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分子动力学模拟在煤结构及相关研究中的应用 预览
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作者 王善彪 秦志宏 +3 位作者 周婧兰 连露露 杨小芹 林喆 《洁净煤技术》 CAS 2019年第1期29-34,共6页
随着计算机技术的深入发展和不同类型分子动力学模拟软件的开发运用,更多的煤科学科研人员从事煤大分子的动力学模拟计算领域研究,从煤的结构特征、孔径分布特性、热力学特性和基于孔径分布的吸附特性等方面,深入研究煤炭这一聚集体系... 随着计算机技术的深入发展和不同类型分子动力学模拟软件的开发运用,更多的煤科学科研人员从事煤大分子的动力学模拟计算领域研究,从煤的结构特征、孔径分布特性、热力学特性和基于孔径分布的吸附特性等方面,深入研究煤炭这一聚集体系所表现出的深层信息,理解其所能表现出的动力学行为特征,从而有效解决了实验室中无法解决的一些问题,为煤炭的高效综合利用提供了更多的基础理论支持。笔者综述了分子动力学模拟技术在煤大分子结构、煤炭吸附性质、油页岩干酪根分子结构及分子识别等方面的研究进展,简要介绍了相关的研究成果,指出利用计算机技术研究煤结构及其功能机制存在的不足,认为这种不足往往不是计算技术如分子动力学模拟本身的问题,而是复杂煤结构解析不到位的问题。若结合萃取反萃取之煤全组分分离方法以及由此建立的煤嵌布结构模型新理论,并通过分子动力学模拟技术深入研究煤族组分分子结构细节、热变化行为和性质演变等,不仅能验证相关理论的正确性,完成试验技术所不能完成的工作,而且有可能进一步推进煤结构和煤反应性机理的研究。 展开更多
关键词 分子动力学 煤结构 计算机模拟 分子结构 分子识别 吸附
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橡胶拉伸行为的分子动力学模拟 预览
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作者 何燕 蒋英男 +3 位作者 唐元政 陈浩 马连湘 李康 《橡胶工业》 CAS 2019年第6期409-412,共4页
采用分子动力学方法,在相同的全原子模型、聚合度及温度和压力条件下,对天然橡胶(NR)、杜仲橡胶[反式-1,4-异戊二烯橡胶(TPI)]和顺丁橡胶(BR)分子模型的拉伸行为进行模拟,研究拉伸过程中分子模型的应力-应变、能量、均方位移和均方回转... 采用分子动力学方法,在相同的全原子模型、聚合度及温度和压力条件下,对天然橡胶(NR)、杜仲橡胶[反式-1,4-异戊二烯橡胶(TPI)]和顺丁橡胶(BR)分子模型的拉伸行为进行模拟,研究拉伸过程中分子模型的应力-应变、能量、均方位移和均方回转半径的变化。结果表明:NR分子模型与TPI分子模型的拉伸性能基本一致,BR分子模型的应力响应较前两者更大;橡胶的拉伸性能与其分子中原子的流动性关联性很大。 展开更多
关键词 橡胶 拉伸行为 分子动力学 分子模拟 均方位移 均方回转半径
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乙炔法制醋酸乙烯技术研究进展 预览
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作者 许献智 张明 《安徽化工》 CAS 2019年第2期17-20,共4页
介绍了国内外的醋酸乙烯生产工艺。我国富煤和天然气,石油资源缺乏,乙炔法尤其是电石乙炔法在我国广泛采用。目前对于乙炔法过程中的反应机理已有相关分子模拟研究,但依旧存在少量副产物生成过程未明确的现象,同时乙炔法工艺过程的流程... 介绍了国内外的醋酸乙烯生产工艺。我国富煤和天然气,石油资源缺乏,乙炔法尤其是电石乙炔法在我国广泛采用。目前对于乙炔法过程中的反应机理已有相关分子模拟研究,但依旧存在少量副产物生成过程未明确的现象,同时乙炔法工艺过程的流程技术改进与模拟也有相关研究。电石乙炔法副产物多、能耗高、污染大,因此需要明确反应机理,研制先进的醋酸乙烯合成催化剂,并开发新的节能工艺流程。 展开更多
关键词 醋酸乙烯 乙炔法 分子模拟 技术改进 流程模拟
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卡马西平印迹吸附剂的分子模拟与吸附机理 预览
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作者 梁建军 何芹 +1 位作者 郑怀礼 向冰彦 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2019年第6期846-854,I0004-I0005共10页
