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重庆市库蚊标本中宜昌病毒的分离鉴定 认领
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作者 李樊 付士红 +14 位作者 何小周 何亚明 叶盛 邵楠 殷启凯 赵洁荣 冯盼盼 禄阳 陈晓菁 何英 凌华 马学军 梁国栋 许松涛 王环宇 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期429-433,共5页
目的对2017年采集自重庆地区蚊虫标本携带的病毒进行分离鉴定。方法采用组织细胞培养法进行病毒分离,应用高通量测序技术获得病毒分离物的全基因组序列,采用系统发育法进行种类及分子特征分析。结果库蚊标本来源的病毒阳性分离物CQFD201... 目的对2017年采集自重庆地区蚊虫标本携带的病毒进行分离鉴定。方法采用组织细胞培养法进行病毒分离,应用高通量测序技术获得病毒分离物的全基因组序列,采用系统发育法进行种类及分子特征分析。结果库蚊标本来源的病毒阳性分离物CQFD2017能引起白纹伊蚊细胞C6/36病变,但不能引起金黄地鼠肾细胞BHK-21、非洲绿猴肾细胞Vero病变。CQFD2017全基因组序列长度为20893 bp,包含6个开放阅读框。系统进化分析发现,该毒株位于Nidovirales病毒目Mesoniviridae病毒科的Yichang病毒所在的进化分支,与Yichang病毒(NC_040534)的核苷酸一致性为98.6%,ORF1a和ORF1b区氨基酸一致性分别为99.06%和99.15%,因此将该毒株命名为Yichang病毒CQFD2017株。结论2017年重庆市库蚊标本分离的CQFD2017株为Yichang病毒。 展开更多
关键词 宜昌病毒 分离 鉴定 系统进化
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中国流感疫苗预防接种技术指南(2019—2020) 认领
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作者 冯录召 +12 位作者 彭质斌 王大燕 郑亚明 郑建东 秦颖 陈涛 杨鹏 杨娟 张延炀 陈健 姜世强 徐莉立 康敏 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期21-36,共16页
流感是由流感病毒引起的一种急性呼吸道传染病,每年流感季节性流行在全球可导致300万至500万重症病例,29万至65万呼吸道疾病相关死亡。接种流感疫苗是预防流感病毒感染及其严重并发症的最有效手段。我国现已批准上市的流感疫苗有三价灭... 流感是由流感病毒引起的一种急性呼吸道传染病,每年流感季节性流行在全球可导致300万至500万重症病例,29万至65万呼吸道疾病相关死亡。接种流感疫苗是预防流感病毒感染及其严重并发症的最有效手段。我国现已批准上市的流感疫苗有三价灭活流感疫苗(IIV3)和四价灭活流感疫苗(IIV4)。2018年,中国疾病预防控制中心印发了《中国流感疫苗预防接种技术指南(2018—2019)》(简称"2018年版指南")。为更好地指导我国流感预防控制和疫苗应用工作,国家免疫规划技术工作组流感疫苗工作组综合国内外最新研究进展,在2018年版指南的基础上进行了更新和修订,形成了《中国流感疫苗预防接种技术指南(2019—2020)》。本指南更新的内容主要为:第一,增加了新的研究证据,尤其是我国的研究结果,包括流感疾病负担、疫苗效果、接种疫苗可避免的疾病负担、疫苗安全性监测、疫苗预防接种成本效果等;第二,增加了一年来国家卫生健康委员会流感防控有关政策和措施;第三,更新了我国2019—2020年度国内批准上市及批签发的流感疫苗种类;第四,更新了本年度IIV3和IIV4组分。本指南建议:原则上,接种服务单位应为≥6月龄所有愿意接种流感疫苗且无禁忌证的人提供接种服务。对可接种不同类型、厂家疫苗产品的人群,可由受种者自愿选择接种任一种流感疫苗,无优先推荐。为降低高危人群罹患流感及感染后发生严重临床结局的风险,指南推荐6月龄至5岁儿童,60岁及以上老人,慢性病患者,医务人员,6月龄以下婴儿的家庭成员和看护人员,以及孕妇或准备在流感季节怀孕的女性为优先接种对象。首次接种流感疫苗的6月龄至8岁儿童应接种两剂次,间隔≥4周;2018—2019年度或以前接种过1剂及以上流感疫苗的儿童,建议接种1剂。9岁及以上儿童和成人仅需接种1剂。建议各地在疫苗供应到� 展开更多
关键词 流感 疾病负担 疫苗 预防接种 技术指南
海南省5市县禽畜厩舍吸血蠓调查 认领
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作者 刘国平 孙定炜# +5 位作者 范娜 付士红 吴群 曾林海 李善干 梁国栋 《中国热带医学》 CAS 2020年第5期413-416,428,共5页
