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毛竹和厚壁毛竹的核型分析及45S和5S rDNA的FISH分析
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作者 韩言利 郭起荣 +2 位作者 韩永华 于钊妍 米月颖 《南京林业大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期203-208,共6页
【目的】厚壁毛竹(Phyllostachys edulis‘Pachyloen’)是毛竹(Phyllostachys edulis)的栽培品种,是具有较高经济价值的优特种质。对毛竹与厚壁毛竹进行细胞遗传学研究,了解其核型特征。【方法】采用双色荧光原位杂交技术,对毛竹、厚壁... 【目的】厚壁毛竹(Phyllostachys edulis‘Pachyloen’)是毛竹(Phyllostachys edulis)的栽培品种,是具有较高经济价值的优特种质。对毛竹与厚壁毛竹进行细胞遗传学研究,了解其核型特征。【方法】采用双色荧光原位杂交技术,对毛竹、厚壁毛竹进行了核型分析,利用45S和5S rDNA在其染色体上进行了物理定位。【结果】毛竹、厚壁毛竹的染色体数目都为48条,毛竹的染色体相对组成为2n=48=12L+10M2+14M1+12S,核型公式为2n=48=32m+12sm+4st(2SAT);厚壁毛竹的染色体相对组成为2n=48=12L+8M2+16M1+12S,核型公式为2n=48=34m+10sm+4st(2SAT)。毛竹与厚壁毛竹的染色体不对称系数分别为61.41%和59.55%,均属于"2B"型。荧光原位杂交(FISH)结果表明:毛竹、厚壁毛竹都有2个45S rDNA位点和4个5S rDNA位点。【结论】厚壁毛竹的染色体数量为48条,补充了毛竹的染色体为48条的循证依据;获得了毛竹、厚壁毛竹45S和5S rDNA荧光原位杂交核型,两者的45S和5S rDNA位点没有明显差异,具有相似的核型,显示其较近的亲缘关系。 展开更多
关键词 毛竹 厚壁毛竹 核型分析 RDNA 荧光原位杂交
核糖体DNA转录的表观调控与肿瘤发生 预览
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作者 程香荣 胡兴琳 +3 位作者 姜琦 黄星卫 王楠 雷蕾 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期185-192,共8页
近年来,表观遗传机制的研究结果提示核糖体DNA(rDNA)表观调控机制的缺陷可能诱导肿瘤发生。ATRX/DAXX复合物通过介导H3.3的H3K9me3修饰,建立和维持rDNA转录沉默。ATRX/DAXX基因在部分肿瘤中经常发生突变,可能刺激rDNA转录而促进肿瘤发... 近年来,表观遗传机制的研究结果提示核糖体DNA(rDNA)表观调控机制的缺陷可能诱导肿瘤发生。ATRX/DAXX复合物通过介导H3.3的H3K9me3修饰,建立和维持rDNA转录沉默。ATRX/DAXX基因在部分肿瘤中经常发生突变,可能刺激rDNA转录而促进肿瘤发生发展。本文主要阐述rDNA转录表达异常对肿瘤发生的促进作用,介绍rDNA基因转录的表观遗传调控机制,以期为针对rDNA转录调控机制的药物研发提供新的理论支持。 展开更多
关键词 RDNA 表观调控 H3.3 ATRX/DAXX 肿瘤发生
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我国北方岩溶泉域刚毛藻的系统发育及形态学研究 预览
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作者 胡变芳 吉莉 +2 位作者 陈乐 冯佳 史胜利 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期53-61,共9页
脆弱刚毛藻(Cladophora fracta)是一种大型丝状绿藻,生境分布广泛。然而,对于岩溶泉域分布的刚毛藻研究较少,它们的遗传多样性、生物地理亲缘性和生理特性都有待于深入研究。该研究对我国北方地区五个典型岩溶泉域的50个脆弱刚毛藻样本... 脆弱刚毛藻(Cladophora fracta)是一种大型丝状绿藻,生境分布广泛。然而,对于岩溶泉域分布的刚毛藻研究较少,它们的遗传多样性、生物地理亲缘性和生理特性都有待于深入研究。该研究对我国北方地区五个典型岩溶泉域的50个脆弱刚毛藻样本进行了形态学和分子系统学描述。主要研究目标:(1)对我国北方地区五个典型岩溶泉的刚毛藻生境进行描述;(2)根据形态学特征和分子序列对藻体进行鉴定;(3)探究生境对藻体生理特性的影响。结果表明:基于SSU和LSU序列的结果,发现所分析的50株刚毛藻个体为同一种,同时还发现了13个不同的核糖体基因型。基于SSU和LSU的系统发育树,刚毛藻属均未能形成单系分支,分布在三个不同的分支上。13个样本基因型在SSU和LSU树中的位置相似,与Cladophora vagabunda有很高的序列同源性,但是形态特征却差异很大。从显微结构结果来看,五个岩溶泉域采集到的刚毛藻在细胞直径上无显著差异,藻体的形态特征与脆弱刚毛藻相一致。但是,岩溶泉域采集的藻体细胞直径比文献报道中在湖泊和河流中采集的脆弱刚毛藻直径要大。另外,仅在两个地点(XA和ST)采集的标本中发现有假根状分枝。因此,基于形态学和分子序列的结果,将这五个泉域的刚毛藻鉴定为脆弱刚毛藻(Cladophora fracta)。 展开更多
关键词 刚毛藻属 岩溶泉 系统发育 绿藻 RDNA 刚毛藻科
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基于年龄因素的肠镜阴性人群与结直肠息肉患者肠道菌群结构及多样性研究 预览
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作者 鲁弘骎 陈晖 黄颉刚 《长江大学学报:自然科学版》 CAS 2019年第4期119-124,共6页