分子模拟可为优选印迹吸附剂的功能单体提供理论指导。本研究构建了目标污染物卡马西平(模板分子)与14种功能单体的印迹识别体系,采用模拟淬火算法搜寻模板-单体相互作用的低能稳定构象,改善了现有研究在搜寻构象时易陷入局部势能阱的... 分子模拟可为优选印迹吸附剂的功能单体提供理论指导。本研究构建了目标污染物卡马西平(模板分子)与14种功能单体的印迹识别体系,采用模拟淬火算法搜寻模板-单体相互作用的低能稳定构象,改善了现有研究在搜寻构象时易陷入局部势能阱的不足。分子模拟发现,功能单体衣康酸对卡马西平的结合能力最强;吸附实验结果表明,以其为单体制备的吸附剂在水溶液中的吸附量可达9.28mg/g,在实际水样中也表现出较高的选择性,重复使用10次后,吸附量仅下降1.3%,吸附性能优于以传统单体甲基丙烯酸制备的吸附剂。模拟并测量了印迹体系的紫外光谱,结果表明,衣康酸和卡马西平之间形成了新的作用体系,分子模拟能够很好地预测二者在水溶液中的紫外光谱,但由于实际发生吸附时二者间会形成多种结合构象,分子模拟对相互作用体系的紫外光谱预测不够理想。能量计算和氢键分析表明,范德华力和静电作用在识别过程中起主要作用,红外分析印证了体系中存在氢键,识别位点位于衣康酸羧基和卡马西平酰胺之间,与分子模拟结果一致。 展开更多
关键词 分子印迹 分子模拟 吸附机理 水污染控制 卡马西平
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不同温度下煤灰熔渣的结构演变规律 预览
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作者 王浩男 玄伟伟 夏德宏 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第8期3094-3103,共10页
采用热力学计算和分子动力学模拟方法研究了高铁煤灰熔体的结构特征以及结构随温度的变化规律,计算了不同温度下Fe^3+和Fe^2+的含量,分析了径向分布函数、配位数、键角、桥氧与非桥氧、Qn结构单元等结构特征。热力学计算的结果显示温度... 采用热力学计算和分子动力学模拟方法研究了高铁煤灰熔体的结构特征以及结构随温度的变化规律,计算了不同温度下Fe^3+和Fe^2+的含量,分析了径向分布函数、配位数、键角、桥氧与非桥氧、Qn结构单元等结构特征。热力学计算的结果显示温度升高有利于Fe^3+转变成Fe^2+,据此得到了Fe^3+/Fe^2+随温度的变化规律。在采用BMH势函数的基础上,分子动力学模拟显示熔体具有短程有序,长程无序的结构特征。随着温度升高,各离子对的径向分布函数曲线的高度和尖锐度下降,各离子的较高配位状态减少,较低配位状态增加,键角曲线的高度和锐度降低并向较小的方向移动,预示着离子的聚集程度减弱,熔体内部的无序化程度增强。氧的配位状态和Qn的变化是熔体聚合度变化的直观反映,温度升高导致三配位氧和桥氧含量降低,非桥氧和自由氧含量增加,并最终导致较高聚合度的Q4结构单元解体生成较低聚合度的Q3、Q2、Q1和Q0结构单元。 展开更多
关键词 高铁煤灰熔渣 显微结构 分子模拟 计算机模拟 热力学计算 聚合度
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煤分子结构模型构建及分析方法综述
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作者 崔馨 严煌 赵培涛 《中国矿业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第4期704-717,共14页
煤分子结构模型的构建对深入了解煤的燃烧特性和提高燃烧效率具有重要的理论价值.煤的化学组成和分子结构形态具有多样性和复杂性,系统全面地阐述煤分子结构模型的构建依据、机理及分析方法对分子模型构建具有重要意义.文章分析了煤的Fu... 煤分子结构模型的构建对深入了解煤的燃烧特性和提高燃烧效率具有重要的理论价值.煤的化学组成和分子结构形态具有多样性和复杂性,系统全面地阐述煤分子结构模型的构建依据、机理及分析方法对分子模型构建具有重要意义.文章分析了煤的Fuchs,Given等经典分子结构模型特点及分子模型研究进展,梳理了物理分析法、化学实验法和溶剂抽提技术等煤分子结构模型表征方法和含氧官能团定量分析方法的研究进展,阐述了分子模拟技术、量子化学和13C核磁共振(13C NMR)预测法等分子模型构建、优化和验证方法.论文可为本领域研究者查阅和参考煤分子结构模型构建思路和方法提供便利. 展开更多
关键词 分子结构 分析方法 分子模拟 模型验证
基于分子动力学的橡胶聚合物计算机辅助设计方法 预览
