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2007-2017年四川省宋内志贺菌分离株脉冲场凝胶电泳分型及耐药性分析
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作者 雷高鹏 吕虹 +2 位作者 黄玉兰 黄伟峰 杨小蓉 《疾病监测》 CAS 2019年第4期344-347,共4页
目的了解2007—2017年四川省腹泻病例样本宋内志贺菌分离株耐药状况及脉冲场凝胶电泳(PFGE)型别分布。方法将腹泻病例监测中经过生化和血清学鉴定的30株宋内志贺菌进行PFGE分型分析,采用微量肉汤稀释法测定菌株对14种药物的最低抑菌浓... 目的了解2007—2017年四川省腹泻病例样本宋内志贺菌分离株耐药状况及脉冲场凝胶电泳(PFGE)型别分布。方法将腹泻病例监测中经过生化和血清学鉴定的30株宋内志贺菌进行PFGE分型分析,采用微量肉汤稀释法测定菌株对14种药物的最低抑菌浓度。结果宋内志贺菌分离株仅对头孢西丁敏感,多重耐药菌株占总数的96.67%。对环丙沙星、阿奇霉素的耐药率超过10%,对包括头孢噻肟在内的7种常见药物耐药率达到50%以上。分离株可分为16个PFGE型,有2个优势簇占总分离数的80%,其他型别占20%。在优势簇I中的SCSN-1和SCSN-3中各检测到一起疑似暴发事件。结论 2007—2017年四川省腹泻病例宋内志贺菌分离株PFGE优势带型明显,且部分带型存在聚集。菌株耐药情况严重,部分菌株对细菌性腹泻常用抗生素环丙沙星、阿奇霉素和三代头孢中的头孢噻肟耐受。 展开更多
关键词 宋内志贺菌 脉冲场凝胶电泳 分型 细菌耐药
老年患者多药耐药鲍氏不动杆菌分子流行病学和耐药性研究
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作者 周娇娇 朱惠莉 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1786-1790,共5页
目的 分析多药耐药鲍氏不动杆菌(MDRAB)的分子流行病学特征和耐药机制。方法 收集2011-2017年老年患者痰标本43株MDRAB。应用多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对MDRAB进行分子分型。PCR和测序方法检测MDRAB的耐药基因。结果 ... 目的 分析多药耐药鲍氏不动杆菌(MDRAB)的分子流行病学特征和耐药机制。方法 收集2011-2017年老年患者痰标本43株MDRAB。应用多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对MDRAB进行分子分型。PCR和测序方法检测MDRAB的耐药基因。结果 MLST将43株MDRAB分为ST208、ST191和ST195、STn1(1-3-G1-2-2-94-3)。PFGE将43株MDRAB分为四个克隆型。ST208、ST191、ST195、STn1组成了克隆复合体92(CC92)。痰标本MDRAB中携带blaOXA-23-like基因阳性率为95.3%,ISAba1-blaOXA-23基因81.4%,blaOXA-66 100%,aac(6’)-Ib基因51.2%,aph(3’)-Ia基因83.7%,aac(3)-Ia基因65.1%,所有MDRAB的gyrA基因83位丝氨酸均突变为亮氨酸。结论 ST208和ST191是医院痰标本MDRAB主要的ST分型,克隆复合体CC92为医院最主要的MDRAB流行克隆,blaOXA-23、blaOXA-66是鲍氏不动杆菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药的主要机制,AAC(6’)-Ib、APH(3’)-I磷酸转移酶、AAC(3)-II氨基糖苷乙酰转移酶的产生为多药耐药鲍氏不动杆菌对氨基糖苷类抗菌药物耐药的主要机制。喹诺酮耐药决定区域的'热点'突变为鲍氏不动杆菌介导喹诺酮类抗菌药物的关键机制。 展开更多
关键词 鲍氏不动杆菌 多位点序列分析 脉冲场凝胶电泳 分子流行病 克隆复合体92
2016-2018年北京市西城区肠炎沙门菌耐药性及分子分型分析
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作者 霍哲 王永全 +2 位作者 徐俊 苗芳 崔京辉 《职业与健康》 CAS 2019年第8期1055-1058,共4页
目的分析2016-2018年北京市西城区感染性腹泻病例中检出的肠炎沙门菌的耐药情况和分子分型特征。方法对从腹泻患者便标本分离的39株沙门菌进行血清分型,采用微量肉汤法和脉冲场凝胶电泳(PFGE),对24株肠炎沙门菌进行药敏试验和分子分型... 目的分析2016-2018年北京市西城区感染性腹泻病例中检出的肠炎沙门菌的耐药情况和分子分型特征。方法对从腹泻患者便标本分离的39株沙门菌进行血清分型,采用微量肉汤法和脉冲场凝胶电泳(PFGE),对24株肠炎沙门菌进行药敏试验和分子分型。结果肠炎沙门菌是北京市西城区优势菌型,24株肠炎沙门菌对阿奇霉素、头孢他啶、头孢噻肟、头孢西丁、氯霉素、亚胺培南和庆大霉素这7种抗生素均敏感;对萘啶酸、氨苄西林和氨苄西林/舒巴坦的耐药率较高;17株菌出现多重耐药。24株菌经XbaⅠ酶切分为12个带型和5个簇,33.33%菌株聚集在II簇,聚类相似性为96.00%,并且2个优势带型聚集在这一簇。结论 2016-2018年北京市西城区感染性腹泻病例中肠炎沙门菌耐药状况比较严重,需加强对多重耐药株的监控,肠炎沙门菌PFGE分子分型条带多样化,但存在一定聚集性。 展开更多
