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细粒棘球绦虫转酮醇酶生物信息学分析 被引量:5
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作者 张耀刚 曹得萍 +1 位作者 李超群 樊海宁 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第3期233-237,共5页
目的 利用生物信息学技术对EgTK基因编码蛋白的结构和功能进行预测和分析。方法 利用ExPASy系统的ProtParam、ProtScale、SignalP、SOMPA程序与SubLoc v1.0、DNAStar、IEDB、SYPEITHI、Phyre2等生物信息学软件分析EgTK的理化性质、抗原... 目的 利用生物信息学技术对EgTK基因编码蛋白的结构和功能进行预测和分析。方法 利用ExPASy系统的ProtParam、ProtScale、SignalP、SOMPA程序与SubLoc v1.0、DNAStar、IEDB、SYPEITHI、Phyre2等生物信息学软件分析EgTK的理化性质、抗原表位、跨膜区、二、三级结构等。结果 EgTK基因由7个外显子,6个内含子构成,CDS长度为1 878bp,编码625个氨基酸,分子式为C_(3015)H_(4791)N_(829)O_(900)S_(22),分子质量为67.76ku;为跨膜蛋白,位于细胞质,二级结构主要以α螺旋、无规则卷曲为主。EgTK有16个潜在的B细胞线性表位,11个CTL细胞表位,13个Th细胞表位;EgTK三级结构与人类转酮醇酶相似性为97%;经多重比对,除去两端多余序列,共有473个氨基酸残基参与比对,发现195个变异位点、123简约性信息位点、72单态突变位点。结论 生物信息学技术分析EgTK蛋白存在多个B、T细胞表位,具有良好的免疫原性,可为该蛋白的基因克隆、表达等提供理论依据。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 转酮醇酶 生物信息学 抗原表位
细粒棘球绦虫延伸因子1生物信息学分析
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作者 李超群 樊海宁 +1 位作者 张耀刚 曹得萍 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期607-610,共4页
目的利用生物信息学技术对细粒棘球绦虫的延伸因子1(EF-1)进行分析,探讨其诊断价值。方法通过Expasy系统预测EF一1的理化性质,使用DNAStar软件分析蛋白亲水性、柔性区域、抗原指数及表面可及性,利用ABCpred与IEDB软件综合预测B细... 目的利用生物信息学技术对细粒棘球绦虫的延伸因子1(EF-1)进行分析,探讨其诊断价值。方法通过Expasy系统预测EF一1的理化性质,使用DNAStar软件分析蛋白亲水性、柔性区域、抗原指数及表面可及性,利用ABCpred与IEDB软件综合预测B细胞线性抗原表位,通过DNAStar软件预测T细胞表位,使用SOPMA软件预测二级结构,SWISS—MODEL网站构建EF-1的三级结构,使用MEGA软件选择neighborjoining法构建EF.1氨基酸序列的系统发育树。结果EF-1基因序列全长1412bp,含有2个内含子;EF一1亲水性得分较高的区域为35—45、52~70、126—140、158—183、301—322、357—380、424—448;柔性区域为26—45、54—71、162~176、300~318、357~381、432~448;抗原性指数得分较高的区域分布与柔性区域一致;表面可及性得分较高的区域较少,主要分布在39—54、62~76、128~132、161~170、220~234、315~329、354~372、424~448;可能的B细胞线性表位的氨基酸序列为120—130、286—295、306—320、365~378;可能的优势性T细胞表位区域为34~48、164—177、222—244、280~290、321—330、396~407;EF-1的二级结构中d螺旋占32.81%、p折叠占22.54%、B转角占10.94%、无规则卷曲占33.71%;系统发育树结果表明多房棘球绦虫为一枝,其余聚于一枝,且内部形成许多梳齿状分枝。结论得到4个可能形成B细胞表位的区域、6个优势性T细胞表位区域,EF-1具有较高的保守性,可作为免疫诊断和药物治疗靶点。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 延伸因子1(EF一1) 生物信息学