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作者 梁馨元 张磊 +1 位作者 刘琳琳 都健 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第2期525-532,共8页
聚合物分子设计的关键步骤是得到能够满足多种性质要求的重复单元结构。作为化学产品工程中的新型发展手段,计算机辅助分子设计(CAMD)技术可以通过基团贡献法生成满足约束条件的聚合物重复单元结构,分子动力学(MD)技术则可以在微观层面... 聚合物分子设计的关键步骤是得到能够满足多种性质要求的重复单元结构。作为化学产品工程中的新型发展手段,计算机辅助分子设计(CAMD)技术可以通过基团贡献法生成满足约束条件的聚合物重复单元结构,分子动力学(MD)技术则可以在微观层面上进行计算机实验模拟系统性质。建立了聚合物的CAMD-MD通用设计方法,并进行轮胎橡胶聚合物的分子设计,首先基于基团贡献法进行重复单元的设计;其次,利用层次分析法确定多性质权重排名,并基于分子动力学方法探究候选结构的性质;最后将方法应用于实际橡胶结构中,模拟得到聚能密度、密度、玻璃化转换温度和热导率性质,验证了方法的可行性。 展开更多
关键词 产品设计 计算机模拟 分子模拟 聚合物
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Computational systems pharmacology analysis of cannabidiol:a combination of chemogenomics-knowledgebase network analysis and integrated in silico modeling and simulation
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作者 Yue-min Bian Xi-bing He +3 位作者 Yan-kang Jing Li-rong Wang Jun-mei Wang Xiang-Qun Xie 《中国药理学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第3期374-386,共13页
With treatment benefits in both the central nervous system and the peripheral system,the medical use of cannabidiol(CBD)has gained increasing popularity.Given that the therapeutic mechanisms of CBD are still vague,the... With treatment benefits in both the central nervous system and the peripheral system,the medical use of cannabidiol(CBD)has gained increasing popularity.Given that the therapeutic mechanisms of CBD are still vague,the systematic identification of its potential targets,signaling pathways,and their associations with corresponding diseases is of great interest for researchers.In the present work,chemogenomics-knowledgebase systems pharmacology analysis was applied for systematic network studies to generate CBD-target,target-pathway,and target-disease networks by combining both the results from the in silico analysis and the reported experimental validations.Based on the network analysis,three human neuro-related rhodopsin-like GPCRs,i.e.,5-hydroxytryptamine receptor 1 A(5HT1A),delta-type opioid receptor(OPRD)and G protein-coupled receptor 55(GPR55),were selected for close evaluation.Integrated