目的调查海南省文昌、乐东、昌江、儋州、澄迈等5市县吸血蠓的地理分布、种类组成和主要种的吸血率。方法2017-2018在海南省5市县猪舍、羊舍、鸡舍,采用诱虫灯采集吸血蠓;在生物显微镜下鉴定吸血蠓种类和记录数量,采用树胶酚封片法制作... 目的调查海南省文昌、乐东、昌江、儋州、澄迈等5市县吸血蠓的地理分布、种类组成和主要种的吸血率。方法2017-2018在海南省5市县猪舍、羊舍、鸡舍,采用诱虫灯采集吸血蠓;在生物显微镜下鉴定吸血蠓种类和记录数量,采用树胶酚封片法制作玻片标本。结果在海南省5市县共采获吸血蠓2属26种22355只,其中,库蠓24种,蠛蠓属2种;海南省新纪录1种,肿足库蠓Lasiohelea turgepeda Yu et Liu,1982。澄迈分布19种,儋州18种,文昌17种,昌江12种,乐东9种。主要种类为尖喙库蠓(32.88%),异域库蠓(16.10%),荒川库蠓(16.08%);不同市县和场所的主要种类组成不同。7种主要吸血蠓的总吸血率为34.10%,其中黄胸库蠓(53.78%)最高,肩宏库蠓(17.92%)最低。不同种类和场所吸血蠓吸血率不同。结论本项研究发现海南省5市县有吸血蠓2属26种,主要种类为尖喙库蠓,异域库蠓和荒川库蠓,其中黄胸库蠓的吸血率最高。 展开更多
关键词 吸血蠓 地理分布 种类组成 吸血率
塔希纳病毒的重组酶介导扩增快速检测方法 认领
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作者 李樊 郭晓芳 +7 位作者 殷启凯 申辛欣 付士红 许松涛 雷雯雯 周红宁 马学军 王环宇 《疾病监测》 CAS 2020年第3期192-196,共5页
目的采用反转录重组酶介导核酸扩增(RT-RAA)方法建立塔希纳病毒(TAHV)检测方法。方法在TAHV S节段保守区设计引物和探针。用构建含检测目的基因片段的质粒和病毒细胞培养物对TAHV的RT-RAA检测方法的灵敏性进行评价,通过检测黄病毒属、... 目的采用反转录重组酶介导核酸扩增(RT-RAA)方法建立塔希纳病毒(TAHV)检测方法。方法在TAHV S节段保守区设计引物和探针。用构建含检测目的基因片段的质粒和病毒细胞培养物对TAHV的RT-RAA检测方法的灵敏性进行评价,通过检测黄病毒属、甲病毒属、正布尼亚病毒属和东南亚十二节段病毒属共7种病毒验证方法的特异性。并选用2018年采集自宁夏回族自治区的30批次蚊虫样本来评价该检测方法。结果该方法对构建的质粒标准品的检测下线为100拷贝/反应,病毒培养物最低检出限为10空斑形成单位/反应,与其他7种虫媒病毒无交叉反应。在检测蚊虫样本时,该方法与实时定量PCR方法检测结果的一致性为100%。结论建立了快速、特异以及灵敏的TAHV的RT-RAA检测方法,并适用于标本中TAHV核酸的现场检测。 展开更多
关键词 塔希纳病毒 检测 核酸 重组酶介导扩增
2020年1月中国大陆需关注的突发公共卫生事件风险评估 认领
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作者 周丰波 王大燕 +5 位作者 李静欣 王哲 李昀 涂文校 向妮娟 施国庆 《疾病监测》 CAS 2020年第1期6-9,共4页
目的评估2020年1月在我国大陆地区发生或者可能由境外输入的突发公共卫生事件风险。方法根据国内外突发公共卫生事件报告及重点传染病监测等各种资料和部门通报信息,采用专家会商法,并通过视频会议形式邀请省(自治区、直辖市)疾病预防... 目的评估2020年1月在我国大陆地区发生或者可能由境外输入的突发公共卫生事件风险。方法根据国内外突发公共卫生事件报告及重点传染病监测等各种资料和部门通报信息,采用专家会商法,并通过视频会议形式邀请省(自治区、直辖市)疾病预防控制中心专家参与评估。结果预计2020年1月突发公共卫生事件的报告数将较2019年12月下降,事件数可能低于前3年水平,报告事件以流行性感冒(流感)、水痘、诺如病毒病、非职业性一氧化碳中毒为主。需要密切关注湖北省武汉市2019新型冠状病毒疫情的病因、临床和流行特征调查进展,动态评估其可能造成的公共卫生风险。流感将于1月底达到流行高峰,诺如病毒引发的感染性腹泻病疫情将维持较高水平,非职业性一氧化碳中毒事件仍将保持较高水平。春节期间我国公民在境内需重点预防季节性流感、人感染禽流感、诺如病毒感染性腹泻等传染病,以及食物中毒和非职业性一氧化碳中毒;出境旅游需预防埃博拉病毒病、霍乱、登革热、黄热病、寨卡病毒病、中东呼吸综合征等,同时注意饮食卫生。结论需要对武汉市2019新型冠状病毒疫情、季节性流感予以重点关注,对诺如病毒感染性腹泻、非职业性一氧化碳中毒和春节假期旅行卫生予以一般关注。 展开更多
关键词 突发公共卫生事件 传染病疫情 风险评估
埃可病毒11型利用双受体CD55和FcRn侵染细胞的分子结构基础 认领
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作者 牛胜 刘闯 +7 位作者 刘聪聪 刘升 宋洋 张勇 田文霞 赵欣 王培毅 高福 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第1期67-79,共13页
埃可病毒11型属于小RNA病毒科,肠道病毒属,是B族肠道病毒中的一个重要血清型.埃可病毒11型可导致儿童和青少年脑炎和脑膜炎等疾病,在婴儿和新生儿中导致重症感染甚至致命的病例也时有报道.此外,埃可病毒11型还多次在新生儿和婴幼儿群体... 埃可病毒11型属于小RNA病毒科,肠道病毒属,是B族肠道病毒中的一个重要血清型.埃可病毒11型可导致儿童和青少年脑炎和脑膜炎等疾病,在婴儿和新生儿中导致重症感染甚至致命的病例也时有报道.此外,埃可病毒11型还多次在新生儿和婴幼儿群体中引起暴发性感染,如2019年中国广东省发生的院内感染暴发事件,造成了19例新生儿的感染和5例死亡,严重威胁人类健康和公共卫生安全.CD55是20世纪90年代初发现的部分埃可病毒的吸附受体,该受体可以帮助病毒吸附在细胞表面,但并不能介导病毒完成完整的入侵过程.