目的:结直肠息肉病具有显著的人口学特征,基于年龄为主要风险因素,探讨结直肠息肉患者和肠镜检查结果阴性人群的肠道菌群构成和多样性差异。方法:①筛选出结直肠息肉患者7例以及肠镜检查结果阴性人群47例的粪便样本;②提取样本菌群的DNA... 目的:结直肠息肉病具有显著的人口学特征,基于年龄为主要风险因素,探讨结直肠息肉患者和肠镜检查结果阴性人群的肠道菌群构成和多样性差异。方法:①筛选出结直肠息肉患者7例以及肠镜检查结果阴性人群47例的粪便样本;②提取样本菌群的DNA、PCR扩增、纯化及产物定量,菌群作16S rDNA基因测序;③样本分组:息肉组(7例)、对照组(47例),后者又分为对照一组(年龄≥40岁)、对照二组(年龄<40岁);④使用I-Sanger云平台进行高通量数据分析,物种差异分析使用秩和检验。结果:①Alpha多样性分析,息肉组与对照组肠道菌群构成不同;②在门水平上,息肉组梭杆菌门(Fusobacteria)相对丰度显著低于对照组;在科水平上,息肉组伯克氏菌科(Burkholderiaceae)、梭杆菌科(Fusobacteriaceae)、产碱杆菌科(Alcaligenaceae)的相对丰度显著低于对照组;在属水平上,息肉组洋葱伯克霍尔德菌(Burkholderia-Paraburkholderia)的相对丰度显著低于对照组;③息肉组与对照一组和2组的Alpha多样性差异无统计学意义(P>0.05)。结论:①息肉组与对照组肠道菌群构成不同;②随着年龄增大,维荣球菌科(Veillonellaceae)、巨单胞菌属(Megamonas)相对丰度下降与结直肠息肉发病风险增大有关。 展开更多
关键词 结直肠息肉 肠道菌群 肠镜阴性 细菌16S RDNA 高通量测序
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Versuriga anadyomene,a newly recorded scyphozoan jellyfish(Scyphozoa:Rhizostomae)in Chinese waters 预览
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作者 SUN Tingting DONG Zhijun LI Yuanchao 《海洋湖沼学报(英文)》 SCIE CAS CSCD 2019年第1期266-272,共7页
Scyphozoans are currently causing great concern worldwide due to the effects of their blooms on the marine environment.During a field survey in Beibu Gulf,South China Sea,on 27 May 2015,we found specimens of a rhizost... Scyphozoans are currently causing great concern worldwide due to the effects of their blooms on the marine environment.During a field survey in Beibu Gulf,South China Sea,on 27 May 2015,we found specimens of a rhizostome jellyfish that had not previously been recorded in Chinese seas.The morphological characters and DNA sequences of several specimens were examined in the laboratory.These specimens had the following morphological characters:hemispherical umbrella with reticular grooves;eight large semicircular velar lappets alternating with narrow lappets in each of the 8 octants;laterally fl attened mouth-arms with numerous fl at,membranous branches bearing many clubs and intermediate filaments;non-anastomosed broad perradial canals and anastomosed narrow interradial canals.The morphological characters of these rhizostome jellyfish were consistent with descriptions of Versuriga anadyomene.Furthermore,phylogenetic analysis of mitochondrial 16S rDNA and nuclear 18S rDNA gene fragments confirmed that these specimens were in the same cluster as V.anadyomene collected in Palau.Therefore,this rhizostome jellyfish was identified as V.anadyomene.This is the first record of the genus Versuriga and the species V.anadyomene in Chinese seas.The arrival of this species may be attributed to physical transport from the coastal waters of South East Asia. 展开更多
关键词 South China Sea Versurigidae 18S rDNA morphology CHARACTERS
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Morphology and Molecular Phylogeny of Two Little-Known Species of Loxodes, L. kahli Dragesco & Njiné, 1971 and L. rostrum Müller, 1786(Protist, Ciliophora, Karyorelictea) 预览
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作者 WANG Lun QU Zhishuai +1 位作者 LI Song HU Xiaozhong 《中国海洋大学学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第3期643-653,共11页