CT三维重建在肝胆外科的应用现状 预览 被引量:3
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作者 姜超 王海久 +5 位作者 任利 阳丹才让 侯立朝 周灜 温浩 樊海宁 《临床肝胆病杂志》 CAS 2017年第2期389-393,共5页
随着影像技术的发展,CT三维重建技术已广泛应用于肝胆外科的临床实践中。CT三维重建能够将二维图像进行分割重建形成三维投影图像,可清晰地显示病灶位置与肝内管道系统之间的关系,对术前评估肝体积,制订诊疗决策,术中精准操作及术后个... 随着影像技术的发展,CT三维重建技术已广泛应用于肝胆外科的临床实践中。CT三维重建能够将二维图像进行分割重建形成三维投影图像,可清晰地显示病灶位置与肝内管道系统之间的关系,对术前评估肝体积,制订诊疗决策,术中精准操作及术后个体化管理等具有重要价值,推进了肝胆外科和微创技术不断发展,在临床应用上显示出了极大的前景。 展开更多
关键词 计算机断层扫描 成像 三维 肝疾病 胆道外科手术 综述
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DWI对儿童肝泡型包虫病生长活性的价值研究 被引量:1
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作者 高会艳 鲍海华 +3 位作者 李伟霞 孙再兴 林洁 樊海宁 《实用放射学杂志》 北大核心 2017年第7期1080-1083,共4页
目的 探讨扩散加权成像(DWI)及表观扩散系数(ADC)值对评估儿童肝泡型包虫病(HAE)生长活性的价值.方法 回顾性分析20例儿童(≤14岁)HAE患者,确定PNM分期,观察HAE病灶不同P分期DWI边缘带表现,并测量边缘带ADC值,比较泡球蚴病灶各... 目的 探讨扩散加权成像(DWI)及表观扩散系数(ADC)值对评估儿童肝泡型包虫病(HAE)生长活性的价值.方法 回顾性分析20例儿童(≤14岁)HAE患者,确定PNM分期,观察HAE病灶不同P分期DWI边缘带表现,并测量边缘带ADC值,比较泡球蚴病灶各分期DWI边缘带连续性及ADC值差异性,对其生长活性进行评估.结果 5例P1期病灶,7例P2期病灶,2例P3期病灶,6例P4期病灶.边缘带DWI特点:HAE病灶边缘与邻近正常肝实质间可见高信号环形带,P1期病灶显示基本完整的明显高信号边缘带,生长活性最强,P2、P3期病灶与肝实质间边缘带连续,仍具有明显的生长活性,P4期病灶边缘带不连续、信号减低,生长活性减低.P1期病灶组ADC值最高,P2期次之,P4期最低,P3期样本量较少,未做统计,3组ADC值间的差异均有统计学意义(P〈0.05).结论 DWI边缘带图像特征可以一定程度上评估儿童HAE不同分期的生长活性,ADC值测量为病灶各分期的生长活性提供重要的参考价值. 展开更多
关键词 肝泡型包虫病 儿童 扩散加权成像 表观扩散系数
青海果洛地区包虫病防治知识与相关行为的现状调查 预览 被引量:1
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作者 马洁 樊海宁 任利 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2016年第A02期92-93,共2页
背景:包虫病是一种严重危害广大牧区人民身体健康、阻碍畜牧业发展的人畜共患寄生虫病。目的:调查青海省果洛地区人群对包虫病防治知识的了解状况及其相关行为。方法:采用随机抽样方法选择青海省果洛地区9-78岁常住居民618名,用自... 背景:包虫病是一种严重危害广大牧区人民身体健康、阻碍畜牧业发展的人畜共患寄生虫病。目的:调查青海省果洛地区人群对包虫病防治知识的了解状况及其相关行为。方法:采用随机抽样方法选择青海省果洛地区9-78岁常住居民618名,用自行设计的包虫病防治知识、卫生行为调查问卷进行调查。结果与结论:618人对包虫病防治知识知晓率为31.6%,相关行为正确率为40.3%。表明青海果洛地区人群包虫病防治知识和相关行为的正确率均不高,建议当地加强包虫病基本知识的健康教育工作,同时开展多种形式的宣传培训,长期进行包虫病宣传教育工作。 展开更多