computational methodologies,including homology modeling,molecular docking,and molecular dynamics simulation,were used to evaluate the protein-CBD binding modes.A CBD-preferred pocket consisting of a hydrophobic cavity and backbone hinges was proposed and tested for CBD-class A GPCR binding.Finally,the neurophysiological effects of CBD were illustrated at the molecular level,and dopamine receptor 3(DRD3)was further predicted to be an active target for CBD. 展开更多
关键词 cannabinoid cannabidiol(CBD) SYSTEMS PHARMACOLOGY homology modeling MOLECULAR docking MOLECULAR dynamics simulation 5HT1A D3
温度对氩-甲烷体系气-液平衡性质影响的分子动力学模拟 预览
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作者 王宝和 雷广平 王维 《河南化工》 CAS 2019年第5期15-18,共4页
采用分子动力学模拟方法,探讨了氩-甲烷二元混合物体系气-液平衡性质与温度之间的关系。模拟结果表明,气、液相主体中氩组分的摩尔分数,均随着温度的升高而降低。随着温度增加,气-液界面厚度增大,气-液界面张力减小,组分氩的表面过剩吸... 采用分子动力学模拟方法,探讨了氩-甲烷二元混合物体系气-液平衡性质与温度之间的关系。模拟结果表明,气、液相主体中氩组分的摩尔分数,均随着温度的升高而降低。随着温度增加,气-液界面厚度增大,气-液界面张力减小,组分氩的表面过剩吸附量降低,相对挥发度减小。饱和汽体逸度与其相对应压力之间的偏差,随着温度的增大而增大。温度对液氩活度系数的影响不大。 展开更多
关键词 分子动力学 模拟 甲烷 温度 气-液平衡性质
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含缺口纳晶铜的失效行为研究 预览
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作者 佟尚 周剑秋 +1 位作者 张烽 杨宝童 《机械制造与自动化》 2019年第4期14-16,29共4页
模拟了含有缺口的纳晶铜在拉伸载荷下的变形情况,研究缺口对纳晶铜失效行为的影响。结果表明,缺口对纳晶铜失效行为的影响与缺口的尺寸有关。随着缺口尺寸的增大,缺口对纳晶铜的失效影响愈发明显,缺口的临界值尺寸等于纳晶铜晶粒的平均... 模拟了含有缺口的纳晶铜在拉伸载荷下的变形情况,研究缺口对纳晶铜失效行为的影响。结果表明,缺口对纳晶铜失效行为的影响与缺口的尺寸有关。随着缺口尺寸的增大,缺口对纳晶铜的失效影响愈发明显,缺口的临界值尺寸等于纳晶铜晶粒的平均尺寸。同时,通过不同模型间的对比发现,纳晶铜对缺口的敏感性与缺口形状和样本尺寸无关。 展开更多
关键词 纳晶铜 缺口 分子模拟 剪切带 失效行为
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高岭石甲烷吸附规律的分子模拟研究 预览
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作者 唐巨鹏 孙胜杰 包思远 《油气地质与采收率》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期43-49,共7页
高岭石作为黏土矿物的主要吸附载体,其对甲烷吸附的贡献不可忽略。考虑高岭石独特的1∶1型双层晶体结构,建立高岭石双层吸附空间模型。采用巨正则系综下的蒙特卡洛方法研究甲烷分子与高岭石超晶胞的定位吸附模拟和高岭石对甲烷的等温吸... 高岭石作为黏土矿物的主要吸附载体,其对甲烷吸附的贡献不可忽略。考虑高岭石独特的1∶1型双层晶体结构,建立高岭石双层吸附空间模型。采用巨正则系综下的蒙特卡洛方法研究甲烷分子与高岭石超晶胞的定位吸附模拟和高岭石对甲烷的等温吸附模拟,分析高岭石的晶体结构、温度和含水率对甲烷吸附行为的影响。研究结果表明:高岭石硅氧四面体层(硅氧烷化面)对甲烷的吸附作用强于铝氧八面体层(铝氧羟基化面),甲烷优先吸附于硅氧烷化面;吸附的甲烷分子呈聚集态分布于硅氧四面体六元环空穴上方位置,且以正三角锥构型吸附最为稳定;在280~400K温度下,高岭石吸附甲烷符合Langmuir等温吸附类型,且属于物理吸附;甲烷吸附量和吸附热均随温度升高而呈线性降低,证实可以利用低温条件下的吸附量预测高温条件下的吸附量;高岭石吸水饱和前,水分子的存在不会改变高岭石对甲烷的吸附趋势和类型,仅降低甲烷吸附量,当含水率由0增至20.94%,甲烷吸附量下降35.06%。 展开更多