我们在2019年的研究中,发现了人新生儿Fc受体(neonatal Fc receptor,FcRn)是B族肠道病毒的通用脱衣壳受体,并以埃可病毒6型为例解析了病毒入侵机制.本研究利用冷冻电子显微镜技术,解析了埃可病毒11型在入侵过程中不同pH条件下各阶段的病毒颗粒结构,以及病毒与两受体的复合物,共10个原子或近原子水平高分辨率冷冻电子显微镜结构,并结合表面等离子共振(surface plasmon resonance,SPR)和脂质体模拟试验等分子水平试验,系统地阐述了埃可病毒11型利用CD55和FcRn"双受体系统"入侵细胞的分子机制.埃可病毒11型利用其VP2、VP3结构域与吸附受体CD55的3、4两个短同源重复(short consensus repeat,SCR)结构域结合,结合后病毒颗粒不发生变构.病毒与脱衣壳受体Fc Rn结合之后,开始发生变构,并可在脂质体膜的辅助作用下释放遗传物质完成脱衣壳.与埃可病毒6型不同的是,埃可病毒11型结合FcRn之后在中性条件下即可起始变构.本项研究解析了重要病原埃可病毒11型侵染细胞的分子结构基础,并进一步完善了非囊膜病毒的"双受体"入侵模型. 展开更多
关键词 埃可病毒11型 肠道病毒 冷冻电子显微镜 入侵 双受体系统 CD55 FCRN
内蒙古自治区采集的蚊虫标本新发现乙脑病毒和盖塔病毒 认领
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作者 程睿 南晓伟 +9 位作者 范娜 付士红 司晓艳 张琳 何英 雷雯雯 李樊 王环宇 鲁晓晴 梁国栋 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期571-579,共9页
目的了解内蒙古自治区的吸血昆虫及其携带虫媒病毒的种类及分布,为虫媒病毒病的预防提供基础数据。方法在自然界使用灯诱法采集蚊虫标本,形态学分类后分装编号,液氮保存。组织培养法进行病毒分离。使用多种生物学信息软件(BioEdit、MEGA... 目的了解内蒙古自治区的吸血昆虫及其携带虫媒病毒的种类及分布,为虫媒病毒病的预防提供基础数据。方法在自然界使用灯诱法采集蚊虫标本,形态学分类后分装编号,液氮保存。组织培养法进行病毒分离。使用多种生物学信息软件(BioEdit、MEGA等)对病毒核苷酸序列进行分子生物学特征分析。结果2014、2017-2018年在内蒙古自治区5个县(旗)的采集点共采集到2属3种蚊虫24240只,蠓虫17110只。其中在淡色库蚊标本中检测到乙脑病毒基因阳性,并且获得4株可以稳定传代的病毒分离物,经分子生物学鉴定分别为盖塔病毒、浓核病毒。盖塔病毒(NMDK1813-1)E2基因遗传进化分析结果显示,与甘肃分离株(GS10-2)在同一进化分支,且有6个共同的氨基酸变异位点。结论本研究发现的乙脑病毒和盖塔病毒均是在内蒙古蚊虫标本中新近发现的病毒,这为内蒙古地区的虫媒病毒及其传播疾病的预防及控制提供了基础数据,对内蒙古的虫媒病毒及其病毒病的预防及控制提出了新的挑战。 展开更多
关键词 乙脑病毒 盖塔病毒 虫媒病毒
Tau蛋白外显子特异性单抗制备及初步应用 认领
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作者 刘恋 陈嘉 +7 位作者 胡超 夏影 杨微 王琳 石琦 董小平 陈志宝 陈操 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期214-222,共9页
目前由于缺失特异性的商品化抗体,不同tau异构体在中枢神经系统疾病中,尤其在朊病毒病中的变化鲜有报道。本研究利用杂交瘤技术制备了抗tau蛋白外显子2和10的单克隆抗体,同时对制备抗体的灵敏度、特异性、免疫反应亲和力、种属反应性等... 目前由于缺失特异性的商品化抗体,不同tau异构体在中枢神经系统疾病中,尤其在朊病毒病中的变化鲜有报道。本研究利用杂交瘤技术制备了抗tau蛋白外显子2和10的单克隆抗体,同时对制备抗体的灵敏度、特异性、免疫反应亲和力、种属反应性等方面进行了评价,随后对制备的抗体应用范围进行了摸索。结果显示,制备的四株单抗特异性高、灵敏度好,尤其可以识别小鼠脑组织中的tau蛋白。制备的四株单抗可用于间接细胞免疫荧光实验和多种感染神经细胞和感染小鼠模型脑组织的蛋白免疫印迹和免疫组织化学实验。综上,本研究制备了四株tau外显子特异性单抗,上述单抗具有较广的应用范围,将成为神经退行性疾病中tau蛋白检测的有力工具。 展开更多
关键词 TAU蛋白 外显子2 外显子10 单克隆抗体 朊病毒病
探针导向重组酶介导等温扩增法检测MTB rpoB基因突变的应用价值 认领
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作者 李鑫娜 申辛欣 +9 位作者 王瑞白 段素霞 张瑞卿 王瑞欢 白雪丁 凡国豪 王金荣 高源 陈子巍 马学军 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2020年第5期481-488,共8页