关键词 肠炎沙门菌 脉冲场凝胶电泳 耐药性 分子分型
耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药基因分布情况及其同源性探讨 预览
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作者 别立翰 马晨芸 +1 位作者 蒋秀娣 陆志成 《中国医药导刊》 2019年第2期110-114,共5页
目的:了解对碳青霉烯类抗生素耐药的肺炎克雷伯杆菌(CR-KP)中碳青霉烯酶的主要类型及流行情况。方法:收集我院2016年1月至2017年12月对厄他培南、亚胺培南或美罗培南药敏试验结果不敏感的CR-KP共34株,根据CLSI M100S-27th文件的改良碳... 目的:了解对碳青霉烯类抗生素耐药的肺炎克雷伯杆菌(CR-KP)中碳青霉烯酶的主要类型及流行情况。方法:收集我院2016年1月至2017年12月对厄他培南、亚胺培南或美罗培南药敏试验结果不敏感的CR-KP共34株,根据CLSI M100S-27th文件的改良碳青霉烯灭活试验确证其是否为产酶菌株,通过PCR方法扩增5种碳青霉烯酶基因(blaKPC、blaIMP、blaOXA-48、blaVIM、blaNDM),PCR扩增产物进行测序明确基因型;通过脉冲场凝胶电泳对肺炎克雷伯菌进行同源性分析。结果:34株肺炎克雷伯菌经改良碳青霉烯灭活试验确证均为产酶菌株,PCR检测显示均为KPC-2型酶。脉冲场凝胶电泳(PFGE)结果显示34株菌可分为5组,其中1、2、4组为主要流行菌株。结论:院内存在以KPC-2为主要耐药基因的CR-KP克隆株的流行,且主要以重症医学科耐药株流行,34株菌间存在不同程度的亲缘关系。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯杆菌 碳青霉烯酶 脉冲场凝胶电泳
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中央空调冷却塔水嗜肺军团菌PFGE分子分型
5
作者 刘绮明 袁展红 吴灿权 《中国热带医学》 CAS 2019年第5期420-424,共5页
目的了解中山市中央空调冷却塔水血清1型(LP1)及血清7型(LP7)嗜肺军团菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型情况。方法对2012—2014年从中山市部分酒店、娱乐场所、商场、医院等公共场所中央空调冷却塔水样本中分离出的41株LP1型嗜肺军团菌... 目的了解中山市中央空调冷却塔水血清1型(LP1)及血清7型(LP7)嗜肺军团菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型情况。方法对2012—2014年从中山市部分酒店、娱乐场所、商场、医院等公共场所中央空调冷却塔水样本中分离出的41株LP1型嗜肺军团菌和12株LP7型嗜肺军团菌进行脉冲场凝胶电泳,运用Bio Numerics6.6软件进行聚类分析。结果按照100%的相似程度,41株LP1型嗜肺军团菌分为26种PFGE型别,每个带型包括1~6株菌,菌株之间的相似系数为16.6%~100%;12株LP7型嗜肺军团菌分为10种PFGE型别,每个带型包括1~2株菌,菌株之间的相似系数为19.3%~100%。不同地区和不同年份分离的菌株存在相同的PFGE型别;同一场所可存在相同的PFGE型别,也可跨月份或年份存在不同的型别。按照90%以上的相似程度,LP1型嗜肺军团菌有4个克隆群,包含的菌株数和PFGE带型占其血清型别分离株总数以及PFGE型别总数的51.2%(21/41)和30.8%(8/26);LP7型嗜肺军团菌有2个克隆群,包含的菌株数和PFGE带型占其血清型别分离株总数以及PFGE型别总数的50.0%(6/12)和40.0%(4/10)。克隆群在空间和时间分布上无明显差异。结论中山市中央空调冷却塔水中LP1型及LP7型嗜肺军团菌分离株存在广泛的PFGE基因型别,未形成某一优势基因群的地区优势及时间趋势。 展开更多
关键词 嗜肺军团菌 脉冲场凝胶电泳 聚类分析 克隆群
2009-2015年贵州省致病性钩端螺旋体分离株PFGE分型分析
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作者 刘英 王铭 +6 位作者 李世军 姚光海 黄荷 陈旭 王斌 唐光鹏 王定明 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第2期186-189,198共5页