The morphology and phylogeny of two little-known species, Loxodes kahli Dragesco & Njiné, 1971 and L. rostrum Müller, 1786, isolated from freshwater muddy sediments in China, were investigated based on l... The morphology and phylogeny of two little-known species, Loxodes kahli Dragesco & Njiné, 1971 and L. rostrum Müller, 1786, isolated from freshwater muddy sediments in China, were investigated based on live features, infraciliature, and small subunit ribosomal DNA(SSU rD NA) sequence data. Loxodes kahli is distinguished from its congeners mainly by the number and arrangement of macronuclei(6-17 in one row) and the number of right somatic ciliary rows(11-26). The Chinese populations of L. kahli also exhibit differences with other populations in terms of the body size and the number of right ciliary rows. The characteristics of L. rostrum are consistent with those of previous studies except for the number of right ciliary rows(9-10). The studied species were redefined based on the new information and previous descriptions. This study also gave a brief morphological summary of the species in the genus Loxodes by an identification key. SSU rDNA sequence-based phylogenetic analyses revealed that both species are grouped with their congeners, supporting the monophyly of the genus Loxodes. 展开更多
关键词 ANAEROBE BENTHIC CILIATE ciliature Loxodida SSU rDNA
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3株松鼠葡萄球菌的鉴定及耐药性分析
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作者 王果帅 王鹏勇 +1 位作者 陈革 王彦红 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第4期96-97,101共3页
为了对从2017年送检的3个病例中分离得到的病料进行病原菌鉴定,试验采用细菌分离、纯化、生化鉴定及16S rDNA基因PCR扩增与序列分析法进行鉴定,并对分离菌进行药敏试验。结果表明:共分离得到3株分离菌,分别命名为J1、J2、J3株,3株分离... 为了对从2017年送检的3个病例中分离得到的病料进行病原菌鉴定,试验采用细菌分离、纯化、生化鉴定及16S rDNA基因PCR扩增与序列分析法进行鉴定,并对分离菌进行药敏试验。结果表明:共分离得到3株分离菌,分别命名为J1、J2、J3株,3株分离菌均能发酵蔗糖和麦芽糖,产酸,不能发酵甘露醇和乳糖;PCR扩增分离菌,得到500 bp的目的条带,与NCBI中已知序列进行比对,均为松鼠葡萄球菌(同源性达99%);3株松鼠葡萄球菌对多西环素、阿莫西林、环丙沙星等药物敏感。说明3株分离菌为松鼠葡萄球菌,其对药物有不同程度的敏感性。 展开更多
关键词 松鼠葡萄球菌 分离 鉴定 耐药性 16S RDNA
Conjunctival microbiome changes associated with fungal keratitis:metagenomic analysis
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作者 Cheng Ge Chao Wei +2 位作者 Bao-Xia Yang Jun Cheng Yu-Sen Huang 《国际眼科杂志:英文版》 SCIE CAS 2019年第2期194-200,共7页
AIM:To investigate the ocular surface microbiome profile of patients with fungal keratitis(FK) through bacterial 16 S r DNA sequencing. METHODS:The swab samples were collected from 8 patients with FK(Group 1 from the ... AIM:To investigate the ocular surface microbiome profile of patients with fungal keratitis(FK) through bacterial 16 S r DNA sequencing. METHODS:The swab samples were collected from 8 patients with FK(Group 1 from the corneal ulcer, Group 2 from the conjunctival sac of the infected eyes, and Group 3 from the conjunctival sac of the fellow eyes) and 10 healthy eyes(Group 4 from the conjunctival sac). Bacterial 16 S rDNA V4-V5 region sequencing was performed to characterize the bacterial communities on the ocular