目的建立可快速检测MTB rpoB基因516位点突变的探针导向重组酶介导等温扩增法(probedirected recombinase amplification,PDRA)。方法设计4条探针[1条野生型探针(P-W)及3条突变型探针(P-GGC、P-GTC、P-TAC)]和1条共同的下游引物,分别构... 目的建立可快速检测MTB rpoB基因516位点突变的探针导向重组酶介导等温扩增法(probedirected recombinase amplification,PDRA)。方法设计4条探针[1条野生型探针(P-W)及3条突变型探针(P-GGC、P-GTC、P-TAC)]和1条共同的下游引物,分别构建TB-516-W、TB-516-GGC、TB-516-GTC和TB-516-TAC4种检测体系,在39℃条件下恒温扩增40 min。通过阳性阈值时间判定MTB rpoB基因516位点是否发生突变及其突变类型;通过同一探针检测对应的重组质粒确定该检测体系的敏感度;通过不同探针检测某一种重组质粒,根据阳性阈值时间确定该检测体系的特异度。应用建立的PDRA方法检测6株利福平耐药MTB菌株和35份MTB培养阳性的痰标本,并与一代测序结果进行比较。结果 4种检测体系检测对应重组质粒的敏感度为1000拷贝/μl。4种检测体系的特异度良好,探针与靶序列完全匹配时,阳性阈值时间早;探针与靶序列不完全匹配时,阳性阈值时间晚,具有稳定的阳性阈值时间差值,体系TB-516 W,TB-516-GGC,TB-516-GTC和TB-516-TAC的阳性阈值时间差值分别为7.0、5.8、10.0、7.0 min。PDRA检测6株MTB利福平耐药菌株和35份MTB培养阳性痰标本的结果与测序结果一致。结论本研究初步建立了可应用于MTB利福平耐药rpoB基因516位点突变检测的PDRA方法,该方法检测敏感度高,特异度好,具有一定的实验室应用价值。 展开更多
关键词 核酸扩增技术 重组酶 结核分枝杆菌 基因
四种商品化诺如病毒实时荧光RT-PCR检测试剂盒的效果比较 认领
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作者 孔翔羽 王婧 +7 位作者 章青 黄民鹏 李晨光 李慧莹 沙比热木·托合塔木 庞立丽 靳淼 段招军 《国际病毒学杂志》 2020年第2期112-115,共4页
目的比较四种商品化诺如病毒实时荧光RT-PCR检测试剂盒的效果。方法将美国疾控中心诺如病毒检测方法作为标准方法,使用4种商品化试剂盒对30份已知诺如病毒基因型阳性样本(5种GI和8种GII基因型)和50份腹泻患者粪便样本进行检测,对检测结... 目的比较四种商品化诺如病毒实时荧光RT-PCR检测试剂盒的效果。方法将美国疾控中心诺如病毒检测方法作为标准方法,使用4种商品化试剂盒对30份已知诺如病毒基因型阳性样本(5种GI和8种GII基因型)和50份腹泻患者粪便样本进行检测,对检测结果进行比较。同时对轮状病毒、星状病毒、肠道腺病毒和札如病毒进行特异性检测。结果30份已知基因型样本四种商品化试剂盒与标准方法均检测阳性。轮状病毒、星状病毒、肠道腺病毒和札如病毒检测阴性。试剂盒A、B、C、D和标准方法分别检测50份腹泻样本,检出率分别为52.0%(26/50)、46.0%(23/50)、50.0%(25/50)、48.0%(24/50)、54.0%(27/50);试剂盒A、B、C、D与标准方法的一致性分别为96.3%、85.2%、92.6%和88.9%。试剂盒C的GI检测范围为10^4~10^8 copies/μL,GII检测范围为10^2~10^8 copies/μL。结论四种试剂盒均能检测本研究出现的诺如病毒基因型,试剂盒A和C检测效果优于试剂盒B和D。 展开更多
关键词 诺如病毒 基因型 实时荧光RT-PCR 评估
柯萨奇病毒B4型江苏地方株的病毒分离与基因进化分析 认领
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作者 夏志强 宋芹芹 +3 位作者 宋娟 薛庆凯 王衍海 韩俊 《国际病毒学杂志》 2020年第1期32-35,共4页
目的建立柯萨奇病毒B4型病毒的分离方法,并对已分离到的江苏地方株进行基因进化分析。方法使用荧光定量PCR方法检测江苏省哨点医院收治的呼吸道感染患者咽拭子样本中肠道病毒感染情况,使用HeLa细胞对阳性样本进行病毒分离,然后进行VP4... 目的建立柯萨奇病毒B4型病毒的分离方法,并对已分离到的江苏地方株进行基因进化分析。方法使用荧光定量PCR方法检测江苏省哨点医院收治的呼吸道感染患者咽拭子样本中肠道病毒感染情况,使用HeLa细胞对阳性样本进行病毒分离,然后进行VP4基因测序与进化树分析。结果荧光定量PCR检测肠道病毒阳性12例,1份样本经病毒分离后呈现细胞病变效应,RT-PCR扩增出特异性的VP4基因,测序显示该病毒株与其他20株CVB4病毒株的VP4核苷酸同源性都在86.56%~93.59%之间,确诊为CVB4江苏地方株。进化树分析显示,该病毒株只与CVB4病毒KY369904株形成一个聚簇。结论本研究采用HeLa细胞分离与鉴定到了1株肠道病毒,VP4基因进化分析判断为CVB4江苏地方株,对预防与控制当地的肠道病毒感染具有重要价值。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒B4型 肠道病毒 病毒分离 细胞病变效应
柯萨奇病毒B3型感染引起HeLa细胞内源性小干扰RNA的变化 认领
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作者 姚海兰 宋娟 +4 位作者 王欣玲 王瑞芳 宋芹芹 史冰田 韩俊 《微生物与感染》 2020年第2期98-103,共6页