关键词 果洛地区 包虫疾病 防治知识 相关行为
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1975年—2015年我国骨包虫病诊治状况的文献复习
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作者 邵军 王志鑫 +7 位作者 李衍飞 阳丹才让 任利 侯立朝 周瀛 王海久 王虎 樊海宁 《华西医学》 CAS 2018年第9期1138-1141,共4页
目的通过搜集文献回顾性研究我国骨包虫病的临床表现、诊断、治疗及预后情况。方法利用中国知网和万方数据库检索2000年—2015年中国骨包虫病的相关病例报道,进行回顾性分析。结果纳入2000年—2015年发表的相关文献21篇,共报道1975年—2... 目的通过搜集文献回顾性研究我国骨包虫病的临床表现、诊断、治疗及预后情况。方法利用中国知网和万方数据库检索2000年—2015年中国骨包虫病的相关病例报道,进行回顾性分析。结果纳入2000年—2015年发表的相关文献21篇,共报道1975年—2015年收治的87例骨包虫病患者。骨包虫病的病例分布主要集中在我国广大畜牧区。诊断依据中,54例(62.1%)提及影像学检查,32例(36.8%)提及实验室检查,8例(9.2%)提及病理检查。治疗上以手术治疗为主,部分辅以联合化学药物治疗。44例有结局资料的患者中,复发26例(59.1%),治愈18例(40.9%);再次手术10例(22.7%),死亡2例(4.5%)。结论骨包虫病临床上较罕见,手术治疗仍是治疗骨包虫病的主要手段。骨包虫病的临床复发率相对较高,因此探索骨包虫病新的诊断和治疗方法至关重要。 展开更多
关键词 骨包虫病 诊断 治疗 文献回顾
超声造影在肝泡型包虫病中诊断及测量的价值分析 预览 被引量:1
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作者 杨建华 马淑梅 +2 位作者 樊海宁 晁丽 李晓君 《川北医学院学报》 CAS 2018年第4期504-506,共3页
目的:探讨超声造影检查对肝泡型包虫病早期诊断与其他肝脏占位性病变的临床价值。方法:选取收治的84例疑为肝包虫病患者,所有患者入院行常规超声检查和超声造影检查。根据患者术后病理结果为诊断金标准,分析对比两种检查手段测量的各... 目的:探讨超声造影检查对肝泡型包虫病早期诊断与其他肝脏占位性病变的临床价值。方法:选取收治的84例疑为肝包虫病患者,所有患者入院行常规超声检查和超声造影检查。根据患者术后病理结果为诊断金标准,分析对比两种检查手段测量的各疾病病灶估测体积;对比两种检查手段肝占位性病变患者检出情况。结果:常规超声在肝泡型包虫病和原发性肝癌病灶体积估测低于超声造影,差异具有统计学意义(P〈0.05);两种检查手段在转移性肝癌、肝硬化增生结节、肝脓肿和肝血管瘤病灶估测的比较,差异无统计学意义(P〉0.05);超声造影在肝泡型包虫病的检出率高于常规超声,差异具有统计学意义(P〈0.05);两种检查手段在原发性肝癌、转移性肝癌、肝硬化增生结节、肝脓肿和肝血管瘤病灶的检出率比较,差异无统计学意义(P〉0.05)。结论:超声造影检查能提高肝泡型包虫病诊断率,且在测量病灶形态学信息具有良好的作用。 展开更多
关键词 肝泡型包虫病 肝占位病变 超声造影 诊断
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抗体芯片检测泡型包虫病肝组织凋亡因子的表达
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作者 邵军 王志鑫 +8 位作者 王虎 李衍飞 张灵强 阳丹才让 任利 侯立朝 周瀛 王海久 樊海宁 《中国普外基础与临床杂志》 CAS 2017年第4期426-431,共6页