surfaces of the patients with FK. RESULTS:Our metagenomic data showed that 97% of the sequence reads were categorized into 245 distinct bacterial genera, with 67.75±7.79 genera detected in Group 1, 73.80±13.44 in Group 2, 74.57±14.14 in Group 3, and 89.60±27.49 in Group 4. Compared with the healthy eyes(Group 4), both infected(Groups 1 and 2) and fellow eyes(Group 3) of the patients with FK showed reduced bacterial diversity and altered ocular surface microbiota compositions, with lower abundance of Corynebacterium and Staphylo coccus and higher abundances of Pseudomonas, Achromobacter, Caulobacter and Psychrobacter. CONCLUSION:Our report depicts the altered ocular surface bacterial community structures both in the affected and fellow eyes of patients with FK. These changes may contribute to the pathogenesis of FK or the increased risk for FK. 展开更多
关键词 CONJUNCTIVA MICROBIOTA bacteria METAGENOMICS 16S rDNA fungal KERATITIS
Molecular diversity and biogeography of benthic ciliates in the Bohai Sea and Yellow Sea 预览
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作者 Guihao Li Lei Su +2 位作者 Qianqian Zhang Xiaoli Zhang Jun Gong 《海洋学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第2期78-86,共9页
This study explored the molecular diversity and biogeography of benthic ciliates in Chinese marginal seas,the Bohai Sea(BHS),North Yellow Sea(NYS)and South Yellow Sea(SYS).From a previous 18S rRNA gene pyrosequencing ... This study explored the molecular diversity and biogeography of benthic ciliates in Chinese marginal seas,the Bohai Sea(BHS),North Yellow Sea(NYS)and South Yellow Sea(SYS).From a previous 18S rRNA gene pyrosequencing dataset of the benthic microeukaryotes,we retrieved the sequences affiliated with phylum Ciliophora and analyzed alpha and beta diversities of ciliate communities.We found that BHS had the highest ciliate operational taxonomic unit(OTU)richness than NYS and SYS,whereas the richness was not significantly different between summer and winter.Among all the measured environmental variables,water depth showed consistently the strongest correlations with alpha diversities.Overall,the class Spirotrichea(mostly Choreotrichia and unassigned lineages within the class)dominated the communities in terms of both relative proportion of sequences(77.0%)and OTU richness(66.5%).OTU-level ciliate community structure was significant different among the three basins,but not between the seasons.Structurally,significant differences in relative proportion among the basins were detected for the class Litostomatea,but not for other classes.Partial Mantel tests demonstrated that water depth difference was more important than geographic and environment distances in shaping the community structure of benthic ciliates in the studied area.About 60%OTUs were not assigned at a class or order level and at least 45%OTUs shared a sequence similarity no more than 97%with the