探究柯萨奇病毒B3型(Coxsackie virus type B3,CVB3)感染的细胞是否诱导内源性小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)的产生。以CVB3接种HeLa细胞,在细胞培养箱(5%CO 2、37℃)孵育1 h。随后加入含2%血清的细胞维持液,继续培养3 h和6 ... 探究柯萨奇病毒B3型(Coxsackie virus type B3,CVB3)感染的细胞是否诱导内源性小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)的产生。以CVB3接种HeLa细胞,在细胞培养箱(5%CO 2、37℃)孵育1 h。随后加入含2%血清的细胞维持液,继续培养3 h和6 h后收集细胞。用高通量测序(二代测序)试剂盒提取细胞RNA,并反转录合成cDNA,构建文库,上机测序。过滤数据,去除插入片段过长的序列、低质量序列、poly A序列和小片段序列,与已知的小RNA数据库比对鉴定siRNA。通过茎-环反转录-聚合酶链反应,证实内源性siRNA在感染CVB3后的表达。结果显示,感染CVB33 h和6 h后,HeLa细胞产生了多种内源性siRNA。其中内源性siRNA(novel_sir3502和novel_sir2806)在感染后3 h和6 h均可持续表达。经比对,novel_sir3502和novel_sir2806均可以识别45S和28S核糖体前体RNA。结果提示,CVB3感染可能干扰核糖体成熟。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒B3型 HELA细胞 内源性小干扰RNA
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3株人鼻病毒地方株的分离鉴定与VP4基因序列分析 认领
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作者 夏志强 王文军 +4 位作者 宋娟 曹天宇 薛庆凯 王衍海 韩俊 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期14-19,共6页
人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)是小儿呼吸道感染的重要病原体,具有多种基因型,定期对HRV进行病毒分离与基因序列分型,对了解病毒的变异情况具有重要价值。为了探讨HRV在安徽省蚌埠市上呼吸道感染患者咽拭子样本中的分离情况,并进行分... 人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)是小儿呼吸道感染的重要病原体,具有多种基因型,定期对HRV进行病毒分离与基因序列分型,对了解病毒的变异情况具有重要价值。为了探讨HRV在安徽省蚌埠市上呼吸道感染患者咽拭子样本中的分离情况,并进行分离株HRV的衣壳蛋白(VP)4基因序列分析,本研究选择安徽省蚌埠医学院第一附属医院诊断为上呼吸道感染患者的64例咽拭子标本,采用定量聚合酶链式反应(quantitative polymerase chain reaction,qPCR)检测HRV感染情况。将检测阳性标本感染H1-HeLa细胞进行病毒分离,对成功分离的HRV地方株进行HRV VP4基因的逆转录-聚合酶链反应(Reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增,并采用MEGA软件进行序列分析。结果显示:qPCR检出HRV阳性6例,从中分离到3株HRV地方株。基因序列分析显示3株HRV地方株分别为HRV A型、HRV B型、HRV C型病毒株(NCBI识别序列号分别为MK820682、MK848595、MN146019)。MK820682株与HRV A2型参考株X02316株(奥地利株)属于同一分支;MK848595株与HRV B型参考株KY093602株(马来西亚株)属于同一分支;MN146019株单独处于一个分支。本研究成功从安徽省蚌埠市分离出3株HRV地方株,分别为HRV A型、HRV B型、HRV C型地方株,说明当地HRV存在频繁变异情况,要加强对当地的HRV防控管理。 展开更多
关键词 人鼻病毒(HRV) 衣壳蛋白 病毒分离 病毒鉴定
2010-2015年山东省狂犬病病毒分子流行病学特征 认领
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作者 刘佳佳 张晓梅 +8 位作者 李木丽 王茜 于鹏程 朵林 李浩 王显军 陶晓燕 丁淑军 朱武洋 《疾病监测》 CAS 2020年第2期118-122,共5页
目的了解山东省境内流行的狂犬病病毒(RABV)的遗传进化特征和流行特点。方法对山东省2010-2015年收集的犬脑组织标本和病例唾液、血液等标本用RABV直接免疫荧光法或反转录-聚合酶链式反应法进行检测,检测阳性标本进行N基因序列测定和种... 目的了解山东省境内流行的狂犬病病毒(RABV)的遗传进化特征和流行特点。方法对山东省2010-2015年收集的犬脑组织标本和病例唾液、血液等标本用RABV直接免疫荧光法或反转录-聚合酶链式反应法进行检测,检测阳性标本进行N基因序列测定和种系发生分析。结果 70份犬脑组织标本有11份为阳性,31份病例液体标本有2份为阳性,13份阳性标本都测序得到N基因全序(1 353 bp)。汇总已发表所有山东标本N基因序列(共26个)以及我国7个RABV种群的代表株共同构建的种系发生树显示,近90%的山东株(2006-2015年)属于ChinaⅠ进化群,其余3株(2006-2008年)属于ChinaⅡ进化群;山东省东部和西部地区的流行株相对聚集又明显交叉,泰安流行株最具多样性。结论山东省RABV分属ChinaⅠ和Ⅱ两个种群,近年山东省狂犬病的流行基本是ChinaⅠ传播扩散的结果。 展开更多