目的 应用抗体芯片技术检测并分析泡型包虫病组织中凋亡因子的表达及其临床意义。方法 收集6例青海大学附属医院泡型包虫病患者手术切除的肝组织标本(包括病变边缘带和正常肝组织),提取组织蛋白并利用抗体芯片技术检测其凋亡因子水平... 目的 应用抗体芯片技术检测并分析泡型包虫病组织中凋亡因子的表达及其临床意义。方法 收集6例青海大学附属医院泡型包虫病患者手术切除的肝组织标本(包括病变边缘带和正常肝组织),提取组织蛋白并利用抗体芯片技术检测其凋亡因子水平,采用AAH-APO-G1软件进行数据分析。结果 边缘带肝组织中5种凋亡因子(Bad、Fas、IGFBP-3、P21及XIAP)表达水平与正常肝组织比较,其差异有统计学意义(P〈0.05),其中Bad、Fas、IGFBP-3及P21表达水平上调,XIAP的表达水平下调。结论 凋亡相关因子在泡型包虫病的疾病进展中发挥相关作用,可能与泡型包虫病的免疫逃逸机制存在联系,而促凋亡因子与抑制性凋亡因子之间也存在某些功能失衡。因此更深入的探究凋亡因子的作用机制对泡型包虫病诊断和治疗具有重要的参考意义。 展开更多
关键词 泡型包虫病 凋亡因子 抗体芯片
不同类型肝泡型包虫病的病灶边缘区CEUS参数分析 预览 被引量:1
9
作者 李舍 樊海宁 +3 位作者 马淑梅 冶青善 乔志忠 郑云慧 《中国医学影像技术》 CSCD 北大核心 2017年第4期550-553,共4页
目的 探讨不同类型肝泡型包虫病(AE)病灶边缘区CEUS参数特点。方法 对45例患者48个肝AE的病灶行常规超声检查并分为浸润型、液化型和钙化型,后行CEUS检查,绘制时间-强度曲线,并分别记录不同类型肝AE病灶的中心区、边缘区和周围正常区... 目的 探讨不同类型肝泡型包虫病(AE)病灶边缘区CEUS参数特点。方法 对45例患者48个肝AE的病灶行常规超声检查并分为浸润型、液化型和钙化型,后行CEUS检查,绘制时间-强度曲线,并分别记录不同类型肝AE病灶的中心区、边缘区和周围正常区的CEUS定量参数,包括峰值强度(pI)、达峰时间(Tp)、曲线下面积(AUC)、平均渡越时间(MTT),并进行统计学分析。结果浸润型、钙化型和液化型病灶边缘区pI、Tp和MTT差异有统计学意义(F=8.832、9.088、5.538,P均〈0.01),AUC差异无统计学意义(F=2.957,P=0.062)。浸润型与液化型、钙化型与液化型pI、Tp和MTT比较差异有统计学意义(P均〈0.01),浸润型与钙化型pI、Tp和MTT差异无统计学意义(P均〉0.05)。病灶中心区和周围正常区的pI、Tp、AUC和MTT差异均无统计学意义(P均〉0.05)。结论 不同类型肝AE病灶的边缘区CEUS参数特点不同,浸润型和钙化型肝AE病灶的边缘区血液供应较液化型更丰富。 展开更多
关键词 棘球绦虫 造影剂 超声检查
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泡型肝包虫病患者血清炎症因子的抗体芯片检测及分析 预览 被引量:3
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作者 邵军 王志鑫 +8 位作者 王虎 张灵强 李衍飞 阳丹才让 任利 侯立朝 周瀛 王海久 樊海宁 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2017年第5期566-569,共4页
目的应用抗体芯片技术检测并分析泡型肝包虫病患者血清中炎症因子的表达及临床意义。方法选取泡型肝包虫病患者与健康对照组血清标本各3份,利用抗体芯片技术检测血清样品中炎症因子的水平,采用AAH—INF—G3数据分析软件进行分析。结... 目的应用抗体芯片技术检测并分析泡型肝包虫病患者血清中炎症因子的表达及临床意义。方法选取泡型肝包虫病患者与健康对照组血清标本各3份,利用抗体芯片技术检测血清样品中炎症因子的水平,采用AAH—INF—G3数据分析软件进行分析。结果与对照组比较,泡型肝包虫病患者血清中多种炎症细胞因子(CSF-2/3、IL-1α、IL-2、IL-6、IL-8、IL-12p70、IL-13、IL-15、IL-17A、MCP-1/2、MIG、IFN-γ TNF-α/β、TGF—β)表达水平发生显著变化(Foldchange〉2,〈0.5;信号值〉400)。其中IL-1α、IFN-γ、TNF-α/β等细胞因子升高(2倍以上),IL-12p70、MCP-2等细胞因子下降(3倍以上)。结论免疫调节相关炎症因子可能参与泡型肝包虫病慢性炎症反应,可能是揭示泡型肝包虫病免疫逃逸机制的重要切入点。 展开更多