目的了解贵州省2009-2015年分离自鼠类宿主动物的钩端螺旋体(简称钩体)PFGE带型特征,为当地钩体病的预防和控制提供科学依据。方法对贵州省近年分离自鼠类宿主动物的56株钩体采用致病性钩体特异引物进行PCR扩增鉴定,应用血清分群PCR对... 目的了解贵州省2009-2015年分离自鼠类宿主动物的钩端螺旋体(简称钩体)PFGE带型特征,为当地钩体病的预防和控制提供科学依据。方法对贵州省近年分离自鼠类宿主动物的56株钩体采用致病性钩体特异引物进行PCR扩增鉴定,应用血清分群PCR对其进行血清群鉴定,采用包埋法提取钩体染色体DNA,利用核酸内切酶NotI对DNA进行酶切,酶切片段经PFGE电泳后采用凝胶成像系统拍照获得DNA指纹图谱,采用国家病原体分子分型实验数据分析与传输系统进行处理和聚类分析。结果致病性钩体特异性PCR和血清分群PCR鉴定显示56株钩体均为黄疸出血群钩体株,PFGE分型将其分为38个带型,聚类分析显示多数钩体株与黄疸出血群赖型具有较高的相似度,为主要流行优势带型,少部分钩体株与爪哇群和波摩那群代表菌株具有较高相似性,聚类关系相对较近。结论黄疸出血群赖型是贵州省近年流行的优势型,钩体株PFGE带型具有多样性,可为当地钩体病的监测、暴发调查和传染源追踪提供参考依据。 展开更多
关键词 贵州 钩端螺旋体 PCR 脉冲场凝胶电泳
肉牛屠宰过程中分离出沙门氏菌的脉冲场凝胶电泳分子溯源分析 预览
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作者 董鹏程 张一敏 +4 位作者 毛衍伟 梁荣蓉 韩广星 朱立贤 罗欣 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第13期171-176,共6页
为确定沙门氏菌在肉牛屠宰过程中不同工序间传播路径与交叉污染情况,应用脉冲场凝胶电泳(pulsedfield gel electrophoresis,PFGE)技术对分离于肉牛屠宰过程6个工序点(粪便、皮毛、去皮后、喷淋后、排酸后、分割肉)的沙门氏菌进行分子溯... 为确定沙门氏菌在肉牛屠宰过程中不同工序间传播路径与交叉污染情况,应用脉冲场凝胶电泳(pulsedfield gel electrophoresis,PFGE)技术对分离于肉牛屠宰过程6个工序点(粪便、皮毛、去皮后、喷淋后、排酸后、分割肉)的沙门氏菌进行分子溯源分析。结果证实,PFGE比血清分型具有更高的分辨率,48 株沙门氏菌的PFGE图谱相似度为48.0%~100.0%,所有菌株在95.7%的相似度下划分为22个基因型,不同工厂(地域)间未发现高度相似的基因型。宰前动物的皮毛和粪便间存在严重的交叉污染现象,部分来源于粪便、皮毛的沙门氏菌已经突破屠宰企业的防控屏障,对胴体(洁净区)造成了污染,具有进一步污染下游产品的可能性。因此,应加强宰前管理,减少宰前交叉污染对企业内部防控措施造成的压力,并对去皮后的胴体设置喷淋减菌的干预程序,以有效扼制沙门氏菌由动物胃肠道向屠宰线的传播。 展开更多
关键词 沙门氏菌 脉冲场凝胶电泳 溯源分析 肉牛屠宰
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河南省小肠结肠炎耶尔森菌病原学特征和分子分型研究
8
作者 穆玉姣 张白帆 +4 位作者 潘静静 梁俊荣 王鑫 夏胜利 黄学勇 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期180-184,共5页
目的了解2011—2017年河南省小肠结肠炎耶尔森菌的分布情况,分析其病原学特征及致病菌株的同源关系。方法采集腹泻患者粪便、各类家禽家畜粪便、苍蝇以及生熟肉制品涂抹等各类标本12 728份,采用冷增菌方法进行目的菌分离。对分离到的小... 目的了解2011—2017年河南省小肠结肠炎耶尔森菌的分布情况,分析其病原学特征及致病菌株的同源关系。方法采集腹泻患者粪便、各类家禽家畜粪便、苍蝇以及生熟肉制品涂抹等各类标本12 728份,采用冷增菌方法进行目的菌分离。对分离到的小肠结肠炎耶尔森菌进行系统生化鉴定、生物分型、血清分型及毒力基因PCR检测,采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型方法对其中的致病性菌株进行基因分型。结果12 728份样本中共分离出390(3.06%)株小肠结肠炎耶尔森菌,其中人源株13株,动物源株377株。菌株分离阳性标本源主要为猪和鸡粪便标本,均为25.13%(98/390)。分离菌株生物分型以1A为主,血清型主要是O∶5和O∶8;毒力基因检测显示21株O∶3血清型菌株具有致病性,其中人源株1株,猪源株20株。致病性菌株经NotⅠ酶切后共分为3种带型,带型相似度为94%~100%。结论河南省小肠结肠炎耶尔森菌在人群和各类动物中均有存在,致病性菌株的主要宿主是猪,且致病株同源性较高。 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森菌 血清分型 毒力基因 PFGE 分子分型
北京市顺义区三起关联性副溶血弧菌食源性疾病暴发事件的识别与分析