关键词 狂犬病 狂犬病病毒 山东 分子流行病学
中国2014-2018年流行性乙型脑炎流行病学特征 认领
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作者 吴丹 尹遵栋 +4 位作者 李军宏 施文 王环宇 付士红 李艺星 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2020年第1期1-4,共4页
目的分析中国2014-2018年流行性乙型脑炎(乙脑)流行病学特征。方法通过中国疾病预防控制信息系统和乙脑监测信息报告管理系统收集2014-2018年乙脑病例,进行描述性流行病学分析。结果中国2014-2018年共报告乙脑5666例,年均发病率为0.083... 目的分析中国2014-2018年流行性乙型脑炎(乙脑)流行病学特征。方法通过中国疾病预防控制信息系统和乙脑监测信息报告管理系统收集2014-2018年乙脑病例,进行描述性流行病学分析。结果中国2014-2018年共报告乙脑5666例,年均发病率为0.083/10万;死亡309例,病死率为5.45%。年均发病率居前5位的省份为甘肃(0.76/10万)、宁夏(0.50/10万)、陕西(0.31/10万)、云南(0.23/10万)和四川(0.17/10万)。7-9月份病例数占90.31%。0-14岁、15-39岁、≥40岁病例分别占42.53%、14.83%、42.64%,其中≥40岁病例构成比从2014年的14.45%上升至2018年的64.04%,0-4岁、5-9岁乙脑发病率分别从2014年的0.28/10万、0.36/10万降至2018年的0.11/10万、0.17/10万;≥40岁各年龄组发病率均上升。在4007例随访病例中,痊愈、好转、有后遗症、死亡分别占48.91%、18.27%、16.45%、16.37%,其中≥40岁病例中死亡占26.70%。结论中国2014-2018年儿童乙脑发病率持续下降。建议在成人乙脑高发地区开展乙脑疫苗接种和相关研究,持续开展蚊种密度和健康人群乙脑抗体水平监测。 展开更多
关键词 流行性乙型脑炎 流行病学特征
4种戊型肝炎病毒IgM抗体诊断试剂在一起暴发疫情中的性能比较 认领
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作者 尹文娇 刘宏图 +3 位作者 姜法春 曹经瑗 许文波 毕胜利 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2020年第2期207-211,共5页
目的比较4种戊型肝炎(戊肝)病毒(hepatitis E virus,HEV)IgM抗体诊断试剂盒在1起暴发疫情中的诊断性能。方法应用4种试剂检测一起戊肝暴发疫情中研究对象的急性期血清标本中的IgM抗体,并检测HEV RNA;进行统计学分析。结果MP、科华、万... 目的比较4种戊型肝炎(戊肝)病毒(hepatitis E virus,HEV)IgM抗体诊断试剂盒在1起暴发疫情中的诊断性能。方法应用4种试剂检测一起戊肝暴发疫情中研究对象的急性期血清标本中的IgM抗体,并检测HEV RNA;进行统计学分析。结果MP、科华、万泰和贝尔公司试剂的HEV IgM抗体检出率分别为40.00%(108/270)、29.26%(79/270)、28.52%(77/270)和20.37%(55/270),一致率为78.52%(212/270);对HEV RNA阳性血清标本,MP、科华和万泰试剂的检测灵敏度均为66.67%(32/48),贝尔试剂灵敏度为58.33%(28/48);对急性戊肝临床诊断病例血清标本,MP、科华和万泰试剂检测灵敏度为69.81%(37/53),贝尔试剂灵敏度为60.38%(32/53);贝尔与科华、贝尔与万泰试剂对HEV RNA阳性或急性戊肝临床诊断病例血清标本的HEV IgM抗体检出率差异具有统计学意义(McNemar检验:P<0.05),而其他试剂的检出率之间差异无统计学意义(McNemar检验:P>0.05);对HEV RNA阴性或临床排除急性戊肝研究对象血清标本,科华与万泰试剂的HEV IgM抗体检测结果最为接近(McNemar检验:P>0.05),其余试剂之间检出情况差异较大(McNemar检验:P<0.05)。结论MP、科华和万泰HEV IgM抗体诊断试剂盒灵敏度较高,适合急性戊肝的早期血清学筛查;在戊肝暴发疫情中,应结合HEV IgM抗体和HEV RNA检测结果进行综合诊断。 展开更多
关键词 戊型肝炎 酶联免疫吸附试验 IGM 性能比较
中国部分地区猪胆汁戊型肝炎病毒基因型和中和抗原位点变异研究 认领
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作者 尹文娇 韩雅琳 +3 位作者 刘宏图 姜法春 曹经瑗 毕胜利 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2020年第2期131-135,154,共6页