关键词 分子模拟 蒙特卡洛方法 高岭石晶体结构 页岩气吸附 吸附量
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甲基硅酸钾页岩抑制剂抑制蒙脱石水化机理的分子模拟
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作者 苏俊霖 罗亚飞 张勇 《化学世界》 CAS CSCD 2019年第1期45-53,共9页
有机硅页岩抑制剂相较于传统的KCl抑制剂具有不会腐蚀钻具、更加环保等优点,因此有机硅钻井液体系得到广泛应用。利用分子模拟方法,选择甲基硅酸钾、甲基硅酸钠、KCl和NaCl作为研究对象,构建了四种抑制剂的分子模型和钠蒙脱石晶体模型... 有机硅页岩抑制剂相较于传统的KCl抑制剂具有不会腐蚀钻具、更加环保等优点,因此有机硅钻井液体系得到广泛应用。利用分子模拟方法,选择甲基硅酸钾、甲基硅酸钠、KCl和NaCl作为研究对象,构建了四种抑制剂的分子模型和钠蒙脱石晶体模型。通过分子动力学方法模拟发现,甲基硅酸钾能够抑制蒙脱石层间Na~+的水化作用,限制水分子和Na~+的自扩散运动,并提高钠蒙脱石晶体的力学性能。对比四种页岩抑制剂的各项模拟结果发现,甲基硅酸钾的抑制效果最佳,其次是甲基硅酸钠和KCl,NaCl的抑制效果最差。从离子的角度看,K~+的抑制效果优于Na~+,甲基硅酸根的抑制效果优于Cl~-,这是由于K~+能镶嵌于钠蒙脱石晶层表面的硅氧六元环中,而甲基硅酸根能够通过氢键吸附于硅氧六元环上,它们均能使蒙脱石晶层发生不完全水化从而抑制蒙脱石的水化膨胀。 展开更多
关键词 钠蒙脱石 分子模拟 页岩抑制剂 甲基硅酸钾 水化膨胀
乙醛氧化生成乙酸反应机理的分子模拟 预览
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作者 夏垒 龙军 +3 位作者 武志强 赵毅 代振宇 王立华 《石油学报(石油加工)》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期20-27,共8页
采用基于密度泛函理论(DFT)的量子化学方法研究了乙醛氧化生成乙酸的反应过程。结果表明:无氧条件下链引发过程最难发生,反应能垒达到380.78kJ/mol,但氧气可将此过程的反应能垒降至116.26kJ/mol;乙酰基自由基生成过氧乙酸以及链终止反... 采用基于密度泛函理论(DFT)的量子化学方法研究了乙醛氧化生成乙酸的反应过程。结果表明:无氧条件下链引发过程最难发生,反应能垒达到380.78kJ/mol,但氧气可将此过程的反应能垒降至116.26kJ/mol;乙酰基自由基生成过氧乙酸以及链终止反应的各步骤的反应能垒均较低,反应较快;过氧乙酸转化为乙酸的反应较难发生,为整体反应过程的速率控制环节。此过程有2个可能的反应路径,速率控制步骤分别为过氧乙酸均裂生成乙酸自由基和羟基自由基的过程及过氧乙酸与乙醛反应生成乙醛单过氧乙酸酯中间化合物的过程,反应能垒分别为147.18、137.21kJ/mol。 展开更多
关键词 分子模拟 氧化 羧酸
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分子模拟指导核酸适配体文库设计
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作者 雷云霞 李招发 林俊生 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期251-258,共8页
核酸适配体是利用配体指数富集的系统进化技术(SELEX)从随机文库中筛选获得一段有功能的单链寡核苷酸。但因筛选过程中的文库选择、洗涤次数、分离效率、缓冲液离子含量和pH值等多种因素的影响,迄今所报道的亲和力与特异性都很高的核酸... 核酸适配体是利用配体指数富集的系统进化技术(SELEX)从随机文库中筛选获得一段有功能的单链寡核苷酸。但因筛选过程中的文库选择、洗涤次数、分离效率、缓冲液离子含量和pH值等多种因素的影响,迄今所报道的亲和力与特异性都很高的核酸适配体为数不多。初始文库是核酸适配体筛选的源头,作为SELEX技术的根本,其设计是否合理直接影响到筛选的成败和效率。分子模拟能以核酸适配体文库为主体,计算机为主要工具,发展多种结构模拟与分析工具,辅助核酸适配体文库的合理设计。本文综述了现阶段利用分子模拟进行核酸适配体初始文库设计的相关方法,希望能为从源头上提高核酸适配体筛选的成功率提供线索。 展开更多