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作者 李颖 张晴 +4 位作者 张爽 张彦春 荆红波 马红梅 逄波 《疾病监测》 CAS 2019年第4期371-376,共6页
目的分析3起由副溶血弧菌(VP)导致的食源性疾病暴发事件,利用国家致病菌识别网(China PIN)对其进行关联性分析。方法收集2018年8月北京市顺义区3起食源性疾病暴发事件的流行病学资料,采集可疑食品、环境和病例样本48份,进行菌株分离和鉴... 目的分析3起由副溶血弧菌(VP)导致的食源性疾病暴发事件,利用国家致病菌识别网(China PIN)对其进行关联性分析。方法收集2018年8月北京市顺义区3起食源性疾病暴发事件的流行病学资料,采集可疑食品、环境和病例样本48份,进行菌株分离和鉴定,对分离的VP菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型,获得的指纹图谱通过致病菌识别网进行比对分析。结果 3起暴发事件中,共从12份病例样本和3份可疑食品样本中分离出15株O3:K6血清型VP,其种特异性基因和毒力基因检测结果为:toxR+/tdh+/trh-,根据PFGE指纹图谱可以将15株VP分成2个簇,每个簇中的指纹图谱相似度为100%。2个指纹图谱簇之间的相似度为93.94%;且与2014—2017年本地区China PIN分子分型数据库中分离自腹泻病例的VP菌株带型不成簇。结论 VP引起的3起食源性疾病暴发事件由共同的传染源导致,China PIN在食源性疾病暴发识别、溯源和关联性分析中有良好的应用前景。 展开更多
关键词 副溶血弧菌 脉冲场凝胶电泳 国家致病菌识别网 食源性疾病
上海市一例肠出血性大肠埃希菌O157∶H7感染病例的病原学分析
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作者 庄源 陈洪友 +4 位作者 陈涌 张曦 顾丽萍 余玮 陈敏 《疾病监测》 CAS 2019年第6期519-524,共6页
目的通过流行病学调查与病原菌鉴定,并结合既往相关菌株资料,对2016年6月上海市腹泻病综合监测中报告的1例肠出血性大肠埃希菌(EHEC)O157∶H7感染病例进行病原学分析。方法对患者开展流行病学调查。采集标本后进行菌株分离培养、生化鉴... 目的通过流行病学调查与病原菌鉴定,并结合既往相关菌株资料,对2016年6月上海市腹泻病综合监测中报告的1例肠出血性大肠埃希菌(EHEC)O157∶H7感染病例进行病原学分析。方法对患者开展流行病学调查。采集标本后进行菌株分离培养、生化鉴定并确定血清型;利用聚合酶链式反应(PCR)检测所携带的毒力基因;采用微量肉汤稀释法进行药敏试验;应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术进行分子分型;通过全基因组测序获取序列信息进行多位点序列分型(MLST)及单核苷酸多态性分析。结果流行病学调查未发现可疑传染源。患者样本分离出EHEC O157∶H7;携带eae、stx2基因;对进行试验的16种抗生素均敏感;菌株图谱带型与以往监测中分离菌株带型均不相同;MLST分型为ST11型,与以往分离菌株核心基因组差异较大。结论上海市较长时间无检出EHEC O157∶H7菌株的病例记录,通过对此次分离的菌株的全面检测,确定了其毒力基因、耐药性和MLST型别,并发现新的PFGE带型,其核心基因组与以往菌株呈现出一定差异,值得进一步关注。 展开更多
关键词 肠出血性大肠埃希菌 腹泻 毒力基因 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型 单核苷酸多态性
2015-2017年北京市顺义区食源性疾病监测腹泻病例霍乱弧菌感染及病原学特征分析
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作者 何牧 张爽 +4 位作者 张彦春 王彦波 朱美娟 张茂俊 李颖 《疾病监测》 CAS 2019年第6期525-528,共4页
目的研究食源性疾病监测腹泻患者霍乱弧菌感染特点及病原学特征,为科学防控和临床治疗提供依据。方法从2015-2017年北京市顺义区腹泻监测病例的粪便标本中分离培养霍乱弧菌,针对分离菌株进行毒力基因聚合酶链式反应(PCR)检测、脉冲场凝... 目的研究食源性疾病监测腹泻患者霍乱弧菌感染特点及病原学特征,为科学防控和临床治疗提供依据。方法从2015-2017年北京市顺义区腹泻监测病例的粪便标本中分离培养霍乱弧菌,针对分离菌株进行毒力基因聚合酶链式反应(PCR)检测、脉冲场凝胶电泳(PFGE)、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)图谱分析以及抗生素敏感性分析。结果 2015-2017年,共收集1 105例腹泻患者,霍乱弧菌的检出率为0.54%(6/1 105),霍乱毒素基因ctxAB均为阴性,血清学分型为非O1/O139型,其中5株霍乱弧菌携带Ⅲ型分泌系统毒力基因。菌株PFGE聚类分析结果和MALDI-TOF MS图谱聚类结果具有较好的一致性。结论霍乱弧菌流行强度不高,但其感染和病原学监测工作应在食源性疾病监测体系中得到重视。 展开更多