described species,indicating a great potential for ciliate species discovery in the offshore sediments.Compared with previous morphology-based surveys,the spatial pattern of ciliate diversity(decreasing from NYS to SYS)is also identified in the present study.Nevertheless,structurally,the dominant class appeared to be Spirotrichea in the sequencing dataset,which differs from previous morphology-based results(dominance of classes Prostomatea and Karyorelictea in biomass).The potential causes for the discrepancies between molecular and morphological findings are also d 展开更多
关键词 18S rDNA BENTHIC CILIATES diversity BIOGEOGRAPHY depth DECAY relationship
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Morphological and molecular diagnoses of Polydora brevipalpa Zachs, 1933 (Annelida: Spionidae) from the shellfish along the coast of China 预览
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作者 YE Lingtong YAO Tuo +2 位作者 WU Lin LU Jie WANG Jiangyong 《海洋湖沼学报(英文)》 SCIE CAS CSCD 2019年第2期713-723,共11页
Shell-boring species Polydora brevipalpa Zachs, 1933 is redescribed based on morphological observations and molecular approach for future unambiguous identification. Genetic distance analyses showed that the interspec... Shell-boring species Polydora brevipalpa Zachs, 1933 is redescribed based on morphological observations and molecular approach for future unambiguous identification. Genetic distance analyses showed that the interspecific polydorid variation (16.7%–25.6%) was at least 15 times higher than the intraspecific one (0.2%–0.9%) based on the cytochrome c oxidase subunit I (CO1) gene sequences of polydorids. However, 18S rDNA variation pattern demonstrated a rather narrow barcoding gap, with the interspecific polydorid variation (0.5%–5.6%) being very close to the intraspecific one (0.0%–0.4%). As such, the CO1 gene exhibited better DNA barcode for identification of polydorids than the 18S rDNA gene because of the sufficiently large barcoding gaps. Analysis of molecular variance results based on CO1 gene sequences showed that most variations in sequences (97.79%) lay within groups of adult worms and egg capsules rather than between them. This indicated that egg capsules from Crassostrea gigas (Thunberg, 1793) in Ningbo and Nantong were related to the adult worms from Patinopecten yessoensis (Jay, 1857) in Dalian, and both of them belonged to P . brevipalpa . This result was further supported by parsimony network analysis, which showed that egg capsules collected from diff erent localities and adult worms shared a single haplotype. This study was the first to report both P . brevipalpa infestation on C . gigas and to utilise the known CO1 sequences of the adult polydorids to validate morphologically unidentified egg capsules or early larvae. P . brevipalpa was most possibly brought to Chinese waters through transportation of Pa . yessoensis brood stock from Japan. 展开更多