关键词 抗体芯片 泡型肝包虫病 炎症细胞因子
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CT、MRI对儿童肝泡状棘球蚴病生长特性的评价
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作者 高会艳 李伟霞 +5 位作者 孙再兴 鲍海华 樊海宁 林洁 纪巧荣 管钰琳 《临床放射学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第8期1170-1173,共4页
目的探讨儿童肝泡状棘球蚴病(HAE)生长特点。方法搜集45例确诊为HAE患儿(≤14岁),运用CT、MRI评估儿童HAE病灶的一般特点,进行PNM分型,评价其生长特点。结果肝脏P1病灶占11.1%(5/45),P2病灶占35.5%(16/45),P3病灶占15.6%(7/45... 目的探讨儿童肝泡状棘球蚴病(HAE)生长特点。方法搜集45例确诊为HAE患儿(≤14岁),运用CT、MRI评估儿童HAE病灶的一般特点,进行PNM分型,评价其生长特点。结果肝脏P1病灶占11.1%(5/45),P2病灶占35.5%(16/45),P3病灶占15.6%(7/45),P4病灶占37.8%(17/45),88.9%(40/45)病灶最大直径〉5 cm,71.1%(32/45)〉10 cm。转移共占62.2%(28/45),单个组织器官转移占20.0%(9/45),多个组织器官转移占42.2%(19/45),P1病灶无转移,P2病灶转移占56.3%(9/16),P3病灶转移占85.7%(6/7),P4病灶转移占76.5%(13/17),直接侵犯邻近组织器官占35.6%(16/45),淋巴结转移33.3%(15/45),肺11.1%(5/45)。结论儿童泡球蚴病灶较巨大(除P1病灶),易直接侵犯邻近组织器官及通过淋巴结转移,以多部位组织器官转移常见,在一定程度上反映了儿童肝泡状棘球蚴病生长特点,对临床综合治疗提供重要的参考依据。 展开更多
关键词 儿童 肝泡状棘球蚴病 生长特点 CT MRI
超声造影参数对肝泡型包虫病灶边缘浸润带的分析研究 被引量:5
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作者 马淑梅 郑云慧 +1 位作者 樊海宁 李舍 《中国超声医学杂志》 CSCD 北大核心 2016年第11期1001-1003,共3页
目的探讨超声造影参数对肝泡型包虫诊断及治疗的指导价值。方法对24例肝包虫病患者分别进行常规超声和超声造影检查,在同一切面下分别测量病灶的周长、面积、最长径和估测体积并进行对比,并且把超声造影状态下的非增强区、浸润增殖带... 目的探讨超声造影参数对肝泡型包虫诊断及治疗的指导价值。方法对24例肝包虫病患者分别进行常规超声和超声造影检查,在同一切面下分别测量病灶的周长、面积、最长径和估测体积并进行对比,并且把超声造影状态下的非增强区、浸润增殖带与周围正常肝组织的造影参数进行对比,包括:峰值强度(pI)、达峰时间(Tp)、曲线下面积(Auc)及平均渡越时间(MTT)。所有的病灶均经手术和病理检查确诊为肝泡型包虫。结果由于边缘浸润带的存在,在同一切面,超声造影状态下的病灶周长、面积、最长径和估测体积均显著大于常规超声测得的上述数值(P=0.005、0.001、0.000、0.025);非增强区、浸润增殖带与周围正常肝组织的对比中,造影参数pI和AUC具有显著性差异(P〈0.05);Tp、MTT没有表现出显著性差异。结论超声造影较常规超声能更精确的显示病灶的大小及周围血管的毗邻关系;肝泡型包虫病灶周边浸润增殖带的超声造影参数对临床手术具有一定的指导意义。 展开更多
关键词 肝泡型包虫 超声造影 浸润带 造影剂
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