关键词 霍乱弧菌 腹泻 食源性疾病 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 耐药 脉冲场凝胶电泳
某院ICU患者及环境分离鲍曼不动杆菌同源性分析 预览
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作者 汪洋 吴晓松 +2 位作者 陈越英 王嵬 徐燕 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期556-560,共5页
目的调查某院ICU患者及环境分离鲍曼不动杆菌的同源性。方法对江苏省该院ICU采集的180份患者和环境标本进行鲍曼不动杆菌分离、药敏分析以及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。结果从180份样本中分离出41株鲍曼不动杆菌,其中临床菌株9株,环境菌... 目的调查某院ICU患者及环境分离鲍曼不动杆菌的同源性。方法对江苏省该院ICU采集的180份患者和环境标本进行鲍曼不动杆菌分离、药敏分析以及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。结果从180份样本中分离出41株鲍曼不动杆菌,其中临床菌株9株,环境菌株32株。药敏结果显示除对左氧氟沙星耐药率较低外(34.1%),对其他抗菌药物的耐药率均高于70%。41株鲍曼不动杆菌PFGE基因分型分成19型,其中I、M、N、O、P5个型别每型包含2株及以上,其余均为1株一型别;P型16株,其中有5株来自于医院感染患者,其余株来自于患者的呼吸机、治疗车以及周围环境,同时该型AB的检出时间跨度长达141 d。结论该院ICU患者及环境分离鲍曼不动杆菌具有同源性,存在医院内传播及医院感染的流行。应加强消毒措施实施的监管,尽量避免医院感染的发生及流行。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 医院感染 脉冲场凝胶电泳 同源性
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耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌分子流行病学研究 预览
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作者 龚林 刘小丽 +1 位作者 许慧琼 梁建生 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期643-647,共5页
目的分析武汉两所医院耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)临床分离株产碳青霉烯酶的情况,以及分子流行病学特征。方法收集武汉两所医院2018年1-10月临床分离的42株非重复CRKP,采用CarbaNP试验方法对菌株产碳青霉烯酶情况进行初筛,聚合酶链... 目的分析武汉两所医院耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)临床分离株产碳青霉烯酶的情况,以及分子流行病学特征。方法收集武汉两所医院2018年1-10月临床分离的42株非重复CRKP,采用CarbaNP试验方法对菌株产碳青霉烯酶情况进行初筛,聚合酶链反应(PCR)检测碳青霉烯酶基因携带情况,采用质粒接合试验分析耐药基因的水平转移情况,应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行亲缘关系分析。结果42株CRKP菌株中14株CarbaNP试验阳性,其中有10株扩增出NDM-1基因,3株扩增出KPC-2基因。共13株CRKP碳青霉烯基因检测阳性,其中12株质粒接合试验成功。PFGE分析结果显示,携带NDM-1基因的CRKP菌株共分成6型,无明显优势型;携带KPC-2基因的CRKP菌株为同一型别。结论检出产NDM-1和KPC-2的CRKP菌株,质粒接合试验提示质粒介导的水平传播在碳青霉烯酶基因的播散过程中可能起重要作用。 展开更多
关键词 碳青霉烯酶 肺炎克雷伯菌 CarbaNP试验 PFGE 分子流行病学
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2017年南京市部分沙门菌感染特征及菌株脉冲场电泳鉴定 预览
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作者 葛藤 程婷婷 +4 位作者 张韶华 江晓 叶艳华 史小超 张洪英 《江苏预防医学》 CAS 2019年第1期19-22,86共5页