关键词 POLYDORA brevipalpa mitochondrial CO1 18S rDNA DNA BARCODE egg CAPSULES
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Relationship between intestinal microbial dysbiosis and primary liver cancer 预览
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作者 Lei Zhang Yong-Na Wu +3 位作者 Tuo Chen Cheng-Hui Ren Xun Li Guang-Xiu Liu 《国际肝胆胰疾病杂志:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第2期149-157,共9页
Background:Intestinal microbial dysbiosis is involved in liver disease pathogenesis.However,its role in primary liver cancer(PLC),particularly in hepatocarcinogenesis remains unclear.The present study aimed to study t... Background:Intestinal microbial dysbiosis is involved in liver disease pathogenesis.However,its role in primary liver cancer(PLC),particularly in hepatocarcinogenesis remains unclear.The present study aimed to study the changes in intestinal flora at various stages of PLC and clarify the relationship between intestinal microbes and PLC.Methods:Twenty-four patients with PLC(PLC group),24 patients with liver cirrhosis(LC group),and 23 healthy control individuals(HC group)were enrolled from October 2016 to October 2017.Stool specimens of the participants were collected and the genomic DNA of fecal bacteria was isolated.High-throughput pyrosequencing of 16S rDNA was used to identify differences in gut bacterial diversity among HC,LC,and PLC groups.We also analyzed the relationship between clinical factors and intestinal microorganisms in LC and PLC groups.Results:Diversity of Firmicutes tended to decrease from the HC to LC and PLC groups at the phylum level.Among species,Enterobacter ludwigii displayed an increasing trend in the PLC group,wherein the relative abundance of Enterobacter ludwigii in the PLC group was 100 times greater than that in the HC and LC groups.The ratio of Firmicutes/Bacteroidetes was significantly decreased with the disease progression.In addition,the linear discriminant analysis effect size method indicated that Clostridia were predominant in the gut microbiota of the HC group,whereas Enterococcaceae,Lactobacillales,Bacilli and Gammaproteobacteria may be used as diagnostic markers of PLC.Redundancy analysis showed a correlation between intestinal microbial diversity and clinical factors AST,ALT,and AFP.Veillonella showed a significant positive correlation with AFP in the PLC group,whereas Subdoligranulum showed a negative correlation with AFP.Conclusions:This study indicates that dysbiosis of the gut microbiota might be involved in PLC development and progression. 展开更多
关键词 GUT MICROBIOTA MICROBIAL DYSBIOSIS HEPATOCARCINOGENESIS 16S rDNA
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猪产气巴氏杆菌广东株的分离鉴定及其16S rDNA基因序列遗传进化分析 预览
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作者 陈胜男 翟颀 +8 位作者 李垦科 张杰 钟汝情 陈晓倩 谢莹 焦思思 冉承峰 翟少伦 邹育根 《中国动物保健》 2019年第3期53-55,共3页