关键词 核酸适配体 配体指数富集的系统进化技术(SELEX) 文库设计 分子模拟 分子对接
基于分子模拟的壳寡糖-金属配合物的结合模式分析 预览
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作者 吕丹丹 张宾 +2 位作者 房传栋 谢枫才 邓尚贵 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第7期79-84,共6页
目的:探讨壳寡糖分子与金属离子之间的相互作用。方法:在构建壳寡糖分子结构基础上,将相同数量壳寡糖分子与Fe2+/Zn2+/Mg2+离子混合,进而采用分子动力学模拟法,分析壳寡糖与金属离子之间的配位结合模式。结果:每个金属离子与1~2个壳寡... 目的:探讨壳寡糖分子与金属离子之间的相互作用。方法:在构建壳寡糖分子结构基础上,将相同数量壳寡糖分子与Fe2+/Zn2+/Mg2+离子混合,进而采用分子动力学模拟法,分析壳寡糖与金属离子之间的配位结合模式。结果:每个金属离子与1~2个壳寡糖分子相结合,而每个壳寡糖结合Fe2+、Zn2+和Mg2+数量分别为2.37,2.22和2.21个。金属离子在壳寡糖分子上的结合位点,主要为氨基中氮原子(N,N1和N2)和羟基中氧原子(O1,O2,O3,O6,O7,O10,O11和O12),而基本不与醚氧原子(O,O4,O5,O8)发生配位结合。在壳寡糖与金属离子混合体系中,主要存在壳寡糖与金属离子以1∶1和2∶1的两种配位模式,进而形成“悬挂”和“桥式”两种典型特征结构。壳寡糖与3种金属离子反应产物的稳定性,依次表现为Zn2+>Fe2+>Mg2+。结论:动力学模拟与文献报道(光谱研究)结果相一致,其可作为研究金属配合物结构、糖分子与金属离子的作用机制提供重要参考。 展开更多
关键词 壳寡糖 金属离子 配位模式 分子模拟
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蒙脱石分子模拟研究进展 预览
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作者 李国青 邱俊 +4 位作者 刘栋梁 姜姗 陈平 王桂芳 吕宪俊 《矿产综合利用》 CAS 北大核心 2019年第4期26-32,共7页
蒙脱石是一种层状硅酸盐矿物,其特殊的晶体结构特点使之具有许多优异的物理化学性能,在许多领域都有非常广泛的应用。在材料科学研究领域,分子模拟技术作为一种全新的科学研究方法,在蒙脱石的基础理论和应用研究中具有重要的作用。本文... 蒙脱石是一种层状硅酸盐矿物,其特殊的晶体结构特点使之具有许多优异的物理化学性能,在许多领域都有非常广泛的应用。在材料科学研究领域,分子模拟技术作为一种全新的科学研究方法,在蒙脱石的基础理论和应用研究中具有重要的作用。本文综述了近几年分子模拟技术在蒙脱石研究领域中的基本进展情况,主要包括蒙脱石的层间水化、无机阳离子种类、有机物吸附等所引起的蒙脱石晶体结构方面的变化规律。 展开更多
关键词 蒙脱石 水化 吸附 分子模拟 研究进展
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铀酰离子-细胞色素b5复合物的分子动力学模拟 预览
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作者 林英武 《南华大学学报:自然科学版》 2019年第1期1-5,共5页
铀酰离子(UO2^2+)的生物学毒性是由于它能与蛋白质形成稳定的复合物而破坏了蛋白的正常功能。通过使用分子建模和分子动力学(molecular dynamics,MD)模拟,对铀酰离子-细胞色素b5复合物(UO2^2+-cytb5)进行了结构预测。模拟结构显示,UO2^2... 铀酰离子(UO2^2+)的生物学毒性是由于它能与蛋白质形成稳定的复合物而破坏了蛋白的正常功能。通过使用分子建模和分子动力学(molecular dynamics,MD)模拟,对铀酰离子-细胞色素b5复合物(UO2^2+-cytb5)进行了结构预测。模拟结构显示,UO2^2+通过配位和氢键作用结合到Cyt b5中谷氨酸Glu37和Glu43,导致Cyt b5的动力学行为发生轻微改变,而对蛋白整体结构几乎不产生影响。这些现象与Cyt b5的体内形成以及作为电子传递蛋白的生物功能紧密相联。这些原子水平上理论信息的获得,为铀酰离子的毒性机制,尤其是涉及Cyt b5的细胞凋亡,提供了深刻内涵。 展开更多
关键词 铀酰离子 细胞色素B5 结构 功能 分子模拟
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金属有机骨架的高通量计算筛选研究进展