目的 了解2017年南京市沙门菌感染及分子流行病学特征。方法2017年4—10月收集南京市各哨点医院送检疑似细菌性感染的分离菌株,以常规方法鉴定,挑取单克隆菌落,进行脉冲场电泳分析,采用PulseNetChina系统聚类分析软件进行图谱分析;并结... 目的 了解2017年南京市沙门菌感染及分子流行病学特征。方法2017年4—10月收集南京市各哨点医院送检疑似细菌性感染的分离菌株,以常规方法鉴定,挑取单克隆菌落,进行脉冲场电泳分析,采用PulseNetChina系统聚类分析软件进行图谱分析;并结合临床指标进行描述性分析。结果分离、鉴定84株沙门菌,共计32种血清型,主要为鼠伤寒沙门菌(23株,占27.38%)。94.0%菌株分离自粪便标本,病例年龄1个月~95岁,主要为≤1岁(29.76%)、≥60岁组(17.86%);7月为感染高峰(占25.00%);临床诊断主要为感染性腹泻/急性胃肠炎(占72.62%)。不同年龄感染谱不同:鼠伤寒沙门菌感染者多为≤10岁组(95.65%),肠炎沙门菌感染者多为50~60岁组(62.50%),乙型副伤寒沙门菌感染以及斯坦利沙门菌感染者均≤1组岁,都柏林沙门菌感染者均为40~50岁组。经XbaⅠ酶切、电泳片段为30~700kD,PFGE指纹图谱带型相似度为0.35%~100.00%,同血清型相同菌株的PFGE指纹图谱带型均不同,鼠伤寒沙门菌S1相似群相似度最高为92.59%,其余种属相似群相似度均<80%。结论南京市2017年沙门菌感染多以鼠伤寒沙门菌为主,婴幼儿和老年人为高危人群,夏季为感染高峰。沙门菌血清型与PFGE指纹图谱未发现直接关联,应进一步加强监测及PFGE数据库建设。 展开更多
关键词 沙门菌 鼠伤寒沙门菌 脉冲场电泳 分子流行病学
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北京市昌平区临床分离沙门菌株分子分型与耐药分析 预览
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作者 李东迅 舒高林 +1 位作者 王维钧 吴杨 《江苏预防医学》 CAS 2019年第3期246-248,共3页
目的了解北京市昌平区沙门菌临床菌株血清型、分子特征及耐药性。方法对2017年昌平区分离的沙门菌进行血清分型、脉冲场凝胶电泳分型分析及药敏实验。结果42株沙门菌主要血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。PFGE分析得到31种PFGE带型,... 目的了解北京市昌平区沙门菌临床菌株血清型、分子特征及耐药性。方法对2017年昌平区分离的沙门菌进行血清分型、脉冲场凝胶电泳分型分析及药敏实验。结果42株沙门菌主要血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。PFGE分析得到31种PFGE带型,菌株相似系数为56.9%~100.0%。沙门菌对萘啶酸、链霉素、氨苄西林和磺胺异恶唑的耐药率较高,分别为57.14%、42.86%、40.48%和40.48%;19株(45.24%)沙门菌同时耐受3种及以上抗生素。结论北京市昌平区引起腹泻的沙门菌主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌,对萘啶酸、磺胺异恶唑、链霉素和氨苄西林等抗生素耐药率高,多重耐药严重,且PFGE带型呈高度多态性。 展开更多
关键词 腹泻 沙门菌 血清型 分子分型 脉冲场凝胶电泳 耐药性
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肺炎克雷伯菌耐药表型及分子分型特征分析 预览
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作者 熊流新 陆丽苗 +1 位作者 梁启兰 苏乐斌 《检验医学与临床》 CAS 2019年第16期2319-2322,共4页
目的探讨肺炎克雷伯菌耐药表型及通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术分析其分子分型,为完善肺炎克雷伯菌分子流行病学特征提供依据。方法收集2018年1-12月肇庆市第二人民医院非重复分离的51株肺炎克雷伯菌为研究对象,采用微量肉汤法进行药敏... 目的探讨肺炎克雷伯菌耐药表型及通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术分析其分子分型,为完善肺炎克雷伯菌分子流行病学特征提供依据。方法收集2018年1-12月肇庆市第二人民医院非重复分离的51株肺炎克雷伯菌为研究对象,采用微量肉汤法进行药敏试验;采用改良产碳青霉烯酶灭活试验(mCIM)检测CRKP表型;采用PFGE进行分子分型,建立PFGE DNA指纹图谱数据库,并运用Bionumeries6.6生物软件进行聚类分析。结果51株肺炎克雷伯菌根据耐药谱可以分为4个耐药表型,其中产超广谱β-内酰胺酶肺炎克雷伯菌(产ESBLsKP)28株(54.9%)、耐碳青霉烯酶类肺炎克雷伯菌(CRKP)4株(7.8%)、多重耐药肺炎克雷伯菌(MDRKP)9株(17.7%)、高毒力肺炎克雷伯菌(HvKP)10株(19.6%)。PFGE聚类分析结果显示,51株菌株间相似度为47.8%~100.0%,可分为47个PFGE型别,PFGE型别相似度>85.0%共10株,其中Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型具有100.0%相同PFGE图谱,可以视为4个具有分子流行病学意义的单一克隆群。结论肇庆市第二人民医院肺炎克雷伯菌耐药表型以产ESBLsKP为主,PFGE分型呈多样性,并存在院内散发感染风险,需要注意菌株型别变异趋势。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 耐药表型 脉冲场凝胶电泳 改良产碳青霉烯酶灭活试验