产气巴氏杆菌是一种人兽共患性病原菌,可引起人和动物不同程度的流产、不孕等繁殖障碍性疾病。本文对广东某猪场采集的母猪产道分泌物进行病原分离检测,在产道拭子中分离到一种疑似巴氏杆菌的菌体。经细菌16S rDNA 基因序列扩增、测序,... 产气巴氏杆菌是一种人兽共患性病原菌,可引起人和动物不同程度的流产、不孕等繁殖障碍性疾病。本文对广东某猪场采集的母猪产道分泌物进行病原分离检测,在产道拭子中分离到一种疑似巴氏杆菌的菌体。经细菌16S rDNA 基因序列扩增、测序,鉴定为猪产气巴氏杆菌,命名为GD01 株。序列分析显示GD01 株与GenBank 数据库中公布的产气巴氏杆菌16SrDNA 核酸同源性为98.5%以上。本研究首次报道了猪产气巴氏杆菌在广东的流行,其在猪群的流行病学意义有待进一步调查研究。 展开更多
关键词 产气巴氏杆菌 繁殖障碍 16S rDNA 遗传进化
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大兴安岭落叶松林不同演替阶段土壤细菌群落结构与功能潜势
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作者 李萍 史荣久 +4 位作者 赵峰 于景华 崔晓阳 胡金贵 张颖 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期95-107,共13页
采用土壤细菌16S r DNA高通量测序方法研究了大兴安岭汗马自然保护区落叶松林不同演替阶段的土壤细菌群落结构和功能.结果表明:不同演替阶段落叶松林土壤细菌优势门为变形菌门、酸杆菌门、疣微菌门、拟杆菌门、放线菌门、浮霉菌门和绿... 采用土壤细菌16S r DNA高通量测序方法研究了大兴安岭汗马自然保护区落叶松林不同演替阶段的土壤细菌群落结构和功能.结果表明:不同演替阶段落叶松林土壤细菌优势门为变形菌门、酸杆菌门、疣微菌门、拟杆菌门、放线菌门、浮霉菌门和绿弯菌门,随着演替的进行,酸杆菌门相对丰度逐渐增加,绿弯菌门相对丰度逐渐减少,优势门相对丰度在不同演替阶段不同.细菌群落α多样性在不同演替阶段间无显著差异,但其群落结构分别在落叶松幼龄林与中龄林、幼龄林与过熟林、近熟林与成熟林之间存在显著差异.土壤氧化还原电位、土壤p H和有效磷是影响细菌群落结构的主要环境因素,其中土壤氧化还原电位对微生物群落结构影响最大.随着演替的进行,细菌参与的固氮作用、反硝化作用、氨氧化作用、木质素降解作用呈逐渐减弱的趋势,硫酸盐异化还原作用呈先降后升的趋势,碳固定作用呈先升后降的趋势,碱性磷酸酶没有明显的变化规律,影响土壤功能的主要因素有土壤有效磷和氧化还原电位等. 展开更多
关键词 落叶松 16S RDNA 土壤细菌多样性 功能预测 元素循环
rDNA在细胞发育中的转录及调控
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作者 李佳 王琪 +3 位作者 宮甜甜 张玥 单智焱 雷蕾 《解剖学报》 CSCD 北大核心 2018年第5期695-698,共4页
细胞的生长发育受核糖体DNA(rDNA)和蛋白质基因的协同调控,细胞总RNA的85%是rDNA的转录产物。rDNA的转录改变会导致核糖体生物合成应激,影响细胞的生长、增殖和分化,导致疾病的发生。理解rDNA的转录调控有利于阐明细胞发育的机制,找... 细胞的生长发育受核糖体DNA(rDNA)和蛋白质基因的协同调控,细胞总RNA的85%是rDNA的转录产物。rDNA的转录改变会导致核糖体生物合成应激,影响细胞的生长、增殖和分化,导致疾病的发生。理解rDNA的转录调控有利于阐明细胞发育的机制,找到治疗疾病的新的作用靶点。我们综述了rDNA的结构及转录调控方式,阐述了rDNA在干细胞领域和疾病发生治疗中的作用,为rDNA的研究提供理论依据。 展开更多
关键词 RDNA 细胞发育 调控
长尖叶蔷薇基于rDNA FISH的核型分析 预览
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作者 张婷 蹇洪英 +4 位作者 莫锡君 邱显钦 杨静 唐开学 王其刚 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第10期2036-2040,共5页
【目的】为精确地识别蔷薇属植物染色体组的核型特征,文章研究了长尖叶蔷薇基于染色体荧光原位杂交(FISH)的核型。【方法】利用45S和5S rDNA为探针对长尖叶蔷薇有丝分裂中期的染色体进行FISH研究。【结果】长尖叶蔷薇的染色体组有1对4... 【目的】为精确地识别蔷薇属植物染色体组的核型特征,文章研究了长尖叶蔷薇基于染色体荧光原位杂交(FISH)的核型。【方法】利用45S和5S rDNA为探针对长尖叶蔷薇有丝分裂中期的染色体进行FISH研究。【结果】长尖叶蔷薇的染色体组有1对45S rDNA位点和2对5S rDNA位点。除4、5号是亚中部着丝点(sm)染色体外,其它都是中部着丝点(m)染色体。4号染色体是1对异形同源染色体,长臂(4L)上有1对5S rDNA杂交位点,其中位于较短染色体上的5S rDNA杂交信号极强; 5号染色体也是1对异形同源染色体,其短臂(5S)上有1对45S rDNA,长臂(5L)上则有另1对5S rDNA,两条染色体上的rDNA信号强度没有明显差异。【结论】以rDNA为探针的FISH能准确地识别长尖叶蔷薇染色体组中的同源染色体,体现其在染色体水平上的特征,为该物种用于现代月季的遗传改良提供了分子细胞遗传学背景资料。 展开更多
关键词 蔷薇 RDNA 荧光原位杂交 核型
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台湾蠛蠓rDNA-ITS序列测定与分析 预览
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作者 陈敏 肖颖 +1 位作者 林妙端 黄恩炯 《中国人兽共患病学报》 CSCD 北大核心 2018年第8期728-732,共5页
目的 探讨rDNA-ITS基因序列在吸血蠓分子鉴定中的应用前景。方法 通过PCR扩增获取台湾蠛蠓rDNA-ITS基因,测定分析ITS1和ITS2基因序列,构建系统发育树。结果 台湾蠛蠓ITS1和ITS2片段长度分别为310 bp与360 bp,与汤斯维尔铗蠓的同源性最大... 目的 探讨rDNA-ITS基因序列在吸血蠓分子鉴定中的应用前景。方法 通过PCR扩增获取台湾蠛蠓rDNA-ITS基因,测定分析ITS1和ITS2基因序列,构建系统发育树。结果 台湾蠛蠓ITS1和ITS2片段长度分别为310 bp与360 bp,与汤斯维尔铗蠓的同源性最大,分别为71%和92%。系统发育分析显示,基于ITS1、ITS2基因序列的分子鉴定结果与传统形态学鉴定结果一致。结论 rDNA-ITS基因序列可作为蠓科昆虫分子鉴定的分子标记。 展开更多
