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利用PCR扩增快速筛选天麻萌发真菌小菇属Mycena sp.的研究
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作者 杨志平 秦丽媛 +3 位作者 王玉川 陈林 杨明挚 张汉波 《中国食用菌》 北大核心 2019年第1期51-57,共7页
设计能够鉴定小菇属真菌(Mycena sp.)的引物,可准确而快速发现萌发菌分离材料,从而分离小菇属真菌,对提高天麻种子萌发率及天麻产量具有重要现实价值。同时对全面了解小菇属真菌在自然环境中的物种分布情况具有一定生态学意义。根据适... 设计能够鉴定小菇属真菌(Mycena sp.)的引物,可准确而快速发现萌发菌分离材料,从而分离小菇属真菌,对提高天麻种子萌发率及天麻产量具有重要现实价值。同时对全面了解小菇属真菌在自然环境中的物种分布情况具有一定生态学意义。根据适用于检测“环境DNA”中某物种的引物设计验证框架,运用Primer Premierv 5.0软件,在ITS序列区间内设计了适用于小菇属真菌DNA快速检测的5对引物,并对他们的特异性、灵敏度和实际运用能力进行了评估。其中,特异性较好的4对引物分别为M52-2、M22-3、M11-4和BZZ-5。通过对来自3个门、125个属的125株真菌进行特异性测试,能测出的菌株数量分别为2.4%、6.4%、4.0%和7.2%。灵敏度较好的M22-3和BZZ-5两对引物能检测到小菇属真菌菌丝在土壤中的最小浓度均为0.033%,且能成功从天麻原球茎和种子萌发菌塘土壤样本总DNA中检测出小菇属真菌的存在。结果表明,经过利用2对和多对引物,可在实际运用中快速筛选和发现小菇属真菌。 展开更多
关键词 天麻萌发菌 兰科植物 ITS基因 灵敏度 快速筛选
紫茎泽兰内生真菌及其根际土壤真菌的多样性研究 预览
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作者 周婕 苗一方 +4 位作者 方楷 陈林 杨志平 董星凡 张汉波 《生态科学》 CSCD 2019年第5期1-7,共7页
采用传统分离培养技术和高通量测序技术,系统研究了入侵植物紫茎泽兰不同组织内生真菌及其根际土壤真菌的物种组成差异。培养法选用三种培养基,从其根、茎、鲜叶、腐叶等组织片段和根际土壤分离获得了140个菌株。这些真菌在97%的ITS序... 采用传统分离培养技术和高通量测序技术,系统研究了入侵植物紫茎泽兰不同组织内生真菌及其根际土壤真菌的物种组成差异。培养法选用三种培养基,从其根、茎、鲜叶、腐叶等组织片段和根际土壤分离获得了140个菌株。这些真菌在97%的ITS序列同源水平下分划为43个OTUs(operational taxonomic units),属于5个纲、30个属,优势纲为Sordariomycetes和Dothideomycetes,各占总分离菌株数的52.86%和30.00%。前6个优势属分别为Diaporthe(23.57%)、Stagonosporopsis(10.71%)、Phialophora(8.57%)、Colletotrichum(6.43%)、Alternaria(5.71%)、Penicillium(5.71%),占总分离菌株数的60.71%;不同植物组织之间以及根际土壤之间的真菌群落组成差异明显,Shannon多样性指数在1.37—2.46之间。高通量测序获得了112802个序列,在97%的ITS序列同源水平下划分为个4216个OTUs,前6个优势种属分别为Rachicladosporium(19.81%)、Mycosphaerella(11.18%)、Aureobasidium(5.10%)、Agaricus(4.75%)、Alternaria(3.27%)、Delicatula(2.58%),占测序数的46.69%,Shannon指数在0.98—4.84之间。两种方法获得的真菌群落组成具有显著差异,仅Alternaria为共有优势属,但所揭示的不同分离来源的真菌组成情况是一致的,即植物根、茎、鲜叶、腐叶之间内生真菌群落组成差异明显,具有组织特异性。根际土壤与根内生真菌群落组成存在一定程度的相似,说明两者之间联系紧密。研究结果表明,紫茎泽兰的内生真菌具有较高的多样性,高通量测序技术能更加全面地反映植物内生真菌的物种组成及多样性信息。 展开更多