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2014~2018年北京市人源性肠产毒性大肠埃希菌耐药性与PFGE分子分型研究
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作者 王丽丽 张寻 +2 位作者 陆峥 张诣 陈倩 《食品安全质量检测学报》 CAS 2019年第12期3777-3786,共10页
目的分析北京市门诊腹泻病例肠产毒性大肠埃希菌(enterotoxigenic Escherichiacoli,ETEC)分离株抗生素敏感性及分子分型特征。方法采用微量肉汤稀释法对2014~2018年北京市门诊腹泻病例ETEC分离株进行8大类14种抗生素敏感性检测。参照Pul... 目的分析北京市门诊腹泻病例肠产毒性大肠埃希菌(enterotoxigenic Escherichiacoli,ETEC)分离株抗生素敏感性及分子分型特征。方法采用微量肉汤稀释法对2014~2018年北京市门诊腹泻病例ETEC分离株进行8大类14种抗生素敏感性检测。参照PulseNet中非O157大肠埃希菌脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分型方法,对不同区县不同采样时间分离的菌株采用随机抽样原则,对178株菌基因组经限制性内切酶Xba I酶切后进行分子分型和聚类分析。结果 578株2014~2018年北京市门诊腹泻病例ETEC菌株总耐药率为94.29%,对萘啶酸、氨苄西林、头孢唑林耐药率较高,分别为61.58%、60.38%、36.19%。578株菌分为152个耐药谱,耐3种及3种以上抗生素的菌株数达340株(59.00%),有1株菌对12种抗生素耐药。常见耐药谱为耐喹诺酮类的萘啶酸,占20.18%,其次为耐β-内酰胺类的氨苄西林-头孢唑林-头孢噻肟,占12.29%,再次为耐β-内酰胺类的氨苄西林-喹诺酮类的萘啶酸-大环内酯类的阿奇霉素,占6.79%,且耐药谱种类逐年缓慢上升。其中178株菌共产生153种PFGE带型,带型分布较为分散,无优势带型,菌株之间的相似系数为31.60%~100.0%。结论 2014~2018年北京市腹泻病例肠产毒性大肠埃希菌耐药情况严重,耐药谱复杂广泛,多重耐药菌株占比呈逐年缓慢上升趋势。PFGE带型呈多态性分布。 展开更多
关键词 病人 肠产毒性大肠埃希菌 耐药性 脉冲场凝胶电泳 分子分型
腹泻标本分离的副溶血性弧菌的PFGE分型与tdh毒力基因的检测
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作者 胡利春 俞刚 +1 位作者 冯维 吕火烊 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1619-1623,共5页
目的了解腹泻患者中副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus,VP)的检出情况,探讨流行优势型,分析副溶血性弧菌的毒力基因携带,从而了解疾病发生的诱因,为控制副溶血性弧菌引起的疾病提供依据。方法选择2017年5-10月分离培养腹泻患者标本... 目的了解腹泻患者中副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus,VP)的检出情况,探讨流行优势型,分析副溶血性弧菌的毒力基因携带,从而了解疾病发生的诱因,为控制副溶血性弧菌引起的疾病提供依据。方法选择2017年5-10月分离培养腹泻患者标本中的病原菌;质谱仪鉴定出副溶血性弧菌菌株;利用脉冲场凝胶电泳(Pulsed Field Gel Electrophoresis,PFGE)进行分子分型;聚合酶链式反应(PCR)检测菌株毒力基因。结果 108份腹泻患者的粪便标本中培养分离副溶血性弧菌42株,检出率为38.89%(42/108)。PFGE分为12个型别,优势型为A1型,占59.52%(25/42)。tdh毒力基因阳性的副溶血性弧菌38株,阳性率为90.48%(38/42)。结论腹泻患者中副溶血性弧菌检出率较高,PFGE分型方法准确性高、特异性高、重复性好、结果易判读,致病性的菌株带型集中。患者中分离得到的副溶血性弧菌大多为带毒株,具有致病能力。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 脉冲场凝胶电泳 毒力基因
8株产NDM-1肠杆菌科细菌的耐药特点和流行性分析 预览 被引量:1