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作者 刘治鲁 李炜 +2 位作者 刘昊 庄旭东 李松 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2019年第4期323-339,共17页
近年来,金属有机骨架(Metal-Organic Frameworks, MOFs)在气体吸附分离领域的研究获得爆发式增长.随着MOFs 数量的剧增,高通量计算筛选成为从大量MOFs 中发现高性能目标材料和挖掘其构效关系的最有效研究方法.本综述对MOFs的高通量计算... 近年来,金属有机骨架(Metal-Organic Frameworks, MOFs)在气体吸附分离领域的研究获得爆发式增长.随着MOFs 数量的剧增,高通量计算筛选成为从大量MOFs 中发现高性能目标材料和挖掘其构效关系的最有效研究方法.本综述对MOFs的高通量计算筛选中所用到的数据库包括实验合成的MOFs组成的数据库(experimental MOFs,eMOFs)和计算机设计的MOFs数据库(hypothetical MOFs, hMOFs)、计算筛选方法包括基于分子模拟和机器学习的筛选方法,及其在CH4 储存、H2储存、CO2捕捉和其他气体分离领域的研究进展进行了总结.旨在通过梳理该领域的研究进展和思路,明确未来的研究方向和面临的挑战,加快MOFs 的研发进程,促进MOFs的商业化应用. 展开更多
关键词 金属有机骨架 高通量筛选 分子模拟 机器学习 吸附分离
锐钛矿型TiO2吸附甲醛影响因素的模拟与实验研究
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作者 李妍 张舸 蒋贞 《现代化工》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期207-210,共4页
采用巨正则系蒙特卡洛(GCMC)方法研究了温度、压力、竞争吸附对TiO2吸附甲醛的影响,模拟了空气中主要组分在TiO2中吸附量随压力和温度的变化特性,模拟结果能被Langmuir吸附等温线拟合。设计实验验证了模拟结果的正确性。对混合气吸附量... 采用巨正则系蒙特卡洛(GCMC)方法研究了温度、压力、竞争吸附对TiO2吸附甲醛的影响,模拟了空气中主要组分在TiO2中吸附量随压力和温度的变化特性,模拟结果能被Langmuir吸附等温线拟合。设计实验验证了模拟结果的正确性。对混合气吸附量的模拟表明,水蒸汽对甲醛的竞争吸附最为明显,降低水蒸汽的含量,有利于甲醛气体在催化剂表面的吸附,进而提高甲醛的催化效率。 展开更多
关键词 锐钛矿型TiO2 甲醛 分子模拟 吸附实验 竞争吸附
南极假丝酵母脂肪酶B在离子液体/超临界流体体系中的稳定性模拟 预览
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作者 张静晓 张丽雷 +2 位作者 刘晓洁 吴小亮 徐璐 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期902-907,共6页
脂肪酶在离子液体/超临界流体体系中的结构稳定性是影响其活性的重要因素。本文采用分子动力学方法分别研究了南极假丝酵母脂肪酶B(CALB)在离子液体CYPHOSIL-201/极性超临界流体CHF3两相体系和离子液体CYPHOSIL-201/非极性超临界流体CO... 脂肪酶在离子液体/超临界流体体系中的结构稳定性是影响其活性的重要因素。本文采用分子动力学方法分别研究了南极假丝酵母脂肪酶B(CALB)在离子液体CYPHOSIL-201/极性超临界流体CHF3两相体系和离子液体CYPHOSIL-201/非极性超临界流体CO2两相体系中的结构稳定性,揭示影响CALB结构稳定性的因素。研究结果表明,在超临界CHF3中,CHF3破坏蛋白维持α螺旋结构的氢键是蛋白结构不稳定的主要原因;在超临界CO2中,CALB蛋白的结构紧密性降低,有序二级结构发生了变化,导致稳定性下降。离子液体和两种超临界流体均形成了两相体系,蛋白处于离子液体相中,离子液体不溶于超临界流体,但超临界流体部分进入离子液体相,降低了离子液体相的黏度。其中,相比于CYPHOSIL-201/CO2体系,CYPHOSIL-201/CHF3体系的黏度降低多。在离子液体CY-PHOSIL-201与超临界流体(CHF3、CO2)形成的两相体系中,离子液体CYPHOSIL-201具有保护蛋白结构的作用,使CALB蛋白结构更加稳定。 展开更多
关键词 南极假丝酵母脂肪酶B 离子液体 超临界流体 分子模拟
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