关键词 紫茎泽兰 内生真菌 物种多样性 高通量测序 组织特异性
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利用均匀设计法优化天麻萌发菌小菇属真菌(Mycenasp.)培养基的研究
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作者 王玉川 秦丽媛 +3 位作者 何海艳 陈林 杨明挚 张汉波 《中国食用菌》 北大核心 2018年第5期23-28,31共7页
小菇属真菌(Mycenasp.)是天麻种植的重要萌发菌,系统研究小菇属真菌的营养生长因子需求,对天麻产业具有重要应用价值。本研究以小菇属真菌菌落直径和生物量同时增加作为优化目标,利用均匀设计法对影响真菌生长的14个营养因子进行... 小菇属真菌(Mycenasp.)是天麻种植的重要萌发菌,系统研究小菇属真菌的营养生长因子需求,对天麻产业具有重要应用价值。本研究以小菇属真菌菌落直径和生物量同时增加作为优化目标,利用均匀设计法对影响真菌生长的14个营养因子进行配比优化,获得的最优培养基配方为:可溶性淀粉4g·L^-1、蛋白胨4g·L^-1、酵母膏4g·L^-1、甘露醇8mg·L^-1、烟酸4mg·L^-1、KH2P041.6g·L^-1、MgSO4 7H2O 1.6g·L^-1。在25℃,pH5.5培养芝1d,菌落直径达到69cm,生物量为0.2685g。可溶性淀粉和KH2PO4,蛋白胨和酵母膏间的交互作用对菌落直径有显著影响;蛋白胨和MgSO4·7H2O,甘露醇和MgSO4·7H2O间的交互作用对生物量大小有显著影响。研究结果表明影响小菇属真菌生长的营养因子较多,且其多被因子间的交互作用影响。 展开更多
关键词 均匀设计 营养因子 小菇属真菌 生物量 菌落直径
轻小型无人机航摄技术辅助的热带森林样地测量精度问题探讨 被引量:1
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作者 邓云 王彬 +4 位作者 李强 张志明 邓晓保 曹敏 林露湘 《生物多样性》 CSCD 北大核心 2018年第8期892-904,共13页
准确的样地坐标位置是无人机航摄数据与地面调查数据融合使用的必要前提,但是在森林样地的具体实践中,会有许多因素制约着样地位置的测量精度,这有可能影响后期的数据融合过程甚至得出错误的结论,研究者们需要对此予以足够的重视。本文... 准确的样地坐标位置是无人机航摄数据与地面调查数据融合使用的必要前提,但是在森林样地的具体实践中,会有许多因素制约着样地位置的测量精度,这有可能影响后期的数据融合过程甚至得出错误的结论,研究者们需要对此予以足够的重视。本文通过对比西双版纳地区10个热带森林样地及周围区域无人机航摄过程中的地面控制点测量精度、Photoscan摄影测量软件所得点云解算精度和照片曝光点重投影精度,发现:(1)即使使用性能相对较好的实时差分(real time kinematic,RTK)式GNSS系统进行定位,在林内也很难获得很好的定位精度,林窗处的地面控制点均方根误差(root mean square error,RMSE)在水平和垂直方向分别为0.167±0.158 m和0.297±0.170 m,林下样地顶点桩处分别为0.392±0.368 m和0.657±0.412 m;(2)软件的全局解算精度主要受控制点地面测量精度和控制点数量的影响;(3)若仅依托普通的单站式GPS对无人机位置进行定位,则照片曝光点的重投影坐标位置可能存在较大误差(RMSE在水平和垂直方向上分别为18.434±5.252 m和34.042±6.920 m);(4)估测地形与实测地形间的高差标准差与林冠平均高度正相关(r=0.713,P〈0.05),估测地形模型在20 ha样地尺度下的验证结果优于1ha样地。基于以上结果,我们建议:(1)在对热带森林进行无人机航摄的过程中,必须有足够数量和质量的分布相对均匀的地面控制点对测量误差进行控制;(2)摄影测量法的优势在于能够以相对简单的前端设备建立数字表面模型,但该方法可能很难在森林样地中建立准确的数字地形模型。在使用无人机获取数据之前,研究者应预先考虑到适合自己的恰当方法以应对以上的精度控制问题。 展开更多
关键词 轻小型无人机 全球导航卫星系统 定位精度 森林样地
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