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作者 张盼 沈振华 +2 位作者 张燕华 刘兴晖 李向阳 《检验医学》 CAS 2018年第7期616-621,共6页
目的 研究温州医科大学附属第二医院临床分离的8株产新德里金属β-内酰胺酶1(NDM-1)肠杆菌科细菌的耐药特点及分子生物学特点。方法 采用Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统进行菌株的鉴定和体外药物敏感性试验;采用聚合酶链反应(PCR... 目的 研究温州医科大学附属第二医院临床分离的8株产新德里金属β-内酰胺酶1(NDM-1)肠杆菌科细菌的耐药特点及分子生物学特点。方法 采用Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统进行菌株的鉴定和体外药物敏感性试验;采用聚合酶链反应(PCR)扩增β-内酰胺酶基因,并对扩增产物进行测序和Blast比对分析。采用接合转移试验检测NDM-1耐药基因的水平转移能力。采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析菌株的同源性。结果 8株菌株对β-内酰胺类药物及β-内酰胺酶抑制剂复合物均表现出较高的耐药性,而对氨基糖苷类和氟喹诺酮类药物敏感性很好;各菌株多同时携带多种耐药基因,其中5株携带SHV基因、2株携带CTX-M-1基因、1株携带DHA-1基因。产NDM-1菌株(2株大肠埃希菌除外)接合成功,接合子对β-内酰胺类药物的耐药性很高。PFGE结果显示,2株大肠埃希菌为不同克隆株,而3株阴沟肠杆菌中有2株具有同源性,视为同一克隆株。结论 产NDM-1肠杆菌科细菌多同时携带多种耐药基因,对β-内酰胺类药物及β-内酰胺酶抑制剂复合物均表现出较高的耐药性。NDM-1耐药基因具有水平转移能力。 展开更多
关键词 新德里金属β-内酰胺酶1 碳青霉烯酶 肠杆菌科 脉冲场凝胶电泳
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耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的分子流行病学分析 预览 被引量:1
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作者 史玮炀 刘洋 +4 位作者 韩逸超 郑丹丹 戴尔宽 郑冰 李敏 《检验医学》 CAS 2018年第1期37-43,共7页
目的分析上海交通大学医学院附属仁济医院分离的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药性及同源性,为CRKP感染的临床治疗和医院感染控制提供依据. 方法收集分离自上海交通大学医学院附属仁济医院2013年1月-2015年8月感染患者的CRKP 10... 目的分析上海交通大学医学院附属仁济医院分离的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药性及同源性,为CRKP感染的临床治疗和医院感染控制提供依据. 方法收集分离自上海交通大学医学院附属仁济医院2013年1月-2015年8月感染患者的CRKP 107株,采用纸片扩散法检测其对18种抗菌药物的敏感性,微量肉汤稀释法检测美罗培南和替加环素的最低抑菌浓度(MIC),聚合酶链反应(PCR)检测碳青霉烯酶耐药基因,脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子生物学分型,NTSYS(2.1)软件中UPGMA算法进行聚类分析. 结果107株CRKP除对复方磺胺甲噁唑(敏感率67.3%)、磷霉素(敏感率24.0%)、替加环素(敏感率100.0%)相对敏感外,对其余17种抗菌药物均不敏感(耐药率〉95.0%);107株CRKP均检出KPC-2基因;受检菌株经PFGE指纹图谱分析共得出24种型别(A型~X型),以A型[19.6%(21/107)]、B型[13.1%(14/107)]和C型[11.2%(12/107)]为主.在21株A型CRKP中有15株于1个月内分离自神经外科(6株)、门诊(3株)、血液科(2株)、老年科(2株)、外科重症监护病房(ICU,1株)和泌尿外科(1株).在6株F型CRKP中有4株分别于2周内分离自普外科(2株)和老年科(2株),其余PFGE型别菌株分布离散性较大,散发于不同时期和不同病区. 结论上海交通大学医学院附属仁济医院分离的CRKP耐药基因主要为KPC-2,院内存在A型和F型菌株暴发流行.CRKP对复方磺胺甲噁唑、磷霉素和替加环素具有-定的敏感性,建议临床治疗首选复方磺胺甲噁唑.临床医护人员应采取合理措施加强对CRKP的耐药性监测,控制其在医院的传播. 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌 基因分型 脉冲场凝胶电泳
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