目的调查猪胆汁戊型肝炎病毒(HEV)携带率、基因型和中和抗原位点变异。方法在中国4个地区屠宰场采集成年商品猪的胆汁标本,采用real-time RT-PCR检测HEV RNA;采用巢式RT-PCR扩增HEV ORF2区部分基因片段,进行基因分型和中和抗原位点氨基... 目的调查猪胆汁戊型肝炎病毒(HEV)携带率、基因型和中和抗原位点变异。方法在中国4个地区屠宰场采集成年商品猪的胆汁标本,采用real-time RT-PCR检测HEV RNA;采用巢式RT-PCR扩增HEV ORF2区部分基因片段,进行基因分型和中和抗原位点氨基酸序列分析。结果猪胆汁标本HEV RNA总阳性率为8.6%(46/532),4个地区阳性率在3.0%-12.5%之间。19株HEV基因分型成功,均为基因4型,其中11株HEV基因亚型分型成功,均为4a亚型。在该11株HEV的21个中和抗原位点中,2株HEV在ORF2区分别发生第487位氨基酸突变(Ser487Tyr)和第564位氨基酸突变(Thr564Pro)。结论中国部分地区猪胆汁HEV携带率较高,为中国人群中优势流行的基因4型,且部分中和抗原位点发生突变;应加强猪群HEV的持续监测。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 基因型 中和抗原位点 变异 猪胆汁
2017~2018年河北省重症手足口病的主要致病病原体为柯萨奇病毒A组6型 认领
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作者 肖金波 于秋丽 +10 位作者 张勇 宋洋 张曼 路环环 韩振志 刘莹莹 冀天娇 严冬梅 祝双利 许文波 李琦 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期192-200,共9页
肠道病毒是引起重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)的主要病原体,近年来引起重症手足口病的病原谱正在发生变化,这为病原谱的检测带来了困难,而包括高通量测序(High-throughput sequencing,HTS)在内的新技术为明确重症手... 肠道病毒是引起重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)的主要病原体,近年来引起重症手足口病的病原谱正在发生变化,这为病原谱的检测带来了困难,而包括高通量测序(High-throughput sequencing,HTS)在内的新技术为明确重症手足口病的病原谱提供了帮助。为了明确河北省2017~2018年重症手足口病的病原谱,本研究采集2017~2018年河北省重症HFMD病例的50份标本(2017年29份,2018年21份)进行病毒分离,从23份标本中分离到病毒,采用一代测序方法获得其全长VP1区序列,而其余27份标本未能直接分离到病毒,其中17份采用高通量测序的方法获得了部分或者全长基因组序列。序列分析结果显示,近年来河北省重症HFMD的肠道病毒病原谱发生了较大变化,2017年重症HFMD标本中,10份检出肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71),1份检出柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16),10份检出柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)(其中高通量测序检出5份),还有3份检出其他肠道病毒;2018年重症HFMD标本中,1份检出CV-A16,7份CV-A6通过高通量测序检出,5份检出柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)(其中高通量测序检出3份),还有3份检出其他肠道病毒。通过高通量测序,可检出病原体的重症标本由原来的23份上升到40份,可检出CV-A6的标本由5份上升到17份,CV-A10由2份上升到5份;重症病例病原谱中CV-A6所占的比例由21.7%(5/23)上升到42.5%(17/40),CV-A10由8.7%(2/23)上升到12.5%(5/40),而EV-A71由于病毒分离比较敏感,含有EV-A71的标本病毒分离全部是阳性,高通量测序并没有多检出,在病原谱中的比例由43.5%(10/23)下降到25.0%(10/40)。RAxML构建的CV-A6和CV-A10的VP1区的系统发育树显示,CV-A6属于中国流行的优势基因亚型D3a,CV-A10属于中国流行的优势基因型C。河北重症HFMD标本检测到的两株CV-A6与其余中国CV-A6序列的3D区的核苷酸相似度为76.4%~98.9%,氨� 展开更多
关键词 重症手足口病(HFMD) 高通量测序(HTS) 病原谱 柯萨奇病毒A组6型(CV-A6) 柯萨奇病毒A组10型(CV-A10)
2015~2018年柯萨奇病毒A组6型在黑龙江省的持续流行 认领
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作者 张曼 陈淑红 +10 位作者 张勇 宋洋 许军 孙巍 杨明 韩振志 肖金波 路环环 许文波 刘志军 杨倩 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期201-206,共6页