关键词 台湾蠛蠓 RDNA ITS1 ITS2
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杂交三倍体泥鳅染色体C带及rDNA序列的FISH定位 预览
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作者 周贺 徐其征 +5 位作者 高养春 张蕊 李霞 庄子昕 梁雨婷 李雅娟 《水产学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期178-185,共8页
对杂交三倍体泥鳅(4n♀×2n♂)的胚胎染色体进行了C带及染色体荧光原位杂交(FISH)分析,首次探讨了杂交三倍体泥鳅C带特征,为准确鉴别染色体提供依据,研究了核糖体5.8S+28S r DNA在杂交三倍体泥鳅胚胎中期染色体上的数目和位置... 对杂交三倍体泥鳅(4n♀×2n♂)的胚胎染色体进行了C带及染色体荧光原位杂交(FISH)分析,首次探讨了杂交三倍体泥鳅C带特征,为准确鉴别染色体提供依据,研究了核糖体5.8S+28S r DNA在杂交三倍体泥鳅胚胎中期染色体上的数目和位置。C带结果表明,杂交三倍体泥鳅的染色体C带包括臂端C带和着丝粒C带,没有发现臂间C带。M染色体只有1号染色体既有臂端C带又有着丝粒C带,但臂端C带均比着丝粒C带大,信号也比着丝粒的强;而其他M染色体及SM染色体、T染色体只有着丝粒C带。FISH分析显示,核糖体5.8S+28S r DNA清楚地定位在杂交三倍体泥鳅中期染色体中部着丝粒染色体(M)的端部区域,在杂交三倍体泥鳅中期染色体上可以检测到三簇杂交信号。该结果从分子细胞遗传学层面进一步证实了杂交三倍体泥鳅是含有三套染色体组的遗传三倍体。 展开更多
关键词 泥鳅 杂交三倍体 C带 RDNA FISH
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基于ITS和LSU序列对一株野生鹅膏菌的分类鉴定 预览
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作者 渠文思 石家祺 石亚伟 《山西农业科学》 2018年第12期2073-2076,共4页
以山西左权地区一株野生的鹅膏菌作为研究材料,提取鹅膏菌基因组DNA后,将rDNA的ITS和LSU区段进行克隆后连接到T载体上进行测序。通过GenBank核酸数据库对测序得到的ITS和LSU序列进行同源性比对,并从GenBank检索获得7个相似物种的ITS和LS... 以山西左权地区一株野生的鹅膏菌作为研究材料,提取鹅膏菌基因组DNA后,将rDNA的ITS和LSU区段进行克隆后连接到T载体上进行测序。通过GenBank核酸数据库对测序得到的ITS和LSU序列进行同源性比对,并从GenBank检索获得7个相似物种的ITS和LSU序列,与测序得到的ITS和LSU序列分别做系统发育树。测序结果表明,ITS序列有666bp,LSU序列有968bp;系统发育树结果显示,ITS序列以100%的支持值与拟橙盖鹅膏菌聚在一起,LSU序列以98%的支持值与拟橙盖鹅膏菌聚在一起。结合形态学观察,将山西左权鹅膏菌鉴定为拟橙盖鹅膏菌(Amanita caesareoides)。 展开更多
关键词 鹅膏菌 RDNA 内转录间隔区 核糖体大亚基基因组序列 分类鉴定
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表观调控rDNA转录的研究进展 被引量:1
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作者 程香荣 魏艳军 +4 位作者 黄星卫 王楠 姜琦 刘惠 雷蕾 《生物化学与生物物理进展》 CSCD 北大核心 2018年第5期485-493,共9页
rDNA是控制细胞核糖体生物合成的串联重复基因,影响着整体蛋白质的翻译水平,与细胞生长代谢息息相关.由于rDNA序列具有多拷贝的重复特征,其转录除了受一般转录机制的调节外,还受多重表观调控机制的调节,精细调控着rDNA的转录状态.一般认... rDNA是控制细胞核糖体生物合成的串联重复基因,影响着整体蛋白质的翻译水平,与细胞生长代谢息息相关.由于rDNA序列具有多拷贝的重复特征,其转录除了受一般转录机制的调节外,还受多重表观调控机制的调节,精细调控着rDNA的转录状态.一般认为rDNA分为活跃和沉默两种状态,分别与活跃染色质标记和异染色质标记相关.近些年来,发现一种平衡态rDNA的存在,更加丰富了rDNA表观机制的研究.H3.3是一种H3组蛋白变体,是近些年来的研究热点,已有报道H3.3可能在分子伴侣HIRA的介导下整合进入活跃rDNA,然而沉默rDNA的维持是否也与H3.3的作用相关需要更多的探索.CTCF是rDNA重复单元间的绝缘子成分,与H3.3相关但并不清楚是否也调控着rDNA的转录.该综述讨论了几种调控rDNA表观状态的机制,并对可能参与该过程的新机制提出了设想. 展开更多
关键词 RDNA 表观遗传调控 H3.3 分子伴侣 CTCF
组蛋白H3变体H3.3及其在细胞重编程中的作用 预览 被引量:1
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作者 黄星卫 程香荣 +5 位作者 王楠 张雨薇 廖辰 金连弘 雷蕾 王晓群 《遗传》 CSCD 北大核心 2018年第3期186-196,共11页
组蛋白是真核生物中一类进化上相对保守的蛋白质。由组蛋白八聚体及缠绕其上的DNA构成的核小体是真核生物染色质的基本组成单位。核小体使DNA保持固缩状态,既能维持基因组的稳定性,又能保证DNA序列可以正确地进行复制、转录、重组和修... 组蛋白是真核生物中一类进化上相对保守的蛋白质。由组蛋白八聚体及缠绕其上的DNA构成的核小体是真核生物染色质的基本组成单位。核小体使DNA保持固缩状态,既能维持基因组的稳定性,又能保证DNA序列可以正确地进行复制、转录、重组和修复。核小体调控细胞的生物过程除了通过组蛋白翻译后修饰,还可以通过组蛋白变体替换的方式进行。研究发现,组蛋白H3变体H3.3与常规组蛋白H3尽管仅有几个氨基酸的区别,但H3.3却能由特异的分子伴侣介导,整合进入染色质的特定区域,从而发挥不同的作用。同时,H3.3作为一种母源因子在正常受精和体细胞核移植等细胞重编程过程中也发挥着重要作用。本文总结了H3.3的结构特点和富集情况,探讨了特异的分子伴侣及其在细胞重编程中的作用,以期为提高体细胞重编程效率提供新思路,为体细胞重编程的应用奠定基础。 展开更多
关键词 组蛋白变体 H3.3 分子伴侣 重编程 RDNA
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