分别为25.55±10.12、50.90±3.72、76.77±6.75、89.07±3.33和36.34±12.32。发酵14d左右,3种抗氧化酶活性均较高,与茶砖在发花车间的发花时间一致。茯砖茶沸水冲泡液和沸水冲洗液中POD和CAT活性差异无统计学意义,而沸水冲泡液的T-SOD活性显著高于沸水冲洗液。结论泾阳茯砖茶的抗氧化酶活性与茶砖发花期产生的赤散囊菌有关,泾阳茯砖茶适用于热水冲泡或煮沸后饮用。 展开更多
关键词 茯砖茶 金花菌 分子鉴定 抗氧化酶活性
注射美容致龟分枝杆菌感染一例附文献复习 预览
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作者 暴芳芳 孙勇虎 +4 位作者 孙乐乐 周桂芝 刘永霞 刘红 张福仁 《中国麻风皮肤病杂志》 2019年第3期160-162,共3页
医源性龟分枝杆菌感染多与手术伤口、器官移植、透析和注射等有关。本文报道一例经美容注射后引起的龟分枝杆菌感染,通过病理、培养和PCR测序确诊,并对分离菌株进行表型、分子鉴定及体外药敏试验。患者经克拉霉素、阿米卡星药物治疗痊... 医源性龟分枝杆菌感染多与手术伤口、器官移植、透析和注射等有关。本文报道一例经美容注射后引起的龟分枝杆菌感染,通过病理、培养和PCR测序确诊,并对分离菌株进行表型、分子鉴定及体外药敏试验。患者经克拉霉素、阿米卡星药物治疗痊愈。本文对相关文献进行了复习。 展开更多
关键词 龟分枝杆菌 分子鉴定 注射美容
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