手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)是一类常见的儿童传染病,自2009年以来,柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)已经成为引起HFMD流行持续循环的重要病原之一,是其他肠道病毒(Enterovirus,EV)中的优势病原,而黑龙江省CV... 手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)是一类常见的儿童传染病,自2009年以来,柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)已经成为引起HFMD流行持续循环的重要病原之一,是其他肠道病毒(Enterovirus,EV)中的优势病原,而黑龙江省CV-A6相关研究报道尚欠缺。本研究为了解2015~2018年黑龙江省HFMD流行概况和病原学组成,并分析该地区CV-A6的基因特征,收集2015~2018年黑龙江省HFMD疫情资料进行流行病学分析,并采集HFMD病例临床标本进行EV核酸检测。对分离出的EV毒株进行CV-A6的特异性荧光定量PCR法检测,对所有CV-A6阳性毒株进行全长VP1区扩增和核苷酸序列测定,并与GenBank上下载的CV-A6分型代表株构建系统进化树,以了解CV-A6的基因特征。流行病学结果显示,2015~2018年黑龙江省HFMD疫情平稳且2017年有所下降,无死亡病例。黑龙江省每年7月~8月为HFMD流行高峰,患病人群平均年龄为(4.39±3.74)岁,男女患病比例为1.44∶1。全省13个地市均收集到标本,哈尔滨市标本数最多,占36.77%。2015~2018年在黑龙江省共分离到69株CV-A6,与CV-A6原型株的核苷酸相似性为81.8%~83.9%,氨基酸相似性为94.0%~96.3%,均属D3基因亚型的D3a进化分支。尽管肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)和CV-A16为主要病原,但D3基因亚型的CV-A6也已成为引起黑龙江省HFMD流行的稳定型别之一,且有加强的趋势,因此应加强CV-A6疫情的监控和分析,为该地区HFMD防控及疫苗研制提供基础数据。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组6型(CV-A6) D3基因亚型 手足口病(HFMD)
表面抗原和表面抗体检测双阳性CD重组型乙型肝炎病毒全基因组序列分析 认领
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作者 刘贺 沈立萍 +5 位作者 张爽 王锋 张国民 梁晓峰 王富珍 毕胜利 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期400-406,共7页
西藏地区藏族人群乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染率较高,而针对感染者血清中HBV表面抗原(Hepatitis B surface antigen,HBsAg)和HBV表面抗原抗体(Hepatitis B surface antibody,HBsAb)双阳性的研究一直进展缓慢,尚无明确的研... 西藏地区藏族人群乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染率较高,而针对感染者血清中HBV表面抗原(Hepatitis B surface antigen,HBsAg)和HBV表面抗原抗体(Hepatitis B surface antibody,HBsAb)双阳性的研究一直进展缓慢,尚无明确的研究结论。为探讨西藏地区藏族人群慢性HBV感染者血清中HBsAg和HBsAb双阳性与基因组核苷酸/氨基酸突变的关系,本研究在西藏选取7个地区作为研究区域,进行多阶段抽样,选取样本进行HBV血清五项指标检测,筛选HBsAg和HBsAb均为阳性的患者血清共24份作为双阳性组,以年龄和乙型肝炎e抗原(HBeAg)等感染指标进行匹配,选取96份HBsAg阳性,HBsAb阴性患者血清作为对照组。HBV全基因组序列通过聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)产物直接测序获得,并进行重组分析和突变分析。852名西藏HBV感染者中,HBsAg/HBsAb双阳性率为2.82%(24/852)。双阳性组在S蛋白N端和主要亲水区(Major hydrophilic region,MHR)的突变率以及PreS缺失发生率均显著高于对照组。T1753C、C1990T和C2002T等核苷酸突变;S蛋白中V224A、PreS区D103E等氨基酸突变在两组内分布存在显著差异。HBV/CD重组型的HBsAg/HBsAb双阳性发生率与中国乙肝主要流行区域接近。HBV感染者血清HBsAg和HBsAb共存可能与S蛋白,特别是MHR内的高氨基酸突变造成的免疫逃逸有关。PreS缺失、S抗原蛋白C端V224A突变和PreS区D103E突变可能对HBsAg/HBsAb双阳性的产生具有协同作用。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒(HBV) 乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg) 抗乙型肝炎病毒表面抗原抗体(HBsAb) 突变
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